{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004069761630068813],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00110521543186493],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001512632209959284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0337133588343, 451.3443619211883, 0, 0, 0.2951907953378544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000408998742041377],
[203.3128251948419, 484.3097986699546, 0, 1, 0.2956750085564639, 0, 0.002064794069304957, 0.003397677283909516, 0.7043249914435361, 1, 0.001103092373894833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1231814417778, 451.3631285704561, 0, 0, 0.2952805992655259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004064306859174346],
[203.3575592363137, 484.3191819945885, 1, 0, 0.2957167911078616, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2957167911078615, 0.001106292490512263],
[189.3528556710529, 451.424103802098, 0, 0, 0.2955050940451097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000406331839311223],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4723963509512, 484.3496696104095, 0, 1, 0.2958212689303015, 0, 0.002064624098545082, 0.003397397592196748, 0.7041787310696985, 1, 0.0011063787230554],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004040690254459062],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001108656108424526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 450.8772131984953, 0, 0, 0.2955896547348731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004074425496477134],
[203.3961122193073, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2958607952816851, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7041392047183149, 1, 0.001104767758478741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070971038076935],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001105112686370107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070798430505051],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001105127364297889],
[188.5148343265171, 451.5626662797432, 0, 0, 0.2945187639746157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000407082628237694],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0533856786834, 484.4189508492321, 1, 0, 0.2953622638900732, 0.004924813229080674, 0, -0.00810392003962751, 1, 0.2953622638900733, 0.001105127364297889],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070625838576514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001105142042225686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4425227648079, 451.0437872474261, 0, 0, 0.2957791912229777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070815039150686],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001104996797068188],
[189.1231814417778, 451.3631285704561, 0, 0, 0.2952805992655259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004031200317485325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.3191819945885, 1, 0, 0.2957167911078616, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2957167911078615, 0.001109607126705626],
[189.4425227648079, 451.0437872474261, 0, 0, 0.2957791912229776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000407064380567423],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001105011472867625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001600758115017129],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001352966286102769],
[203.3961122193073, 484.0886543569029, 0, 1, 0.2958554459791948, 0, 0.002065737321046017, 0.003399229431439021, 0.7041445540208052, 1, 0.001517688736812602],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.4017466901164, 2, 0, 0.2957207696776105, 0.009833029639443377, 0, -0.01618052954268311, 0.9999999999999999, 0.08745077361871845, 0.003028384693380444],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001513785387338669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 450.8772131984953, 0, 0, 0.2955896547348731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004455438139134543],
[189.200287407765, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2954952901821955, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7045047098178046, 1, 0.0005596389725668808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005067784288210881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.000589123796439032],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005268546891443926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003950838743068388],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2951344019114696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005162405813625332],
[203.2749945407858, 484.280629011595, 1, 0, 0.2956487992790005, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2956487992790005, 0.0009967182896153794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4425227648079, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2956673682387988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005193516794458403],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5172298978287, 484.280629011595, 1, 0, 0.2958968645533832, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2958968645533833, 0.0009927670524061394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2951344019114696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001612495105069562],
[203.2749945407858, 484.280629011595, 1, 0, 0.2956487992790005, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2956487992790005, 0.001351765939645045],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4046921107518, 451.2278802230555, 0, 1, 0.2956526100768738, 0, 0.002216175116452622, 0.003646779096411909, 0.7043473899231262, 1, 0.001512806600115994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.3537601723816, 0, 1, 0.2957414030656027, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001512617512894598],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4346652023009, 484.0967512981428, 1, 0, 0.2958914462960684, 0.004915583089074682, 0, -0.00808873158209953, 1, 0.2958914462960684, 0.001512601726311893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6170003832997, 450.8693096289343, 1, 0, 0.2960516055053195, 0.005273788731909895, 0, -0.008678169140896421, 1, 0.2960516055053195, 0.001513169049743765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001513252460869963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00151318812167162],
[188.7206110979571, 451.9119612358502, 1, 0, 0.2945847889226941, 0.005298838288950542, 0, -0.008719388898447183, 1, 0.294584788922694, 0.001512675924633837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1562740644034, 484.5935983272856, 0, 1, 0.2953926743132877, 0, 0.002063584833666371, 0.00339568745232234, 0.7046073256867122, 1, 0.001513421274745158],
[203.4346652023009, 484.1108024864013, 1, 0, 0.2958853992393844, 0.004915583089074682, 0, -0.00808873158209953, 1, 0.2958853992393844, 0.001513828812867515],
[189.4628344921652, 451.0234755200687, 0, 1, 0.2958109041995703, 0, 0.002217179491260215, 0.003648431823683369, 0.7041890958004298, 1, 0.001513027780238251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4628344921652, 451.0234755200687, 0, 0, 0.2958109041995703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002938018983891275],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001218657808576611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.700287407765, 451.7860226044689, 0, 1, 0.2946203290499068, 0, 0.00221343722462942, 0.003642273817657099, 0.7053796709500932, 1, 0.001512360105337438],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513186976839725],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001515087953253289],
[187.8668614566957, 452.6194485555382, 0, 1, 0.2933190897602593, 0, 0.002209361535814111, 0.003635567155956585, 0.7066809102397407, 1, 0.001512648824362888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3960311150554, 452.0902788971785, 0, 1, 0.2941452895557703, 0, 0.00221194758365383, 0.003639822571124003, 0.7058547104442296, 1, 0.001512289123342618],
[188.7835744322304, 451.7027355800035, 1, 0, 0.294750366215672, 0.005297071013765452, 0, -0.008716480796937176, 1, 0.2947503662156721, 0.0005681153187336577],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005600759663442218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003835565064029342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8489620443867, 451.6373479678472, 1, 0, 0.294852456785188, 0.005295236940539614, 0, -0.008713462777353968, 1, 0.294852456785188, 0.001515311187247175],
[188.4960796400841, 451.9902303721498, 0, 1, 0.2943014966806764, 0, 0.002212437200637372, 0.003640628249776188, 0.7056985033193236, 1, 0.001513169471605904],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2940083354668, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427593, 0, -0.00809432808565768, 1, 0.2956243771915015, 0.001512263846091108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[187.9580520507221, 452.5282579615118, 0, 0, 0.293461466876836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000394711555087514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.0791697292435, 452.4071402829904, 1, 0, 0.2936505695580769, 0.005316909902567029, 0, -0.008749126251910714, 1, 0.2936505695580769, 0.001117618922290065],
[188.6170003832997, 451.8693096289343, 1, 0, 0.2944902918841417, 0.005301749036236614, 0, -0.008724178615775466, 1, 0.2944902918841417, 0.001515024907522748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.200287407765, 452.3693096289343, 0, 1, 0.2938014671292348, 0, 0.002210583208706779, 0.003637577453398586, 0.7061985328707652, 1, 0.001514875453344756],
[188.200287407765, 452.2860226044689, 1, 0, 0.2938396722393179, 0.005313488166111806, 0, -0.008743495687391828, 1, 0.293839672239318, 0.001512580819893786],
[188.200287407765, 452.2860226044689, 0, 1, 0.2938396722393179, 0, 0.002210990280534305, 0.003638247301652157, 0.706160327760682, 1, 0.001513220215416899],
[188.200287407765, 452.2860226044689, 0, 0, 0.2938396722393179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003013076496140339],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.8961122193073, 484.780629011595, 0, 1, 0.2950457679521555, 0, 0.002062788692771967, 0.003394377379869149, 0.7049542320478446, 1, 0.001211904069369731],
[188.4580520507221, 452.0282579615118, 0, 1, 0.2942421236874249, 0, 0.00221225107587222, 0.003640321976188942, 0.7057578763125751, 1, 0.001512850202061994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002924467956360759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001220116200408703],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001518732719301679],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512493471196183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8668614566957, 451.6194485555382, 0, 1, 0.2948804033814371, 0, 0.002214253622598417, 0.003643617223701861, 0.7051195966185629, 1, 0.001512292667648222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3668614566957, 452.1194485555382, 0, 0, 0.2940997465708482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005431543238325929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.9793992437726, 484.6973419871296, 1, 0, 0.2951668815793465, 0.004926608334272523, 0, -0.008106873936204047, 1, 0.2951668815793465, 0.0009693256469944611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000412898355767162],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001100192756421702],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001514460384526801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513616436079684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004166860530673948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001094984282357392],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5815669313825, 450.9778742416381, 1, 0, 0.2959624895766307, 0.005274774421301949, 0, -0.00867979112078592, 1, 0.2959624895766307, 0.001512205870242688],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001517772984342594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512914709041765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.1194485555382, 1, 0, 0.2954778320601508, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954778320601508, 0.001512277561783403],
[189.200287407765, 451.1194485555382, 0, 0, 0.2954778320601508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006236729472558097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.1973419871296, 0, 1, 0.2958086802237671, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441443, 0.7041913197762329, 1, 0.0008890887216043147],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513487538437896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513038569860485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 2, 0, 0.2954009858604957, 0.01057080846653047, 0, -0.0173945655565443, 1, 0.08726174244735274, 0.003029546941356357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.001512898378397793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.001511865384699295],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.001512421964356039],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513419388701491],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001514920676551515],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004596922778999047],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001053268645417414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2648386771072, 484.4119025537951, 0, 1, 0.2955819595021851, 0, 0.002064358853958894, 0.003396961124696881, 0.7044180404978149, 1, 0.001513236699653635],
[187.2967880907493, 450.2042952010548, 1.6875, 1.8125, 0.2937983840335182, 0.009009764754654363, 0.004025950039393923, -0.00820100866085615, 0.8810128378968406, 0.407741567661305, 0.003045490045714621],
[188.2029019414035, 449.2912875010102, 0.75, 1, 0.2952229291784067, 0.003985060762949928, 0.002225727557643217, -0.002895032756709971, 0.8401633394571588, 0.4578860398735222, 0.001608530374362449],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001515140489822109],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513594687870183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1421450263516, 451.3441649858823, 0, 1, 0.2953102073684272, 0, 0.002215604138875439, 0.00364583953659214, 0.7046897926315727, 1, 0.001513157879291249],
[188.8646091625781, 451.6217008496559, 0, 1, 0.2948768868439524, 0, 0.002214242579837629, 0.003643599052525355, 0.7051231131560476, 1, 0.0009069222746472153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 0, 0, 0.2947627061664835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006070261090198519],
[188.9958827047782, 451.4904273074557, 0, 1, 0.2950818460134896, 0, 0.002214886384111574, 0.00364465845074302, 0.7049181539865104, 1, 0.001512598898955097],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512740265366152],
[189.8288458301685, 451.4908901331347, 0, 0, 0.2959971995014834, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002269201556928661],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.710391430509, 484.3830627759278, 0, 1, 0.2960504713207071, 0, 0.002064481764224264, 0.00339716337702936, 0.7039495286792929, 1, 0.001285934931932866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2388403907586, 451.2474696214754, 1, 0, 0.2954611791579806, 0.005284327455902307, 0, -0.00869551091053956, 1, 0.2954611791579806, 0.0011314763360753],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003807308316094776],
[203.4518693614165, 484.6415848450204, 0, 1, 0.2956747635334696, 0, 0.002063380508958557, 0.003395351230212541, 0.7043252364665304, 1, 0.001512570673554279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4628344921652, 451.0234755200687, 0, 0, 0.2958109041995703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004605831343482395],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001052193658651895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.735499246154, 0, 0, 0.295193826507188, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005656676559763659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 1, 0, 0.295676224380046, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2956762243800459, 0.0009473875344963769],
[198.7360349284482, 475.2458782846205, 2.5, 4.75, 0.2948684987420737, 0.01257950024463397, 0.009994826293170432, -0.004253154395274119, 0.7500404402272565, 0.5224380908132986, 0.007645167995854394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4434468007322, 449.0455834027043, 0.75, 0, 0.2956026501986957, 0.003979973900568061, 0, -0.006549160089879954, 1, 0.2311116422828582, 0.0005615435890520612],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.0009499771714461602],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513786178655533],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512930503094608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2940083354669, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427592, 0, -0.008094328085657678, 1, 0.2956243771915015, 0.001512968373474831],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9960796400841, 451.4902303721498, 0, 0, 0.2950821534912653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004196279464068986],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0981835239246, 451.3881264883094, 1, 0, 0.2952415696758805, 0.005288258096215296, 0, -0.008701978890809941, 1, 0.2952415696758806, 0.0005547921526549348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005375424678172012],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.450229585413, 484.2265116454893, 0, 1, 0.2958515496994251, 0, 0.002065149214159752, 0.003398261684854661, 0.7041484503005749, 1, 0.001512626907391136],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513429114926869],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512862224068282],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001514017278054824],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4518693614166, 484.3701965999442, 0, 1, 0.2957914254714325, 0, 0.002064536602415961, 0.003397253614831275, 0.7042085745285676, 1, 0.001513260045579356],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001638888325620241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001349076006717456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512618631966534],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9377403233648, 451.5485696888691, 0, 0, 0.2949910675214212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004547473622632779],
[189.0690138655649, 451.4172961466691, 0, 1, 0.2951960266909585, 0, 0.002215245203354131, 0.003645248897997587, 0.7048039733090415, 1, 0.0005848977650610208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004722145541218283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.64350513197, 450.8428048802639, 0, 0, 0.2960929877304444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005529963372073693],
[203.6177210814098, 484.0590201494925, 0, 1, 0.2960951110792923, 0, 0.00206586378597215, 0.003399437533066743, 0.7039048889207077, 1, 0.000959256762028613],
[203.470098654218, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2959684162447108, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7040315837552892, 1, 0.00151332941852305],
[203.1177210814098, 484.5590201494925, 0, 1, 0.2953680252698973, 0, 0.002063732091276492, 0.003395929768902103, 0.7046319747301026, 1, 0.001513847121753165],
[203.3229810585206, 484.3537601723816, 0, 1, 0.2956665085030854, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7043334914969146, 1, 0.001513786178655533],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001512924096100232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0533856786834, 484.4189508492321, 1, 0, 0.2953622638900732, 0.004924813229080674, 0, -0.00810392003962751, 1, 0.2953622638900733, 0.001512886278629085],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[184.6155007816922, 447.2276099327113, 1.5, 3, 0.2921856670605362, 0.008124994887475616, 0.006707993722595464, -0.002331715661507714, 0.7451352398533621, 0.5926907994878574, 0.004577607417988369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001768052717146043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001336461124422402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00151395700354314],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00151332941852305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512626907391136],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513307007526527],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9958827047782, 451.4904273074557, 0, 1, 0.2950818460134896, 0, 0.002214886384111574, 0.00364465845074302, 0.7049181539865104, 1, 0.0005693009171211052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005572107157410087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003854765017485441],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512980260382371],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001512473097629164],
[188.9786785456625, 451.3623067361129, 0, 1, 0.2951219473520103, 0, 0.002215515086386347, 0.003645692998192131, 0.7048780526479896, 1, 0.001514937243545584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005520337076420718],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.000960109251616709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7938752039304, 451.7655659690903, 0, 1, 0.2947327961604979, 0, 0.002213537452450327, 0.003642438745383004, 0.705267203839502, 1, 0.001513166639430536],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001512928275179328],
[203.1562740644034, 484.5935983272856, 0, 1, 0.2953926743132877, 0, 0.002063584833666371, 0.00339568745232234, 0.7046073256867122, 1, 0.001512423264886993],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6799637175729, 450.515696833744, 0, 0, 0.2962843633682651, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005328660832363045],
[189.4401255626689, 450.9008597191064, 0, 1, 0.2958425743735703, 0, 0.002217782420337279, 0.003649423960603658, 0.7041574256264297, 1, 0.0005553911603110234],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004250320143942728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3789080601916, 483.881120195176, 0, 1, 0.2959271595883085, 0, 0.002066623305320623, 0.003400687343726003, 0.7040728404116915, 1, 0.001515113190143749],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001512714812627874],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 1, 0, 0.2950227804980138, 0.005292179873507425, 0, -0.008708432286727774, 1, 0.2950227804980138, 0.001512666795472299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005184453215241356],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.000993567059315556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512731428469804],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002337246222303865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001278901077580039],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 1, 0, 0.2947627061664835, 0.005296849257096824, 0, -0.008716115890040767, 1, 0.2947627061664835, 0.001512668629905657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513382409931903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1711177494053, 451.3151922628286, 0, 1, 0.2953554428755737, 0, 0.002215746372255154, 0.003646073585658077, 0.7046445571244263, 1, 0.001514677842930225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512326615751831],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512414358905111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512604358706245],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512741194192904],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512873987110931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.0009535644446513923],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005588260611175088],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.00151284937548894],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 1, 0, 0.2950227804980138, 0.005292179873507425, 0, -0.008708432286727774, 1, 0.2950227804980138, 0.001512676409376077],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003024677058939057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001210732650022643],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.001512778182410759],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002925731352782074],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001219988309763228],
[189.200287407765, 451.2276832877496, 1, 0, 0.2954278951968488, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954278951968488, 0.001513713364283076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.2514593532353, 1, 0, 0.2957854002947646, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957854002947646, 0.001512639942542061],
[203.3961122193073, 484.3347463777006, 1, 0, 0.295749579471018, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957495794710181, 0.001512766103143404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9960796400841, 451.4902303721498, 0, 0, 0.2950821534912653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001625838910081487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2940083354668, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427593, 0, -0.00809432808565768, 1, 0.2956243771915015, 0.001350406511159297],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343596, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656404, 1, 0.00151395700354314],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.00151332941852305],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00017380334366604],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00133951245112286],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 2, 0, 0.2954009858604957, 0.01057080846653047, 0, -0.0173945655565443, 1, 0.08726174244735274, 0.003031940239020297],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513128796445723],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513269628341918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0337133588343, 451.4525966533997, 0, 0, 0.2951409115289655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005456942602083386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1170003832997, 451.3693096289343, 0, 1, 0.2952709486947306, 0, 0.002215480713170528, 0.003645636436089256, 0.7047290513052694, 1, 0.0005498474041498562],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004165511188105107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513291387672398],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.0680570542658, 449.5662168697463, 0, 1.5, 0.2949465935965013, 0, 0.003336549642106667, 0.00549038719848624, 0.5920154254626691, 1, 0.0005478870429545783],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000540515294878985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004234696777749437],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513144560181476],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.64350513197, 451.842804880264, 0, 0, 0.2945316741092666, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003201623422305753],
[203.1177210814097, 484.5590201494925, 0, 1, 0.2953680252698972, 0, 0.002063732091276492, 0.003395929768902103, 0.7046319747301028, 1, 0.001192862362443227],
[188.6796609128246, 451.8066490994094, 0, 1, 0.2945881246223992, 0, 0.00221333617376661, 0.003642107535592369, 0.7054118753776009, 1, 0.001512871361052915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002967734057081894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001215736490870336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.39308569442, 0, 2, 0.2956391998026325, 0, 0.004128878093156149, 0.006794186167858637, 0.4961241368546758, 1, 0.003028851908673566],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001513043967256481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2954952901821955, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7045047098178046, 1, 0.001512392830707933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2954952901821955, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7045047098178046, 1, 0.001514332876334721],
[189.3651139940725, 451.0408667271611, 0, 1, 0.2956954177423625, 0, 0.002217094001384379, 0.003648291147664656, 0.7043045822576375, 1, 0.002018381964934928],
[189.6320356925595, 450.9496014790173, 0, 3, 0.2960310203861923, 0, 0.006652628121104106, 0.01094708851666828, 0.3488675434331033, 1, 0.004572356823400695],
[189.2855096536664, 450.9706051364023, 0, 3, 0.2956402996880874, 0, 0.006652318279353504, 0.01094657866326775, 0.3494487569955783, 1, 0.004050884382371174],
[189.200287407765, 450.8772131984953, 1, 0, 0.2955896547348731, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2955896547348731, 0.001512759970961147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2958607952816851, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7041392047183149, 1, 0.001512224726940882],
[188.5148343265171, 451.3582615767564, 0, 1, 0.2946128467245543, 0, 0.002215534942257711, 0.003645725671592394, 0.7053871532754457, 1, 0.001512866536569281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0533856786834, 484.4189508492321, 1, 0, 0.2953622638900732, 0.004924813229080674, 0, -0.00810392003962751, 1, 0.2953622638900733, 0.001513031092033192],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2956849645052712, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7043150354947287, 1, 0.001512660396545271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.3191819945886, 1, 0, 0.2957167911078615, 0.004917446903647875, 0, -0.008091798541914505, 1, 0.2957167911078615, 0.001512660396545271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004084904239091487],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001103588507385783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005241719667533779],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.0009876010094242572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.00151452139617138],
[189.0791697292435, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2952677190966199, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952677190966199, 0.001513314777107571],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513050999335292],
[190.0398442072052, 450.4464658050287, 2, 0, 0.2967117973272141, 0.01052410881698761, 0, -0.01731771995689004, 1, 0.08803789067314582, 0.003028336112298644],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0210273478301, 450.4652826644038, 0, 1, 0.2966824183083641, 0, 0.002219926903323644, 0.003652952768263859, 0.7033175816916359, 1, 0.001512425997259111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.7648386771072, 483.9119025537951, 0, 1, 0.2963090453115801, 0, 0.002066491844326629, 0.003400471020926722, 0.7036909546884198, 1, 0.001512939201906315],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0525481663633, 451.4479280581854, 0, 2, 0.2951637901672452, 0, 0.004430189786455787, 0.007290003116831714, 0.4967940826914031, 1, 0.0030347297799858],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512622611127833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512369917983537],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.0005471311086133001],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005456609503616385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004191319844497065],
[188.9580520507221, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2952286567875281, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7047713432124718, 1, 0.001513092459883544],
[188.9934855026392, 451.1774579917651, 0, 1, 0.2952234671430244, 0, 0.002216422789496394, 0.003647186649439675, 0.7047765328569755, 1, 0.001512994891249401],
[188.8747650262567, 451.3693096289343, 0, 1, 0.2950043155463436, 0, 0.002215480713170528, 0.003645636436089256, 0.7049956844536565, 1, 0.001513435974886097],
[188.7158166936792, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2947560534555728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003890233293254695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8369343722007, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2949452276835212, 0.005295574212346531, 0, -0.008714017767691212, 1, 0.2949452276835212, 0.001124216372694931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2951344019114696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001350205850418173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.280629011595, 1, 0, 0.2956487992790005, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2956487992790005, 0.001377815771185186],
[188.6703603232699, 451.6948320104426, 1, 0, 0.294629318679377, 0.005300249590272625, 0, -0.008721711234855484, 1, 0.294629318679377, 0.001512796981780481],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 1, 0, 0.2947627061664835, 0.005296849257096824, 0, -0.008716115890040767, 1, 0.2947627061664835, 0.001513272487832992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 0, 0, 0.2947627061664835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005591769737297382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.0009531251913005328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2952677190966199, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952677190966199, 0.001512440279614344],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513306572587953],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512788865195209],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[201.4016305321564, 480.0187154483597, 0.75, 1.75, 0.2955615160600372, 0.00372390232401943, 0.003645691185947654, -0.0001286986489963309, 0.7441456915908184, 0.5835070213569076, 0.001518559294590871],
[203.3575592363137, 484.3191819945885, 1, 0, 0.2957167911078616, 0.004917446903647875, 0, -0.008091798541914505, 1, 0.2957167911078615, 0.001512641572273657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.733335620378, 450.752974391856, 0, 1, 0.2962332412955928, 0, 0.002218510041667886, 0.003650621282168574, 0.7037667587044072, 1, 0.001512971680570348],
[189.9377403233648, 450.5485696888691, 0, 0, 0.296552381142599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002293797294602836],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.7648386771072, 483.9119025537951, 0, 1, 0.2963090453115801, 0, 0.002066491844326629, 0.003400471020926722, 0.7036909546884198, 1, 0.001283302850274352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.6703603232699, 451.6696873673906, 1, 0, 0.294640888077664, 0.005300249590272625, 0, -0.008721711234855484, 1, 0.294640888077664, 0.001512871703215331],
[188.7914780017914, 451.5485696888691, 0, 0, 0.2948300339525132, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006227377889461621],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4119025537951, 0, 1, 0.2955070400162688, 0, 0.002064358853958894, 0.003396961124696881, 0.7044929599837313, 1, 0.0008900397101197069],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513586693637434],
[189.7584417520132, 451.0185177211378, 0, 1, 0.2961380538838869, 0, 0.002217203863497007, 0.003648471928891214, 0.7038619461161131, 1, 0.001512555916812922],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4329193705049, 451.344040102646, 1, 0, 0.2956300418889239, 0.005278913524233538, 0, -0.00868660213221582, 1, 0.2956300418889239, 0.001512546167102843],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4518693614165, 484.3701965999442, 0, 1, 0.2957914254714324, 0, 0.002064536602415961, 0.003397253614831275, 0.7042085745285676, 1, 0.001513037634009395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6170003832997, 450.8693096289343, 1, 0, 0.2960516055053195, 0.005273788731909895, 0, -0.008678169140896421, 1, 0.2960516055053195, 0.001513317275872005],
[189.3771622283957, 451.2544725142968, 0, 1, 0.295610069746959, 0, 0.00221604451791515, 0.003646564192809328, 0.704389930253041, 1, 0.001518606194860375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513034617995972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001514825438138999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624567537089, 451.323853258525, 0, 1, 0.2953419203450199, 0, 0.002215703851635746, 0.003646003616771198, 0.7046580796549801, 1, 0.001512606829407306],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005562611677289451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.0005803565185862803],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003753144911327216],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.001512574055586932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2027355800035, 0, 1, 0.2954394039632425, 0, 0.002216298619543029, 0.003646982324254823, 0.7045605960367576, 1, 0.001512506492036436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.1973419871296, 0, 1, 0.2958086802237671, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441443, 0.7041913197762329, 1, 0.001513367612072655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001513181885064735],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9960796400841, 451.4902303721498, 0, 0, 0.2950821534912653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005443416634783345],
[203.2940083354669, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427592, 0, -0.008094328085657678, 1, 0.2956243771915015, 0.0009677547079741089],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5712661596825, 451.9150438525514, 0, 1, 0.2944188864178543, 0, 0.002212805290735741, 0.003641233952487296, 0.7055811135821457, 1, 0.001512659069192108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3668614566957, 452.1194485555382, 0, 0, 0.2940997465708482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006315569890252006],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.9793992437726, 484.6973419871296, 1, 0, 0.2951668815793465, 0.004926608334272523, 0, -0.008106873936204047, 1, 0.2951668815793465, 0.0008807585873766982],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.0005848375005853939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005546537976768532],
[188.6108234753483, 448.8829570265445, 1, 0.5, 0.2958630017172196, 0.005301922665804496, 0.001113876105504341, -0.006891549561006413, 0.9632622838180391, 0.4091384263091219, 0.001513290939037782],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003723267634067513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.2963367818382, 451.8603066834179, 1.666666666666667, 10.33333333333333, 0.2941410336110303, 0.008851296287286146, 0.02286842455620486, 0.02306558267139085, 0.2086733340774459, 0.9337058877963021, 0.01849253477092259],
[189.1231814417778, 451.3631285704561, 0, 0, 0.2952805992655259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002172498840802377],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.3191819945886, 1, 0, 0.2957167911078615, 0.004917446903647875, 0, -0.008091798541914505, 1, 0.2957167911078615, 0.001295465382541897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 0, 0, 0.2947627061664835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070280727433863],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001105171398081334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004084911841527069],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001103720438454152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0540250861916, 451.4322849260423, 0, 0, 0.2951726245055581, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005521257708182675],
[203.3229810585206, 484.3537601723816, 0, 1, 0.2956665085030854, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7043334914969146, 1, 0.0009607782831057356],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.6917075163205, 484.3915788636029, 0, 1, 0.2960276925021147, 0, 0.002064445468573236, 0.003397103651504749, 0.7039723074978853, 1, 0.001511582739573911],
[189.962846455, 450.6697258788073, 0, 0, 0.2965238650962914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070816382422109],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.7773917429248, 483.9724806487641, 1, 0, 0.2962957899712543, 0.004907315730400305, 0, -0.008075127408596979, 1, 0.2962957899712543, 0.001104996797068188],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.9793992437726, 484.6973419871296, 0, 1, 0.2951668815793466, 0, 0.002063143148052488, 0.003394960646100243, 0.7048331184206534, 1, 0.001512612527215315],
[202.5361815195677, 484.7238467357999, 0, 2, 0.2947009475201293, 0, 0.004126060670355477, 0.006789550018621616, 0.4974467534290034, 1, 0.003033307202498118],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001512211170228917],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001513078658331253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005997366202755391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.0009124143521748233],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512629768521587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513344404105291],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512490950895804],
[189.200287407765, 451.2319052383633, 0, 1, 0.2954259476339409, 0, 0.002216155348039386, 0.003646746566926479, 0.7045740523660591, 1, 0.001513787790678002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.1777878722576, 0, 0, 0.2954509136263481, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003310283046838014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.2265116454893, 0, 1, 0.2957961317155556, 0, 0.002065149214159752, 0.003398261684854661, 0.7042038682844445, 1, 0.001182150049065284],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512989226765287],
[203.3221257843966, 484.4757331250271, 0, 1, 0.2956131996496548, 0, 0.002064086870873124, 0.003396513568804569, 0.7043868003503452, 1, 0.001512989226910178],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002980169020964419],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001215158939265255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.00151319013477677],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002972020030009093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001215302631818699],
[189.0878307249399, 451.398479287294, 0, 1, 0.2952254057098085, 0, 0.002215337547390245, 0.003645400852731703, 0.7047745942901915, 1, 0.001514935119000506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0337133588343, 451.4525966533997, 0, 0, 0.2951409115289655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003202917703369695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001192554389056695],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.00151339506168418],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512580819749097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.3537601723817, 0, 1, 0.2957414030656026, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001514654357925213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001511950018411145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001518168727932376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512989226910178],
[203.8128251948419, 483.8639160360603, 0, 1, 0.2963788259437546, 0, 0.002066696785724923, 0.00340080825781822, 0.7036211740562455, 1, 0.001512580819894514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001511875816964174],
[203.6745033572048, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2961776822532037, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7038223177467963, 1, 0.001512989226910178],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001512580819749097],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.001512856011701555],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5172298978287, 484.1785251277545, 1, 0, 0.2959407970902155, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959407970902155, 0.001512989226765287],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.00151240497189571],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001511875816964174],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006220566420366646],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.0008906967488031431],
[203.0148326956898, 484.5887773744258, 1, 0, 0.2952498063164447, 0.004925748462423708, 0, -0.008105458992655331, 1, 0.2952498063164446, 0.00151274272430177],
[188.4022949086128, 452.0108839428344, 0, 1, 0.2941886599624699, 0, 0.002212336108540408, 0.003640461899859484, 0.7058113400375301, 1, 0.001513354180838073],
[187.9022949086128, 452.5108839428344, 0, 1, 0.2934079140057788, 0, 0.002209891597052348, 0.00363643938677854, 0.7065920859942212, 1, 0.001514707441351391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0148326956898, 484.5887773744258, 1, 0, 0.2952498063164447, 0.004925748462423708, 0, -0.008105458992655331, 1, 0.2952498063164446, 0.001512655681057673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.4504555367886, 1, 0, 0.2956603512440871, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2956603512440872, 0.001512772394601404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3465497293384, 451.1397602828956, 0, 0, 0.2956293472154333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279472488432],
[203.469243380094, 484.2074978508082, 0, 1, 0.2958791990200157, 0, 0.002065230308160398, 0.003398395127335902, 0.7041208009799842, 1, 0.001136551637852867],
[203.8961122193073, 483.780629011595, 0, 1, 0.2964999395709455, 0, 0.002067052585472645, 0.003401393736408278, 0.7035000604290544, 1, 0.001512804961739662],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512772394601404],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279498802664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001136551634824035],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001512804961594708],
[189.3214050862864, 451.1649049259475, 1, 0, 0.2955900885417367, 0.005282022915180843, 0, -0.008691718723330404, 1, 0.2955900885417366, 0.001513652141086209],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513146584540542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3118016919835, 451.6239849619355, 0, 0, 0.2953678131787713, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279496769582],
[203.4518693614166, 484.4496101903282, 0, 1, 0.295757278344555, 0, 0.002064198172452084, 0.003396696718713859, 0.704242721655445, 1, 0.001136551634996546],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512580819749097],
[203.3575592363137, 484.4504555367886, 1, 0, 0.2956603512440871, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2956603512440872, 0.001512772394601404],
[189.3482602775864, 450.7292403286739, 0, 0, 0.2958208343493436, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279464484789],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.470098654218, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2959684162447108, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7040315837552892, 1, 0.001136551637852867],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512580819749097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.4322849260423, 0, 0, 0.2953335430924366, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279472488432],
[203.3961122193073, 484.3537601723817, 0, 1, 0.2957414030656026, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001136551637852867],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512580819749097],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512055482007265],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512485880070744],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512404971894596],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512580819749097],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512652533166141],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001514975681240849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1170003832997, 451.3693096289343, 0, 1, 0.2952709486947306, 0, 0.002215480713170528, 0.003645636436089256, 0.7047290513052694, 1, 0.001514531578315803],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512586149601787],
[203.6562740644034, 484.2452054873414, 0, 1, 0.296054420753843, 0, 0.002065069490969159, 0.003398130498080298, 0.7039455792461571, 1, 0.001512404971894596],
[203.710391430509, 484.3830627759278, 0, 1, 0.2960504713207071, 0, 0.002064481764224264, 0.00339716337702936, 0.7039495286792929, 1, 0.001512404971894596],
[203.1917075163205, 484.4119025537951, 0, 1, 0.2955070400162687, 0, 0.002064358853958894, 0.003396961124696881, 0.7044929599837313, 1, 0.001512978721404997],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.001512999865067332],
[203.3961122193073, 484.3639160360603, 1, 0, 0.2957370359764287, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957370359764286, 0.001513857411630009],
[203.470098654218, 484.0855248981628, 0, 1, 0.2959325641217984, 0, 0.002065750675379873, 0.00339925140637466, 0.7040674358782016, 1, 0.001512823897076758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0337133588343, 450.4525966533997, 2, 0, 0.2967022251501432, 0.01052444834471801, 0, -0.01731827865941345, 1, 0.0880322104090463, 0.003027269080547657],
[203.470098654218, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2959684162447108, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7040315837552892, 1, 0.001513232602325794],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001514127668610672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[187.9580520507221, 452.5282579615118, 0, 0, 0.293461466876836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004012824035212064],
[188.4580520507221, 452.0282579615118, 0, 1, 0.2942421236874249, 0, 0.00221225107587222, 0.003640321976188942, 0.7057578763125751, 1, 0.001110903864150362],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 1, 0, 0.2950227804980138, 0.005292179873507425, 0, -0.008708432286727774, 1, 0.2950227804980138, 0.001513109506766915],
[189.1624567537089, 451.323853258525, 0, 1, 0.2953419203450199, 0, 0.002215703851635746, 0.003646003616771198, 0.7046580796549802, 1, 0.001512458224838667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9039346846164, 451.9990883031521, 1, 0, 0.2947465184420289, 0.005293695981873246, 0, -0.008710927086103205, 1, 0.2947465184420289, 0.001514147642109487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000279379727470089],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.0008569230798187532],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003757792130845686],
[194.2226380108297, 460.6003655416459, 1, 0, 0.29660326066304, 0.005148730396423927, 0, -0.008472382098032994, 1, 0.29660326066304, 0.001513125304616303],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0337133588343, 450.4525966533997, 1, 0, 0.2967022251501432, 0.005262224172359005, 0, -0.008659139329706723, 1, 0.2967022251501432, 0.001512137490878449],
[194.7604686648858, 460.0625348875898, 0, 1, 0.2974245981101644, 0, 0.002173617550153995, 0.003576749412376643, 0.7025754018898356, 1, 0.001518760026964228],
[193.4070962163413, 460.5268918387262, 4, 11, 0.2957593575944467, 0.02068176441429884, 0.02388568440831059, 0.005272141345689544, 0.5300864211818149, 0.6906218269176472, 0.02450605093257777],
[194.3437556893511, 460.4792478631244, 0, 0, 0.2967882231305531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002257697769026126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001287263928339908],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513312844090852],
[203.3961122193073, 484.1973419871296, 0, 1, 0.295808680223767, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441442, 0.7041913197762331, 1, 0.001511602377069303],
[203.3961122193073, 484.1493554693948, 0, 1, 0.2958293258816133, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.7041706741183866, 1, 0.001513204610787593],
[203.3961122193073, 484.3537601723817, 0, 1, 0.2957414030656026, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001511602377069303],
[188.8646091625781, 451.6217008496559, 0, 1, 0.2948768868439524, 0, 0.002214242579837629, 0.003643599052525355, 0.7051231131560476, 1, 0.00151450521294171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512983256147577],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001512580819893786],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512804961739662],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513222375075461],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512343095426648],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001515339569827753],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027512],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512580819894514],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.0015137846955072],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747519881428],
[203.3789080601916, 484.1525084402521, 0, 1, 0.2958103487043495, 0, 0.002065464874325663, 0.003398781112622833, 0.7041896512956505, 1, 0.001514705861031176],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027946],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512580819749097],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513784695660332],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.00151316564271299],
[203.3961122193073, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2956849645052712, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7043150354947287, 1, 0.001514066589961854],
[203.4793992437726, 484.1973419871296, 0, 1, 0.2958939673887415, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441442, 0.7041060326112585, 1, 0.001512747519881428],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521902, 0.004913588891230622, 0, -0.008085450072909287, 1, 0.2959489796521901, 0.001512804961739662],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001512747520027946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4520392209783, 484.0793772794654, 0, 2, 0.2959167164411999, 0, 0.004131553819210467, 0.006798589151075157, 0.4957332701869417, 1, 0.003035805369199011],
[203.5955543158715, 483.8097986699546, 1, 0, 0.2961797626851904, 0.004911698604423034, 0, -0.008082339552280769, 1, 0.2961797626851903, 0.001513784695660332],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513165642566158],
[203.3961122193073, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2958607952816851, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7041392047183149, 1, 0.001512580819894514],
[203.9315456712244, 484.151740708699, 0, 1, 0.2963762522762748, 0, 0.002065468149585096, 0.003398786502155252, 0.7036237477237253, 1, 0.001512970939157232],
[203.3575592363137, 484.4504555367886, 1, 0, 0.2956603512440871, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2956603512440872, 0.00151234309528181],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 0, 1, 0.2956762243800459, 0, 0.002063960623399786, 0.003396305825001596, 0.7043237756199541, 1, 0.001512970939157232],
[203.4982161031477, 484.1785251277545, 1, 0, 0.2959213303315996, 0.004914047990932397, 0, -0.008086205534507594, 1, 0.2959213303315995, 0.001512747520027946],
[187.9022949086128, 452.5108839428344, 0, 1, 0.2934079140057788, 0, 0.002209891597052348, 0.00363643938677854, 0.7065920859942212, 1, 0.00151450521294171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0148326956898, 484.5887773744258, 1, 0, 0.2952498063164447, 0.004925748462423708, 0, -0.008105458992655331, 1, 0.2952498063164446, 0.001513001490539587],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 1, 0, 0.295676224380046, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2956762243800459, 0.001512404972039354],
[203.413316378423, 484.6801378280139, 0, 1, 0.2956187348316154, 0, 0.002063216381181365, 0.003395081153293726, 0.7043812651683846, 1, 0.001514066646039866],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027946],
[203.4723963509512, 484.3496696104095, 0, 1, 0.2958212689303014, 0, 0.002064624098545082, 0.003397397592196748, 0.7041787310696985, 1, 0.001512404971894596],
[203.3961122193073, 484.0558906907524, 1, 0, 0.2958695463222293, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2958695463222294, 0.001514705814701888],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027512],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.001514066589961854],
[203.6745033572048, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2961776822532037, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7038223177467963, 1, 0.001512747519881428],
[203.3961122193073, 484.2012154212109, 0, 1, 0.2958070138481464, 0, 0.002065257104177426, 0.003398439220942963, 0.7041929861518536, 1, 0.001512392261790564],
[189.200287407765, 451.7354992461541, 1, 1, 0.2951938265071879, 0.005285404233265234, 0.002213684781622824, -0.00505460159855146, 0.9128606047920444, 0.5032482578064199, 0.003039154987887147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 1, 0, 0.2956762243800459, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2956762243800459, 0.001512605815484252],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3198280876633, 484.2115884127804, 0, 1, 0.2957244181256001, 0, 0.002065212861340115, 0.003398366418097612, 0.7042755818744, 1, 0.001513134249441817],
[203.0799899327594, 484.5967512981428, 0, 1, 0.2953131577043856, 0, 0.002063571407198231, 0.003395665358687686, 0.7046868422956144, 1, 0.001511602377069303],
[203.3961122193073, 484.4726036662871, 0, 1, 0.2956903076445999, 0, 0.002064100203876166, 0.003396535508639748, 0.7043096923554002, 1, 0.001518696986582033],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513165642566158]
],
"NAMES": [
["epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1"],
["epi_isl_454614_California_20200429_null_4"],
["Node1"],
["epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1"],
["epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1"],
["epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1"],
["epi_isl_464561_England_20200304_null_19"],
["Node1266"],
["epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3"],
["epi_isl_465645_England_20200506_null_9"],
["Node1263"],
["epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18"],
["epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1"],
["Node1260"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_440088_England_20200321_null_1"],
["Node1257"],
["epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2"],
["epi_isl_467843_California_20200315_null_7"],
["Node1254"],
["epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1"],
["epi_isl_467478_KZN_20200513_null_44"],
["Node1251"],
["epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2"],
["epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6"],
["Node1248"],
["epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2"],
["epi_isl_465917_England_20200330_null_1"],
["Node1245"],
["epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2"],
["epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1"],
["Node1242"],
["epi_isl_440436_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5"],
["Node1239"],
["epi_isl_442012_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1"],
["Node1236"],
["epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1"],
["Node1233"],
["epi_isl_442621_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_465573_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_453570_England_20200424_null_1"],
["epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1"],
["epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1"],
["epi_isl_466607_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466567_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466561_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_466542_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_466428_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466384_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_466373_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466358_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466352_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466197_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_465905_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_454626_California_20200430_null_2"],
["epi_isl_438435_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423653_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2"],
["epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1"],
["Node204"],
["epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3"],
["epi_isl_466304_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_465261_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1"],
["epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_464634_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_459173_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_465675_England_20200518_null_1"],
["epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1"],
["epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1"],
["epi_isl_465894_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_465252_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_457384_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1"],
["epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1"],
["epi_isl_465632_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_465851_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_449004_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1"],
["epi_isl_423445_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_464759_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1"],
["epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18"],
["Node259"],
["epi_isl_458364_England_20200501_null_1"],
["Node258"],
["epi_isl_466387_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2"],
["Node253"],
["epi_isl_465545_England_20200501_null_1"],
["Node252"],
["epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1"],
["epi_isl_465958_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_461588_England_20200528_null_36"],
["Node266"],
["epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2"],
["epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1"],
["Node270"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["Node269"],
["epi_isl_448615_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_423856_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_449030_England_20200419_null_3"],
["epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6"],
["Node294"],
["epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5"],
["epi_isl_461587_England_20200530_null_1"],
["epi_isl_465831_England_20200326_null_3"],
["Node288"],
["epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1"],
["epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2"],
["epi_isl_465392_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_439409_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2"],
["epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3"],
["Node309"],
["epi_isl_466399_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_467307_British_Columbia_20200401_null_14"],
["Node301"],
["epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1"],
["epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19"],
["Node313"],
["epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6"],
["epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2"],
["epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22"],
["Node325"],
["epi_isl_445178_California_20200405_null_1"],
["Node324"],
["epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4"],
["epi_isl_444084_England_20200404_null_1"],
["Node320"],
["epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1"],
["epi_isl_442065_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4"],
["epi_isl_465850_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1"],
["epi_isl_457312_England_20200504_null_1"],
["Node383"],
["epi_isl_465604_England_20200504_null_2"],
["Node382"],
["epi_isl_458314_England_20200429_null_1"],
["Node381"],
["epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1"],
["epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1"],
["epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4"],
["epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31"],
["Node365"],
["epi_isl_465165_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1"],
["epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1"],
["Node355"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_467999_South_Australia_20200331_null_720"],
["epi_isl_464625_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_464350_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1"],
["epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1"],
["epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4"],
["Node338"],
["epi_isl_466515_England_20200414_null_37"],
["Node337"],
["epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1"],
["epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7"],
["Node361"],
["epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3"],
["Node360"],
["epi_isl_466288_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466013_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_454653_California_20200410_null_1"],
["epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1"],
["epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1"],
["epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1"],
["epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1"],
["epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1"],
["epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1"],
["epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6"],
["Node392"],
["epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1"],
["Node391"],
["epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_438511_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3"],
["Node443"],
["epi_isl_441307_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9"],
["epi_isl_465516_England_20200429_null_1"],
["Node402"],
["epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3"],
["epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1"],
["Node418"],
["epi_isl_423067_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_462280_Singapore_20200319_null_17"],
["epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1"],
["Node412"],
["epi_isl_459024_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1"],
["epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11"],
["epi_isl_462991_USA_20200511_null_1"],
["Node423"],
["epi_isl_465429_England_20200423_null_4"],
["Node422"],
["epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1"],
["epi_isl_466544_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_465833_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_465918_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1"],
["Node435"],
["epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4"],
["Node434"],
["epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1"],
["Node431"],
["epi_isl_465213_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4"],
["epi_isl_464610_England_20200308_null_1"],
["Node454"],
["epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1"],
["epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1"],
["epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1"],
["epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4"],
["epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1"],
["Node46"],
["epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1"],
["epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1"],
["epi_isl_442625_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_468038_South_Australia_20200304_null_32"],
["epi_isl_465270_England_20200419_null_18"],
["epi_isl_465271_England_20200419_null_1"],
["Node466"],
["epi_isl_466411_England_20200409_null_1"],
["Node465"],
["epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2"],
["Node460"],
["epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1"],
["epi_isl_466031_England_20200401_null_1"],
["Node471"],
["epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_443713_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2"],
["Node476"],
["epi_isl_458756_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2"],
["epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_459208_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2"],
["Node498"],
["epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1"],
["epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2"],
["epi_isl_448978_England_20200421_null_1"],
["Node491"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_457519_England_20200507_null_2"],
["epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1"],
["epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1"],
["Node505"],
["epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1"],
["epi_isl_458498_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1"],
["epi_isl_423378_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_466416_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4"],
["Node515"],
["epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1"],
["epi_isl_424156_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1"],
["epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2"],
["epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1"],
["Node525"],
["epi_isl_456599_Timor_Leste_20200413_null_3"],
["Node524"],
["epi_isl_443107_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1"],
["epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_443318_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1"],
["epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1"],
["epi_isl_458506_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1"],
["epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1"],
["epi_isl_465551_England_20200502_null_1"],
["epi_isl_465558_England_20200502_null_7"],
["Node548"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1"],
["epi_isl_441103_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_466283_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_460323_Massachusetts_20200408_null_12"],
["epi_isl_466202_England_20200402_null_7"],
["Node559"],
["epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1"],
["epi_isl_465781_England_20200318_null_18"],
["Node562"],
["epi_isl_459241_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2"],
["epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_458849_England_20200420_null_7"],
["Node573"],
["epi_isl_465251_England_20200418_null_2"],
["Node572"],
["epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1"],
["epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3"],
["Node578"],
["epi_isl_433845_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466007_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1"],
["epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5"],
["epi_isl_464271_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1"],
["epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1"],
["epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1"],
["epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1"],
["epi_isl_461149_Noord_Brabant_20200321_null_2"],
["Node596"],
["epi_isl_457554_England_20200511_null_1"],
["Node595"],
["epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2"],
["epi_isl_467344_Rio_de_Janeiro_20200402_null_9"],
["epi_isl_465574_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1"],
["epi_isl_440384_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_458747_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2"],
["epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_465258_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1"],
["epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1"],
["epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1"],
["epi_isl_466123_England_20200331_null_1"],
["Node643"],
["epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1"],
["Node642"],
["epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1"],
["epi_isl_443680_England_20200413_null_5"],
["epi_isl_448539_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_466628_Narayanganj_20200601_null_32"],
["Node633"],
["epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3"],
["Node632"],
["epi_isl_466285_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3"],
["epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8"],
["Node65"],
["epi_isl_423528_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_466400_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_465974_England_20200330_null_1"],
["Node649"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["Node648"],
["epi_isl_465465_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1"],
["epi_isl_465408_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1"],
["epi_isl_465108_England_20200314_null_9"],
["Node684"],
["epi_isl_448334_England_20200423_null_2"],
["Node683"],
["epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3"],
["epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1"],
["Node679"],
["epi_isl_458741_England_20200414_null_2"],
["Node678"],
["epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12"],
["epi_isl_464541_England_20200304_null_4"],
["Node675"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1"],
["epi_isl_468000_South_Australia_20200315_null_300"],
["Node668"],
["epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2"],
["epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4"],
["Node671"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2"],
["Node689"],
["epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1"],
["epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3"],
["Node698"],
["epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5"],
["epi_isl_448684_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1"],
["epi_isl_465390_England_20200421_null_33"],
["Node704"],
["epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8"],
["Node703"],
["epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2"],
["epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1"],
["Node709"],
["epi_isl_466240_England_20200405_null_1"],
["Node708"],
["epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1"],
["epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5"],
["Node715"],
["epi_isl_452577_Andalusia_20200325_null_2"],
["epi_isl_440230_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2"],
["epi_isl_465968_England_20200330_null_1"],
["Node73"],
["epi_isl_433949_England_20200412_null_2"],
["epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1"],
["epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3"],
["epi_isl_465352_England_20200416_null_1"],
["Node732"],
["epi_isl_423740_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1"],
["Node729"],
["epi_isl_441198_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12"],
["epi_isl_466242_England_20200403_null_4"],
["epi_isl_439434_England_20200401_null_9"],
["epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1"],
["Node738"],
["epi_isl_429065_California_20200328_null_1"],
["Node737"],
["epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2"],
["epi_isl_443629_England_20200417_null_4"],
["epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1"],
["epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1"],
["epi_isl_466037_England_20200402_null_1"],
["Node751"],
["epi_isl_443381_England_20200412_null_1"],
["Node750"],
["epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1"],
["epi_isl_466665_Nebraska_20200504_null_2"],
["epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2"],
["epi_isl_464659_England_20200309_null_9"],
["Node759"],
["epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2"],
["epi_isl_466461_England_20200415_null_25"],
["Node763"],
["epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1"],
["Node762"],
["epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1"],
["epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1"],
["epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1"],
["epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5"],
["epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1"],
["epi_isl_439458_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_442846_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1"],
["epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1"],
["Node783"],
["epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4"],
["epi_isl_459686_Scotland_20200324_null_9"],
["Node771"],
["epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_467413_New_York_20200318_null_35"],
["Node787"],
["epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1"],
["epi_isl_440052_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_465643_England_20200506_null_1"],
["epi_isl_443823_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6"],
["epi_isl_465529_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2"],
["epi_isl_467961_San_Diego_20200319_null_8"],
["Node900"],
["epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1"],
["epi_isl_466368_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_465222_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1"],
["epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1"],
["epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54"],
["Node825"],
["epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1"],
["Node824"],
["epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1"],
["epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1"],
["epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3"],
["Node810"],
["epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1"],
["epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3"],
["epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1"],
["epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21"],
["Node817"],
["epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1"],
["epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1"],
["Node83"],
["epi_isl_441046_England_20200404_null_1"],
["Node82"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2"],
["epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6"],
["Node836"],
["epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1"],
["Node835"],
["epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1"],
["epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2"],
["epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1"],
["epi_isl_432711_England_20200312_null_17"],
["epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1"],
["Node848"],
["epi_isl_468074_Chittagong_20200517_null_372"],
["epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1"],
["Node841"],
["epi_isl_465403_England_20200420_null_6"],
["Node840"],
["epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1"],
["epi_isl_452954_England_20200512_null_1"],
["epi_isl_456688_England_20200518_null_7"],
["Node861"],
["epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1"],
["Node860"],
["epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1"],
["epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1"],
["epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1"],
["Node870"],
["epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1"],
["epi_isl_464336_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_466477_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1"],
["epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1"],
["epi_isl_457288_England_20200417_null_2"],
["Node891"],
["epi_isl_459311_England_20200502_null_1"],
["Node890"],
["epi_isl_448896_England_20200413_null_3"],
["epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1"],
["Node883"],
["epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2"],
["Node882"],
["epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2"],
["epi_isl_443673_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1"],
["Node162"],
["epi_isl_465840_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_448433_England_20200429_null_9"],
["epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1"],
["Node160"],
["epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5"],
["epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8"],
["epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4"],
["epi_isl_465477_England_20200429_null_16"],
["Node169"],
["epi_isl_465578_England_20200502_null_1"],
["epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1"],
["epi_isl_465719_England_20200314_null_1"],
["epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5"],
["epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1"],
["Node147"],
["epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1"],
["Node146"],
["epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1"],
["Node145"],
["epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1"],
["epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7"],
["Node156"],
["epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6"],
["epi_isl_467506_KZN_20200601_null_16"],
["Node152"],
["epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1"],
["epi_isl_464453_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_464633_England_20200308_null_26"],
["Node139"],
["epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2"],
["epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49"],
["Node916"],
["epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1"],
["epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25"],
["Node135"],
["epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1"],
["Node134"],
["epi_isl_467865_Massachusetts_20200315_null_379"],
["epi_isl_458970_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_459072_England_20200410_null_1"],
["Node122"],
["epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51"],
["Node121"],
["epi_isl_423718_England_20200323_null_2"],
["Node120"],
["epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3"],
["epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1"],
["Node130"],
["epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1"],
["Node129"],
["epi_isl_418703_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1"],
["Node1230"],
["epi_isl_458476_England_20200429_null_3"],
["epi_isl_460601_Michigan_20200503_null_7"],
["Node1227"],
["epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1"],
["epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1"],
["Node1224"],
["epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_440816_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41"],
["epi_isl_420198_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_465882_England_20200329_null_1"],
["Node1214"],
["epi_isl_442072_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_425380_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11"],
["Node112"],
["epi_isl_453286_England_20200403_null_1"],
["Node111"],
["epi_isl_447679_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1"],
["epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1"],
["Node1197"],
["epi_isl_465303_England_20200420_null_2"],
["Node1196"],
["epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1"],
["epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_423216_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2"],
["Node1186"],
["epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8"],
["epi_isl_462403_Singapore_20200414_null_6"],
["Node1190"],
["epi_isl_452365_Andalusia_20200410_null_2"],
["Node1189"],
["epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1"],
["epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4"],
["Node943"],
["epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1"],
["Node942"],
["epi_isl_445096_California_20200313_null_1"],
["epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1"],
["epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_465712_England_20200430_null_3"],
["epi_isl_443337_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_443657_England_20200413_null_7"],
["Node106"],
["epi_isl_449700_England_20200416_null_3"],
["Node105"],
["epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2"],
["epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1"],
["epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2"],
["epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1"],
["epi_isl_464029_Ontario_20200427_null_6"],
["epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1"],
["epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2"],
["epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1"],
["epi_isl_461894_England_20200515_null_2"],
["epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1"],
["epi_isl_466287_England_20200407_null_26"],
["epi_isl_466609_England_20200416_null_1"],
["Node101"],
["epi_isl_424040_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6"],
["epi_isl_459080_England_20200411_null_8"],
["epi_isl_464508_England_20200304_null_2"],
["epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12"],
["Node1154"],
["epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1"],
["epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1"],
["epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1"],
["epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11"],
["Node1147"],
["epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1"],
["epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1"],
["Node955"],
["epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5"],
["epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1"],
["epi_isl_462363_Singapore_20200407_null_74"],
["Node97"],
["epi_isl_423815_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1"],
["Node1141"],
["epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1"],
["epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1"],
["epi_isl_441250_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2"],
["Node1135"],
["epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3"],
["epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2"],
["epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3"],
["Node1130"],
["epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2"],
["epi_isl_433051_England_20200404_null_3"],
["epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4"],
["Node1125"],
["epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1"],
["epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1"],
["epi_isl_449684_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1"],
["epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1"],
["Node1115"],
["epi_isl_438652_England_20200423_null_2"],
["epi_isl_457474_England_20200508_null_3"],
["epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3"],
["epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1"],
["epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1"],
["epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3"],
["epi_isl_464932_England_20200313_null_1"],
["Node1100"],
["epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2"],
["epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1"],
["epi_isl_465540_England_20200430_null_1"],
["Node1083"],
["epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1"],
["epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3"],
["epi_isl_465716_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_433666_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_467784_Virginia_20200418_null_141"],
["Node1073"],
["epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1"],
["Node1072"],
["epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10"],
["Node1071"],
["epi_isl_442782_England_20200407_null_4"],
["epi_isl_468040_South_Australia_20200401_null_30"],
["epi_isl_443412_England_20200416_null_4"],
["epi_isl_461567_England_20200525_null_4"],
["Node1092"],
["epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1"],
["Node1089"],
["epi_isl_466337_England_20200407_null_3"],
["Node1088"],
["epi_isl_459045_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3"],
["epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7"],
["epi_isl_450495_GP_20200325_null_1"],
["epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3"],
["Node1057"],
["epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1"],
["epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1"],
["epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2"],
["epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1"],
["epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1"],
["epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1"],
["epi_isl_423427_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1"],
["epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_435059_EC_20200320_null_1"],
["epi_isl_453618_England_20200505_null_7"],
["epi_isl_421787_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4"],
["epi_isl_442224_England_20200406_null_2"],
["epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2"],
["epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_453815_Portugal_20200324_null_6"],
["epi_isl_468162_Islamabad_20200602_null_41290"],
["epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1"],
["epi_isl_448657_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_452598_Andalusia_20200326_null_5"],
["epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1"],
["epi_isl_465571_England_20200501_null_26"],
["epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1"],
["epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2"],
["epi_isl_459156_Scotland_20200406_null_11"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2"],
["Node1002"],
["epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_443744_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_458280_California_20200421_null_1"],
["epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1"],
["epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2"],
["epi_isl_441573_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2"],
["epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1"],
["epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1"],
["epi_isl_458267_California_20200410_null_2"],
["Node989"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_459493_England_20200427_null_1"],
["epi_isl_465333_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1"],
["epi_isl_461542_England_20200101_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004069761630068813],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00110521543186493],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001512632209959284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0337133588343, 451.3443619211883, 0, 0, 0.2951907953378544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000408998742041377],
[203.3128251948419, 484.3097986699546, 0, 1, 0.2956750085564639, 0, 0.002064794069304957, 0.003397677283909516, 0.7043249914435361, 1, 0.001103092373894833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1231814417778, 451.3631285704561, 0, 0, 0.2952805992655259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004064306859174346],
[203.3575592363137, 484.3191819945885, 1, 0, 0.2957167911078616, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2957167911078615, 0.001106292490512263],
[189.3528556710529, 451.424103802098, 0, 0, 0.2955050940451097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000406331839311223],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4723963509512, 484.3496696104095, 0, 1, 0.2958212689303015, 0, 0.002064624098545082, 0.003397397592196748, 0.7041787310696985, 1, 0.0011063787230554],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004040690254459062],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001108656108424526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 450.8772131984953, 0, 0, 0.2955896547348731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004074425496477134],
[203.3961122193073, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2958607952816851, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7041392047183149, 1, 0.001104767758478741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070971038076935],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001105112686370107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070798430505051],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001105127364297889],
[188.5148343265171, 451.5626662797432, 0, 0, 0.2945187639746157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000407082628237694],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0533856786834, 484.4189508492321, 1, 0, 0.2953622638900732, 0.004924813229080674, 0, -0.00810392003962751, 1, 0.2953622638900733, 0.001105127364297889],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070625838576514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001105142042225686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4425227648079, 451.0437872474261, 0, 0, 0.2957791912229777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070815039150686],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001104996797068188],
[189.1231814417778, 451.3631285704561, 0, 0, 0.2952805992655259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004031200317485325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.3191819945885, 1, 0, 0.2957167911078616, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2957167911078615, 0.001109607126705626],
[189.4425227648079, 451.0437872474261, 0, 0, 0.2957791912229776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000407064380567423],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001105011472867625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001600758115017129],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001352966286102769],
[203.3961122193073, 484.0886543569029, 0, 1, 0.2958554459791948, 0, 0.002065737321046017, 0.003399229431439021, 0.7041445540208052, 1, 0.001517688736812602],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.4017466901164, 2, 0, 0.2957207696776105, 0.009833029639443377, 0, -0.01618052954268311, 0.9999999999999999, 0.08745077361871845, 0.003028384693380444],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001513785387338669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 450.8772131984953, 0, 0, 0.2955896547348731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004455438139134543],
[189.200287407765, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2954952901821955, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7045047098178046, 1, 0.0005596389725668808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005067784288210881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.000589123796439032],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005268546891443926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003950838743068388],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2951344019114696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005162405813625332],
[203.2749945407858, 484.280629011595, 1, 0, 0.2956487992790005, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2956487992790005, 0.0009967182896153794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4425227648079, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2956673682387988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005193516794458403],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5172298978287, 484.280629011595, 1, 0, 0.2958968645533832, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2958968645533833, 0.0009927670524061394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2951344019114696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001612495105069562],
[203.2749945407858, 484.280629011595, 1, 0, 0.2956487992790005, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2956487992790005, 0.001351765939645045],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4046921107518, 451.2278802230555, 0, 1, 0.2956526100768738, 0, 0.002216175116452622, 0.003646779096411909, 0.7043473899231262, 1, 0.001512806600115994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.3537601723816, 0, 1, 0.2957414030656027, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001512617512894598],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4346652023009, 484.0967512981428, 1, 0, 0.2958914462960684, 0.004915583089074682, 0, -0.00808873158209953, 1, 0.2958914462960684, 0.001512601726311893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6170003832997, 450.8693096289343, 1, 0, 0.2960516055053195, 0.005273788731909895, 0, -0.008678169140896421, 1, 0.2960516055053195, 0.001513169049743765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001513252460869963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00151318812167162],
[188.7206110979571, 451.9119612358502, 1, 0, 0.2945847889226941, 0.005298838288950542, 0, -0.008719388898447183, 1, 0.294584788922694, 0.001512675924633837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1562740644034, 484.5935983272856, 0, 1, 0.2953926743132877, 0, 0.002063584833666371, 0.00339568745232234, 0.7046073256867122, 1, 0.001513421274745158],
[203.4346652023009, 484.1108024864013, 1, 0, 0.2958853992393844, 0.004915583089074682, 0, -0.00808873158209953, 1, 0.2958853992393844, 0.001513828812867515],
[189.4628344921652, 451.0234755200687, 0, 1, 0.2958109041995703, 0, 0.002217179491260215, 0.003648431823683369, 0.7041890958004298, 1, 0.001513027780238251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4628344921652, 451.0234755200687, 0, 0, 0.2958109041995703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002938018983891275],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001218657808576611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.700287407765, 451.7860226044689, 0, 1, 0.2946203290499068, 0, 0.00221343722462942, 0.003642273817657099, 0.7053796709500932, 1, 0.001512360105337438],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513186976839725],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001515087953253289],
[187.8668614566957, 452.6194485555382, 0, 1, 0.2933190897602593, 0, 0.002209361535814111, 0.003635567155956585, 0.7066809102397407, 1, 0.001512648824362888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3960311150554, 452.0902788971785, 0, 1, 0.2941452895557703, 0, 0.00221194758365383, 0.003639822571124003, 0.7058547104442296, 1, 0.001512289123342618],
[188.7835744322304, 451.7027355800035, 1, 0, 0.294750366215672, 0.005297071013765452, 0, -0.008716480796937176, 1, 0.2947503662156721, 0.0005681153187336577],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005600759663442218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003835565064029342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8489620443867, 451.6373479678472, 1, 0, 0.294852456785188, 0.005295236940539614, 0, -0.008713462777353968, 1, 0.294852456785188, 0.001515311187247175],
[188.4960796400841, 451.9902303721498, 0, 1, 0.2943014966806764, 0, 0.002212437200637372, 0.003640628249776188, 0.7056985033193236, 1, 0.001513169471605904],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2940083354668, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427593, 0, -0.00809432808565768, 1, 0.2956243771915015, 0.001512263846091108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[187.9580520507221, 452.5282579615118, 0, 0, 0.293461466876836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000394711555087514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.0791697292435, 452.4071402829904, 1, 0, 0.2936505695580769, 0.005316909902567029, 0, -0.008749126251910714, 1, 0.2936505695580769, 0.001117618922290065],
[188.6170003832997, 451.8693096289343, 1, 0, 0.2944902918841417, 0.005301749036236614, 0, -0.008724178615775466, 1, 0.2944902918841417, 0.001515024907522748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.200287407765, 452.3693096289343, 0, 1, 0.2938014671292348, 0, 0.002210583208706779, 0.003637577453398586, 0.7061985328707652, 1, 0.001514875453344756],
[188.200287407765, 452.2860226044689, 1, 0, 0.2938396722393179, 0.005313488166111806, 0, -0.008743495687391828, 1, 0.293839672239318, 0.001512580819893786],
[188.200287407765, 452.2860226044689, 0, 1, 0.2938396722393179, 0, 0.002210990280534305, 0.003638247301652157, 0.706160327760682, 1, 0.001513220215416899],
[188.200287407765, 452.2860226044689, 0, 0, 0.2938396722393179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003013076496140339],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.8961122193073, 484.780629011595, 0, 1, 0.2950457679521555, 0, 0.002062788692771967, 0.003394377379869149, 0.7049542320478446, 1, 0.001211904069369731],
[188.4580520507221, 452.0282579615118, 0, 1, 0.2942421236874249, 0, 0.00221225107587222, 0.003640321976188942, 0.7057578763125751, 1, 0.001512850202061994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002924467956360759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001220116200408703],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001518732719301679],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512493471196183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8668614566957, 451.6194485555382, 0, 1, 0.2948804033814371, 0, 0.002214253622598417, 0.003643617223701861, 0.7051195966185629, 1, 0.001512292667648222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3668614566957, 452.1194485555382, 0, 0, 0.2940997465708482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005431543238325929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.9793992437726, 484.6973419871296, 1, 0, 0.2951668815793465, 0.004926608334272523, 0, -0.008106873936204047, 1, 0.2951668815793465, 0.0009693256469944611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000412898355767162],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001100192756421702],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001514460384526801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513616436079684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004166860530673948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001094984282357392],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5815669313825, 450.9778742416381, 1, 0, 0.2959624895766307, 0.005274774421301949, 0, -0.00867979112078592, 1, 0.2959624895766307, 0.001512205870242688],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001517772984342594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512914709041765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.1194485555382, 1, 0, 0.2954778320601508, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954778320601508, 0.001512277561783403],
[189.200287407765, 451.1194485555382, 0, 0, 0.2954778320601508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006236729472558097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.1973419871296, 0, 1, 0.2958086802237671, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441443, 0.7041913197762329, 1, 0.0008890887216043147],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513487538437896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513038569860485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 2, 0, 0.2954009858604957, 0.01057080846653047, 0, -0.0173945655565443, 1, 0.08726174244735274, 0.003029546941356357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.001512898378397793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.001511865384699295],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.001512421964356039],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513419388701491],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001514920676551515],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004596922778999047],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001053268645417414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2648386771072, 484.4119025537951, 0, 1, 0.2955819595021851, 0, 0.002064358853958894, 0.003396961124696881, 0.7044180404978149, 1, 0.001513236699653635],
[187.2964894421576, 450.2048548911748, 1, 1, 0.2937977952627269, 0.005339128367960299, 0.002221211053447488, -0.005130621493984792, 0.9136828554987609, 0.5012784460242146, 0.003045490045714621],
[188.2029019414035, 449.2912875010102, 0.75, 1, 0.2952229291784067, 0.003985060762949928, 0.002225727557643217, -0.002895032756709971, 0.8401633394571588, 0.4578860398735222, 0.001608530374362449],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001515140489822109],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513594687870183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1421450263516, 451.3441649858823, 0, 1, 0.2953102073684272, 0, 0.002215604138875439, 0.00364583953659214, 0.7046897926315727, 1, 0.001513157879291249],
[188.8646091625781, 451.6217008496559, 0, 1, 0.2948768868439524, 0, 0.002214242579837629, 0.003643599052525355, 0.7051231131560476, 1, 0.0009069222746472153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 0, 0, 0.2947627061664835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006070261090198519],
[188.9958827047782, 451.4904273074557, 0, 1, 0.2950818460134896, 0, 0.002214886384111574, 0.00364465845074302, 0.7049181539865104, 1, 0.001512598898955097],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512740265366152],
[189.8288458301685, 451.4908901331347, 0, 0, 0.2959971995014834, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002269201556928661],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.710391430509, 484.3830627759278, 0, 1, 0.2960504713207071, 0, 0.002064481764224264, 0.00339716337702936, 0.7039495286792929, 1, 0.001285934931932866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2388403907586, 451.2474696214754, 1, 0, 0.2954611791579806, 0.005284327455902307, 0, -0.00869551091053956, 1, 0.2954611791579806, 0.0011314763360753],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003807308316094776],
[203.4518693614165, 484.6415848450204, 0, 1, 0.2956747635334696, 0, 0.002063380508958557, 0.003395351230212541, 0.7043252364665304, 1, 0.001512570673554279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4628344921652, 451.0234755200687, 0, 0, 0.2958109041995703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004605831343482395],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001052193658651895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.735499246154, 0, 0, 0.295193826507188, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005656676559763659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 1, 0, 0.295676224380046, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2956762243800459, 0.0009473875344963769],
[198.735209195481, 475.2475297505549, 2, 3.75, 0.2948669123281409, 0.01006364200936709, 0.007890624917015934, -0.003575761342008279, 0.7770105341020196, 0.543321333228687, 0.007645167995854394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4434468007322, 449.0456353192748, 0, 0, 0.2956026261250665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005615435890520612],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.0009499771714461602],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513786178655533],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512930503094608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2940083354669, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427592, 0, -0.008094328085657678, 1, 0.2956243771915015, 0.001512968373474831],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9960796400841, 451.4902303721498, 0, 0, 0.2950821534912653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004196279464068986],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0981835239246, 451.3881264883094, 1, 0, 0.2952415696758805, 0.005288258096215296, 0, -0.008701978890809941, 1, 0.2952415696758806, 0.0005547921526549348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005375424678172012],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.450229585413, 484.2265116454893, 0, 1, 0.2958515496994251, 0, 0.002065149214159752, 0.003398261684854661, 0.7041484503005749, 1, 0.001512626907391136],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513429114926869],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512862224068282],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001514017278054824],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4518693614166, 484.3701965999442, 0, 1, 0.2957914254714325, 0, 0.002064536602415961, 0.003397253614831275, 0.7042085745285676, 1, 0.001513260045579356],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001638888325620241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001349076006717456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512618631966534],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9377403233648, 451.5485696888691, 0, 0, 0.2949910675214212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004547473622632779],
[189.0690138655649, 451.4172961466691, 0, 1, 0.2951960266909585, 0, 0.002215245203354131, 0.003645248897997587, 0.7048039733090415, 1, 0.0005848977650610208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004722145541218283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.64350513197, 450.8428048802639, 0, 0, 0.2960929877304444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005529963372073693],
[203.6177210814098, 484.0590201494925, 0, 1, 0.2960951110792923, 0, 0.00206586378597215, 0.003399437533066743, 0.7039048889207077, 1, 0.000959256762028613],
[203.470098654218, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2959684162447108, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7040315837552892, 1, 0.00151332941852305],
[203.1177210814098, 484.5590201494925, 0, 1, 0.2953680252698973, 0, 0.002063732091276492, 0.003395929768902103, 0.7046319747301026, 1, 0.001513847121753165],
[203.3229810585206, 484.3537601723816, 0, 1, 0.2956665085030854, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7043334914969146, 1, 0.001513786178655533],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001512924096100232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0533856786834, 484.4189508492321, 1, 0, 0.2953622638900732, 0.004924813229080674, 0, -0.00810392003962751, 1, 0.2953622638900733, 0.001512886278629085],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[184.6188622191733, 447.223701159932, 1.5, 1.5, 0.2921912402226092, 0.008124846952091223, 0.003354026175512518, -0.007850521085447263, 0.8844094375876643, 0.4258138414520096, 0.004577607417988369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001768052717146043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001336461124422402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00151395700354314],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00151332941852305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512626907391136],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513307007526527],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9958827047782, 451.4904273074557, 0, 1, 0.2950818460134896, 0, 0.002214886384111574, 0.00364465845074302, 0.7049181539865104, 1, 0.0005693009171211052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005572107157410087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003854765017485441],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512980260382371],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001512473097629164],
[188.9786785456625, 451.3623067361129, 0, 1, 0.2951219473520103, 0, 0.002215515086386347, 0.003645692998192131, 0.7048780526479896, 1, 0.001514937243545584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005520337076420718],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.000960109251616709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7938752039304, 451.7655659690903, 0, 1, 0.2947327961604979, 0, 0.002213537452450327, 0.003642438745383004, 0.705267203839502, 1, 0.001513166639430536],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001512928275179328],
[203.1562740644034, 484.5935983272856, 0, 1, 0.2953926743132877, 0, 0.002063584833666371, 0.00339568745232234, 0.7046073256867122, 1, 0.001512423264886993],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6799637175729, 450.515696833744, 0, 0, 0.2962843633682651, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005328660832363045],
[189.4401255626689, 450.9008597191064, 0, 1, 0.2958425743735703, 0, 0.002217782420337279, 0.003649423960603658, 0.7041574256264297, 1, 0.0005553911603110234],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004250320143942728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3789080601916, 483.881120195176, 0, 1, 0.2959271595883085, 0, 0.002066623305320623, 0.003400687343726003, 0.7040728404116915, 1, 0.001515113190143749],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001512714812627874],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 1, 0, 0.2950227804980138, 0.005292179873507425, 0, -0.008708432286727774, 1, 0.2950227804980138, 0.001512666795472299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005184453215241356],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.000993567059315556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512731428469804],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002337246222303865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001278901077580039],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 1, 0, 0.2947627061664835, 0.005296849257096824, 0, -0.008716115890040767, 1, 0.2947627061664835, 0.001512668629905657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513382409931903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1711177494053, 451.3151922628286, 0, 1, 0.2953554428755737, 0, 0.002215746372255154, 0.003646073585658077, 0.7046445571244263, 1, 0.001514677842930225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512326615751831],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512414358905111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512604358706245],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512741194192904],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512873987110931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.0009535644446513923],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005588260611175088],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.00151284937548894],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 1, 0, 0.2950227804980138, 0.005292179873507425, 0, -0.008708432286727774, 1, 0.2950227804980138, 0.001512676409376077],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003024677058939057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001210732650022643],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.001512778182410759],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002925731352782074],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001219988309763228],
[189.200287407765, 451.2276832877496, 1, 0, 0.2954278951968488, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954278951968488, 0.001513713364283076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.2514593532353, 1, 0, 0.2957854002947646, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957854002947646, 0.001512639942542061],
[203.3961122193073, 484.3347463777006, 1, 0, 0.295749579471018, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957495794710181, 0.001512766103143404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9960796400841, 451.4902303721498, 0, 0, 0.2950821534912653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001625838910081487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2940083354668, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427593, 0, -0.00809432808565768, 1, 0.2956243771915015, 0.001350406511159297],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343596, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656404, 1, 0.00151395700354314],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.00151332941852305],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00017380334366604],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.00133951245112286],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 2, 0, 0.2954009858604957, 0.01057080846653047, 0, -0.0173945655565443, 1, 0.08726174244735274, 0.003031940239020297],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513128796445723],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513269628341918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0337133588343, 451.4525966533997, 0, 0, 0.2951409115289655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005456942602083386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1170003832997, 451.3693096289343, 0, 1, 0.2952709486947306, 0, 0.002215480713170528, 0.003645636436089256, 0.7047290513052694, 1, 0.0005498474041498562],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004165511188105107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513291387672398],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.0681225640159, 449.5662168697463, 0, 1, 0.2949466660328016, 0, 0.002224366428071111, 0.00366025813232416, 0.7050533339671984, 1, 0.0005478870429545783],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000540515294878985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004234696777749437],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513144560181476],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.64350513197, 451.842804880264, 0, 0, 0.2945316741092666, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003201623422305753],
[203.1177210814097, 484.5590201494925, 0, 1, 0.2953680252698972, 0, 0.002063732091276492, 0.003395929768902103, 0.7046319747301028, 1, 0.001192862362443227],
[188.6796609128246, 451.8066490994094, 0, 1, 0.2945881246223992, 0, 0.00221333617376661, 0.003642107535592369, 0.7054118753776009, 1, 0.001512871361052915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002967734057081894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001215736490870336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.39308569442, 0, 2, 0.2956391998026325, 0, 0.004128878093156149, 0.006794186167858637, 0.4961241368546758, 1, 0.003028851908673566],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001513043967256481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2954952901821955, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7045047098178046, 1, 0.001512392830707933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2954952901821955, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7045047098178046, 1, 0.001514332876334721],
[189.3651139940725, 451.0408667271611, 0, 1, 0.2956954177423625, 0, 0.002217094001384379, 0.003648291147664656, 0.7043045822576375, 1, 0.002018381964934928],
[189.6320356925595, 450.9496014790173, 0, 3, 0.2960310203861923, 0, 0.006652628121104106, 0.01094708851666828, 0.3488675434331033, 1, 0.004572356823400695],
[189.2855096536664, 450.9706051364023, 0, 3, 0.2956402996880874, 0, 0.006652318279353504, 0.01094657866326775, 0.3494487569955783, 1, 0.004050884382371174],
[189.200287407765, 450.8772131984953, 1, 0, 0.2955896547348731, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2955896547348731, 0.001512759970961147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2958607952816851, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7041392047183149, 1, 0.001512224726940882],
[188.5148343265171, 451.3582615767564, 0, 1, 0.2946128467245543, 0, 0.002215534942257711, 0.003645725671592394, 0.7053871532754457, 1, 0.001512866536569281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0533856786834, 484.4189508492321, 1, 0, 0.2953622638900732, 0.004924813229080674, 0, -0.00810392003962751, 1, 0.2953622638900733, 0.001513031092033192],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2956849645052712, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7043150354947287, 1, 0.001512660396545271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.3191819945886, 1, 0, 0.2957167911078615, 0.004917446903647875, 0, -0.008091798541914505, 1, 0.2957167911078615, 0.001512660396545271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004084904239091487],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001103588507385783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005241719667533779],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.0009876010094242572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.00151452139617138],
[189.0791697292435, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2952677190966199, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952677190966199, 0.001513314777107571],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513050999335292],
[190.0398442072052, 450.4464658050287, 2, 0, 0.2967117973272141, 0.01052410881698761, 0, -0.01731771995689004, 1, 0.08803789067314582, 0.003028336112298644],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0210273478301, 450.4652826644038, 0, 1, 0.2966824183083641, 0, 0.002219926903323644, 0.003652952768263859, 0.7033175816916359, 1, 0.001512425997259111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.7648386771072, 483.9119025537951, 0, 1, 0.2963090453115801, 0, 0.002066491844326629, 0.003400471020926722, 0.7036909546884198, 1, 0.001512939201906315],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0525481663633, 451.4479280581854, 0, 2, 0.2951637901672452, 0, 0.004430189786455787, 0.007290003116831714, 0.4967940826914031, 1, 0.0030347297799858],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512622611127833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512369917983537],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.0005471311086133001],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005456609503616385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004191319844497065],
[188.9580520507221, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2952286567875281, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7047713432124718, 1, 0.001513092459883544],
[188.9934855026392, 451.1774579917651, 0, 1, 0.2952234671430244, 0, 0.002216422789496394, 0.003647186649439675, 0.7047765328569755, 1, 0.001512994891249401],
[188.8747650262567, 451.3693096289343, 0, 1, 0.2950043155463436, 0, 0.002215480713170528, 0.003645636436089256, 0.7049956844536565, 1, 0.001513435974886097],
[188.7158166936792, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2947560534555728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003890233293254695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8369343722007, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2949452276835212, 0.005295574212346531, 0, -0.008714017767691212, 1, 0.2949452276835212, 0.001124216372694931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2951344019114696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001350205850418173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.280629011595, 1, 0, 0.2956487992790005, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2956487992790005, 0.001377815771185186],
[188.6703603232699, 451.6948320104426, 1, 0, 0.294629318679377, 0.005300249590272625, 0, -0.008721711234855484, 1, 0.294629318679377, 0.001512796981780481],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 1, 0, 0.2947627061664835, 0.005296849257096824, 0, -0.008716115890040767, 1, 0.2947627061664835, 0.001513272487832992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 0, 0, 0.2947627061664835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005591769737297382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.0009531251913005328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2952677190966199, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952677190966199, 0.001512440279614344],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513306572587953],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512788865195209],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[201.401109884204, 480.0192360963122, 0, 1, 0.2955607519972153, 0, 0.002083249846677723, 0.003428046789744761, 0.7044392480027847, 1, 0.001518559294590871],
[203.3575592363137, 484.3191819945885, 1, 0, 0.2957167911078616, 0.004917446903647875, 0, -0.008091798541914505, 1, 0.2957167911078615, 0.001512641572273657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.733335620378, 450.752974391856, 0, 1, 0.2962332412955928, 0, 0.002218510041667886, 0.003650621282168574, 0.7037667587044072, 1, 0.001512971680570348],
[189.9377403233648, 450.5485696888691, 0, 0, 0.296552381142599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002293797294602836],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.7648386771072, 483.9119025537951, 0, 1, 0.2963090453115801, 0, 0.002066491844326629, 0.003400471020926722, 0.7036909546884198, 1, 0.001283302850274352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.6703603232699, 451.6696873673906, 1, 0, 0.294640888077664, 0.005300249590272625, 0, -0.008721711234855484, 1, 0.294640888077664, 0.001512871703215331],
[188.7914780017914, 451.5485696888691, 0, 0, 0.2948300339525132, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006227377889461621],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4119025537951, 0, 1, 0.2955070400162688, 0, 0.002064358853958894, 0.003396961124696881, 0.7044929599837313, 1, 0.0008900397101197069],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513586693637434],
[189.7584417520132, 451.0185177211378, 0, 1, 0.2961380538838869, 0, 0.002217203863497007, 0.003648471928891214, 0.7038619461161131, 1, 0.001512555916812922],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4329193705049, 451.344040102646, 1, 0, 0.2956300418889239, 0.005278913524233538, 0, -0.00868660213221582, 1, 0.2956300418889239, 0.001512546167102843],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4518693614165, 484.3701965999442, 0, 1, 0.2957914254714324, 0, 0.002064536602415961, 0.003397253614831275, 0.7042085745285676, 1, 0.001513037634009395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6170003832997, 450.8693096289343, 1, 0, 0.2960516055053195, 0.005273788731909895, 0, -0.008678169140896421, 1, 0.2960516055053195, 0.001513317275872005],
[189.3771622283957, 451.2544725142968, 0, 1, 0.295610069746959, 0, 0.00221604451791515, 0.003646564192809328, 0.704389930253041, 1, 0.001518606194860375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513034617995972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001514825438138999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624567537089, 451.323853258525, 0, 1, 0.2953419203450199, 0, 0.002215703851635746, 0.003646003616771198, 0.7046580796549801, 1, 0.001512606829407306],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005562611677289451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.0005803565185862803],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003753144911327216],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.001512574055586932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2027355800035, 0, 1, 0.2954394039632425, 0, 0.002216298619543029, 0.003646982324254823, 0.7045605960367576, 1, 0.001512506492036436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.1973419871296, 0, 1, 0.2958086802237671, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441443, 0.7041913197762329, 1, 0.001513367612072655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001513181885064735],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9960796400841, 451.4902303721498, 0, 0, 0.2950821534912653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005443416634783345],
[203.2940083354669, 484.3827328954354, 1, 0, 0.2956243771915015, 0.004918984126427592, 0, -0.008094328085657678, 1, 0.2956243771915015, 0.0009677547079741089],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5712661596825, 451.9150438525514, 0, 1, 0.2944188864178543, 0, 0.002212805290735741, 0.003641233952487296, 0.7055811135821457, 1, 0.001512659069192108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3668614566957, 452.1194485555382, 0, 0, 0.2940997465708482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006315569890252006],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.9793992437726, 484.6973419871296, 1, 0, 0.2951668815793465, 0.004926608334272523, 0, -0.008106873936204047, 1, 0.2951668815793465, 0.0008807585873766982],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.0005848375005853939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005546537976768532],
[188.6105689748117, 448.8832115270812, 1, 0, 0.2958626024967966, 0.005301929819921952, 0, -0.008724476100464184, 1, 0.2958626024967966, 0.001513290939037782],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003723267634067513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.2963367818382, 451.8603066834179, 1.666666666666667, 10.33333333333333, 0.2941410336110303, 0.008851296287286146, 0.02286842455620486, 0.02306558267139085, 0.2086733340774459, 0.9337058877963021, 0.01849253477092259],
[189.1231814417778, 451.3631285704561, 0, 0, 0.2952805992655259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002172498840802377],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.3191819945886, 1, 0, 0.2957167911078615, 0.004917446903647875, 0, -0.008091798541914505, 1, 0.2957167911078615, 0.001295465382541897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7914780017914, 451.6948320104426, 0, 0, 0.2947627061664835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070280727433863],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001105171398081334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004084911841527069],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001103720438454152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0540250861916, 451.4322849260423, 0, 0, 0.2951726245055581, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005521257708182675],
[203.3229810585206, 484.3537601723816, 0, 1, 0.2956665085030854, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7043334914969146, 1, 0.0009607782831057356],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.6917075163205, 484.3915788636029, 0, 1, 0.2960276925021147, 0, 0.002064445468573236, 0.003397103651504749, 0.7039723074978853, 1, 0.001511582739573911],
[189.962846455, 450.6697258788073, 0, 0, 0.2965238650962914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004070816382422109],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.7773917429248, 483.9724806487641, 1, 0, 0.2962957899712543, 0.004907315730400305, 0, -0.008075127408596979, 1, 0.2962957899712543, 0.001104996797068188],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[202.9793992437726, 484.6973419871296, 0, 1, 0.2951668815793466, 0, 0.002063143148052488, 0.003394960646100243, 0.7048331184206534, 1, 0.001512612527215315],
[202.5361815195677, 484.7238467357999, 0, 2, 0.2947009475201293, 0, 0.004126060670355477, 0.006789550018621616, 0.4974467534290034, 1, 0.003033307202498118],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001512211170228917],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001513078658331253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005997366202755391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.0009124143521748233],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512629768521587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513344404105291],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512490950895804],
[189.200287407765, 451.2319052383633, 0, 1, 0.2954259476339409, 0, 0.002216155348039386, 0.003646746566926479, 0.7045740523660591, 1, 0.001513787790678002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.1777878722576, 0, 0, 0.2954509136263481, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003310283046838014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.2265116454893, 0, 1, 0.2957961317155556, 0, 0.002065149214159752, 0.003398261684854661, 0.7042038682844445, 1, 0.001182150049065284],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512989226765287],
[203.3221257843966, 484.4757331250271, 0, 1, 0.2956131996496548, 0, 0.002064086870873124, 0.003396513568804569, 0.7043868003503452, 1, 0.001512989226910178],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002980169020964419],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001215158939265255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 1, 0.2954009858604957, 0, 0.002215889590882484, 0.003646309255976945, 0.7045990141395043, 1, 0.00151319013477677],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002972020030009093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001215302631818699],
[189.0878307249399, 451.398479287294, 0, 1, 0.2952254057098085, 0, 0.002215337547390245, 0.003645400852731703, 0.7047745942901915, 1, 0.001514935119000506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0337133588343, 451.4525966533997, 0, 0, 0.2951409115289655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003202917703369695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3128251948419, 484.3639160360603, 0, 1, 0.2956517401343595, 0, 0.002064563372482006, 0.003397297665735257, 0.7043482598656405, 1, 0.001192554389056695],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.00151339506168418],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512580819749097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.3537601723817, 0, 1, 0.2957414030656026, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001514654357925213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4046921107518, 451.0816179014821, 0, 1, 0.2957201257075018, 0, 0.002216893706846648, 0.003647961557314192, 0.7042798742924982, 1, 0.001511950018411145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001518168727932376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512989226910178],
[203.8128251948419, 483.8639160360603, 0, 1, 0.2963788259437546, 0, 0.002066696785724923, 0.00340080825781822, 0.7036211740562455, 1, 0.001512580819894514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001511875816964174],
[203.6745033572048, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2961776822532037, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7038223177467963, 1, 0.001512989226910178],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001512580819749097],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.001512856011701555],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.5172298978287, 484.1785251277545, 1, 0, 0.2959407970902155, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959407970902155, 0.001512989226765287],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.00151240497189571],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001511875816964174],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006220566420366646],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.0008906967488031431],
[203.0148326956898, 484.5887773744258, 1, 0, 0.2952498063164447, 0.004925748462423708, 0, -0.008105458992655331, 1, 0.2952498063164446, 0.00151274272430177],
[188.4022949086128, 452.0108839428344, 0, 1, 0.2941886599624699, 0, 0.002212336108540408, 0.003640461899859484, 0.7058113400375301, 1, 0.001513354180838073],
[187.9022949086128, 452.5108839428344, 0, 1, 0.2934079140057788, 0, 0.002209891597052348, 0.00363643938677854, 0.7065920859942212, 1, 0.001514707441351391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0148326956898, 484.5887773744258, 1, 0, 0.2952498063164447, 0.004925748462423708, 0, -0.008105458992655331, 1, 0.2952498063164446, 0.001512655681057673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3575592363137, 484.4504555367886, 1, 0, 0.2956603512440871, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2956603512440872, 0.001512772394601404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3465497293384, 451.1397602828956, 0, 0, 0.2956293472154333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279472488432],
[203.469243380094, 484.2074978508082, 0, 1, 0.2958791990200157, 0, 0.002065230308160398, 0.003398395127335902, 0.7041208009799842, 1, 0.001136551637852867],
[203.8961122193073, 483.780629011595, 0, 1, 0.2964999395709455, 0, 0.002067052585472645, 0.003401393736408278, 0.7035000604290544, 1, 0.001512804961739662],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512772394601404],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 0, 0, 0.2954009858604957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279498802664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001136551634824035],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.001512804961594708],
[189.3214050862864, 451.1649049259475, 1, 0, 0.2955900885417367, 0.005282022915180843, 0, -0.008691718723330404, 1, 0.2955900885417366, 0.001513652141086209],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513146584540542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3118016919835, 451.6239849619355, 0, 0, 0.2953678131787713, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279496769582],
[203.4518693614166, 484.4496101903282, 0, 1, 0.295757278344555, 0, 0.002064198172452084, 0.003396696718713859, 0.704242721655445, 1, 0.001136551634996546],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512580819749097],
[203.3575592363137, 484.4504555367886, 1, 0, 0.2956603512440871, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2956603512440872, 0.001512772394601404],
[189.3482602775864, 450.7292403286739, 0, 0, 0.2958208343493436, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279464484789],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.470098654218, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2959684162447108, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7040315837552892, 1, 0.001136551637852867],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512580819749097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.200287407765, 451.4322849260423, 0, 0, 0.2953335430924366, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003762279472488432],
[203.3961122193073, 484.3537601723817, 0, 1, 0.2957414030656026, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001136551637852867],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512580819749097],
[189.200287407765, 451.2860226044689, 1, 0, 0.2954009858604957, 0.005285404233265234, 0, -0.00869728277827215, 1, 0.2954009858604957, 0.001512055482007265],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512485880070744],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512404971894596],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512580819749097],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512652533166141],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001514975681240849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1170003832997, 451.3693096289343, 0, 1, 0.2952709486947306, 0, 0.002215480713170528, 0.003645636436089256, 0.7047290513052694, 1, 0.001514531578315803],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512586149601787],
[203.6562740644034, 484.2452054873414, 0, 1, 0.296054420753843, 0, 0.002065069490969159, 0.003398130498080298, 0.7039455792461571, 1, 0.001512404971894596],
[203.710391430509, 484.3830627759278, 0, 1, 0.2960504713207071, 0, 0.002064481764224264, 0.00339716337702936, 0.7039495286792929, 1, 0.001512404971894596],
[203.1917075163205, 484.4119025537951, 0, 1, 0.2955070400162687, 0, 0.002064358853958894, 0.003396961124696881, 0.7044929599837313, 1, 0.001512978721404997],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.001512999865067332],
[203.3961122193073, 484.3639160360603, 1, 0, 0.2957370359764287, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957370359764286, 0.001513857411630009],
[203.470098654218, 484.0855248981628, 0, 1, 0.2959325641217984, 0, 0.002065750675379873, 0.00339925140637466, 0.7040674358782016, 1, 0.001512823897076758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0337133588343, 450.4525966533997, 2, 0, 0.2967022251501432, 0.01052444834471801, 0, -0.01731827865941345, 1, 0.0880322104090463, 0.003027269080547657],
[203.470098654218, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2959684162447108, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7040315837552892, 1, 0.001513232602325794],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001514127668610672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[187.9580520507221, 452.5282579615118, 0, 0, 0.293461466876836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004012824035212064],
[188.4580520507221, 452.0282579615118, 0, 1, 0.2942421236874249, 0, 0.00221225107587222, 0.003640321976188942, 0.7057578763125751, 1, 0.001110903864150362],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 1, 0, 0.2950227804980138, 0.005292179873507425, 0, -0.008708432286727774, 1, 0.2950227804980138, 0.001513109506766915],
[189.1624567537089, 451.323853258525, 0, 1, 0.2953419203450199, 0, 0.002215703851635746, 0.003646003616771198, 0.7046580796549802, 1, 0.001512458224838667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9039346846164, 451.9990883031521, 1, 0, 0.2947465184420289, 0.005293695981873246, 0, -0.008710927086103205, 1, 0.2947465184420289, 0.001514147642109487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9580520507221, 451.5282579615118, 0, 0, 0.2950227804980138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000279379727470089],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0791697292435, 451.4071402829904, 1, 0, 0.2952118831792547, 0.005288789883264105, 0, -0.008702853961502208, 1, 0.2952118831792547, 0.0008569230798187532],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 0, 0.2957728537615505, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003757792130845686],
[194.2226380108297, 460.6003655416459, 1, 0, 0.29660326066304, 0.005148730396423927, 0, -0.008472382098032994, 1, 0.29660326066304, 0.001513125304616303],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0337133588343, 450.4525966533997, 1, 0, 0.2967022251501432, 0.005262224172359005, 0, -0.008659139329706723, 1, 0.2967022251501432, 0.001512137490878449],
[194.7604686648858, 460.0625348875898, 0, 1, 0.2974245981101644, 0, 0.002173617550153995, 0.003576749412376643, 0.7025754018898356, 1, 0.001518760026964228],
[193.4070962163413, 460.5268918387262, 4, 11, 0.2957593575944467, 0.02068176441429884, 0.02388568440831059, 0.005272141345689544, 0.5300864211818149, 0.6906218269176472, 0.02450605093257777],
[194.3437556893511, 460.4792478631244, 0, 0, 0.2967882231305531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002257697769026126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001287263928339908],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513312844090852],
[203.3961122193073, 484.1973419871296, 0, 1, 0.295808680223767, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441442, 0.7041913197762331, 1, 0.001511602377069303],
[203.3961122193073, 484.1493554693948, 0, 1, 0.2958293258816133, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.7041706741183866, 1, 0.001513204610787593],
[203.3961122193073, 484.3537601723817, 0, 1, 0.2957414030656026, 0, 0.002064606661965626, 0.003397368899810031, 0.7042585969343973, 1, 0.001511602377069303],
[188.8646091625781, 451.6217008496559, 0, 1, 0.2948768868439524, 0, 0.002214242579837629, 0.003643599052525355, 0.7051231131560476, 1, 0.00151450521294171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001512983256147577],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.001512580819893786],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512804961739662],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513222375075461],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512343095426648],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001515339569827753],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027512],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512580819894514],
[203.5273857615074, 484.1493554693948, 0, 1, 0.295963748020916, 0, 0.002065478325444584, 0.003398803246821046, 0.704036251979084, 1, 0.0015137846955072],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747519881428],
[203.3789080601916, 484.1525084402521, 0, 1, 0.2958103487043495, 0, 0.002065464874325663, 0.003398781112622833, 0.7041896512956505, 1, 0.001514705861031176],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027946],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001512580819749097],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 0, 1, 0.2957728537615505, 0, 0.002064918437974642, 0.003397881936087717, 0.7042271462384495, 1, 0.001513784695660332],
[203.2749945407858, 484.4017466901164, 1, 0, 0.2955967278709109, 0.004919444234934447, 0, -0.008095085207273396, 1, 0.2955967278709108, 0.00151316564271299],
[203.3961122193073, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2956849645052712, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7043150354947287, 1, 0.001514066589961854],
[203.4793992437726, 484.1973419871296, 0, 1, 0.2958939673887415, 0, 0.002065273625617261, 0.003398466407441442, 0.7041060326112585, 1, 0.001512747519881428],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521902, 0.004913588891230622, 0, -0.008085450072909287, 1, 0.2959489796521901, 0.001512804961739662],
[203.5172298978287, 484.1595113330735, 1, 0, 0.2959489796521901, 0.004913588891230623, 0, -0.008085450072909289, 1, 0.2959489796521901, 0.001512747520027946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.4520392209783, 484.0793772794654, 0, 2, 0.2959167164411999, 0, 0.004131553819210467, 0.006798589151075157, 0.4957332701869417, 1, 0.003035805369199011],
[203.5955543158715, 483.8097986699546, 1, 0, 0.2961797626851904, 0.004911698604423034, 0, -0.008082339552280769, 1, 0.2961797626851903, 0.001513784695660332],
[203.1917075163205, 484.4850337145817, 0, 1, 0.2954756142437199, 0, 0.002064047246894146, 0.003396448366421787, 0.7045243857562801, 1, 0.001513165642566158],
[203.3961122193073, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2958607952816851, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7041392047183149, 1, 0.001512580819894514],
[203.9315456712244, 484.151740708699, 0, 1, 0.2963762522762748, 0, 0.002065468149585096, 0.003398786502155252, 0.7036237477237253, 1, 0.001512970939157232],
[203.3575592363137, 484.4504555367886, 1, 0, 0.2956603512440871, 0.004917446903647874, 0, -0.008091798541914504, 1, 0.2956603512440872, 0.00151234309528181],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 0, 1, 0.2956762243800459, 0, 0.002063960623399786, 0.003396305825001596, 0.7043237756199541, 1, 0.001512970939157232],
[203.4982161031477, 484.1785251277545, 1, 0, 0.2959213303315996, 0.004914047990932397, 0, -0.008086205534507594, 1, 0.2959213303315995, 0.001512747520027946],
[187.9022949086128, 452.5108839428344, 0, 1, 0.2934079140057788, 0, 0.002209891597052348, 0.00363643938677854, 0.7065920859942212, 1, 0.00151450521294171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.0148326956898, 484.5887773744258, 1, 0, 0.2952498063164447, 0.004925748462423708, 0, -0.008105458992655331, 1, 0.2952498063164446, 0.001513001490539587],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 1, 0, 0.295676224380046, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2956762243800459, 0.001512404972039354],
[203.413316378423, 484.6801378280139, 0, 1, 0.2956187348316154, 0, 0.002063216381181365, 0.003395081153293726, 0.7043812651683846, 1, 0.001514066646039866],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027946],
[203.4723963509512, 484.3496696104095, 0, 1, 0.2958212689303014, 0, 0.002064624098545082, 0.003397397592196748, 0.7041787310696985, 1, 0.001512404971894596],
[203.3961122193073, 484.0558906907524, 1, 0, 0.2958695463222293, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2958695463222294, 0.001514705814701888],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001512747520027512],
[203.6005169222941, 484.0762243086081, 0, 1, 0.2960700932793812, 0, 0.002065790364788667, 0.003399316716424063, 0.7039299067206188, 1, 0.001514066589961854],
[203.6745033572048, 484.0022378736974, 0, 1, 0.2961776822532037, 0, 0.002066106149411967, 0.003399836348990403, 0.7038223177467963, 1, 0.001512747519881428],
[203.3961122193073, 484.2012154212109, 0, 1, 0.2958070138481464, 0, 0.002065257104177426, 0.003398439220942963, 0.7041929861518536, 1, 0.001512392261790564],
[189.200287407765, 451.7354992461541, 1, 1, 0.2951938265071879, 0.005285404233265234, 0.002213684781622824, -0.00505460159855146, 0.9128606047920444, 0.5032482578064199, 0.003039154987887147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3961122193073, 484.5053673324375, 1, 0, 0.2956762243800459, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2956762243800459, 0.001512605815484252],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.3198280876633, 484.2115884127804, 0, 1, 0.2957244181256001, 0, 0.002065212861340115, 0.003398366418097612, 0.7042755818744, 1, 0.001513134249441817],
[203.0799899327594, 484.5967512981428, 0, 1, 0.2953131577043856, 0, 0.002063571407198231, 0.003395665358687686, 0.7046868422956144, 1, 0.001511602377069303],
[203.3961122193073, 484.4726036662871, 0, 1, 0.2956903076445999, 0, 0.002064100203876166, 0.003396535508639748, 0.7043096923554002, 1, 0.001518696986582033],
[203.3961122193073, 484.280629011595, 1, 0, 0.2957728537615505, 0.004916514819721689, 0, -0.008090264771341556, 1, 0.2957728537615505, 0.001513165642566158]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.0006397933355991447, 2.998972537762916, 0, 1, 0.0002132920074257863, 0, 0.3334475349167252, 0.5486973890541785, 0.9997867079925742, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999292680347654, 1, 3, 0.333411942939856, 1.000000000000001, 1.500530677418543, 0.8236374454219968, 0.5924528421829397, 0.802562286266241, 0.6077075298125768],
[0.6014227884271495, 2.398089254249102, 0, 10.5, 0.2005068757418766, 0, 4.378485905558088, 7.204922912356308, 0.09540138895342931, 1, 0.6077075298125768],
[0.9997750667057796, 2.000224933294218, 1, 2, 0.3332583555685935, 1.00022498390059, 0.9998875460002152, -0.0005552636487475695, 0.7408407054712188, 0.7036037221069653, 0.6077075298125768],
[0.833425951069283, 2.166574048930718, 0, 1, 0.2778086503564275, 0, 0.4615581916037145, 0.7595071131438238, 0.7221913496435725, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000003, 0.8227642006578484, 0.6666666666666667, 1, 0.6077075298125768],
[0.9996771897896241, 2.000322810210374, 0, 1, 0.3332257299298749, 0, 0.4999193104711085, 0.8226314237463681, 0.6667742700701251, 1, 0.6077075298125768],
[0.737924311030872, 2.262075688969127, 0, 3, 0.2459747703436241, 0, 1.32621557034069, 2.182325387262699, 0.4287040958298322, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000002, 0, -4.93658520394709, 1, 0.03703703703703698, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -0.8227642006578484, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6077075298125768],
[0.5575353972475647, 1.992987961067345, 0, 1, 0.2185964678307904, 0, 0.5017591774435255, 0.8256589771041229, 0.7814035321692095, 1, 0.6077075298125768],
[0.4804970923473016, 2.071284153516546, 0, 2, 0.1882987004180448, 0, 0.9655845609616032, 1.588896818934265, 0.6588589997430351, 1, 0.6077075298125768],
[0.9998085135049906, 2.000191486495007, 0, 1, 0.3332695045016637, 0, 0.4999521329591941, 0.8226854340827148, 0.6667304954983363, 1, 0.6077075298125768],
[0.5566607343947378, 2.152011650935318, 1, 1, 0.2055105436189205, 1.796426329741595, 0.4646814990826722, -2.19142394215462, 0.9577654164614559, 0.3687865036992967, 0.6077075298125768],
[0.4800560443467414, 2.229917646350831, 0, 3, 0.1771441715447689, 0, 1.345341163118458, 2.213797093370514, 0.5571488636115003, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994684265605861, 2.000531573439412, 1, 2, 0.3331561421868622, 1.000531856160022, 0.9997342839041035, -0.001312427799215467, 0.7409769641948732, 0.7034673860427743, 0.6077075298125768],
[0.998654538071042, 2.001345461928956, 1, 2, 0.3328848460236808, 1.001347274635688, 0.9993277212982213, -0.003323232374773586, 0.7413385224989921, 0.7031053182522242, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.993741082519879, 0, 0, 0.2183011866877738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5568251389194987, 1.61126688124171, 0, 2, 0.2568272627460231, 0, 1.241259299302867, 2.042527430400087, 0.5523057173975686, 1, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.833425951069283, 2.166574048930718, 0, 0, 0.2778086503564275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.833425951069285, 1.166574048930716, 0, 0, 0.6111419836897614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.005743847663101, 1.992728937595647, 2, 2, 0.3354187013494312, 1.98857791141065, 1.00364879651576, -1.620728831842271, 0.8870265309673452, 0.4111146921065918, 0.6077075298125768],
[0.4439108253627515, 2.556089174637246, 0, 1, 0.1479702751209173, 0, 0.391222657614016, 0.6437679943420695, 0.8520297248790827, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000003, 0.8227642006578484, 0.6666666666666667, 1, 0.6077075298125768],
[0.8330296659306561, 2.166970334069345, 1, 1, 0.2776765553102186, 1.200437440463547, 0.4614737840559653, -1.215985684158768, 0.9228957306310512, 0.4782488412514881, 0.6077075298125768],
[1.832343534794855, 1.167010903946073, 1, 0, 0.6109126387757086, 0.5457491900458272, 0, -0.8980457922154459, 1, 0.6109126387757086, 0.6077075298125768],
[0.8330434322085535, 2.166956567791448, 1, 0, 0.2776811440695177, 1.200417602895942, 0, -1.975321259004579, 1, 0.2776811440695177, 0.6077075298125768],
[0.9972675906436083, 2.002732409356389, 1, 1, 0.3324225302145364, 1.002739895873512, 0.4993178296452327, -0.8283953078276648, 0.8894952614057656, 0.5543403218348384, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -3.291056802631394, 1, 0.1111111111111109, 0.6077075298125768],
[0.0007352496504398604, 2.040923351757069, 0, 1, 0.0003601237003742855, 0, 0.4899743045906558, 0.8062666341188315, 0.9996398762996257, 1, 0.6077075298125768],
[0.7372044111453598, 2.262795588854639, 0, 1, 0.24573480371512, 0, 0.4419312132856731, 0.7272103628894795, 0.75426519628488, 1, 0.6077075298125768],
[0.5916994321904776, 2.262584374206721, 0, 2, 0.2073022419369525, 0, 0.883944936065076, 1.454556497494269, 0.6283697356381819, 1, 0.6077075298125768],
[0.999789689662378, 1.999949268809283, 0.6875, 1.8125, 0.3332922309252407, 0.6876446187719378, 0.9062729881539017, 0.3597591911513603, 0.6747900215271456, 0.637056694819602, 0.6077075298125768],
[1.830866241234001, 1.167607128445334, 1, 0, 0.6105994669646838, 0.5461895454066603, 0, -0.8987704094683683, 1, 0.6105994669646838, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.609791773135683, 0, 0, 0.2569874203329557, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5915559210293964, 2.408444078970603, 0, 1, 0.1971853070097988, 0, 0.4152058205260102, 0.6832329700671372, 0.8028146929902011, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2281540367541053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.999792431683945, 2.000207568316053, 2, 4, 0.3332641438946485, 2.000415222819211, 1.999792453224015, -0.001024785056372219, 0.6805207511930933, 0.6486973345249714, 0.6077075298125768],
[0.8324623179086968, 2.167537682091304, 1, 0, 0.2774874393028989, 1.201255574561248, 0, -1.976700165179338, 1, 0.277487439302899, 0.6077075298125768],
[0.6313642746015233, 2.367912163086767, 1, 2, 0.2105055294896895, 1.583871689019997, 0.8446259245498519, -1.216449900987957, 0.8857183515298362, 0.5079068973153851, 0.6077075298125768],
[0.591104650581468, 2.408169379152638, 0, 2, 0.1970825755570828, 0, 0.8305063660861512, 1.366621812868252, 0.6446763904740477, 1, 0.6077075298125768],
[0.6322445730957746, 2.367755426904226, 0, 0, 0.2107481910319248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914920999581611, 2.408507900041838, 1, 0, 0.1971640333193871, 1.690639655323773, 0, -2.781995569225847, 1, 0.1971640333193871, 0.6077075298125768],
[1.069171666726635, 1.784785196209006, 1, 1, 0.3746278300881052, 0.935303498138507, 0.5602915141407839, -0.6170928705020005, 0.8596539889234778, 0.6089096490996881, 0.6077075298125768],
[0.5917941589087341, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2283337806262776, 1.689776732240811, 0, -2.780575604784682, 1, 0.2283337806262775, 0.6077075298125768],
[0.4439107146366349, 2.556089285363362, 0, 1, 0.1479702382122118, 0, 0.3912226406668124, 0.6437679664549647, 0.8520297617877882, 1, 0.6077075298125768],
[0.7374529155997791, 2.262547084400221, 0, 0, 0.2458176385332597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.4796763098078576, 2.229674229275091, 0, 0, 0.1770447577337914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.147876926732396, 1.443640355092645, 1, 0, 0.4429362423251983, 0.8711735349944268, 0, -1.433540794307923, 1, 0.4429362423251983, 0.6077075298125768],
[0.7384967654128441, 2.261503234587155, 0, 1, 0.2461655884709481, 0, 0.4421837584426684, 0.72762593311793, 0.753834411529052, 1, 0.6077075298125768],
[0.8303357174651256, 2.169664282534875, 3, 1, 0.2767785724883751, 3.612996450590482, 0.4609007983629956, -5.18686291940405, 0.9941314628208094, 0.06720640445672332, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.829881369615842, 1.170118630384159, 1, 0, 0.6099604565386136, 0.5464835134148266, 0, -0.8992541421748842, 1, 0.6099604565386136, 0.6077075298125768],
[1.147876899497635, 1.443640475062216, 1, 0, 0.4429362159659813, 0.8711735556640673, 0, -1.433540828320403, 1, 0.4429362159659813, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.000229980584184, 1.999134644660162, 1, 1, 0.3334806219176167, 0.9997700722947241, 0.5002164324804609, -0.8220297022950015, 0.8887906748054395, 0.555751918640673, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.149399975541866, 1.443437174964005, 2, 1, 0.4432981744794942, 1.740038317868531, 0.6927908033302087, -1.723275528380082, 0.9128860254844524, 0.4153118654594606, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 1.645528401315697, 0.4444444444444445, 1, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.262584388427939, 0, 3, 0.2071609000923918, 0, 1.32591739576371, 2.181834732527729, 0.4983737729987828, 1, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 0, 0.1970635313421294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.000088217817123, 1.999729709282288, 2, 1, 0.3333829726073176, 1.999823579929147, 0.5000675818127964, -2.467891089944024, 0.9629464140741216, 0.2593254474217179, 0.6077075298125768],
[1.00091398091196, 1.999086019088039, 1.75, 1, 0.3336379936373201, 1.748401993951097, 0.5002285996958696, -2.05390477001359, 0.926577094536204, 0.3343149270362059, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 2.75, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.375000000000001, 0.6170731504933863, 0.6284860284717878, 0.7813961640098129, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 13, 2, 0.3333333333333333, 13.00000000000001, 1.000000000000001, -19.74634081578836, 0.9999978395567006, 3.143096543745116e-05, 0.6077075298125768],
[0.9974193823072095, 2.002580617692789, 1, 3, 0.3324731274357367, 1.002587294510781, 1.498067030857593, 0.8153259784350911, 0.5941218449739589, 0.8014476576073499, 0.6077075298125768],
[0.8297803212251199, 1.999999999999999, 4, 0, 0.2932313561590805, 4.820552979726302, 0, -7.932356838186635, 1, 0.007393356292692665, 0.6077075298125768],
[0.7093505390829483, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2618157114963231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.443217724204969, 2.556782275795028, 0, 0, 0.1477392414016565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5911477128057874, 2.408490066536774, 0, 1, 0.1970730322430299, 0, 0.4151978926107526, 0.6832199244574176, 0.8029269677569701, 1, 0.6077075298125768],
[0.001333034745929658, 2.040326495341542, 0, 1, 0.0006529172598491709, 0, 0.4901176367033376, 0.80650249118107, 0.9993470827401508, 1, 0.6077075298125768],
[0.9413151711717094, 2.05868482882829, 1, 0, 0.3137717237239032, 1.062343443116127, 0, -1.748116307599092, 1, 0.3137717237239033, 0.6077075298125768],
[0.9997923914101141, 2.000207608589884, 2, 1, 0.3332641304700382, 2.000415303400325, 0.4999481032396356, -2.469061393107058, 0.9629860257953565, 0.2591669935645649, 0.6077075298125768],
[0.9972459970727295, 2.001572741801488, 1, 4, 0.3325462736861196, 1.002761608404902, 1.998428493985112, 1.638398138471782, 0.4624609510698209, 0.8675335767264183, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.553890096616746, 2, 1, 0.39155952768866, 2.000000000000001, 0.643546156949761, -2.232083323812994, 0.9399665381345597, 0.3398896674404197, 0.6077075298125768],
[0.7377797031681801, 2.26222029683182, 0, 1, 0.2459265677227267, 0, 0.4420435982297895, 0.7273952955069032, 0.7540734322772733, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 1.645528401315697, 0.4444444444444445, 1, 0.6077075298125768],
[0.9414264625202995, 2.0585735374797, 1, 0, 0.3138088208400999, 1.062217857487129, 0, -1.74790965287978, 1, 0.3138088208401, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.004137668531502258, 2.995862331468495, 0, 2, 0.001379222843834087, 0, 0.6675874184844974, 1.098534057477267, 0.9972434565679849, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994903944942404, 2.000509605505757, 0, 2, 0.3331634648314137, 0, 0.9997452621550256, 1.6451092229569, 0.4446709646356453, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914921366826561, 2.262520201793236, 1, 1, 0.2072493270994499, 1.690639550355534, 0.4419850038056751, -2.054696519779765, 0.9570477164168252, 0.3715463706157252, 0.6077075298125768],
[1.001123240145519, 2.006838480839929, 1, 1, 0.3328244615485126, 0.9988780201073391, 0.4982962054731314, -0.8259076736608884, 0.8892278777949427, 0.5548768008919678, 0.6060989994382143],
[1.002143304313751, 2.00530805177982, 0, 2, 0.3332201208452634, 0, 0.9973529993184294, 1.645528206188863, 0.4445954072456051, 1, 0.6060989994382143],
[1.002029782894485, 2.005661497968517, 1, 2, 0.3331557960320219, 0.9979743287783104, 0.997177241536395, -0.001315110638120532, 0.740977425611804, 0.7034669242573726, 0.6060989994382143],
[1.073462920618379, 1.788395837059608, 1, 2, 0.3750929069222652, 0.9315645475895343, 1.118320652819401, 0.3081280540026767, 0.6834630931683964, 0.755968234115901, 0.6060989994382143],
[0, 3.007961720985446, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6060989994382143],
[0, 2.046063068741721, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6060989994382143],
[1.003694362342446, 2.004267358643002, 2, 0, 0.3336792337947779, 1.992638471468897, 0, -3.287645208647183, 1, 0.11134183106587, 0.6060989994382143],
[0.8357728454586878, 2.172188875526763, 0, 2, 0.2778535510035934, 0, 0.9207302470486104, 1.519108673503873, 0.5214954937981197, 1, 0.6060989994382143],
[0.8356377860307652, 2.005307813990298, 0, 0, 0.2941407206194196, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6060989994382143],
[0.8356377860307652, 2.172323934954686, 0, 0, 0.2778086503564275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6060989994382143],
[0.739410047051083, 2.268551673934367, 0, 0, 0.2458176385332597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6060989994382143],
[1.002143005457239, 2.005818715528209, 0, 2, 0.3331634835861287, 0, 0.9970990820440737, 1.645109269225444, 0.4446709396229871, 1, 0.6060989994382143],
[0.9974093040872994, 2.002529478846243, 0.75, 2, 0.3324765524421686, 0.7519480687883732, 0.9987368581222082, 0.4060979619751416, 0.6671085225296924, 0.6709340509342334, 0.6077075298125768],
[0.8324183188210478, 2.167581681178953, 1, 0, 0.2774727729403492, 1.201319069258709, 0, -1.976804647507342, 1, 0.2774727729403492, 0.6077075298125768],
[0.7098473445010783, 1.998827173055354, 1, 0, 0.2620644672883956, 1.408753597159482, 0, -2.318144054581578, 1, 0.2620644672883956, 0.6077075298125768],
[1.828993273948307, 1.170824683496727, 2, 0, 0.609701421850969, 1.093497733691789, 0, -1.799381577564187, 1, 0.3717358238070931, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 0, 0.1970635313421294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -0.8227642006578484, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9974942798169255, 2.002505720183072, 3, 1, 0.3324980932723087, 3.007536043766189, 0.4993743538013856, -4.127251295929057, 0.987777595948408, 0.1103700707517706, 0.6077075298125768],
[0.9994909935220037, 2.000509006477994, 0, 2, 0.3331636645073348, 0, 0.9997455615164211, 1.645109715564579, 0.4446706983332863, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.00818125486041168, 2.991818745139585, 1, 2, 0.002727084953470562, 122.2306378498127, 0.6684896948550566, -200.0339673139292, 0.9999777295855897, 0.008158964164691085, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.833425951069285, 0, 0, 0.3529296396902899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.8331243700157188, 2.166875629984282, 1, 0, 0.2777081233385729, 1.200300982650565, 0, -1.975129357078643, 1, 0.2777081233385729, 0.6077075298125768],
[0.591573087526761, 2.408426912473238, 1, 0, 0.1971910291755871, 1.690408203288597, 0, -2.781614708328423, 1, 0.1971910291755871, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.993741082519879, 0, 0, 0.2183011866877738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.8317795441267481, 2.168220455873252, 3, 1, 0.2772598480422493, 3.606724908280329, 0.4612077140455025, -5.176037879940267, 0.9940905382831196, 0.06752682592456538, 0.6077075298125768],
[0.7374529155997791, 2.262547084400221, 0, 0, 0.2458176385332597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.001037599743745, 1.998962400256253, 3, 0, 0.3336791999145818, 2.996890427260644, 0, -4.931468313688519, 0.9999999999999999, 0.03715244556251918, 0.6077075298125768],
[0.8326640507120859, 2.167335949287915, 2, 0, 0.2775546835706952, 2.401929083271483, 0, -3.952442524469397, 1, 0.07703660237202858, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.001037196386868, 1.99896280361313, 0, 1, 0.3336790654622897, 0, 0.5002594336385339, 0.823191106078312, 0.6663209345377104, 1, 0.6077075298125768],
[0.9993778889193243, 2.000622111080673, 1, 1, 0.3331259629731084, 1.000622498343793, 0.4998445205925627, -0.8240443851430889, 0.8890270927932392, 0.555279018739456, 0.6077075298125768],
[0.5920012251213459, 2.398815874050264, 1, 7, 0.1979396283662138, 1.689185693484037, 2.918106418972832, 2.022223956757303, 0.5093812157774709, 0.8287397895889842, 0.6077075298125768],
[0.9995851157879584, 2.000414884212039, 0, 2, 0.3331950385959864, 0, 0.9997926009172828, 1.645187120234678, 0.4446288565530082, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994903098620636, 2.000509690137934, 1, 1, 0.333163436620688, 1.00050995005445, 0.4998726099302475, -0.8238129619335213, 0.8890021244990929, 0.5553289977404688, 0.6077075298125768],
[0.7377070796334425, 2.262292920366557, 1, 0, 0.2459023598778143, 1.355551583559273, 0, -2.230598630195251, 1, 0.2459023598778143, 0.6077075298125768],
[1.825684985567236, 1.173768587227406, 1, 2.5, 0.6086725269317018, 0.5477396198716626, 2.129891724147538, 2.603476222787345, 0.2415689141549226, 0.9625120937770919, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6077075298125768],
[0.7090080588428194, 2.001020835038608, 0, 1.5, 0.2616238005593164, 0, 0.7496173821553731, 1.233516692456588, 0.6344779505202396, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999700965010191, 3, 2, 0.3333665627555653, 3.000000000000002, 1.000149539853729, -3.290810730554956, 0.9547160986519537, 0.209925774437197, 0.6077075298125768],
[0.9982058377371211, 2.001794162262877, 1.5, 1.5, 0.3327352792457073, 1.502696080600389, 0.7493277921763762, -1.239688915252308, 0.8523498724825628, 0.48068389730392, 0.6077075298125768],
[1.831003271717137, 1.168487863318608, 1.5, 0.5, 0.6104379674038666, 0.8192230036778044, 0.4279034602721127, -0.643927422663956, 0.813682743975918, 0.6104379674038666, 0.6077075298125768],
[0.5566605246193629, 1.993862833695547, 1, 0, 0.2182534509259071, 1.79642700671794, 0, -2.956071660444912, 1, 0.2182534509259071, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 1, 0.1970635313421294, 0, 0.4151428492101111, 0.683129348978357, 0.8029364686578706, 1, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.993741082519879, 0, 0, 0.2183011866877738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999272962189274, 2.000072703781071, 1, 1, 0.3333090987396427, 1.000072709067297, 0.4999818247154383, -0.8229137534400661, 0.8889050446973672, 0.5555232421766525, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9414064821403283, 2.058593517859671, 1, 0, 0.3138021607134429, 1.062240401963726, 0, -1.747946750456313, 1, 0.3138021607134429, 0.6077075298125768],
[0.9985839483603639, 1.554647287765556, 2, 0.75, 0.3911059579059278, 2.002836119370758, 0.4824245382873634, -2.501880438362027, 0.9606812962922351, 0.2930277214691726, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 1.645528401315697, 0.4444444444444445, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 5, 0, 0.3333333333333333, 5.000000000000004, 0, -8.227642006578485, 1, 0.004115226337448097, 0.6077075298125768],
[0.9416606832806484, 2.058339316719351, 0, 0, 0.3138868944268829, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994912377779815, 2.000508762222016, 1, 1, 0.3331637459259941, 1.000509021192772, 0.4998728417911424, -0.8238110519315607, 0.8890019184005596, 0.5553294102525479, 0.6077075298125768],
[0.9994912250597007, 2.000508774940297, 1, 1, 0.3331637416865671, 1.000509033924004, 0.4998728386131892, -0.823811078110577, 0.8890019212254063, 0.5553294045985406, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.55052335831491, 0, 0, 0.3920763935526878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914491892391501, 2.407511877894686, 1, 1, 0.1972180285102565, 1.690762314318862, 0.4153665903714988, -2.098699886671979, 0.9611050492305278, 0.3555411062510406, 0.6077075298125768],
[0.9994912377779815, 2.000508762222016, 0, 1, 0.3331637459259941, 0, 0.4998728417911424, 0.8225549582137122, 0.6668362540740059, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.7387049226132496, 2.26129507738675, 0, 1.5, 0.2462349742044166, 0, 0.6633366936496694, 1.09153936903538, 0.6544160978262679, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000003, -2.468292601973545, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.6077075298125768],
[0.9988938630433614, 1.552188802729784, 1, 1, 0.3915568383749851, 1.001107361850506, 0.6442515229083812, -0.5872164181546057, 0.8466832423217859, 0.6297969190717558, 0.6077075298125768],
[0.8331243732528615, 2.16687562674714, 1, 0, 0.2777081244176204, 1.200300977986741, 0, -1.975129349404187, 1, 0.2777081244176205, 0.6077075298125768],
[0.5920013504762716, 2.407352967097591, 1, 2, 0.1973762642871528, 1.689185335802847, 0.8307880179329443, -1.412517166168143, 0.8985063589804336, 0.4829458877957473, 0.6077075298125768],
[1.829202617691376, 1.168717404016347, 0, 2, 0.6101572438378114, 0, 1.711277673393855, 2.815956014107034, 0.1519773745321316, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.55052335831491, 0, 0, 0.3920763935526878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9995292228284817, 2.000299700925023, 1, 3, 0.3331954082160896, 1.000470998907051, 1.499775257983928, 0.8216193392088906, 0.5928377927905295, 0.8023056182609486, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.261721351433048, 0, 0.5, 0.2072235685252396, 0, 0.2210705574686269, 0.3637778810093192, 0.8903799365859276, 1, 0.6077075298125768],
[0.8333169064277881, 2.166683093572213, 1, 0, 0.277772302142596, 1.200023655210283, 0, -1.974673006899195, 1, 0.277772302142596, 0.6077075298125768],
[0.9400221052202535, 2.059977894779745, 2, 0, 0.3133407017400846, 2.127609541194126, 0, -3.501041926945191, 1, 0.09818239536696871, 0.6077075298125768],
[0.4819064468108367, 2.229977559246834, 1, 3, 0.1777017179696396, 2.075091558989937, 1.345305017783783, -1.200884480452673, 0.8524326826191262, 0.5427880933822219, 0.6077075298125768],
[0.833043436162808, 2.166956563837193, 1, 0, 0.2776811453876025, 1.200417597197852, 0, -1.97532124962821, 1, 0.2776811453876025, 0.6077075298125768],
[1.804106540025703, 1.182848559458537, 2, 2, 0.6039951991033343, 1.108581979848876, 1.690833525566049, 0.9581114551875726, 0.5178850084137946, 0.8253717728130134, 0.6077075298125768],
[0.9916302951496252, 2.000426069987407, 0.6666666666666666, 2.333333333333333, 0.3314209941710807, 0.6722935653817178, 1.166418178777295, 0.8130960851315602, 0.59514237114876, 0.7011465970783877, 0.6077075298125768],
[0.5566475183448023, 2.157125251003924, 1, 1, 0.2051194280641231, 1.796468980897483, 0.4635799425808032, -2.193306768352461, 0.9579260202306472, 0.3681648763588932, 0.6077075298125768],
[0.5636043769593734, 1.995557924028874, 1.5, 2.5, 0.2202300247787065, 2.661441360857503, 1.252782477470109, -2.317988200379612, 0.8758590776210354, 0.4214495530858465, 0.6077075298125768],
[0.936018486377914, 2.061033360111566, 1.5, 2.5, 0.3123130777581627, 1.602532451901148, 1.212983762603761, -0.6410134319341538, 0.7683073213818913, 0.5732144044901433, 0.6077075298125768],
[0.9937799666913955, 2.006220033308603, 0, 2, 0.331259988897132, 0, 0.9968996255618359, 1.640426647122983, 0.447213202449864, 1, 0.6077075298125768],
[0.9996731191699856, 2.000326880830012, 1, 1, 0.3332243730566621, 1.00032698771603, 0.4999182931466989, -0.8234367191791461, 0.8889615172009946, 0.5554102633143186, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -3.291056802631394, 1, 0.1111111111111109, 0.6077075298125768],
[0.9992622295206827, 1.834649571525632, 0, 3, 0.3526087964882121, 0, 1.635189655049657, 2.690751018921827, 0.2713316040434721, 1, 0.6077075298125768],
[1.108099894845911, 1.059512424862091, 1, 0, 0.5112076014566952, 0.902445713289285, 0, -1.48500005186312, 1, 0.5112076014566952, 0.6077075298125768],
[0.9795007637983723, 2.020499236201625, 3, 7, 0.3265002545994576, 3.06278474798366, 3.464490297536282, 0.6610178907549688, 0.5779215550076001, 0.6846174711937828, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5915954713203675, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2282746199656544, 1.690344244468478, 0, -2.781509462273403, 1, 0.2282746199656543, 0.6077075298125768],
[0.8330215263832826, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2940399565006985, 1.200449170073294, 0, -1.975373203691461, 1, 0.2940399565006986, 0.6077075298125768],
[0.8214918923339887, 3.347173343385168, 0, 0, 0.1970635313421298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.024731444080176, 3.143933791638982, 0, 0, 0.2458176385332593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.1580912629229, 3.010573972796256, 0, 0, 0.2778086503564281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.1580912629229, 3.010573972796256, 0, 0, 0.2778086503564281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0.8214918923339887, 3.143933791638982, 0, 0, 0.2071636080974121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.1580912629229, 3.010573972796256, 0, 0, 0.2778086503564281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0.8785386574454855, 3.290126578273675, 0, 0, 0.2107481910319248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0.5801781952210124, 2.243018904114975, 0, 0, 0.2055039640546066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5832014788799991],
[1.071160350227549, 1.783992769469126, 2, 1, 0.3751673921927335, 1.867134084616869, 0.5605403884554848, -2.150037036013608, 0.9471949748913355, 0.3166416662767606, 0.6077075298125768],
[0.991790968231118, 1.550990934803322, 0, 2, 0.3900416968704866, 0, 1.289498187978523, 2.121905891763786, 0.3720491315566355, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.9930059125331724, 1.897679035910096, 2, 2, 0.3435192455227401, 2.01408669853533, 1.053919004296126, -1.579983210896416, 0.8796272714002019, 0.425511500770134, 0.6077075298125768],
[0.482223681917668, 1.686424632248044, 2, 2, 0.2223614030766355, 4.147452883372634, 1.185940931931214, -4.873252026932726, 0.963356026691924, 0.2160453113507648, 0.6077075298125768],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.91934919437271, 0, -3.291056802631394, 1, 0.111111111111111, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08382387008839, 0, 2, 0.3333563534636265, 0, 0.9597740138734305, 1.645698868453857, 0.4444137514673133, 1, 0.5832014788799991],
[1.041489591235042, 2.084380300330673, 0, 1, 0.3331839223523699, 0, 0.4797588999672261, 0.8226297726277585, 0.6668160776476301, 1, 0.5832014788799991],
[0.8680475157798658, 2.258012097338607, 1, 1, 0.277681050014886, 1.152010669717298, 0.442867423597351, -1.215948984700469, 0.9228932344626304, 0.4782553344924023, 0.5832014788799991],
[1.042211791757879, 1.910392706721589, 1, 2, 0.352980493084867, 0.9594978754877822, 1.046905169268671, 0.1498749522184836, 0.7141736848874916, 0.729135478950693, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.083985643980872, 2.75, 0, 0.3333391019409965, 2.639105142262476, 0, -4.525203103618166, 1, 0.07328464739586527, 0.5832014788799991],
[0.6169931620624838, 2.509066451055987, 1, 1, 0.1973708880896831, 1.620763505153285, 0.3985546096553687, -2.095688951003845, 0.9610447325346896, 0.3557865087140561, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9596745971863549, 1.645528401315697, 0.4444444444444444, 1, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9596745971863549, 0.4798372985931775, -0.8227642006578484, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.5832014788799991],
[0.8282081465689423, 2.001047779174479, 2, 1, 0.292730021004134, 2.414851880273692, 0.4997381923646743, -3.151373965202733, 0.9749157112309963, 0.2069040180532343, 0.6077075298125768],
[0.5916999884470562, 2.405350968035989, 0, 3, 0.1974274034837897, 0, 1.247219237386198, 2.052334677786292, 0.5169552861440224, 1, 0.6077075298125768],
[0.9966414171892838, 2.003358582810714, 0, 1, 0.3322138057297615, 0, 0.4991617619432858, 0.821384856128461, 0.6677861942702386, 1, 0.6077075298125768],
[1.257703488437317, 3.106191420730553, 0, 0, 0.2882066398517242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[0.833425951069283, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2941407206194196, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.6194968145523603, 2.361160045034476, 0, 1, 0.2078390246632522, 0, 0.4235206343182886, 0.6969152323139829, 0.7921609753367478, 1, 0.6077075298125768],
[0.7345038720828261, 2.265496127917173, 0, 1, 0.2448346240276087, 0, 0.4414044180774517, 0.726343506412674, 0.7551653759723913, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[2.766779953867372, 1.760449442422793, 0, 0, 0.6111419836897614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[0.8921518120288378, 3.414356556995763, 0, 0, 0.2071636080974121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[1.732378840799705, 2.177925902089242, 0, 0, 0.443029112743734, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[1.112872839294401, 3.414356556995763, 0, 0, 0.2458176385332592, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[0.8329115980101174, 2.165968874386312, 2, 2, 0.2777408455177712, 2.401215212728621, 0.9233743031356643, -2.431829189361432, 0.932152038239578, 0.309292211813564, 0.6077075298125768],
[0.591104298617863, 2.002425975485286, 0, 4, 0.2279149406969111, 0, 1.997576963628133, 3.287069627464063, 0.3553534971515113, 1, 0.6077075298125768],
[0.5632345597032539, 2.145896658628824, 1, 3, 0.2079022809570733, 1.775459234118838, 1.398016995803017, -0.6210919230048509, 0.8069449517569538, 0.6063456537821696, 0.6077075298125768],
[1.154561741994586, 1.459733111728988, 0, 1, 0.4416340950792634, 0, 0.6850567353477003, 1.135826206176164, 0.5583659049207366, 1, 0.6031351729891761],
[0.8331244898095869, 2.166875510190414, 1, 0, 0.2777081632698621, 1.200300810060875, 0, -1.975129073077405, 1, 0.2777081632698621, 0.6077075298125768],
[0.9978492165545741, 2.001722997705991, 0, 3.5, 0.3326638418007073, 0, 1.748493674704772, 2.877196001247549, 0.2427763058873565, 1, 0.6077075298125768],
[0.8331244898095581, 2.166460810621695, 1, 2, 0.2777465570623309, 1.200300810060916, 0.923164633393979, -0.4560354497374891, 0.8114230387247181, 0.6232364656093841, 0.6077075298125768],
[0.5916994488102493, 2.407791788967683, 0, 2, 0.1972666035352679, 0, 0.8306366061898901, 1.366836126657945, 0.6443809057998048, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -0.8227642006578484, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6077075298125768],
[0.5920817867011647, 2.407918213298834, 1, 1, 0.197360595567055, 1.68895585451393, 0.4152964973963987, -2.095842645738388, 0.9610487953174174, 0.3557699864515274, 0.6077075298125768],
[0.833425951069283, 2.166574048930718, 0, 0, 0.2778086503564275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914179160633855, 2.408582083936613, 0, 1, 0.1971393053544619, 0, 0.4151820304025466, 0.6831938227433071, 0.8028606946455381, 1, 0.6077075298125768],
[0.8324631780644689, 2.167536821935532, 1, 0, 0.2774877260214896, 1.201254333344888, 0, -1.976698122722565, 1, 0.2774877260214896, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 0, 0.1970635313421294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.7377799148047566, 2.262220085195243, 0, 1, 0.2459266382682522, 0, 0.4420436395841186, 0.7273953635566263, 0.7540733617317478, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[1.070866903834247, 1.782870774592363, 0, 0, 0.3752506447700766, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.4805760439140109, 1.687190991581524, 0, 1, 0.2216917390314292, 0, 0.5927011257111023, 0.9753065358494034, 0.7783082609685709, 1, 0.6077075298125768]
],
"RESOLVED": [
[0.0006397933355991447, 2.998972537762916, 0, 1, 0.0002132920074257863, 0, 0.3334475349167252, 0.5486973890541785, 0.9997867079925742, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999292680347654, 1, 3, 0.333411942939856, 1.000000000000001, 1.500530677418543, 0.8236374454219968, 0.5924528421829397, 0.802562286266241, 0.6077075298125768],
[0.6011682878904999, 2.398343754785751, 0, 10, 0.2004220284290375, 0, 4.169544078093725, 6.861103201040894, 0.1068090882114826, 1, 0.6077075298125768],
[0.9997750667057796, 2.000224933294218, 1, 2, 0.3332583555685935, 1.00022498390059, 0.9998875460002152, -0.0005552636487475695, 0.7408407054712188, 0.7036037221069653, 0.6077075298125768],
[0.833425951069283, 2.166574048930718, 0, 1, 0.2778086503564275, 0, 0.4615581916037145, 0.7595071131438238, 0.7221913496435725, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000003, 0.8227642006578484, 0.6666666666666667, 1, 0.6077075298125768],
[0.9996771897896241, 2.000322810210374, 0, 1, 0.3332257299298749, 0, 0.4999193104711085, 0.8226314237463681, 0.6667742700701251, 1, 0.6077075298125768],
[0.737924311030872, 2.262075688969127, 0, 3, 0.2459747703436241, 0, 1.32621557034069, 2.182325387262699, 0.4287040958298322, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000002, 0, -4.93658520394709, 1, 0.03703703703703698, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -0.8227642006578484, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6077075298125768],
[0.5575353972475647, 1.992987961067345, 0, 1, 0.2185964678307904, 0, 0.5017591774435255, 0.8256589771041229, 0.7814035321692095, 1, 0.6077075298125768],
[0.4804970923473016, 2.071284153516546, 0, 2, 0.1882987004180448, 0, 0.9655845609616032, 1.588896818934265, 0.6588589997430351, 1, 0.6077075298125768],
[0.9998085135049906, 2.000191486495007, 0, 1, 0.3332695045016637, 0, 0.4999521329591941, 0.8226854340827148, 0.6667304954983363, 1, 0.6077075298125768],
[0.5566607343947378, 2.152011650935318, 1, 1, 0.2055105436189205, 1.796426329741595, 0.4646814990826722, -2.19142394215462, 0.9577654164614559, 0.3687865036992967, 0.6077075298125768],
[0.4800560443467414, 2.229917646350831, 0, 3, 0.1771441715447689, 0, 1.345341163118458, 2.213797093370514, 0.5571488636115003, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994684265605861, 2.000531573439412, 1, 2, 0.3331561421868622, 1.000531856160022, 0.9997342839041035, -0.001312427799215467, 0.7409769641948732, 0.7034673860427743, 0.6077075298125768],
[0.998654538071042, 2.001345461928956, 1, 2, 0.3328848460236808, 1.001347274635688, 0.9993277212982213, -0.003323232374773586, 0.7413385224989921, 0.7031053182522242, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.993741082519879, 0, 0, 0.2183011866877738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5568251389194987, 1.61126688124171, 0, 2, 0.2568272627460231, 0, 1.241259299302867, 2.042527430400087, 0.5523057173975686, 1, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.833425951069283, 2.166574048930718, 0, 0, 0.2778086503564275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.833425951069285, 1.166574048930716, 0, 0, 0.6111419836897614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.005743847663101, 1.992728937595647, 2, 2, 0.3354187013494312, 1.98857791141065, 1.00364879651576, -1.620728831842271, 0.8870265309673452, 0.4111146921065918, 0.6077075298125768],
[0.4439108253627515, 2.556089174637246, 0, 1, 0.1479702751209173, 0, 0.391222657614016, 0.6437679943420695, 0.8520297248790827, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000003, 0.8227642006578484, 0.6666666666666667, 1, 0.6077075298125768],
[0.8330296659306561, 2.166970334069345, 1, 1, 0.2776765553102186, 1.200437440463547, 0.4614737840559653, -1.215985684158768, 0.9228957306310512, 0.4782488412514881, 0.6077075298125768],
[1.832343534794855, 1.167010903946073, 1, 0, 0.6109126387757086, 0.5457491900458272, 0, -0.8980457922154459, 1, 0.6109126387757086, 0.6077075298125768],
[0.8330434322085535, 2.166956567791448, 1, 0, 0.2776811440695177, 1.200417602895942, 0, -1.975321259004579, 1, 0.2776811440695177, 0.6077075298125768],
[0.9972675906436083, 2.002732409356389, 1, 1, 0.3324225302145364, 1.002739895873512, 0.4993178296452327, -0.8283953078276648, 0.8894952614057656, 0.5543403218348384, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -3.291056802631394, 1, 0.1111111111111109, 0.6077075298125768],
[0.0007352496504398604, 2.040923351757069, 0, 1, 0.0003601237003742855, 0, 0.4899743045906558, 0.8062666341188315, 0.9996398762996257, 1, 0.6077075298125768],
[0.7372044111453598, 2.262795588854639, 0, 1, 0.24573480371512, 0, 0.4419312132856731, 0.7272103628894795, 0.75426519628488, 1, 0.6077075298125768],
[0.5916994321904776, 2.262584374206721, 0, 2, 0.2073022419369525, 0, 0.883944936065076, 1.454556497494269, 0.6283697356381819, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994910410706375, 2.00050895892936, 0, 1, 0.3331636803568794, 0, 0.499872792639321, 0.8225548773329941, 0.6668363196431206, 1, 0.6077075298125768],
[1.830866241234001, 1.167607128445334, 1, 0, 0.6105994669646838, 0.5461895454066603, 0, -0.8987704094683683, 1, 0.6105994669646838, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.609791773135683, 0, 0, 0.2569874203329557, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5915559210293964, 2.408444078970603, 0, 1, 0.1971853070097988, 0, 0.4152058205260102, 0.6832329700671372, 0.8028146929902011, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2281540367541053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.999792431683945, 2.000207568316053, 2, 4, 0.3332641438946485, 2.000415222819211, 1.999792453224015, -0.001024785056372219, 0.6805207511930933, 0.6486973345249714, 0.6077075298125768],
[0.8324623179086968, 2.167537682091304, 1, 0, 0.2774874393028989, 1.201255574561248, 0, -1.976700165179338, 1, 0.277487439302899, 0.6077075298125768],
[0.6313642746015233, 2.367912163086767, 1, 2, 0.2105055294896895, 1.583871689019997, 0.8446259245498519, -1.216449900987957, 0.8857183515298362, 0.5079068973153851, 0.6077075298125768],
[0.591104650581468, 2.408169379152638, 0, 2, 0.1970825755570828, 0, 0.8305063660861512, 1.366621812868252, 0.6446763904740477, 1, 0.6077075298125768],
[0.6322445730957746, 2.367755426904226, 0, 0, 0.2107481910319248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914920999581611, 2.408507900041838, 1, 0, 0.1971640333193871, 1.690639655323773, 0, -2.781995569225847, 1, 0.1971640333193871, 0.6077075298125768],
[1.069171666726635, 1.784785196209006, 1, 1, 0.3746278300881052, 0.935303498138507, 0.5602915141407839, -0.6170928705020005, 0.8596539889234778, 0.6089096490996881, 0.6077075298125768],
[0.5917941589087341, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2283337806262776, 1.689776732240811, 0, -2.780575604784682, 1, 0.2283337806262775, 0.6077075298125768],
[0.4439107146366349, 2.556089285363362, 0, 1, 0.1479702382122118, 0, 0.3912226406668124, 0.6437679664549647, 0.8520297617877882, 1, 0.6077075298125768],
[0.7374529155997791, 2.262547084400221, 0, 0, 0.2458176385332597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.4796763098078576, 2.229674229275091, 0, 0, 0.1770447577337914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.147876926732396, 1.443640355092645, 1, 0, 0.4429362423251983, 0.8711735349944268, 0, -1.433540794307923, 1, 0.4429362423251983, 0.6077075298125768],
[0.7384967654128441, 2.261503234587155, 0, 1, 0.2461655884709481, 0, 0.4421837584426684, 0.72762593311793, 0.753834411529052, 1, 0.6077075298125768],
[0.8303357174651256, 2.169664282534875, 3, 1, 0.2767785724883751, 3.612996450590482, 0.4609007983629956, -5.18686291940405, 0.9941314628208094, 0.06720640445672332, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.829881369615842, 1.170118630384159, 1, 0, 0.6099604565386136, 0.5464835134148266, 0, -0.8992541421748842, 1, 0.6099604565386136, 0.6077075298125768],
[1.147876899497635, 1.443640475062216, 1, 0, 0.4429362159659813, 0.8711735556640673, 0, -1.433540828320403, 1, 0.4429362159659813, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.000229980584184, 1.999134644660162, 1, 1, 0.3334806219176167, 0.9997700722947241, 0.5002164324804609, -0.8220297022950015, 0.8887906748054395, 0.555751918640673, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.149399975541866, 1.443437174964005, 2, 1, 0.4432981744794942, 1.740038317868531, 0.6927908033302087, -1.723275528380082, 0.9128860254844524, 0.4153118654594606, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 1.645528401315697, 0.4444444444444445, 1, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.262584388427939, 0, 3, 0.2071609000923918, 0, 1.32591739576371, 2.181834732527729, 0.4983737729987828, 1, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 0, 0.1970635313421294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.000088217817123, 1.999729709282288, 2, 1, 0.3333829726073176, 1.999823579929147, 0.5000675818127964, -2.467891089944024, 0.9629464140741216, 0.2593254474217179, 0.6077075298125768],
[1.000393332959506, 1.999606667040492, 1, 1, 0.3334644443198356, 0.9996068216904819, 0.5000983525825332, -0.8219553726148533, 0.8888014643744634, 0.5557303530141344, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 13, 2, 0.3333333333333333, 13.00000000000001, 1.000000000000001, -19.74634081578836, 0.9999978395567006, 3.143096543745116e-05, 0.6077075298125768],
[0.9974193823072095, 2.002580617692789, 1, 3, 0.3324731274357367, 1.002587294510781, 1.498067030857593, 0.8153259784350911, 0.5941218449739589, 0.8014476576073499, 0.6077075298125768],
[0.8297803212251199, 1.999999999999999, 4, 0, 0.2932313561590805, 4.820552979726302, 0, -7.932356838186635, 1, 0.007393356292692665, 0.6077075298125768],
[0.7093505390829483, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2618157114963231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.443217724204969, 2.556782275795028, 0, 0, 0.1477392414016565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5911477128057874, 2.408490066536774, 0, 1, 0.1970730322430299, 0, 0.4151978926107526, 0.6832199244574176, 0.8029269677569701, 1, 0.6077075298125768],
[0.001333034745929658, 2.040326495341542, 0, 1, 0.0006529172598491709, 0, 0.4901176367033376, 0.80650249118107, 0.9993470827401508, 1, 0.6077075298125768],
[0.9413151711717094, 2.05868482882829, 1, 0, 0.3137717237239032, 1.062343443116127, 0, -1.748116307599092, 1, 0.3137717237239033, 0.6077075298125768],
[0.9997923914101141, 2.000207608589884, 2, 1, 0.3332641304700382, 2.000415303400325, 0.4999481032396356, -2.469061393107058, 0.9629860257953565, 0.2591669935645649, 0.6077075298125768],
[0.9972459970727295, 2.001572741801488, 1, 4, 0.3325462736861196, 1.002761608404902, 1.998428493985112, 1.638398138471782, 0.4624609510698209, 0.8675335767264183, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.553890096616746, 2, 1, 0.39155952768866, 2.000000000000001, 0.643546156949761, -2.232083323812994, 0.9399665381345597, 0.3398896674404197, 0.6077075298125768],
[0.7377797031681801, 2.26222029683182, 0, 1, 0.2459265677227267, 0, 0.4420435982297895, 0.7273952955069032, 0.7540734322772733, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 1.645528401315697, 0.4444444444444445, 1, 0.6077075298125768],
[0.9414264625202995, 2.0585735374797, 1, 0, 0.3138088208400999, 1.062217857487129, 0, -1.74790965287978, 1, 0.3138088208401, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.004137668531502258, 2.995862331468495, 0, 2, 0.001379222843834087, 0, 0.6675874184844974, 1.098534057477267, 0.9972434565679849, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994903944942404, 2.000509605505757, 0, 2, 0.3331634648314137, 0, 0.9997452621550256, 1.6451092229569, 0.4446709646356453, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914921366826561, 2.262520201793236, 1, 1, 0.2072493270994499, 1.690639550355534, 0.4419850038056751, -2.054696519779765, 0.9570477164168252, 0.3715463706157252, 0.6077075298125768],
[1.001123240145519, 2.006838480839929, 1, 1, 0.3328244615485126, 0.9988780201073391, 0.4982962054731314, -0.8259076736608884, 0.8892278777949427, 0.5548768008919678, 0.6060989994382143],
[1.002143304313751, 2.00530805177982, 0, 2, 0.3332201208452634, 0, 0.9973529993184294, 1.645528206188863, 0.4445954072456051, 1, 0.6060989994382143],
[1.002029782894485, 2.005661497968517, 1, 2, 0.3331557960320219, 0.9979743287783104, 0.997177241536395, -0.001315110638120532, 0.740977425611804, 0.7034669242573726, 0.6060989994382143],
[1.073462920618379, 1.788395837059608, 1, 2, 0.3750929069222652, 0.9315645475895343, 1.118320652819401, 0.3081280540026767, 0.6834630931683964, 0.755968234115901, 0.6060989994382143],
[0, 3.007961720985446, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6060989994382143],
[0, 2.046063068741721, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6060989994382143],
[1.003694362342446, 2.004267358643002, 2, 0, 0.3336792337947779, 1.992638471468897, 0, -3.287645208647183, 1, 0.11134183106587, 0.6060989994382143],
[0.8357728454586878, 2.172188875526763, 0, 2, 0.2778535510035934, 0, 0.9207302470486104, 1.519108673503873, 0.5214954937981197, 1, 0.6060989994382143],
[0.8356377860307652, 2.005307813990298, 0, 0, 0.2941407206194196, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6060989994382143],
[0.8356377860307652, 2.172323934954686, 0, 0, 0.2778086503564275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6060989994382143],
[0.739410047051083, 2.268551673934367, 0, 0, 0.2458176385332597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6060989994382143],
[1.002143005457239, 2.005818715528209, 0, 2, 0.3331634835861287, 0, 0.9970990820440737, 1.645109269225444, 0.4446709396229871, 1, 0.6060989994382143],
[0.9974093040872994, 2.002529478846243, 0.75, 2, 0.3324765524421686, 0.7519480687883732, 0.9987368581222082, 0.4060979619751416, 0.6671085225296924, 0.6709340509342334, 0.6077075298125768],
[0.8324183188210478, 2.167581681178953, 1, 0, 0.2774727729403492, 1.201319069258709, 0, -1.976804647507342, 1, 0.2774727729403492, 0.6077075298125768],
[0.7098473445010783, 1.998827173055354, 1, 0, 0.2620644672883956, 1.408753597159482, 0, -2.318144054581578, 1, 0.2620644672883956, 0.6077075298125768],
[1.828993273948307, 1.170824683496727, 2, 0, 0.609701421850969, 1.093497733691789, 0, -1.799381577564187, 1, 0.3717358238070931, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 0, 0.1970635313421294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -0.8227642006578484, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9974942798169255, 2.002505720183072, 3, 1, 0.3324980932723087, 3.007536043766189, 0.4993743538013856, -4.127251295929057, 0.987777595948408, 0.1103700707517706, 0.6077075298125768],
[0.9994909935220037, 2.000509006477994, 0, 2, 0.3331636645073348, 0, 0.9997455615164211, 1.645109715564579, 0.4446706983332863, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.00818125486041168, 2.991818745139585, 1, 2, 0.002727084953470562, 122.2306378498127, 0.6684896948550566, -200.0339673139292, 0.9999777295855897, 0.008158964164691085, 0.6077075298125768],
[0, 2.040647380384285, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.833425951069285, 0, 0, 0.3529296396902899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.8331243700157188, 2.166875629984282, 1, 0, 0.2777081233385729, 1.200300982650565, 0, -1.975129357078643, 1, 0.2777081233385729, 0.6077075298125768],
[0.591573087526761, 2.408426912473238, 1, 0, 0.1971910291755871, 1.690408203288597, 0, -2.781614708328423, 1, 0.1971910291755871, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.993741082519879, 0, 0, 0.2183011866877738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.8317795441267481, 2.168220455873252, 3, 1, 0.2772598480422493, 3.606724908280329, 0.4612077140455025, -5.176037879940267, 0.9940905382831196, 0.06752682592456538, 0.6077075298125768],
[0.7374529155997791, 2.262547084400221, 0, 0, 0.2458176385332597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.001037599743745, 1.998962400256253, 3, 0, 0.3336791999145818, 2.996890427260644, 0, -4.931468313688519, 0.9999999999999999, 0.03715244556251918, 0.6077075298125768],
[0.8326640507120859, 2.167335949287915, 2, 0, 0.2775546835706952, 2.401929083271483, 0, -3.952442524469397, 1, 0.07703660237202858, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.001037196386868, 1.99896280361313, 0, 1, 0.3336790654622897, 0, 0.5002594336385339, 0.823191106078312, 0.6663209345377104, 1, 0.6077075298125768],
[0.9993778889193243, 2.000622111080673, 1, 1, 0.3331259629731084, 1.000622498343793, 0.4998445205925627, -0.8240443851430889, 0.8890270927932392, 0.555279018739456, 0.6077075298125768],
[0.5920012251213459, 2.398815874050264, 1, 7, 0.1979396283662138, 1.689185693484037, 2.918106418972832, 2.022223956757303, 0.5093812157774709, 0.8287397895889842, 0.6077075298125768],
[0.9995851157879584, 2.000414884212039, 0, 2, 0.3331950385959864, 0, 0.9997926009172828, 1.645187120234678, 0.4446288565530082, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994903098620636, 2.000509690137934, 1, 1, 0.333163436620688, 1.00050995005445, 0.4998726099302475, -0.8238129619335213, 0.8890021244990929, 0.5553289977404688, 0.6077075298125768],
[0.7377070796334425, 2.262292920366557, 1, 0, 0.2459023598778143, 1.355551583559273, 0, -2.230598630195251, 1, 0.2459023598778143, 0.6077075298125768],
[1.827254448108343, 1.172199124686299, 1, 2, 0.6091957764179891, 0.5472691562115202, 1.706194756403043, 1.90704499012699, 0.3388103745725342, 0.9403132755319595, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6077075298125768],
[0.7092305712416566, 2.000250987341516, 0, 1, 0.2617587741075174, 0, 0.4999372610379638, 0.8226609619139481, 0.7382412258924826, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999700965010191, 3, 2, 0.3333665627555653, 3.000000000000002, 1.000149539853729, -3.290810730554956, 0.9547160986519537, 0.209925774437197, 0.6077075298125768],
[0.9982058377371211, 2.001794162262877, 1.5, 1.5, 0.3327352792457073, 1.502696080600389, 0.7493277921763762, -1.239688915252308, 0.8523498724825628, 0.48068389730392, 0.6077075298125768],
[1.832572734258244, 1.166918400777501, 1, 0, 0.6109612103375679, 0.5456809333162768, 0, -0.8979334738283896, 1, 0.6109612103375679, 0.6077075298125768],
[0.5566605246193629, 1.993862833695547, 1, 0, 0.2182534509259071, 1.79642700671794, 0, -2.956071660444912, 1, 0.2182534509259071, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 1, 0.1970635313421294, 0, 0.4151428492101111, 0.683129348978357, 0.8029364686578706, 1, 0.6077075298125768],
[0.5567822757950311, 1.993741082519879, 0, 0, 0.2183011866877738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999272962189274, 2.000072703781071, 1, 1, 0.3333090987396427, 1.000072709067297, 0.4999818247154383, -0.8229137534400661, 0.8889050446973672, 0.5555232421766525, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9414064821403283, 2.058593517859671, 1, 0, 0.3138021607134429, 1.062240401963726, 0, -1.747946750456313, 1, 0.3138021607134429, 0.6077075298125768],
[0.9985839483603639, 1.554647287765556, 2, 0.75, 0.3911059579059278, 2.002836119370758, 0.4824245382873634, -2.501880438362027, 0.9606812962922351, 0.2930277214691726, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 1.645528401315697, 0.4444444444444445, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 5, 0, 0.3333333333333333, 5.000000000000004, 0, -8.227642006578485, 1, 0.004115226337448097, 0.6077075298125768],
[0.9416606832806484, 2.058339316719351, 0, 0, 0.3138868944268829, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9994912377779815, 2.000508762222016, 1, 1, 0.3331637459259941, 1.000509021192772, 0.4998728417911424, -0.8238110519315607, 0.8890019184005596, 0.5553294102525479, 0.6077075298125768],
[0.9994912250597007, 2.000508774940297, 1, 1, 0.3331637416865671, 1.000509033924004, 0.4998728386131892, -0.823811078110577, 0.8890019212254063, 0.5553294045985406, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.55052335831491, 0, 0, 0.3920763935526878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914491892391501, 2.407511877894686, 1, 1, 0.1972180285102565, 1.690762314318862, 0.4153665903714988, -2.098699886671979, 0.9611050492305278, 0.3555411062510406, 0.6077075298125768],
[0.9994912377779815, 2.000508762222016, 0, 1, 0.3331637459259941, 0, 0.4998728417911424, 0.8225549582137122, 0.6668362540740059, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.7378791896460768, 2.262120810353923, 0, 1, 0.2459597298820256, 0, 0.4420630389954919, 0.7274272858390098, 0.7540402701179744, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000003, -2.468292601973545, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.6077075298125768],
[0.9988938630433614, 1.552188802729784, 1, 1, 0.3915568383749851, 1.001107361850506, 0.6442515229083812, -0.5872164181546057, 0.8466832423217859, 0.6297969190717558, 0.6077075298125768],
[0.8331243732528615, 2.16687562674714, 1, 0, 0.2777081244176204, 1.200300977986741, 0, -1.975129349404187, 1, 0.2777081244176205, 0.6077075298125768],
[0.5920013504762716, 2.407352967097591, 1, 2, 0.1973762642871528, 1.689185335802847, 0.8307880179329443, -1.412517166168143, 0.8985063589804336, 0.4829458877957473, 0.6077075298125768],
[1.829202617691376, 1.168717404016347, 0, 2, 0.6101572438378114, 0, 1.711277673393855, 2.815956014107034, 0.1519773745321316, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.55052335831491, 0, 0, 0.3920763935526878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9995292228284817, 2.000299700925023, 1, 3, 0.3331954082160896, 1.000470998907051, 1.499775257983928, 0.8216193392088906, 0.5928377927905295, 0.8023056182609486, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.262547084400221, 0, 0, 0.2071636080974119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.8333169064277881, 2.166683093572213, 1, 0, 0.277772302142596, 1.200023655210283, 0, -1.974673006899195, 1, 0.277772302142596, 0.6077075298125768],
[0.9400221052202535, 2.059977894779745, 2, 0, 0.3133407017400846, 2.127609541194126, 0, -3.501041926945191, 1, 0.09818239536696871, 0.6077075298125768],
[0.4819064468108367, 2.229977559246834, 1, 3, 0.1777017179696396, 2.075091558989937, 1.345305017783783, -1.200884480452673, 0.8524326826191262, 0.5427880933822219, 0.6077075298125768],
[0.833043436162808, 2.166956563837193, 1, 0, 0.2776811453876025, 1.200417597197852, 0, -1.97532124962821, 1, 0.2776811453876025, 0.6077075298125768],
[1.804106540025703, 1.182848559458537, 2, 2, 0.6039951991033343, 1.108581979848876, 1.690833525566049, 0.9581114551875726, 0.5178850084137946, 0.8253717728130134, 0.6077075298125768],
[0.9916302951496252, 2.000426069987407, 0.6666666666666666, 2.333333333333333, 0.3314209941710807, 0.6722935653817178, 1.166418178777295, 0.8130960851315602, 0.59514237114876, 0.7011465970783877, 0.6077075298125768],
[0.5566475183448023, 2.157125251003924, 1, 1, 0.2051194280641231, 1.796468980897483, 0.4635799425808032, -2.193306768352461, 0.9579260202306472, 0.3681648763588932, 0.6077075298125768],
[0.5636043769593734, 1.995557924028874, 1.5, 2.5, 0.2202300247787065, 2.661441360857503, 1.252782477470109, -2.317988200379612, 0.8758590776210354, 0.4214495530858465, 0.6077075298125768],
[0.936018486377914, 2.061033360111566, 1.5, 2.5, 0.3123130777581627, 1.602532451901148, 1.212983762603761, -0.6410134319341538, 0.7683073213818913, 0.5732144044901433, 0.6077075298125768],
[0.9937799666913955, 2.006220033308603, 0, 2, 0.331259988897132, 0, 0.9968996255618359, 1.640426647122983, 0.447213202449864, 1, 0.6077075298125768],
[0.9996731191699856, 2.000326880830012, 1, 1, 0.3332243730566621, 1.00032698771603, 0.4999182931466989, -0.8234367191791461, 0.8889615172009946, 0.5554102633143186, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -3.291056802631394, 1, 0.1111111111111109, 0.6077075298125768],
[0.9992622295206827, 1.834649571525632, 0, 3, 0.3526087964882121, 0, 1.635189655049657, 2.690751018921827, 0.2713316040434721, 1, 0.6077075298125768],
[1.108099894845911, 1.059512424862091, 1, 0, 0.5112076014566952, 0.902445713289285, 0, -1.48500005186312, 1, 0.5112076014566952, 0.6077075298125768],
[0.9795007637983723, 2.020499236201625, 3, 7, 0.3265002545994576, 3.06278474798366, 3.464490297536282, 0.6610178907549688, 0.5779215550076001, 0.6846174711937828, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5915954713203675, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2282746199656544, 1.690344244468478, 0, -2.781509462273403, 1, 0.2282746199656543, 0.6077075298125768],
[0.8330215263832826, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2940399565006985, 1.200449170073294, 0, -1.975373203691461, 1, 0.2940399565006986, 0.6077075298125768],
[0.8214918923339887, 3.347173343385168, 0, 0, 0.1970635313421298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.024731444080176, 3.143933791638982, 0, 0, 0.2458176385332593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.1580912629229, 3.010573972796256, 0, 0, 0.2778086503564281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.1580912629229, 3.010573972796256, 0, 0, 0.2778086503564281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0.8214918923339887, 3.143933791638982, 0, 0, 0.2071636080974121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[1.1580912629229, 3.010573972796256, 0, 0, 0.2778086503564281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0.8785386574454855, 3.290126578273675, 0, 0, 0.2107481910319248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.6077075298125768],
[1.389555078573053, 2.779110157146105, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2543182767628335],
[0.5801781952210124, 2.243018904114975, 0, 0, 0.2055039640546066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5832014788799991],
[1.071160350227549, 1.783992769469126, 2, 1, 0.3751673921927335, 1.867134084616869, 0.5605403884554848, -2.150037036013608, 0.9471949748913355, 0.3166416662767606, 0.6077075298125768],
[0.991790968231118, 1.550990934803322, 0, 2, 0.3900416968704866, 0, 1.289498187978523, 2.121905891763786, 0.3720491315566355, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[0.9930059125331724, 1.897679035910096, 2, 2, 0.3435192455227401, 2.01408669853533, 1.053919004296126, -1.579983210896416, 0.8796272714002019, 0.425511500770134, 0.6077075298125768],
[0.482223681917668, 1.686424632248044, 2, 2, 0.2223614030766355, 4.147452883372634, 1.185940931931214, -4.873252026932726, 0.963356026691924, 0.2160453113507648, 0.6077075298125768],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.91934919437271, 0, -3.291056802631394, 1, 0.111111111111111, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08382387008839, 0, 2, 0.3333563534636265, 0, 0.9597740138734305, 1.645698868453857, 0.4444137514673133, 1, 0.5832014788799991],
[1.041489591235042, 2.084380300330673, 0, 1, 0.3331839223523699, 0, 0.4797588999672261, 0.8226297726277585, 0.6668160776476301, 1, 0.5832014788799991],
[0.8680475157798658, 2.258012097338607, 1, 1, 0.277681050014886, 1.152010669717298, 0.442867423597351, -1.215948984700469, 0.9228932344626304, 0.4782553344924023, 0.5832014788799991],
[1.042211791757879, 1.910392706721589, 1, 2, 0.352980493084867, 0.9594978754877822, 1.046905169268671, 0.1498749522184836, 0.7141736848874916, 0.729135478950693, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.91934919437271, 0, -3.291056802631394, 1, 0.111111111111111, 0.5832014788799991],
[0.6169931620624838, 2.509066451055987, 1, 1, 0.1973708880896831, 1.620763505153285, 0.3985546096553687, -2.095688951003845, 0.9610447325346896, 0.3557865087140561, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9596745971863549, 1.645528401315697, 0.4444444444444444, 1, 0.5832014788799991],
[1.04201987103949, 2.08403974207898, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9596745971863549, 0.4798372985931775, -0.8227642006578484, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.5832014788799991],
[0.8282081465689423, 2.001047779174479, 2, 1, 0.292730021004134, 2.414851880273692, 0.4997381923646743, -3.151373965202733, 0.9749157112309963, 0.2069040180532343, 0.6077075298125768],
[0.5916999884470562, 2.405350968035989, 0, 3, 0.1974274034837897, 0, 1.247219237386198, 2.052334677786292, 0.5169552861440224, 1, 0.6077075298125768],
[0.9966414171892838, 2.003358582810714, 0, 1, 0.3322138057297615, 0, 0.4991617619432858, 0.821384856128461, 0.6677861942702386, 1, 0.6077075298125768],
[1.257703488437317, 3.106191420730553, 0, 0, 0.2882066398517242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[0.833425951069283, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2941407206194196, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.6194968145523603, 2.361160045034476, 0, 1, 0.2078390246632522, 0, 0.4235206343182886, 0.6969152323139829, 0.7921609753367478, 1, 0.6077075298125768],
[0.7345038720828261, 2.265496127917173, 0, 1, 0.2448346240276087, 0, 0.4414044180774517, 0.726343506412674, 0.7551653759723913, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[2.766779953867372, 1.760449442422793, 0, 0, 0.6111419836897614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[0.8921518120288378, 3.414356556995763, 0, 0, 0.2071636080974121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[1.732378840799705, 2.177925902089242, 0, 0, 0.443029112743734, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[1.112872839294401, 3.414356556995763, 0, 0, 0.2458176385332592, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2525736553595929],
[0.8329115980101174, 2.165968874386312, 2, 2, 0.2777408455177712, 2.401215212728621, 0.9233743031356643, -2.431829189361432, 0.932152038239578, 0.309292211813564, 0.6077075298125768],
[0.591104298617863, 2.002425975485286, 0, 4, 0.2279149406969111, 0, 1.997576963628133, 3.287069627464063, 0.3553534971515113, 1, 0.6077075298125768],
[0.5632345597032539, 2.145896658628824, 1, 3, 0.2079022809570733, 1.775459234118838, 1.398016995803017, -0.6210919230048509, 0.8069449517569538, 0.6063456537821696, 0.6077075298125768],
[1.154561741994586, 1.459733111728988, 0, 1, 0.4416340950792634, 0, 0.6850567353477003, 1.135826206176164, 0.5583659049207366, 1, 0.6031351729891761],
[0.8331244898095869, 2.166875510190414, 1, 0, 0.2777081632698621, 1.200300810060875, 0, -1.975129073077405, 1, 0.2777081632698621, 0.6077075298125768],
[0.9979147263046867, 2.001722997705991, 0, 3, 0.3326784159023113, 0, 1.498708864032662, 2.466168001069328, 0.2971703776522471, 1, 0.6077075298125768],
[0.8331244898095581, 2.166460810621695, 1, 2, 0.2777465570623309, 1.200300810060916, 0.923164633393979, -0.4560354497374891, 0.8114230387247181, 0.6232364656093841, 0.6077075298125768],
[0.5916994488102493, 2.407791788967683, 0, 2, 0.1972666035352679, 0, 0.8306366061898901, 1.366836126657945, 0.6443809057998048, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -0.8227642006578484, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6077075298125768],
[0.5920817867011647, 2.407918213298834, 1, 1, 0.197360595567055, 1.68895585451393, 0.4152964973963987, -2.095842645738388, 0.9610487953174174, 0.3557699864515274, 0.6077075298125768],
[0.833425951069283, 2.166574048930718, 0, 0, 0.2778086503564275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.5914179160633855, 2.408582083936613, 0, 1, 0.1971393053544619, 0, 0.4151820304025466, 0.6831938227433071, 0.8028606946455381, 1, 0.6077075298125768],
[0.8324631780644689, 2.167536821935532, 1, 0, 0.2774877260214896, 1.201254333344888, 0, -1.976698122722565, 1, 0.2774877260214896, 0.6077075298125768],
[0.5911905940263881, 2.408809405973611, 0, 0, 0.1970635313421294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.7377799148047566, 2.262220085195243, 0, 1, 0.2459266382682522, 0, 0.4420436395841186, 0.7273953635566263, 0.7540733617317478, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -1.645528401315697, 1, 0.3333333333333333, 0.6077075298125768],
[1.070866903834247, 1.782870774592363, 0, 0, 0.3752506447700766, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.9999999999999993, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6077075298125768],
[0.4805760439140109, 1.687190991581524, 0, 1, 0.2216917390314292, 0, 0.5927011257111023, 0.9753065358494034, 0.7783082609685709, 1, 0.6077075298125768]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.00110521543186493,
"Nucleotide GTR":0.001097860872032702,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1002":{
"Global MG94xREV":0.001513001490539587,
"Nucleotide GTR":0.001502933353896176,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node101":{
"Global MG94xREV":0.0008906967488031431,
"Nucleotide GTR":0.0008847696848637718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node105":{
"Global MG94xREV":0.001518168727932376,
"Nucleotide GTR":0.001508066206357779,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1057":{
"Global MG94xREV":0.001512983256147577,
"Nucleotide GTR":0.00150291524084334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "F", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "TTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node106":{
"Global MG94xREV":0.001511950018411145,
"Nucleotide GTR":0.001501888878697435,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1071":{
"Global MG94xREV":0.0003757792130845686,
"Nucleotide GTR":0.000373278623039717,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1072":{
"Global MG94xREV":0.0008569230798187532,
"Nucleotide GTR":0.0008512207598181098,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1073":{
"Global MG94xREV":0.000279379727470089,
"Nucleotide GTR":0.0002775206194063127,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1083":{
"Global MG94xREV":0.001110903864150362,
"Nucleotide GTR":0.001103511451140928,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1088":{
"Global MG94xREV":0.001287263928339908,
"Nucleotide GTR":0.001278697942643464,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1089":{
"Global MG94xREV":0.0002257697769026126,
"Nucleotide GTR":0.0002242674115857107,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1092":{
"Global MG94xREV":0.001518760026964228,
"Nucleotide GTR":0.001508653570641723,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1100":{
"Global MG94xREV":0.001513232602325794,
"Nucleotide GTR":0.001503162927769131,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node111":{
"Global MG94xREV":0.0009124143521748233,
"Nucleotide GTR":0.0009063427703353184,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1115":{
"Global MG94xREV":0.001512586149601787,
"Nucleotide GTR":0.001502520776808473,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.0005997366202755391,
"Nucleotide GTR":0.0005957457251701833,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1125":{
"Global MG94xREV":0.001512485880070744,
"Nucleotide GTR":0.001502421174512293,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1130":{
"Global MG94xREV":0.001136551637852867,
"Nucleotide GTR":0.001128988553967131,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1135":{
"Global MG94xREV":0.001136551637852867,
"Nucleotide GTR":0.001128988553967131,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1141":{
"Global MG94xREV":0.001136551634996546,
"Nucleotide GTR":0.001128988551129818,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "D", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAT", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1147":{
"Global MG94xREV":0.001136551637852867,
"Nucleotide GTR":0.001128988553967131,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1154":{
"Global MG94xREV":0.001512655681057673,
"Nucleotide GTR":0.001502589845573341,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1186":{
"Global MG94xREV":0.001215158939265255,
"Nucleotide GTR":0.001207072769938601,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1189":{
"Global MG94xREV":0.001215302631818699,
"Nucleotide GTR":0.001207215506302463,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1190":{
"Global MG94xREV":0.0002972020030009093,
"Nucleotide GTR":0.0002952242981568507,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1196":{
"Global MG94xREV":0.001182150049065284,
"Nucleotide GTR":0.001174283534523545,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1197":{
"Global MG94xREV":0.0003310283046838014,
"Nucleotide GTR":0.0003288255056613071,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.0003723267634067513,
"Nucleotide GTR":0.0003698491473875888,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.0005546537976768532,
"Nucleotide GTR":0.0005509629022879757,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1214":{
"Global MG94xREV":0.001104996797068188,
"Nucleotide GTR":0.001097643692122174,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node122":{
"Global MG94xREV":0.0005848375005853939,
"Nucleotide GTR":0.0005809457503743722,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1224":{
"Global MG94xREV":0.0009607782831057356,
"Nucleotide GTR":0.0009543848677001232,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "F", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "TTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1227":{
"Global MG94xREV":0.001103720438454152,
"Nucleotide GTR":0.001096375826925369,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1230":{
"Global MG94xREV":0.001105171398081334,
"Nucleotide GTR":0.001097817131268085,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1233":{
"Global MG94xREV":0.001105011472867625,
"Nucleotide GTR":0.001097658270262782,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1236":{
"Global MG94xREV":0.001109607126705626,
"Nucleotide GTR":0.001102223342722578,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1239":{
"Global MG94xREV":0.001104996797068188,
"Nucleotide GTR":0.001097643692122174,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1242":{
"Global MG94xREV":0.001105142042225686,
"Nucleotide GTR":0.001097787970758422,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1245":{
"Global MG94xREV":0.001105127364297889,
"Nucleotide GTR":0.001097773390503616,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1248":{
"Global MG94xREV":0.001105127364297889,
"Nucleotide GTR":0.001097773390503616,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1251":{
"Global MG94xREV":0.001105112686370107,
"Nucleotide GTR":0.001097758810248826,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1254":{
"Global MG94xREV":0.001104767758478741,
"Nucleotide GTR":0.001097416177650073,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1257":{
"Global MG94xREV":0.001108656108424526,
"Nucleotide GTR":0.0011012786529098,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1260":{
"Global MG94xREV":0.0011063787230554,
"Nucleotide GTR":0.001099016422203262,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1263":{
"Global MG94xREV":0.001106292490512263,
"Nucleotide GTR":0.001098930763487075,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1266":{
"Global MG94xREV":0.001103092373894833,
"Nucleotide GTR":0.001095751941766959,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node129":{
"Global MG94xREV":0.001295465382541897,
"Nucleotide GTR":0.001286844820982774,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.0002172498840802377,
"Nucleotide GTR":0.0002158042136480791,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node134":{
"Global MG94xREV":0.0008807585873766982,
"Nucleotide GTR":0.0008748976560669721,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node135":{
"Global MG94xREV":0.0006315569890252006,
"Nucleotide GTR":0.0006273543480474062,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node139":{
"Global MG94xREV":0.001513181885064735,
"Nucleotide GTR":0.00150311254800167,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node145":{
"Global MG94xREV":0.0003753144911327216,
"Nucleotide GTR":0.0003728169935396241,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.0005803565185862803,
"Nucleotide GTR":0.0005764945866796989,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.0005562611677289451,
"Nucleotide GTR":0.0005525595762360508,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node152":{
"Global MG94xREV":0.001513367612072655,
"Nucleotide GTR":0.00150329703910539,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.001512506492036436,
"Nucleotide GTR":0.001502441649317453,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node160":{
"Global MG94xREV":0.001513037634009395,
"Nucleotide GTR":0.001502969256852412,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.001512546167102843,
"Nucleotide GTR":0.001502481060369584,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node169":{
"Global MG94xREV":0.001513034617995972,
"Nucleotide GTR":0.001502966260908789,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.001352966286102769,
"Nucleotide GTR":0.001343963089788962,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node252":{
"Global MG94xREV":0.0003950838743068388,
"Nucleotide GTR":0.0003924548230752299,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node253":{
"Global MG94xREV":0.0005268546891443926,
"Nucleotide GTR":0.0005233487805020719,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node258":{
"Global MG94xREV":0.0005067784288210881,
"Nucleotide GTR":0.0005034061159045403,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node259":{
"Global MG94xREV":0.0005596389725668808,
"Nucleotide GTR":0.0005559149037658832,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node266":{
"Global MG94xREV":0.0009967182896153794,
"Nucleotide GTR":0.0009900857145666562,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node269":{
"Global MG94xREV":0.0009927670524061394,
"Nucleotide GTR":0.0009861607705212911,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node270":{
"Global MG94xREV":0.0005193516794458403,
"Nucleotide GTR":0.0005158956989280821,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node288":{
"Global MG94xREV":0.001512617512894598,
"Nucleotide GTR":0.001502551931396984,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.001351765939645045,
"Nucleotide GTR":0.001342770730932196,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.00151318812167162,
"Nucleotide GTR":0.001503118743107595,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node309":{
"Global MG94xREV":0.001513252460869963,
"Nucleotide GTR":0.001503182654166348,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node313":{
"Global MG94xREV":0.001513421274745158,
"Nucleotide GTR":0.001503350344684314,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node320":{
"Global MG94xREV":0.001513186976839725,
"Nucleotide GTR":0.001503117605893887,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node324":{
"Global MG94xREV":0.001218657808576611,
"Nucleotide GTR":0.001210548356328861,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.0002938018983891275,
"Nucleotide GTR":0.0002918468192450744,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node337":{
"Global MG94xREV":0.001211904069369731,
"Nucleotide GTR":0.001203839559291313,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node338":{
"Global MG94xREV":0.0003013076496140339,
"Nucleotide GTR":0.0002993026241021709,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node355":{
"Global MG94xREV":0.001117618922290065,
"Nucleotide GTR":0.00111018182451109,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node360":{
"Global MG94xREV":0.001220116200408703,
"Nucleotide GTR":0.001211997043419524,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"Global MG94xREV":0.0002924467956360759,
"Nucleotide GTR":0.00029050073390527,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node365":{
"Global MG94xREV":0.001512263846091108,
"Nucleotide GTR":0.001502200618038436,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node381":{
"Global MG94xREV":0.0003835565064029342,
"Nucleotide GTR":0.0003810041630370622,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node382":{
"Global MG94xREV":0.0005600759663442218,
"Nucleotide GTR":0.0005563489896061938,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node383":{
"Global MG94xREV":0.0005681153187336577,
"Nucleotide GTR":0.0005643348448253435,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.0009693256469944611,
"Nucleotide GTR":0.0009628753539002867,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node392":{
"Global MG94xREV":0.0005431543238325929,
"Nucleotide GTR":0.0005395399506908613,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node402":{
"Global MG94xREV":0.001513616436079684,
"Nucleotide GTR":0.001503544207334735,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "N", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AAT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node412":{
"Global MG94xREV":0.001517772984342594,
"Nucleotide GTR":0.001507673096209245,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node418":{
"Global MG94xREV":0.001094984282357392,
"Nucleotide GTR":0.001087697804818477,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.0008890887216043147,
"Nucleotide GTR":0.0008831723581418873,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.0006236729472558097,
"Nucleotide GTR":0.0006195227699473048,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.001513419388701491,
"Nucleotide GTR":0.001503348471191159,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node434":{
"Global MG94xREV":0.001511865384699295,
"Nucleotide GTR":0.001501804808173249,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node435":{
"Global MG94xREV":0.001512898378397793,
"Nucleotide GTR":0.001502830927905149,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node443":{
"Global MG94xREV":0.001100192756421702,
"Nucleotide GTR":0.001092871619545761,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node454":{
"Global MG94xREV":0.001053268645417414,
"Nucleotide GTR":0.001046259760951279,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node46":{
"Global MG94xREV":0.001515140489822109,
"Nucleotide GTR":0.00150505811939427,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node460":{
"Global MG94xREV":0.001512740265366152,
"Nucleotide GTR":0.001502673867022907,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.0006070261090198519,
"Nucleotide GTR":0.0006029867066465277,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node466":{
"Global MG94xREV":0.0009069222746472153,
"Nucleotide GTR":0.0009008872393592837,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node471":{
"Global MG94xREV":0.001285934931932866,
"Nucleotide GTR":0.001277377789927265,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "R"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node476":{
"Global MG94xREV":0.0003807308316094776,
"Nucleotide GTR":0.0003781972914504159,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node491":{
"Global MG94xREV":0.0009473875344963769,
"Nucleotide GTR":0.0009410832266611134,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGT", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node498":{
"Global MG94xREV":0.001052193658651895,
"Nucleotide GTR":0.001045191927591564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.0009499771714461602,
"Nucleotide GTR":0.0009436556310973608,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTC", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node515":{
"Global MG94xREV":0.001512968373474831,
"Nucleotide GTR":0.001502900457206044,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node524":{
"Global MG94xREV":0.0005375424678172012,
"Nucleotide GTR":0.0005339654382825581,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.0005547921526549348,
"Nucleotide GTR":0.0005511003365949056,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.001513260045579356,
"Nucleotide GTR":0.001503190188403952,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node559":{
"Global MG94xREV":0.001349076006717456,
"Nucleotide GTR":0.001340098697928994,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node562":{
"Global MG94xREV":0.001512618631966534,
"Nucleotide GTR":0.001502553043022153,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node572":{
"Global MG94xREV":0.0004722145541218283,
"Nucleotide GTR":0.0004690722434991144,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.0005848977650610208,
"Nucleotide GTR":0.0005810056138252952,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"Global MG94xREV":0.000959256762028613,
"Nucleotide GTR":0.0009528734714524925,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "G", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GGA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"Global MG94xREV":0.001336461124422402,
"Nucleotide GTR":0.001327567760269476,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.0001768052717146043,
"Nucleotide GTR":0.0001756287364328956,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"Global MG94xREV":0.000960109251616709,
"Nucleotide GTR":0.0009537202882228709,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node633":{
"Global MG94xREV":0.0005520337076420718,
"Nucleotide GTR":0.0005483602474141331,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node642":{
"Global MG94xREV":0.0003854765017485441,
"Nucleotide GTR":0.0003829113819408668,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0005572107157410087,
"Nucleotide GTR":0.0005535028055635692,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.0004250320143942728,
"Nucleotide GTR":0.0004222036758727956,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node649":{
"Global MG94xREV":0.0005553911603110234,
"Nucleotide GTR":0.0005516953582067177,
"amino-acid": [
["K", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node65":{
"Global MG94xREV":0.001512928275179328,
"Nucleotide GTR":0.001502860625741154,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node668":{
"Global MG94xREV":0.001512326615751831,
"Nucleotide GTR":0.001502262970003916,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node671":{
"Global MG94xREV":0.001512604358706245,
"Nucleotide GTR":0.001502538864742032,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node675":{
"Global MG94xREV":0.001513382409931903,
"Nucleotide GTR":0.001503311738493573,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node678":{
"Global MG94xREV":0.001278901077580039,
"Nucleotide GTR":0.001270390741745613,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node679":{
"Global MG94xREV":0.0002337246222303865,
"Nucleotide GTR":0.000232169322088081,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node683":{
"Global MG94xREV":0.000993567059315556,
"Nucleotide GTR":0.0009869554538544064,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node684":{
"Global MG94xREV":0.0005184453215241356,
"Nucleotide GTR":0.0005149953722862271,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node689":{
"Global MG94xREV":0.001512873987110931,
"Nucleotide GTR":0.001502806698927981,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node698":{
"Global MG94xREV":0.0005588260611175088,
"Nucleotide GTR":0.0005551074017649506,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.001210732650022643,
"Nucleotide GTR":0.001202675935052243,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node704":{
"Global MG94xREV":0.0003024677058939057,
"Nucleotide GTR":0.0003004549608885639,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node708":{
"Global MG94xREV":0.001219988309763228,
"Nucleotide GTR":0.001211870003811209,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.0002925731352782074,
"Nucleotide GTR":0.0002906262328312567,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node715":{
"Global MG94xREV":0.001512639942542061,
"Nucleotide GTR":0.001502574211788309,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node729":{
"Global MG94xREV":0.001513128796445723,
"Nucleotide GTR":0.001503059812656249,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node73":{
"Global MG94xREV":0.001350406511159297,
"Nucleotide GTR":0.001341420348644908,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node732":{
"Global MG94xREV":0.00133951245112286,
"Nucleotide GTR":0.001330598782182161,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node737":{
"Global MG94xREV":0.0004165511188105107,
"Nucleotide GTR":0.000413779215670049,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node738":{
"Global MG94xREV":0.0005498474041498562,
"Nucleotide GTR":0.0005461884924880898,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node750":{
"Global MG94xREV":0.0004234696777749437,
"Nucleotide GTR":0.0004206517356864272,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node751":{
"Global MG94xREV":0.000540515294878985,
"Nucleotide GTR":0.0005369184829255782,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node759":{
"Global MG94xREV":0.001192862362443227,
"Nucleotide GTR":0.001184924563745107,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node762":{
"Global MG94xREV":0.001215736490870336,
"Nucleotide GTR":0.001207646478276826,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node763":{
"Global MG94xREV":0.0002967734057081894,
"Nucleotide GTR":0.0002947985529274862,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node771":{
"Global MG94xREV":0.001512224726940882,
"Nucleotide GTR":0.001502161759203187,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node783":{
"Global MG94xREV":0.004050884382371174,
"Nucleotide GTR":0.004023928125061852,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "L", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "TTA", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node787":{
"Global MG94xREV":0.001513031092033192,
"Nucleotide GTR":0.001502962758409222,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node810":{
"Global MG94xREV":0.001513050999335292,
"Nucleotide GTR":0.001502982533239912,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node813":{
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "N", "I", "G", "S", "F", "A", "A", "C", "S", "R", "-", "L", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAT", "ATT", "GGG", "AGC", "TTC", "GCA", "GCG", "TGT", "AGC", "AGG", "---", "CTC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node817":{
"Global MG94xREV":0.001512939201906315,
"Nucleotide GTR":0.001502871479757191,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node82":{
"Global MG94xREV":0.001512369917983537,
"Nucleotide GTR":0.001502305984084695,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node824":{
"Global MG94xREV":0.0009876010094242572,
"Nucleotide GTR":0.0009810291045224946,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node825":{
"Global MG94xREV":0.0005241719667533779,
"Nucleotide GTR":0.0005206839100535554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node83":{
"Global MG94xREV":0.001512622611127833,
"Nucleotide GTR":0.001502556995704468,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node835":{
"Global MG94xREV":0.0004191319844497065,
"Nucleotide GTR":0.0004163429071636308,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node836":{
"Global MG94xREV":0.0005456609503616385,
"Nucleotide GTR":0.0005420298970919852,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node840":{
"Global MG94xREV":0.001377815771185186,
"Nucleotide GTR":0.001368647216137173,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node841":{
"Global MG94xREV":0.0001350205850418173,
"Nucleotide GTR":0.0001341221023183209,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node848":{
"Global MG94xREV":0.001124216372694931,
"Nucleotide GTR":0.001116735372756845,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node860":{
"Global MG94xREV":0.0009531251913005328,
"Nucleotide GTR":0.0009467827027277916,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node861":{
"Global MG94xREV":0.0005591769737297382,
"Nucleotide GTR":0.0005554559792597639,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node870":{
"Global MG94xREV":0.001513306572587953,
"Nucleotide GTR":0.001503236405802623,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node882":{
"Global MG94xREV":0.0008900397101197069,
"Nucleotide GTR":0.0008841170183870293,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node883":{
"Global MG94xREV":0.0006227377889461621,
"Nucleotide GTR":0.0006185938345671819,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node890":{
"Global MG94xREV":0.001283302850274352,
"Nucleotide GTR":0.001274763223226904,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node891":{
"Global MG94xREV":0.0002293797294602836,
"Nucleotide GTR":0.0002278533420284965,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node900":{
"Global MG94xREV":0.001103588507385783,
"Nucleotide GTR":0.001096244773780806,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node916":{
"Global MG94xREV":0.0009677547079741089,
"Nucleotide GTR":0.0009613148685568239,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node942":{
"Global MG94xREV":0.001192554389056695,
"Nucleotide GTR":0.001184618639740652,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node943":{
"Global MG94xREV":0.0003202917703369695,
"Nucleotide GTR":0.0003181604166471843,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node955":{
"Global MG94xREV":0.001136551634824035,
"Nucleotide GTR":0.001128988550958455,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node97":{
"Global MG94xREV":0.001513146584540542,
"Nucleotide GTR":0.001503077482381741,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node989":{
"Global MG94xREV":0.001512605815484252,
"Nucleotide GTR":0.001502540311826036,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGG", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003039154987887147,
"Nucleotide GTR":0.0030189311957165,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "A", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GCT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512741194192904,
"Nucleotide GTR":0.001502674789668862,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513027780238251,
"Nucleotide GTR":0.00150295946865233,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513344404105291,
"Nucleotide GTR":0.001503273985573422,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "P", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "CCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512574055586932,
"Nucleotide GTR":0.001502508763272185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003762279498802664,
"Nucleotide GTR":0.0003737243737554906,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003029546941356357,
"Nucleotide GTR":0.003009387085094535,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007645167995854394,
"Nucleotide GTR":0.007594293891284517,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "RGW", "P", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "YC", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "V", "H", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "KAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "NGG", "CCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TRT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GTG", "CAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004577607417988369,
"Nucleotide GTR":0.004547146128113661,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "PL", "T", "RS", "P", "M", "LV", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CYG", "ACT", "AGW", "CCC", "ATG", "STA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KRM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ADG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "TA", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "RCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "LF", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "YTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418703_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "RC", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "YGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAR", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "ED", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAK", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCR", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004070816382422109,
"Nucleotide GTR":0.0004043727489354439,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420198_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "GC", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "KGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAW", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512626907391136,
"Nucleotide GTR":0.001502561263378664,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "I", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ATC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCK", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "V", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GTG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421787_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "NK", "PL", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAS", "CYC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "SL", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TYA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "HP", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TS", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CMC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "WCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512989226910178,
"Nucleotide GTR":0.001502921171874022,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTC", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513784695660332,
"Nucleotide GTR":0.001503711347246659,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "H", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "CAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423067_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "AS", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "KCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423216_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819894514,
"Nucleotide GTR":0.001502515482567273,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "V", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423427_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512423264886993,
"Nucleotide GTR":0.001502358975995829,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423528_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTR", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "AV", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GYT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423653_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513290939037782,
"Nucleotide GTR":0.00150322087628455,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGT", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423718_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "DEAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNS", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423815_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "RC", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "YGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423856_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151274272430177,
"Nucleotide GTR":0.001502676309595753,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424040_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "NS", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ARC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512862224068282,
"Nucleotide GTR":0.001502795014161475,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "A", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "GCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512404971894596,
"Nucleotide GTR":0.001502340804732554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "R", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AGG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512211170228917,
"Nucleotide GTR":0.00150214829270318,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425380_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151450521294171,
"Nucleotide GTR":0.001504427069908541,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "M", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "ATG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515024907522748,
"Nucleotide GTR":0.001504943306227253,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTA", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512676409376077,
"Nucleotide GTR":0.001502610435956957,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001513169471605904,
"Nucleotide GTR":0.001503100217147118,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512989226910178,
"Nucleotide GTR":0.001502921171874022,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "S", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TCA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513786178655533,
"Nucleotide GTR":0.001503712820373396,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGG", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514705814701888,
"Nucleotide GTR":0.001504626336781778,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGA", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514017278054824,
"Nucleotide GTR":0.001503942381941864,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "N", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005656676559763659,
"Nucleotide GTR":0.0005619034698266898,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGT", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512772394601404,
"Nucleotide GTR":0.001502705782456961,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTG", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "LF", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTW", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "NT", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AMC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512866536569281,
"Nucleotide GTR":0.001502799297965311,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACR", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002980169020964419,
"Nucleotide GTR":0.0002960337745773254,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513204610787593,
"Nucleotide GTR":0.001503135122498183,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "Y", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819894514,
"Nucleotide GTR":0.001502515482567273,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "Y", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "TAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512994891249401,
"Nucleotide GTR":0.001502926798520391,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "L", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "TTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512404971894596,
"Nucleotide GTR":0.001502340804732554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "S", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AGT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "NTSIYCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429065_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "TISF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "IL", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "MTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513078658331253,
"Nucleotide GTR":0.001503010008181493,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004070280727433863,
"Nucleotide GTR":0.0004043195398835656,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513787790678002,
"Nucleotide GTR":0.001503714421668802,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "A", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "GCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001512458224838667,
"Nucleotide GTR":0.001502393703309547,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512850202061994,
"Nucleotide GTR":0.001502783072154582,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "RGW", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "NGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TP", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "MCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001600758115017129,
"Nucleotide GTR":0.0001590106009559326,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTY", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTR", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "DA", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GMT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "IM", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATN", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "YS", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "PL", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TMC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CYA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTK", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "NTSI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "QHPRL", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "TS", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ANT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTS", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CNN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AST", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "NHDY", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAR", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAN", "NAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTR", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATM", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512404972039354,
"Nucleotide GTR":0.001502340804876348,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGG", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0003890233293254695,
"Nucleotide GTR":0.0003864346074625937,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432711_England_20200312_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001512055482007265,
"Nucleotide GTR":0.001501993640495239,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACT", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCT", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001517688736812602,
"Nucleotide GTR":0.001507589409297106,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "Q", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "CAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001514147642109487,
"Nucleotide GTR":0.001504071878500279,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGC", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433666_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151332941852305,
"Nucleotide GTR":0.001503259099711434,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433845_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151395700354314,
"Nucleotide GTR":0.001503882508521668,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "H", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CAC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433949_England_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003045490045714621,
"Nucleotide GTR":0.003025224097453416,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "QHPRL", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "M", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTC", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CNN", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ATG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512626907391136,
"Nucleotide GTR":0.001502561263378664,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "L", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CTT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513857411630009,
"Nucleotide GTR":0.001503783579334249,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCT", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512999865067332,
"Nucleotide GTR":0.001502931739240486,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "L", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "CTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KN", "I", "G", "S", "F", "A", "A", "C", "S", "R", "-", "L", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AA-", "ATT", "GGG", "AGC", "TTC", "GCA", "GCG", "TGT", "AGC", "AGG", "---", "CTC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512493471196183,
"Nucleotide GTR":0.001502428715123249,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512666795472299,
"Nucleotide GTR":0.001502600886028066,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001512759970961147,
"Nucleotide GTR":0.001502693441488736,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512414358905111,
"Nucleotide GTR":0.001502350129278025,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "CW", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TG-", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003035805369199011,
"Nucleotide GTR":0.003015603866774188,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "I", "A", "Y", "A", "N", "R", "K", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "ATT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAA", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514705861031176,
"Nucleotide GTR":0.001504626382802774,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "K", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAA", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512425997259111,
"Nucleotide GTR":0.001502361690185611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "L", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "CTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512989226765287,
"Nucleotide GTR":0.001502921171730095,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACC", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004070625838576514,
"Nucleotide GTR":0.0004043538213466265,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514531578315803,
"Nucleotide GTR":0.00150445325983655,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "D", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GAC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "QH", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAN", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KQE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "NAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "RM", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "RM", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TA", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "RCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "IL", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "MTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001513354180838073,
"Nucleotide GTR":0.001503283697247791,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "V", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "GTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "NIYF", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "WWC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512886278629085,
"Nucleotide GTR":0.001502818908653299,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "TTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003028336112298644,
"Nucleotide GTR":0.003008184313393329,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATC", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513713364283076,
"Nucleotide GTR":0.001503640490537841,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513785387338669,
"Nucleotide GTR":0.001503712034322283,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "D", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GAC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512856011701555,
"Nucleotide GTR":0.001502788843134401,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "L", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CTT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004166860530673948,
"Nucleotide GTR":0.0004139132520186735,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512421964356039,
"Nucleotide GTR":0.001502357684119143,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514920676551515,
"Nucleotide GTR":0.00150483976885194,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "D", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GAT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513314777107571,
"Nucleotide GTR":0.001503244555725981,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512641572273657,
"Nucleotide GTR":0.001502575830675001,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAG", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "LF", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTK", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004196279464068986,
"Nucleotide GTR":0.0004168355687851742,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "LF", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "YTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438435_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACY", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438511_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512404971894596,
"Nucleotide GTR":0.001502340804732554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "G", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GGG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "LF", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "YTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515113190143749,
"Nucleotide GTR":0.001505031001379242,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "Q", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAA", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WC", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGK", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513169049743765,
"Nucleotide GTR":0.001503099798092226,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTG", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439409_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005456942602083386,
"Nucleotide GTR":0.0005420629852812118,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "QPRL", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CNA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439458_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512660396545271,
"Nucleotide GTR":0.001502594529682138,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "H", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "CAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440052_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004040690254459062,
"Nucleotide GTR":0.0004013801833086073,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "PR", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CSC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCK", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440230_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTS", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAY", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440436_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440816_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441046_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "IV", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "RTC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441103_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACK", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441198_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003762279464484789,
"Nucleotide GTR":0.0003737243703465398,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441250_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001514460384526801,
"Nucleotide GTR":0.001504382539800416,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441307_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514066589961854,
"Nucleotide GTR":0.001503991365707104,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441573_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004031200317485325,
"Nucleotide GTR":0.0004004375046071391,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442012_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442065_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "PL", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CYA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442072_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442224_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001514066589961854,
"Nucleotide GTR":0.001503991365707104,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "F", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TTT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442224_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442621_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442625_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442625_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001513125304616303,
"Nucleotide GTR":0.001503056344062903,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442782_England_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514332876334721,
"Nucleotide GTR":0.001504255880100494,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "N", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "AAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442846_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "SF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TYT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTK", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443318_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443337_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443412_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443412_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001513291387672398,
"Nucleotide GTR":0.001503221321933766,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "A", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "GCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443629_England_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443657_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443657_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512555916812922,
"Nucleotide GTR":0.001502490745201069,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443673_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443680_England_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001512473097629164,
"Nucleotide GTR":0.001502408477130358,
"amino-acid": [
["M", "V", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443680_England_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAR", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443713_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514066646039866,
"Nucleotide GTR":0.00150399142141195,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "H", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAT", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443744_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "KN", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAW", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512360105337438,
"Nucleotide GTR":0.001502296236735996,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444084_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512804961739662,
"Nucleotide GTR":0.001502738132880034,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTC", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512980260382371,
"Nucleotide GTR":0.001502912265013193,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515339569827753,
"Nucleotide GTR":0.001505255874639356,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "N", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "AAT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004605831343482395,
"Nucleotide GTR":0.0004575182239953661,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002018381964934928,
"Nucleotide GTR":0.002004950817940943,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "F", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "TTT", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151339506168418,
"Nucleotide GTR":0.001503324306055868,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "N", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AAT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445096_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "TI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "AYT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445178_California_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000407064380567423,
"Nucleotide GTR":0.0004043556061003497,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001625838910081487,
"Nucleotide GTR":0.0001615019906657349,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAY", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGY", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001518606194860375,
"Nucleotide GTR":0.001508500762200206,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCY", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512490950895804,
"Nucleotide GTR":0.001502426211593988,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "A", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "GCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512804961739662,
"Nucleotide GTR":0.001502738132880034,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTC", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513487538437896,
"Nucleotide GTR":0.00150341616743108,
"amino-acid": [
["M", "T", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "ACA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "VL", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "KTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512652533166141,
"Nucleotide GTR":0.001502586718629179,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512675924633837,
"Nucleotide GTR":0.001502609954440391,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512788865195209,
"Nucleotide GTR":0.001502722143448634,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "T", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "HY", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "YAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "MI", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATK", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001511875816964174,
"Nucleotide GTR":0.001501815171017531,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCG", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513092459883544,
"Nucleotide GTR":0.001503023717892557,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTY", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "HR", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CRT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATY", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513786178655533,
"Nucleotide GTR":0.001503712820373396,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512970939157232,
"Nucleotide GTR":0.001502903005815334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "V", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GTA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512989226910178,
"Nucleotide GTR":0.001502921171874022,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "T", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ACA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "ML", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "MTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTY", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512629768521587,
"Nucleotide GTR":0.001502564105469971,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447679_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512772394601404,
"Nucleotide GTR":0.001502705782456961,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "GV", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GKT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGY", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448334_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTY", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448334_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448433_England_20200429_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514937243545584,
"Nucleotide GTR":0.00150485622560239,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "K", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AAA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "ED", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAW", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448615_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513784695660332,
"Nucleotide GTR":0.001503711347246659,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "CGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448657_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151284937548894,
"Nucleotide GTR":0.001502782251081886,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "S", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "TCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448684_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448896_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGW", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448978_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAY", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449004_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449030_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819893786,
"Nucleotide GTR":0.001502515482566551,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTC", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514975681240849,
"Nucleotide GTR":0.00150489440751736,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCA", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449684_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449700_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449700_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCM", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001608530374362449,
"Nucleotide GTR":0.001597826549081762,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CT-", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003031940239020297,
"Nucleotide GTR":0.00301176445676761,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCA", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512772394601404,
"Nucleotide GTR":0.001502705782456961,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "S", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AGC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512989226765287,
"Nucleotide GTR":0.001502921171730095,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGC", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151450521294171,
"Nucleotide GTR":0.001504427069908541,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "I", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "ATT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "VL", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "KTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514677842930225,
"Nucleotide GTR":0.001504598551145832,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "I", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "ATC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "F", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "TTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001512804961594708,
"Nucleotide GTR":0.001502738132736046,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "T", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ACT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0030347297799858,
"Nucleotide GTR":0.003014535434975719,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "K", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "AAA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512871703215331,
"Nucleotide GTR":0.001502804430230367,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512292667648222,
"Nucleotide GTR":0.001502229247805008,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "V", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "GTG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "BTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "TR", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "TM", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "HY", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ASA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "AYG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTY", "GCT", "GCA", "YAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "LF", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "YTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCY", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GC", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "KGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GV", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GKT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTK", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "CF", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TKT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "PA", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTY", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "SCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512612527215315,
"Nucleotide GTR":0.001502546978894468,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTK", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "VL", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "KTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512747520027512,
"Nucleotide GTR":0.001502681073408754,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCC", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000394711555087514,
"Nucleotide GTR":0.0003920849814217229,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "ED", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "NK", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAW", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATY", "AAS", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "SC", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TST", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "TI", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "AYT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "HY", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "YAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCR", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "GV", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GKG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCY", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "SI", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AKT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003028851908673566,
"Nucleotide GTR":0.003008696677446198,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "C", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "P", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "TGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "CCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514935119000506,
"Nucleotide GTR":0.001504854115194914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "I", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "ATC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "PS", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "YCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAY", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTY", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "LF", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "YTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513307007526527,
"Nucleotide GTR":0.001503236837846936,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "H", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CAT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00151316564271299,
"Nucleotide GTR":0.001503096413733239,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAT", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512731428469804,
"Nucleotide GTR":0.001502665088930917,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515311187247175,
"Nucleotide GTR":0.001505227680928186,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AS", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "KCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512823897076758,
"Nucleotide GTR":0.001502756942213577,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "L", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TTA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452365_Andalusia_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTY", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452365_Andalusia_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CF", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TKT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "N", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AAT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512747519881428,
"Nucleotide GTR":0.001502681073263644,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "L", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "CTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "LF", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "YTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452577_Andalusia_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512766103143404,
"Nucleotide GTR":0.00150269953286492,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCT", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452577_Andalusia_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452598_Andalusia_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001513165642566158,
"Nucleotide GTR":0.001503096413587382,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "F", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "TTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452598_Andalusia_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LV", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACW", "STT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "TI", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AYA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009535644446513923,
"Nucleotide GTR":0.000947219033105483,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "F", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "TTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452954_England_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513272487832992,
"Nucleotide GTR":0.001503202547861697,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452954_England_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513429114926869,
"Nucleotide GTR":0.00150335813269422,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "N", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AAC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453286_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453286_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTY", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453570_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCM", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453570_England_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453618_England_20200505_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001512747520027946,
"Nucleotide GTR":0.001502681073409188,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453618_England_20200505_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453815_Portugal_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001512747520027946,
"Nucleotide GTR":0.001502681073409188,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAC", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453815_Portugal_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001513166639430536,
"Nucleotide GTR":0.001503097403818214,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001511875816964174,
"Nucleotide GTR":0.001501815171017531,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTG", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151395700354314,
"Nucleotide GTR":0.001503882508521668,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCA", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005615435890520612,
"Nucleotide GTR":0.0005578068461465467,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GG-", "TTC", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0003762279472488432,
"Nucleotide GTR":0.0003737243711415787,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512659069192108,
"Nucleotide GTR":0.00150259321116173,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454614_California_20200429_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004069761630068813,
"Nucleotide GTR":0.0004042679755758809,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454614_California_20200429_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454626_California_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "IV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "RTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454626_California_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512747520027512,
"Nucleotide GTR":0.001502681073408754,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTC", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454653_California_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAR", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454653_California_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000407082628237694,
"Nucleotide GTR":0.0004043737323430879,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003762279496769582,
"Nucleotide GTR":0.0003737243735535356,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "D", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAT", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512632209959284,
"Nucleotide GTR":0.001502566530661332,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "V", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "GTT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512930503094608,
"Nucleotide GTR":0.001502862838830969,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGC", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KTRMQPLEAGVSW", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["NNG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[21.5, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["---", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002269201556928661,
"Nucleotide GTR":0.000225410135280497,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "R"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003762279472488432,
"Nucleotide GTR":0.0003737243711415787,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512440279614344,
"Nucleotide GTR":0.001502375877500155,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000412898355767162,
"Nucleotide GTR":0.000410150759620234,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819893786,
"Nucleotide GTR":0.001502515482566551,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAT", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0015137846955072,
"Nucleotide GTR":0.001503711347094547,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "L", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513222375075461,
"Nucleotide GTR":0.001503152768575144,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "A", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "GCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518696986582033,
"Nucleotide GTR":0.001508590949756259,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "E", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "GAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513652141086209,
"Nucleotide GTR":0.001503579674745406,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAC", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "HY", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "YAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAR", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TI", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AYC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "IV", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "RTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "QHL", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "EAGV", "SC", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CWW", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GNA", "WGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "ED", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "TI", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "YC", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "KE", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "GC", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAW", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "AYT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TRC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGY", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "RAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "KGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "NI", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AWC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "KQE", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AS", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "VF", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "NAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "YAA", "TTT", "KCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "KTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "VF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "PA", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GV", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "VF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "SI", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "KTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "SCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GKC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "KTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AKC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAY", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACW", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "IF", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "WTC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAY", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "WC", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGK", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456599_Timor_Leste_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456599_Timor_Leste_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "PA", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "SCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001513236699653635,
"Nucleotide GTR":0.00150316699783166,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "I", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "ATT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "RC", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "YGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001512660396545271,
"Nucleotide GTR":0.001502594529682138,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAG", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456688_England_20200518_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456688_England_20200518_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49":{
"Global MG94xREV":0.0005443416634783345,
"Nucleotide GTR":0.0005407193892883427,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457288_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512971680570348,
"Nucleotide GTR":0.001502903742294784,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457288_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457312_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512289123342618,
"Nucleotide GTR":0.001502225727084675,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "V", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "GTC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457312_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457384_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "WL", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TKG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTN", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457384_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457474_England_20200508_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001512404971894596,
"Nucleotide GTR":0.001502340804732554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "R", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CGG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457474_England_20200508_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457519_England_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "AV", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GYA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457519_England_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457554_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACY", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457554_England_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCT", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512747519881428,
"Nucleotide GTR":0.001502681073263644,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "T", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ACA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0001612495105069562,
"Nucleotide GTR":0.0001601764896833693,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151452139617138,
"Nucleotide GTR":0.001504443145448319,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACC", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005693009171211052,
"Nucleotide GTR":0.0005655125537515819,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "F", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "TTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0004455438139134543,
"Nucleotide GTR":0.0004425789814085592,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458267_California_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGG", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458267_California_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458280_California_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512747520027946,
"Nucleotide GTR":0.001502681073409188,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGC", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458280_California_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458314_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "AV", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GYT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458314_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458364_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458364_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458476_England_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAY", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458476_England_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458498_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DY", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "KAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458498_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458506_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "EG", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GRA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458506_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458741_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AS", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "KCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458741_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458747_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "QE", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "HR", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "SAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CRT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458747_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458756_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512570673554279,
"Nucleotide GTR":0.001502505403744978,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "H", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAT", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458756_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458849_England_20200420_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0004547473622632779,
"Nucleotide GTR":0.0004517212855474744,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458849_England_20200420_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458970_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACY", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458970_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459024_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "VF", "V", "QHPRL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "KTT", "GTR", "CNN", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459024_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459045_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513312844090852,
"Nucleotide GTR":0.001503242635572352,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "T", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "ACA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459045_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459072_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "VF", "V", "QHPRL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "KTT", "GTG", "CNN", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459072_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459080_England_20200411_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001514707441351391,
"Nucleotide GTR":0.001504627952606884,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "M", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "ATG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459080_England_20200411_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459156_Scotland_20200406_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001512747520027946,
"Nucleotide GTR":0.001502681073409188,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATC", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459156_Scotland_20200406_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459173_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "QE", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "SAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "YGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459173_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459208_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "KE", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "RAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459208_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459241_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "TI", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "AYT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459241_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459311_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459311_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459493_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513134249441817,
"Nucleotide GTR":0.001503065229365855,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "K", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AAG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459493_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001512668629905657,
"Nucleotide GTR":0.001502602708254344,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004596922778999047,
"Nucleotide GTR":0.000456633295673677,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459686_Scotland_20200324_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459686_Scotland_20200324_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.02450605093257777,
"Nucleotide GTR":0.02434297755100989,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "V", "Q", "A", "K", "Q", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "H", "C", "Y", "W", "N", "G", "L", "C", "L", "I", "F", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GTA", "CAA", "GCA", "AAG", "CAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGT", "CAC", "TGC", "TAC", "TGG", "AAT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "TTC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001512924096100232,
"Nucleotide GTR":0.001502856474471379,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "T", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ACT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151332941852305,
"Nucleotide GTR":0.001503259099711434,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "L", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CTC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513043967256481,
"Nucleotide GTR":0.001502975547955455,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "S", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "AGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460323_Massachusetts_20200408_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0001638888325620241,
"Nucleotide GTR":0.0001627982485996942,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460323_Massachusetts_20200408_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001513317275872005,
"Nucleotide GTR":0.001503247037862602,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTG", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "DY", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "KAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460601_Michigan_20200503_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0004084911841527069,
"Nucleotide GTR":0.0004057729151454434,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460601_Michigan_20200503_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518732719301679,
"Nucleotide GTR":0.001508626444695634,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "P", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "CCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513594687870183,
"Nucleotide GTR":0.001503522603846801,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "S", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "TCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512392261790564,
"Nucleotide GTR":0.001502328179206804,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "E", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "GAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512343095426648,
"Nucleotide GTR":0.001502279340016174,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTG", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001513220215416899,
"Nucleotide GTR":0.001503150623287844,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "V", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GTT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005471311086133001,
"Nucleotide GTR":0.0005434902723036041,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00017380334366604,
"Nucleotide GTR":0.0001726467844530763,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461149_Noord_Brabant_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461149_Noord_Brabant_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513435974886097,
"Nucleotide GTR":0.001503364947004443,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "S", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "AGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001514127668610672,
"Nucleotide GTR":0.001504052037913372,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTC", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512392830707933,
"Nucleotide GTR":0.001502328744338361,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "D", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "GAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512606829407306,
"Nucleotide GTR":0.001502541319002029,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512796981780481,
"Nucleotide GTR":0.001502730206022795,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461542_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513165642566158,
"Nucleotide GTR":0.001503096413587382,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTT", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461542_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461567_England_20200525_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001512137490878449,
"Nucleotide GTR":0.001502075103645533,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTG", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461567_England_20200525_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461587_England_20200530_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512806600115994,
"Nucleotide GTR":0.001502739760353935,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "S", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TCT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461587_England_20200530_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461588_England_20200528_null_36":{
"Global MG94xREV":0.0005162405813625332,
"Nucleotide GTR":0.0005128053033760072,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461588_England_20200528_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41":{
"Global MG94xREV":0.001511582739573911,
"Nucleotide GTR":0.001501524043885236,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "C", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGT", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001513828812867515,
"Nucleotide GTR":0.001503755170879731,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTA", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461894_England_20200515_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151240497189571,
"Nucleotide GTR":0.001502340804733661,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "G", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "GGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461894_England_20200515_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462280_Singapore_20200319_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462280_Singapore_20200319_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HR", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CRT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "IL", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "MTT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462363_Singapore_20200407_null_74":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462363_Singapore_20200407_null_74",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAY", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462403_Singapore_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00151319013477677,
"Nucleotide GTR":0.001503120742816714,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462403_Singapore_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512914709041765,
"Nucleotide GTR":0.001502847149878275,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTT", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512601726311893,
"Nucleotide GTR":0.001502536249864721,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGA", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAR", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512580819894514,
"Nucleotide GTR":0.001502515482567273,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "L", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CTA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAY", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512871361052915,
"Nucleotide GTR":0.001502804090344842,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004572356823400695,
"Nucleotide GTR":0.004541930473150366,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "K", "L", "-", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "AAA", "TTA", "---", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514875453344756,
"Nucleotide GTR":0.001504794846579073,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "T", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "ACA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512277561783403,
"Nucleotide GTR":0.00150221424246085,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512205870242688,
"Nucleotide GTR":0.001502143027985248,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "CTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0004070815039150686,
"Nucleotide GTR":0.0004043726155021703,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512804961739662,
"Nucleotide GTR":0.001502738132880034,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "T", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ACG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512747519881428,
"Nucleotide GTR":0.001502681073263644,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCC", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005529963372073693,
"Nucleotide GTR":0.0005493164712448291,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "G", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GGA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "F", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "TTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515087953253289,
"Nucleotide GTR":0.001505005932425473,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "D", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GAT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001511602377069303,
"Nucleotide GTR":0.001501543550704624,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "F", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TTT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18":{
"Global MG94xREV":0.000406331839311223,
"Nucleotide GTR":0.0004036279394761374,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003033307202498118,
"Nucleotide GTR":0.003013122323906032,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "E", "H", "H", "Q", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GAA", "CAC", "CAT", "CAA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513586693637434,
"Nucleotide GTR":0.001503514662810978,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464029_Ontario_20200427_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464029_Ontario_20200427_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512580819749097,
"Nucleotide GTR":0.001502515482422822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCT", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003028384693380444,
"Nucleotide GTR":0.003008232571196554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTT", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAC", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464271_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "SF", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TYT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464271_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464336_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "GV", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "WAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GKG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464336_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464350_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "NS", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "ART", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464350_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464453_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "HR", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CRT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464453_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464508_England_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "YTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464508_England_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464541_England_20200304_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464541_England_20200304_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464561_England_20200304_null_19":{
"Global MG94xREV":0.000408998742041377,
"Nucleotide GTR":0.0004062770955343489,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464561_England_20200304_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464610_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "TS", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "ILVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "WCG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACN", "NTY", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464610_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464625_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACY", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464625_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464633_England_20200308_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464633_England_20200308_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464634_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "HY", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KQE", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "YAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "NAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464634_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464659_England_20200309_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0003201623422305753,
"Nucleotide GTR":0.0003180318498088513,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464659_England_20200309_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464759_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GC", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAY", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "KGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464759_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464932_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003027269080547657,
"Nucleotide GTR":0.003007124382112191,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "CTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464932_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465108_England_20200314_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465108_England_20200314_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465165_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "MI", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATK", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465165_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465213_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "AV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GYT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465213_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465222_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "LF", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "YTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465222_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465251_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465251_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465252_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "LF", "R", "L", "ILVF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "YTC", "AGA", "CTG", "NTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465252_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465258_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "SR", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "MGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465258_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465261_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WL", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TKG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465261_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465270_England_20200419_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465270_England_20200419_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465271_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513157879291249,
"Nucleotide GTR":0.001503088701972511,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "R", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CGT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465271_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465303_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "PS", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "YCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465303_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465333_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001511602377069303,
"Nucleotide GTR":0.001501543550704624,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "M", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "ATG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465333_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465352_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCY", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465352_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465390_England_20200421_null_33":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465390_England_20200421_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465392_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "RS", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGK", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465392_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465403_England_20200420_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465403_England_20200420_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465408_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512714812627874,
"Nucleotide GTR":0.001502648583657659,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAC", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465408_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465429_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465429_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465465_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "EAGV", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["---", "GNA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAY", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465465_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465477_England_20200429_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465477_England_20200429_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465516_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "NS", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ART", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465516_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465529_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DV", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GWC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465529_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465540_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004012824035212064,
"Nucleotide GTR":0.0003986121047168035,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465540_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465545_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCW", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465545_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465551_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "HD", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "SAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465551_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465558_England_20200502_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465558_England_20200502_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465571_England_20200501_null_26":{
"Global MG94xREV":0.001512970939157232,
"Nucleotide GTR":0.001502903005815334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "L", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TTG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465571_England_20200501_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465573_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "AV", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GYA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465573_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "RI", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AKA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465574_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465578_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465578_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465604_England_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465604_England_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465632_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "HPRL", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "ILVF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CNC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "NTY", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465632_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465643_England_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "NY", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "WAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465643_England_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465645_England_20200506_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0004064306859174346,
"Nucleotide GTR":0.0004037261283162179,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465645_England_20200506_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465675_England_20200518_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "TI", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "AYC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465675_England_20200518_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465712_England_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001514654357925213,
"Nucleotide GTR":0.001504575222419743,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "S", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "AGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465712_England_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465716_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["RM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AKG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465716_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465719_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514825438138999,
"Nucleotide GTR":0.001504745164195149,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "N", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AAC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465719_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465781_England_20200318_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465781_England_20200318_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465831_England_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465831_England_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465833_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513038569860485,
"Nucleotide GTR":0.001502970186475964,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTC", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465833_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465840_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "HPRL", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "KN", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CNT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAK", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465840_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465850_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001512648824362888,
"Nucleotide GTR":0.001502583034505835,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465850_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465851_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "-", "ILV", "NI", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "---", "NTA", "AWT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465851_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465882_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "YTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465882_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465894_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "RC", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "EAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "YGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465894_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465905_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGM", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465905_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465917_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "YTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465917_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465918_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "AV", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GYT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465918_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465958_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCY", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465958_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465968_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465968_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465974_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005328660832363045,
"Nucleotide GTR":0.000529320172295563,
"amino-acid": [
["K", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465974_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466007_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513847121753165,
"Nucleotide GTR":0.001503773357930494,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "I", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "ATA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466007_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466013_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "VL", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "KTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466013_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466031_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "LV", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "IM", "DAGV", "L", "L", "V", "QHPRL"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "STT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATN", "GNT", "TTG", "CTT", "GTA", "CNN"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 13]
],
"original name":"epi_isl_466031_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 11]
]
},
"epi_isl_466037_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005478870429545783,
"Nucleotide GTR":0.0005442411763456474,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "I", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "TR", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ATA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ASA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466037_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466123_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466123_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466197_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "VF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "KTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466197_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466202_England_20200402_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466202_England_20200402_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466240_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "AV", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GYT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466240_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466242_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466242_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466283_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "GV", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GKA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466283_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466285_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AG", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GSA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466285_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466287_England_20200407_null_26":{
"Global MG94xREV":0.0006220566420366646,
"Nucleotide GTR":0.0006179172202904695,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466287_England_20200407_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466288_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "AG", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GSC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466288_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466304_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "KAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466304_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466337_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGY", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466337_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466352_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466352_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466358_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AV", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GYC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466358_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466368_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466368_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466373_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "AS", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "KCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466373_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466384_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466384_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "NHDY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCN", "NAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466387_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466399_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466399_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466400_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AWG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466400_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466411_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "ILVF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "SI", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "NTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATY", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AKT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466411_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466416_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466416_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466428_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "PS", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "YCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466428_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466461_England_20200415_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466461_England_20200415_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466477_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518559294590871,
"Nucleotide GTR":0.00150845417402446,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "Q", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "TPAS", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "CAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTN", "NCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466477_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466515_England_20200414_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466515_England_20200414_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466542_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "PL", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CYG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466542_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466544_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "IL", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "WTA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466544_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466561_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "RL", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CKG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466561_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466567_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "LF", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "YTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466567_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466607_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "AS", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "KCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466607_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466609_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "NTSIHPRLDAGVYCF", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "AG", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCN", "NNT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GSA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466609_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466628_Narayanganj_20200601_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466628_Narayanganj_20200601_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466665_Nebraska_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001513144560181476,
"Nucleotide GTR":0.001503075471493596,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTC", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466665_Nebraska_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001512598898955097,
"Nucleotide GTR":0.001502533441322323,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "L", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "CTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001512778182410759,
"Nucleotide GTR":0.001502711531751844,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001513269628341918,
"Nucleotide GTR":0.001503199707398855,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACA", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KN", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAM", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGY", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KR", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "ARG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "IF", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "WTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "KN", "D", "L", "P", "KE", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAK", "GAC", "CTG", "CCT", "RAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "AS", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "KCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001512978721404997,
"Nucleotide GTR":0.001502910736276811,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "C", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "TGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151234309528181,
"Nucleotide GTR":0.001502279339872298,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTG", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005521257708182675,
"Nucleotide GTR":0.0005484516979639411,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "F", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "TTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467307_British_Columbia_20200401_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467307_British_Columbia_20200401_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467344_Rio_de_Janeiro_20200402_null_9":{
"Global MG94xREV":0.00151332941852305,
"Nucleotide GTR":0.001503259099711434,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCT", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467344_Rio_de_Janeiro_20200402_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467413_New_York_20200318_null_35":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467413_New_York_20200318_null_35",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467478_KZN_20200513_null_44":{
"Global MG94xREV":0.0004070971038076935,
"Nucleotide GTR":0.0004043881115866682,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467478_KZN_20200513_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467506_KZN_20200601_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467506_KZN_20200601_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0011314763360753,
"Nucleotide GTR":0.001123947025343206,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAA", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001511602377069303,
"Nucleotide GTR":0.001501543550704624,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "S", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "TCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01849253477092259,
"Nucleotide GTR":0.01836947780890319,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "Q", "W", "R", "A", "R", "D", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CAG", "TGG", "AGG", "GCT", "AGA", "GAT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2.333333333333333, 1, 1.5, 1.5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.6666666666666666, 0, 0.5, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467784_Virginia_20200418_null_141":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467784_Virginia_20200418_null_141",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467843_California_20200315_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0004074425496477134,
"Nucleotide GTR":0.0004047312586874315,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467843_California_20200315_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001513109506766915,
"Nucleotide GTR":0.001503040651338928,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467865_Massachusetts_20200315_null_379":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467865_Massachusetts_20200315_null_379",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467961_San_Diego_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0004084904239091487,
"Nucleotide GTR":0.0004057721599608596,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467961_San_Diego_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467999_South_Australia_20200331_null_720":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467999_South_Australia_20200331_null_720",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468000_South_Australia_20200315_null_300":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468000_South_Australia_20200315_null_300",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0004070798430505051,
"Nucleotide GTR":0.0004043709656896845,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468038_South_Australia_20200304_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468038_South_Australia_20200304_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468040_South_Australia_20200401_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468040_South_Australia_20200401_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468074_Chittagong_20200517_null_372":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468074_Chittagong_20200517_null_372",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000589123796439032,
"Nucleotide GTR":0.0005852035234455695,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCT", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468162_Islamabad_20200602_null_41290":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468162_Islamabad_20200602_null_41290",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":9951.233573928203,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01846222897163508],
[0.01579781340663309],
[0.01183544289526361],
[0.02546932240111491],
[0.01549468530048941],
[0.01325853706763737],
[0.009933061892785174],
[0.02137548700258754],
[0.01621995509772478],
[0.01387913802236468],
[0.0103980051714124],
[0.02237602330413374],
[0.02769302549241995],
[0.02369644803271217],
[0.0177529605074326],
[0.03820354495724098],
[0.01349145010773543],
[0.01154440299242092],
[0.008648862906517141],
[0.01861195053860488],
[0.01132288923443573],
[0.009688802561403198],
[0.00725867982405868],
[0.01562034123111715],
[0.01185288706400885],
[0.01014231263488242],
[0.007598441564429442],
[0.0163514926870994],
[0.02023694280561943],
[0.01731640566559217],
[0.01297314540506494],
[0.02791760526430068],
[0.01594606913701187],
[0.01364477849250041],
[0.01022242714923468],
[0.02199818757014662],
[0.0133829627742919],
[0.01145157223762109],
[0.008579315743939803],
[0.01846228828080515],
[0.01400938780387366],
[0.01198759341609209],
[0.008980893347444206],
[0.0193264645979258],
[0.0239188290749517],
[0.02046693274207465],
[0.01533346466849123],
[0.03299690249227547],
[0.01341829089136548],
[0.02163304300332078],
[0.01316082101240889],
[0.01126148933325238],
[0.008436908987883482],
[0.01815583556803452],
[0.01178861317777721],
[0.008831820865877044],
[0.01900566755401563],
[0.02352180407215523],
[0.02012720524104631],
[0.01507894682257951],
[0.03244919193072505]
],
"Log Likelihood":-4143.083441302538,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5576450106186684, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":828
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":10946.02384041664,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2537430272513757],
[0.218979666565302],
[0.2084373499665654],
[0.3188399562167569]
],
"Log Likelihood":-4190.417401392823,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2608258033228067,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3412612067316403,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1711448435813834,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.598351533410295,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.7457276279209174
},
"display order":0,
"estimated parameters":1279
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-16/sequences.M.compressed.fas",
"number of sequences":637,
"number of sites":239,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1,epi_isl_454614_California_20200429_null_4)Node1,epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1,epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1,(epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1,epi_isl_464561_England_20200304_null_19)Node1266,(epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3,epi_isl_465645_England_20200506_null_9)Node1263,(epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18,epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1)Node1260,(epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_440088_England_20200321_null_1)Node1257,(epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2,epi_isl_467843_California_20200315_null_7)Node1254,(epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1,epi_isl_467478_KZN_20200513_null_44)Node1251,(epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2,epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6)Node1248,(epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2,epi_isl_465917_England_20200330_null_1)Node1245,(epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2,epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1)Node1242,(epi_isl_440436_England_20200316_null_2,epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5)Node1239,(epi_isl_442012_England_20200324_null_2,epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1)Node1236,(epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1,epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1)Node1233,epi_isl_442621_England_20200412_null_1,epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1,epi_isl_465573_England_20200501_null_1,epi_isl_453570_England_20200424_null_1,epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1,epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1,epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1,epi_isl_466607_England_20200416_null_1,epi_isl_466567_England_20200416_null_1,epi_isl_466561_England_20200414_null_1,epi_isl_466542_England_20200415_null_1,epi_isl_466428_England_20200408_null_1,epi_isl_466384_England_20200413_null_1,epi_isl_466373_England_20200409_null_1,epi_isl_466358_England_20200409_null_1,epi_isl_466352_England_20200409_null_1,epi_isl_466197_England_20200403_null_1,epi_isl_465905_England_20200330_null_1,epi_isl_454626_California_20200430_null_2,epi_isl_438435_England_20200329_null_1,epi_isl_423653_England_20200323_null_1,epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1,(epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1)Node204,epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3,epi_isl_466304_England_20200408_null_1,epi_isl_465261_England_20200419_null_1,epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_464634_England_20200308_null_1,epi_isl_459173_England_20200507_null_1,epi_isl_465675_England_20200518_null_1,epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1,epi_isl_465894_England_20200331_null_1,epi_isl_465252_England_20200418_null_1,epi_isl_457384_England_20200429_null_1,epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1,epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1,epi_isl_465632_England_20200505_null_1,epi_isl_465851_England_20200328_null_1,epi_isl_449004_England_20200419_null_1,epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_464759_England_20200310_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1,((epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18)Node259,epi_isl_458364_England_20200501_null_1)Node258,((epi_isl_466387_England_20200413_null_1,epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2)Node253,epi_isl_465545_England_20200501_null_1)Node252,epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1,epi_isl_465958_England_20200330_null_1,(epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1,epi_isl_461588_England_20200528_null_36)Node266,((epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2,epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1)Node270,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1)Node269,epi_isl_448615_England_20200101_null_1,epi_isl_423856_England_20200317_null_1,(epi_isl_449030_England_20200419_null_3,epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6)Node294,(epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5,epi_isl_461587_England_20200530_null_1,epi_isl_465831_England_20200326_null_3)Node288,epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1,epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2,epi_isl_465392_England_20200421_null_1,(epi_isl_439409_England_20200331_null_1,epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2,(epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1,epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3)Node309,epi_isl_466399_England_20200413_null_1,epi_isl_467307_British_Columbia_20200401_null_14)Node301,(epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1,epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19)Node313,epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6,((epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2,epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22)Node325,epi_isl_445178_California_20200405_null_1)Node324,(epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4,epi_isl_444084_England_20200404_null_1)Node320,epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1,epi_isl_442065_England_20200404_null_1,epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4,(((epi_isl_465850_England_20200323_null_3,epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1,epi_isl_457312_England_20200504_null_1)Node383,epi_isl_465604_England_20200504_null_2)Node382,epi_isl_458314_England_20200429_null_1)Node381,(epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1,epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1,epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4,epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31)Node365,((epi_isl_465165_England_20200416_null_1,(epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1,epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1)Node355,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_467999_South_Australia_20200331_null_720,epi_isl_464625_England_20200308_null_1,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_464350_England_20200304_null_1,epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1,epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1,epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4)Node338,epi_isl_466515_England_20200414_null_37)Node337,((epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1,epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7)Node361,epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3)Node360,epi_isl_466288_England_20200408_null_1,epi_isl_466013_England_20200401_null_1,epi_isl_454653_California_20200410_null_1,epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1,epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1,epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1,epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1,epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1,((epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1,epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6)Node392,epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1)Node391,epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1,(epi_isl_438511_England_20200401_null_2,epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3)Node443,(epi_isl_441307_England_20200401_null_2,epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9,epi_isl_465516_England_20200429_null_1)Node402,epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,((epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1)Node418,epi_isl_423067_England_20200324_null_1,epi_isl_462280_Singapore_20200319_null_17,epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1)Node412,epi_isl_459024_England_20200410_null_1,epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1,((epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11,epi_isl_462991_USA_20200511_null_1)Node423,epi_isl_465429_England_20200423_null_4)Node422,epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1,epi_isl_466544_England_20200415_null_1,epi_isl_465833_England_20200325_null_1,(epi_isl_465918_England_20200330_null_1,epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4,((epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1)Node435,epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4)Node434,epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1)Node431,epi_isl_465213_England_20200417_null_1,epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1,(epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4,epi_isl_464610_England_20200308_null_1)Node454,epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1,epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1,epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4,(epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1)Node46,epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1,epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1,(epi_isl_442625_England_20200405_null_2,epi_isl_468038_South_Australia_20200304_null_32,((epi_isl_465270_England_20200419_null_18,epi_isl_465271_England_20200419_null_1)Node466,epi_isl_466411_England_20200409_null_1)Node465,epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2)Node460,(epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1,epi_isl_466031_England_20200401_null_1)Node471,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_443713_England_20200330_null_1,epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2)Node476,epi_isl_458756_England_20200419_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2,epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_459208_England_20200505_null_1,(epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2)Node498,epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1,(epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2,epi_isl_448978_England_20200421_null_1)Node491,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_457519_England_20200507_null_2,(epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1)Node505,epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_458498_England_20200416_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,(epi_isl_466416_England_20200409_null_1,epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4)Node515,epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1,epi_isl_424156_England_20200320_null_1,epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1,((epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2,epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1)Node525,epi_isl_456599_Timor_Leste_20200413_null_3)Node524,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_1,epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1,epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1,epi_isl_443318_England_20200415_null_1,epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1,epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1,epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1,epi_isl_458506_England_20200501_null_1,epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1,epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1,(epi_isl_465551_England_20200502_null_1,epi_isl_465558_England_20200502_null_7)Node548,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1,epi_isl_441103_England_20200401_null_1,epi_isl_466283_England_20200408_null_1,(epi_isl_460323_Massachusetts_20200408_null_12,epi_isl_466202_England_20200402_null_7)Node559,(epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_465781_England_20200318_null_18)Node562,epi_isl_459241_England_20200501_null_1,epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2,epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1,((epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_458849_England_20200420_null_7)Node573,epi_isl_465251_England_20200418_null_2)Node572,(epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1,epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3)Node578,epi_isl_433845_England_20200408_null_1,epi_isl_466007_England_20200331_null_1,epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1,epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5,epi_isl_464271_England_20200303_null_1,epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1,epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1,epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1,epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1,((epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1,epi_isl_461149_Noord_Brabant_20200321_null_2)Node596,epi_isl_457554_England_20200511_null_1)Node595,epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2,epi_isl_467344_Rio_de_Janeiro_20200402_null_9,epi_isl_465574_England_20200501_null_1,epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_458747_England_20200419_null_1,epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1,epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_465258_England_20200418_null_1,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1,((epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1,epi_isl_466123_England_20200331_null_1)Node643,epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1)Node642,((epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_443680_England_20200413_null_5,epi_isl_448539_England_20200406_null_1,epi_isl_466628_Narayanganj_20200601_null_32)Node633,epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3)Node632,epi_isl_466285_England_20200407_null_2,(epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3,epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8)Node65,epi_isl_423528_England_20200326_null_1,((epi_isl_466400_England_20200412_null_1,epi_isl_465974_England_20200330_null_1)Node649,epi_isl_417938_California_20200318_null_1)Node648,epi_isl_465465_England_20200429_null_1,epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1,epi_isl_465408_England_20200421_null_1,((epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1,epi_isl_465108_England_20200314_null_9)Node684,epi_isl_448334_England_20200423_null_2)Node683,((epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3,epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1)Node679,epi_isl_458741_England_20200414_null_2)Node678,(epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12,epi_isl_464541_England_20200304_null_4)Node675,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,(epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1,epi_isl_468000_South_Australia_20200315_null_300)Node668,(epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4)Node671,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2)Node689,epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3)Node698,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5,epi_isl_448684_England_20200101_null_1,((epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1,epi_isl_465390_England_20200421_null_33)Node704,epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8)Node703,((epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2,epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1)Node709,epi_isl_466240_England_20200405_null_1)Node708,(epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5)Node715,epi_isl_452577_Andalusia_20200325_null_2,epi_isl_440230_England_20200323_null_1,(epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2,epi_isl_465968_England_20200330_null_1)Node73,epi_isl_433949_England_20200412_null_2,epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1,(epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3,epi_isl_465352_England_20200416_null_1)Node732,(epi_isl_423740_England_20200323_null_2,epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1)Node729,epi_isl_441198_England_20200403_null_1,epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12,epi_isl_466242_England_20200403_null_4,((epi_isl_439434_England_20200401_null_9,epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1)Node738,epi_isl_429065_California_20200328_null_1)Node737,epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2,epi_isl_443629_England_20200417_null_4,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1,((epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1,epi_isl_466037_England_20200402_null_1)Node751,epi_isl_443381_England_20200412_null_1)Node750,epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1,epi_isl_466665_Nebraska_20200504_null_2,(epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2,epi_isl_464659_England_20200309_null_9)Node759,((epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2,epi_isl_466461_England_20200415_null_25)Node763,epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1)Node762,epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1,epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1,epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1,(epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5,epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1,epi_isl_439458_England_20200330_null_1,epi_isl_442846_England_20200411_null_1,(epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1,epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1)Node783,epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4,epi_isl_459686_Scotland_20200324_null_9)Node771,(epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1,epi_isl_467413_New_York_20200318_null_35)Node787,epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_440052_England_20200322_null_1,epi_isl_465643_England_20200506_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6,epi_isl_465529_England_20200501_null_1,(epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2,epi_isl_467961_San_Diego_20200319_null_8)Node900,epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1,epi_isl_466368_England_20200410_null_1,epi_isl_465222_England_20200417_null_1,((epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1,epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54)Node825,epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1)Node824,(epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1,epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1,epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1,epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3)Node810,(epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3,epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21)Node817,((epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1)Node83,epi_isl_441046_England_20200404_null_1)Node82,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,((epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2,epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6)Node836,epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1)Node835,((epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2,epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1,(epi_isl_432711_England_20200312_null_17,epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1)Node848,epi_isl_468074_Chittagong_20200517_null_372,epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1,epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1,epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1)Node841,epi_isl_465403_England_20200420_null_6)Node840,((epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1,epi_isl_452954_England_20200512_null_1,epi_isl_456688_England_20200518_null_7)Node861,epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1)Node860,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,(epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1)Node870,epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1,epi_isl_464336_England_20200303_null_1,epi_isl_466477_England_20200410_null_1,epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1,((epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1,epi_isl_457288_England_20200417_null_2)Node891,epi_isl_459311_England_20200502_null_1)Node890,((epi_isl_448896_England_20200413_null_3,epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1)Node883,epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2)Node882,epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1,epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2,((epi_isl_443673_England_20200412_null_1,epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1)Node162,epi_isl_465840_England_20200327_null_1,epi_isl_448433_England_20200429_null_9,epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1)Node160,(epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5,epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8,epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4,epi_isl_465477_England_20200429_null_16)Node169,epi_isl_465578_England_20200502_null_1,epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1,epi_isl_465719_England_20200314_null_1,(((epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5,epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1)Node147,epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1)Node146,epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1)Node145,((epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1,epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7)Node156,epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6,epi_isl_467506_KZN_20200601_null_16)Node152,(epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1,epi_isl_464453_England_20200304_null_1,epi_isl_464633_England_20200308_null_26)Node139,(epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2,epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49)Node916,epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,((epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1,epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25)Node135,epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1)Node134,(((epi_isl_467865_Massachusetts_20200315_null_379,epi_isl_458970_England_20200410_null_1,epi_isl_459072_England_20200410_null_1)Node122,epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51)Node121,epi_isl_423718_England_20200323_null_2)Node120,((epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3,epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1)Node130,epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1)Node129,(epi_isl_418703_England_20200317_null_1,epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1)Node1230,(epi_isl_458476_England_20200429_null_3,epi_isl_460601_Michigan_20200503_null_7)Node1227,(epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1,epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1)Node1224,epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_440816_England_20200403_null_1,epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41,(epi_isl_420198_England_20200328_null_1,epi_isl_465882_England_20200329_null_1)Node1214,epi_isl_442072_England_20200405_null_1,epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,((epi_isl_425380_England_20200318_null_1,epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11)Node112,epi_isl_453286_England_20200403_null_1)Node111,epi_isl_447679_France_20200301_null_1,epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1,((epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1,epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1)Node1197,epi_isl_465303_England_20200420_null_2)Node1196,epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1,(epi_isl_423216_England_20200325_null_1,epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2)Node1186,((epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8,epi_isl_462403_Singapore_20200414_null_6)Node1190,epi_isl_452365_Andalusia_20200410_null_2)Node1189,((epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4)Node943,epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1)Node942,epi_isl_445096_California_20200313_null_1,epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1,epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_465712_England_20200430_null_3,((epi_isl_443337_England_20200415_null_1,epi_isl_443657_England_20200413_null_7)Node106,epi_isl_449700_England_20200416_null_3)Node105,epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2,epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1,epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1,epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2,epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1,epi_isl_464029_Ontario_20200427_null_6,epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1,epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2,epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1,epi_isl_461894_England_20200515_null_2,epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1,(epi_isl_466287_England_20200407_null_26,epi_isl_466609_England_20200416_null_1)Node101,epi_isl_424040_England_20200321_null_1,(epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6,epi_isl_459080_England_20200411_null_8,epi_isl_464508_England_20200304_null_2,epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12)Node1154,epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1,(epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11)Node1147,epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1,(epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1)Node955,epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5,(epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1,epi_isl_462363_Singapore_20200407_null_74)Node97,epi_isl_423815_England_20200323_null_1,(epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1)Node1141,epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1,epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1,(epi_isl_441250_England_20200401_null_2,epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2)Node1135,epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3,(epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2,epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3)Node1130,epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2,(epi_isl_433051_England_20200404_null_3,epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4)Node1125,epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1,epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1,epi_isl_449684_England_20200415_null_1,(epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1)Node1115,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_457474_England_20200508_null_3,epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3,epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1,(epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3,epi_isl_464932_England_20200313_null_1)Node1100,epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2,((((epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1,epi_isl_465540_England_20200430_null_1)Node1083,epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1,epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3,epi_isl_465716_England_20200421_null_1,epi_isl_433666_England_20200403_null_2,epi_isl_467784_Virginia_20200418_null_141)Node1073,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1)Node1072,epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10)Node1071,((epi_isl_442782_England_20200407_null_4,epi_isl_468040_South_Australia_20200401_null_30,(epi_isl_443412_England_20200416_null_4,epi_isl_461567_England_20200525_null_4)Node1092,epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1)Node1089,epi_isl_466337_England_20200407_null_3)Node1088,epi_isl_459045_England_20200409_null_2,epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3,epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7,(epi_isl_450495_GP_20200325_null_1,epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3)Node1057,epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1,epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1,epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2,epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1,epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1,epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1,epi_isl_423427_England_20200331_null_1,epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1,epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_453618_England_20200505_null_7,epi_isl_421787_England_20200326_null_1,epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4,epi_isl_442224_England_20200406_null_2,epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2,epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1,epi_isl_453815_Portugal_20200324_null_6,epi_isl_468162_Islamabad_20200602_null_41290,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_448657_England_20200101_null_1,epi_isl_452598_Andalusia_20200326_null_5,epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1,epi_isl_465571_England_20200501_null_26,epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1,epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2,epi_isl_459156_Scotland_20200406_null_11,(epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2)Node1002,epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1,epi_isl_443744_England_20200325_null_1,epi_isl_458280_California_20200421_null_1,epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1,epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1,epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2,epi_isl_441573_England_20200404_null_1,epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2,epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1,(epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_458267_California_20200410_null_2)Node989,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_459493_England_20200427_null_1,epi_isl_465333_England_20200420_null_1,epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1,epi_isl_461542_England_20200101_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node1002":"test",
"Node101":"test",
"Node105":"test",
"Node1057":"test",
"Node106":"test",
"Node1071":"test",
"Node1072":"test",
"Node1073":"test",
"Node1083":"test",
"Node1088":"test",
"Node1089":"test",
"Node1092":"test",
"Node1100":"test",
"Node111":"test",
"Node1115":"test",
"Node112":"test",
"Node1125":"test",
"Node1130":"test",
"Node1135":"test",
"Node1141":"test",
"Node1147":"test",
"Node1154":"test",
"Node1186":"test",
"Node1189":"test",
"Node1190":"test",
"Node1196":"test",
"Node1197":"test",
"Node120":"test",
"Node121":"test",
"Node1214":"test",
"Node122":"test",
"Node1224":"test",
"Node1227":"test",
"Node1230":"test",
"Node1233":"test",
"Node1236":"test",
"Node1239":"test",
"Node1242":"test",
"Node1245":"test",
"Node1248":"test",
"Node1251":"test",
"Node1254":"test",
"Node1257":"test",
"Node1260":"test",
"Node1263":"test",
"Node1266":"test",
"Node129":"test",
"Node130":"test",
"Node134":"test",
"Node135":"test",
"Node139":"test",
"Node145":"test",
"Node146":"test",
"Node147":"test",
"Node152":"test",
"Node156":"test",
"Node160":"test",
"Node162":"test",
"Node169":"test",
"Node204":"test",
"Node252":"test",
"Node253":"test",
"Node258":"test",
"Node259":"test",
"Node266":"test",
"Node269":"test",
"Node270":"test",
"Node288":"test",
"Node294":"test",
"Node301":"test",
"Node309":"test",
"Node313":"test",
"Node320":"test",
"Node324":"test",
"Node325":"test",
"Node337":"test",
"Node338":"test",
"Node355":"test",
"Node360":"test",
"Node361":"test",
"Node365":"test",
"Node381":"test",
"Node382":"test",
"Node383":"test",
"Node391":"test",
"Node392":"test",
"Node402":"test",
"Node412":"test",
"Node418":"test",
"Node422":"test",
"Node423":"test",
"Node431":"test",
"Node434":"test",
"Node435":"test",
"Node443":"test",
"Node454":"test",
"Node46":"test",
"Node460":"test",
"Node465":"test",
"Node466":"test",
"Node471":"test",
"Node476":"test",
"Node491":"test",
"Node498":"test",
"Node505":"test",
"Node515":"test",
"Node524":"test",
"Node525":"test",
"Node548":"test",
"Node559":"test",
"Node562":"test",
"Node572":"test",
"Node573":"test",
"Node578":"test",
"Node595":"test",
"Node596":"test",
"Node632":"test",
"Node633":"test",
"Node642":"test",
"Node643":"test",
"Node648":"test",
"Node649":"test",
"Node65":"test",
"Node668":"test",
"Node671":"test",
"Node675":"test",
"Node678":"test",
"Node679":"test",
"Node683":"test",
"Node684":"test",
"Node689":"test",
"Node698":"test",
"Node703":"test",
"Node704":"test",
"Node708":"test",
"Node709":"test",
"Node715":"test",
"Node729":"test",
"Node73":"test",
"Node732":"test",
"Node737":"test",
"Node738":"test",
"Node750":"test",
"Node751":"test",
"Node759":"test",
"Node762":"test",
"Node763":"test",
"Node771":"test",
"Node783":"test",
"Node787":"test",
"Node810":"test",
"Node817":"test",
"Node82":"test",
"Node824":"test",
"Node825":"test",
"Node83":"test",
"Node835":"test",
"Node836":"test",
"Node840":"test",
"Node841":"test",
"Node848":"test",
"Node860":"test",
"Node861":"test",
"Node870":"test",
"Node882":"test",
"Node883":"test",
"Node890":"test",
"Node891":"test",
"Node900":"test",
"Node916":"test",
"Node942":"test",
"Node943":"test",
"Node955":"test",
"Node97":"test",
"Node989":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":"test",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":"test",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":"test",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":"test",
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":"test",
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_442224_England_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_442625_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443412_England_20200416_null_4":"test",
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":"test",
"epi_isl_443657_England_20200413_null_7":"test",
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443680_England_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":"test",
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":"test",
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_448334_England_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":"test",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":"test",
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_449700_England_20200416_null_3":"test",
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":"test",
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3":"test",
"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_452365_Andalusia_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9":"test",
"epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_452577_Andalusia_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_452598_Andalusia_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_452954_England_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_453286_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_453570_England_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_453618_England_20200505_null_7":"test",
"epi_isl_453815_Portugal_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11":"test",
"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_454614_California_20200429_null_4":"test",
"epi_isl_454626_California_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_454653_California_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3":"test",
"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54":"test",
"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_456599_Timor_Leste_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4":"test",
"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1":"test",
"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6":"test",
"epi_isl_456688_England_20200518_null_7":"test",
"epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49":"test",
"epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4":"test",
"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7":"test",
"epi_isl_457288_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_457312_England_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_457384_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_457474_England_20200508_null_3":"test",
"epi_isl_457519_England_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_457554_England_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6":"test",
"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1":"test",
"epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18":"test",
"epi_isl_458267_California_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_458280_California_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_458314_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_458364_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458476_England_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_458498_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_458506_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458741_England_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_458747_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458756_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458849_England_20200420_null_7":"test",
"epi_isl_458970_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459024_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459045_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_459072_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459080_England_20200411_null_8":"test",
"epi_isl_459156_Scotland_20200406_null_11":"test",
"epi_isl_459173_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_459208_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_459241_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_459311_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_459493_England_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12":"test",
"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_459686_Scotland_20200324_null_9":"test",
"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_460323_Massachusetts_20200408_null_12":"test",
"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8":"test",
"epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6":"test",
"epi_isl_460601_Michigan_20200503_null_7":"test",
"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4":"test",
"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6":"test",
"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_461149_Noord_Brabant_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19":"test",
"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5":"test",
"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_461542_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_461567_England_20200525_null_4":"test",
"epi_isl_461587_England_20200530_null_1":"test",
"epi_isl_461588_England_20200528_null_36":"test",
"epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41":"test",
"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22":"test",
"epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_461894_England_20200515_null_2":"test",
"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8":"test",
"epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11":"test",
"epi_isl_462280_Singapore_20200319_null_17":"test",
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8":"test",
"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_462363_Singapore_20200407_null_74":"test",
"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_462403_Singapore_20200414_null_6":"test",
"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10":"test",
"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2":"test",
"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11":"test",
"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3":"test",
"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31":"test",
"epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7":"test",
"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_464029_Ontario_20200427_null_6":"test",
"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_464271_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_464336_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_464350_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_464453_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_464508_England_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_464541_England_20200304_null_4":"test",
"epi_isl_464561_England_20200304_null_19":"test",
"epi_isl_464610_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464625_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464633_England_20200308_null_26":"test",
"epi_isl_464634_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464659_England_20200309_null_9":"test",
"epi_isl_464759_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_464932_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_465108_England_20200314_null_9":"test",
"epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6":"test",
"epi_isl_465165_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465213_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_465222_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_465251_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_465252_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465258_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465261_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465270_England_20200419_null_18":"test",
"epi_isl_465271_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465303_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_465333_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_465352_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465390_England_20200421_null_33":"test",
"epi_isl_465392_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465403_England_20200420_null_6":"test",
"epi_isl_465408_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465429_England_20200423_null_4":"test",
"epi_isl_465465_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_465477_England_20200429_null_16":"test",
"epi_isl_465516_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_465529_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465540_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_465545_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465551_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_465558_England_20200502_null_7":"test",
"epi_isl_465571_England_20200501_null_26":"test",
"epi_isl_465573_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465578_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_465604_England_20200504_null_2":"test",
"epi_isl_465632_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_465643_England_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_465645_England_20200506_null_9":"test",
"epi_isl_465675_England_20200518_null_1":"test",
"epi_isl_465712_England_20200430_null_3":"test",
"epi_isl_465716_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465719_England_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_465781_England_20200318_null_18":"test",
"epi_isl_465831_England_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_465833_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_465840_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_465850_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_465851_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_465882_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_465894_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_465905_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465917_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465918_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465958_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465968_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465974_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_466007_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_466013_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466031_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466037_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_466123_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_466197_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_466202_England_20200402_null_7":"test",
"epi_isl_466240_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_466242_England_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_466283_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466285_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_466287_England_20200407_null_26":"test",
"epi_isl_466288_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466304_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466337_England_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_466352_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466358_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466368_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466373_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466384_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466399_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466400_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_466411_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466416_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466428_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466461_England_20200415_null_25":"test",
"epi_isl_466477_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466515_England_20200414_null_37":"test",
"epi_isl_466542_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466544_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466561_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_466567_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466607_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466609_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466628_Narayanganj_20200601_null_32":"test",
"epi_isl_466665_Nebraska_20200504_null_2":"test",
"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25":"test",
"epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21":"test",
"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2":"test",
"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12":"test",
"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51":"test",
"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1":"test",
"epi_isl_467307_British_Columbia_20200401_null_14":"test",
"epi_isl_467344_Rio_de_Janeiro_20200402_null_9":"test",
"epi_isl_467413_New_York_20200318_null_35":"test",
"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_467478_KZN_20200513_null_44":"test",
"epi_isl_467506_KZN_20200601_null_16":"test",
"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_467784_Virginia_20200418_null_141":"test",
"epi_isl_467843_California_20200315_null_7":"test",
"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_467865_Massachusetts_20200315_null_379":"test",
"epi_isl_467961_San_Diego_20200319_null_8":"test",
"epi_isl_467999_South_Australia_20200331_null_720":"test",
"epi_isl_468000_South_Australia_20200315_null_300":"test",
"epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_468038_South_Australia_20200304_null_32":"test",
"epi_isl_468040_South_Australia_20200401_null_30":"test",
"epi_isl_468074_Chittagong_20200517_null_372":"test",
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3":"test",
"epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12":"test",
"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_468162_Islamabad_20200602_null_41290":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":28
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":9
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":38
}
}
}