{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103744033970569],
[266.1042564661722, 621.0731768228771, 0, 2, 0.2999447985051186, 0, 0.003220232453494569, 0.007990137532190886, 0.4900772851400391, 1, 0.002209768303956688],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.00110355755910875],
[266.0040890847432, 621.1733442043061, 1, 0, 0.2998318928137986, 0.003759340705779231, 0, -0.009327789128062172, 1, 0.2998318928137986, 0.001104336668539214],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104053225038803],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103826683235889],
[266.1784618995558, 621.0837302706008, 0, 1, 0.2999997793758227, 0, 0.001610088867670561, 0.003995000881932133, 0.7000002206241773, 1, 0.001103743596582628],
[266.21027138099, 621.4249851448606, 0, 1, 0.2999095286310737, 0, 0.001609204689069413, 0.003992807031417234, 0.7000904713689262, 1, 0.00110384171057528],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.2649392946704, 1, 0, 0.2999636138324545, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.2999636138324545, 0.001103736040474671],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103269160197248],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103558615953502],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999610874127955, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.2649392946704, 1, 0, 0.2999636138324545, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.2999636138324545, 0.00110347624415477],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510399814004],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106326066725965],
[265.9983111555446, 621.5310000596784, 0, 1, 0.2997065086124698, 0, 0.001608930206062098, 0.003992125975931217, 0.7002934913875303, 1, 0.001104484847185468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103736040474671],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001103269160197248],
[266.3162862958079, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3001371968529252, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6998628031470748, 1, 0.001103558615953502],
[266.4515936401086, 620.8952878069648, 1, 0, 0.3002789542749989, 0.003753026905707616, 0, -0.009312123137593621, 1, 0.3002789542749988, 0.001103673160487869],
[266.178554759387, 621.1366100660833, 0, 1, 0.29998197406188, 0, 0.001609951794491085, 0.003994660771840141, 0.70001802593812, 1, 0.00110672281825805],
[266.21027138099, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000151705445542, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999848294554458, 1, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1366100660833, 0, 1, 0.3000069949497742, 0, 0.001609951794491085, 0.003994660771840141, 0.6999930050502259, 1, 0.001106723419264677],
[266.2021091025952, 621.2190010335026, 1, 0, 0.2999727029952776, 0.003756544241407932, 0, -0.009320850456629831, 1, 0.2999727029952776, 0.001104336066850628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2420808624243, 621.1260566183598, 0, 1, 0.3000356555716311, 0, 0.001609979148909595, 0.003994728644445354, 0.699964344428369, 1, 0.001104156743208304],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001103179053169658],
[265.9949276572, 621.3202371682702, 1, 0, 0.2997750271849797, 0.003759470185419273, 0, -0.009328110396835931, 1, 0.2997750271849797, 0.001104639643313112],
[266.0667088984634, 621.2484559270069, 0, 1, 0.2998559243048631, 0, 0.001609661948387191, 0.003993941596977231, 0.7001440756951369, 1, 0.001104066995773224],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104155737302012],
[265.8630270668848, 621.4521377585854, 1, 0, 0.2996263758426562, 0.003761335342610177, 0, -0.009332738280906321, 1, 0.2996263758426563, 0.001104901531921938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103945607426433],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679471533],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103795866775229],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104053225287349],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104336668539214],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103826682966977],
[265.7102713809901, 621.6048934444802, 0, 1, 0.2994542209061126, 0, 0.00160873894421701, 0.003991651411293731, 0.7005457790938874, 1, 0.001104209087441765],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665303, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334697, 1, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.2109083592982, 0, 1, 0.299981877217421, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700018122782579, 1, 0.001103680974844395],
[266.1751314181183, 621.140033407352, 1, 0, 0.2999781159724385, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999781159724385, 0.001103680973089149],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104024290573677],
[266.1443210858325, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999433928734684, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000566071265315, 1, 0.001104018228954726],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104209087421651],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103673396886669],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104005398608921],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103680973089149],
[266.4515936401086, 620.8952878069647, 1, 0, 0.300278954274999, 0.003753026905707616, 0, -0.009312123137593621, 1, 0.300278954274999, 0.001103510399814004],
[266.2178072636028, 621.0973575618675, 0, 1, 0.300026211448743, 0, 0.001610053541244361, 0.003994913228941879, 0.6999737885512569, 1, 0.001103648426170733],
[266.2178072636028, 621.0973575618675, 0, 1, 0.300026211448743, 0, 0.001610053541244361, 0.003994913228941879, 0.6999737885512569, 1, 0.001103695903656611],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510399814004],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106574921358573],
[266.0783707906749, 621.2367940347955, 0, 1, 0.2998690672023068, 0, 0.001609692165052268, 0.003994016571474637, 0.7001309327976932, 1, 0.001104880638810995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1443210858324, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999433928734684, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000566071265316, 1, 0.001104175125681025],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103972655994127],
[267.1443210858325, 620.1708437396379, 0, 3, 0.3010703881505036, 0, 0.004837376716889757, 0.01200264447401091, 0.3414289342270476, 1, 0.003325983216202689],
[265.9348083081481, 621.3803565173222, 0, 1, 0.2997072729625397, 0, 0.001609320264973846, 0.00399309380182439, 0.7002927270374604, 1, 0.00110475213128076],
[265.8996683452764, 621.4154964801938, 1, 0, 0.2996676703903481, 0.00376081702629835, 0, -0.009331452218897912, 1, 0.2996676703903481, 0.001104302113433575],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001103530724705691],
[265.9289773620424, 621.2426249809012, 0, 1, 0.2997491992076245, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7002508007923756, 1, 0.001104789425132523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999610874127955, 0.001104169391343402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1418206211641, 621.013298354116, 0, 1, 0.2999946851781395, 0, 0.001610271475104189, 0.003995453972983835, 0.7000053148218605, 1, 0.00110531866895781],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104172816685826],
[266.0733698613383, 620.9217032637517, 0, 1, 0.2999716434995517, 0, 0.001610509013847798, 0.003996043361252563, 0.7000283565004484, 1, 0.001104636862453568],
[266.2111013977592, 620.7839717273308, 0, 1, 0.3001269223061584, 0, 0.001610866332804149, 0.003996929951784562, 0.6998730776938415, 1, 0.001104623042105751],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1418206211641, 621.013298354116, 0, 1, 0.2999946851781395, 0, 0.001610271475104189, 0.003995453972983835, 0.7000053148218605, 1, 0.001104960624316258],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103698773350168],
[265.8446724359736, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7003943097396925, 1, 0.001103826683235889],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001103528088442727],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104024290381348],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104018231225108],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510526362876],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103983373688028],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103256066547491],
[266.1784618995558, 620.9236844204105, 0, 2, 0.3000539036048602, 0, 0.003221007750520682, 0.007992061222469897, 0.4899245378587944, 1, 0.002228915270874067],
[266.1751314181184, 621.140033407352, 1, 0, 0.2999781159724385, 0.003756924978949895, 0, -0.009321795154060186, 1, 0.2999781159724385, 0.001103680974844395],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103558615953502],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001106723813758005],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104336668539214],
[266.0315689355917, 621.3365685451924, 1, 0, 0.2997984237870526, 0.0037589523829862, 0, -0.009326825609878931, 1, 0.2997984237870526, 0.001104158891629421],
[266.0667088984634, 621.2484559270069, 1, 0, 0.2998559243048631, 0.003758455930620094, 0, -0.009325593797349664, 1, 0.2998559243048631, 0.001107315262512122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104218828729323],
[266.1751314181183, 621.1930060626657, 1, 0, 0.2999602083682911, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999602083682911, 0.00110417439370226],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104173191217339],
[266.1399914552467, 621.2811186808513, 0, 1, 0.2999027050578395, 0, 0.001609577323262732, 0.003993731622575421, 0.7000972949421604, 1, 0.001103191160217051],
[266.1399914552467, 621.2811186808513, 1, 0, 0.2999027050578395, 0.003757421026926564, 0, -0.00932302596320623, 1, 0.2999027050578396, 0.001103119433428153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1751314181183, 621.1930060626657, 1, 0, 0.2999602083682911, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999602083682911, 0.001103397367736745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[267.1751314181183, 620.1930060626657, 1, 0, 0.3010871363678009, 0.003742863322241771, 0, -0.009286904948880605, 1, 0.3010871363678009, 0.001103277845592429],
[266.71027138099, 620.6048934444802, 0, 1, 0.3005812161831478, 0, 0.00161133115539873, 0.00399808328357424, 0.6994187838168522, 1, 0.001103675309713574],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209087421651],
[266.1384901397267, 621.2033724766853, 1, 0, 0.2999277971119181, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999277971119181, 0.001104336668539214],
[266.2420808624243, 621.1260566183598, 0, 1, 0.3000356555716311, 0, 0.001609979148909595, 0.003994728644445354, 0.699964344428369, 1, 0.001104005398838592],
[266.3020924052707, 621.0130724201997, 0, 2, 0.3001212004053269, 0, 0.003220544121890446, 0.007990910853180429, 0.4898303341220807, 1, 0.002208762654527724],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1751314181183, 621.140033407352, 1, 0, 0.2999781159724385, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999781159724385, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110367351434356],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104005398838592],
[266.2787221408159, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2999481360078677, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7000518639921323, 1, 0.001104119448556691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104066845842475],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103510525394232],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209748548839],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104005398594313],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103673160487869],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103528090028311],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209747614221],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104005398608921],
[266.4030868485183, 620.912077976952, 0, 1, 0.3002350206658738, 0, 0.001610533979719299, 0.003996105307323159, 0.6997649793341262, 1, 0.001103119889908955],
[266.71027138099, 620.6048934444804, 0, 1, 0.3005812161831476, 0, 0.00161133115539873, 0.003998083283574239, 0.6994187838168524, 1, 0.001103510524678093],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209509807935],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665302, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334698, 1, 0.001104005398838592],
[266.1751314181184, 621.1400334073519, 1, 0, 0.2999781159724386, 0.003756924978949895, 0, -0.009321795154060186, 1, 0.2999781159724386, 0.001103119889908955],
[266.0758703260066, 621.2392944994638, 0, 1, 0.2998662491904352, 0, 0.001609685686102174, 0.00399400049570897, 0.7001337508095649, 1, 0.001103680973180388],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103866100115021],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103222915088252],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510399814004],
[265.9348083081481, 621.316923274116, 0, 1, 0.2997287002572519, 0, 0.001609484568246364, 0.003993501476041506, 0.700271299742748, 1, 0.001104833113441346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665303, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334697, 1, 0.001103777574309755],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104106633921943],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103558615231814],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001103673396886669],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679451566],
[266.1443210858324, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999433928734684, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000566071265316, 1, 0.001104209747614221],
[266.4381387895856, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3003211407235806, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6996788592764194, 1, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103119889908955],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510526362876],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001112419243546117],
[265.9699482710199, 621.3452165544504, 1, 0, 0.2997468755347313, 0.003759823267631023, 0, -0.009328986475029909, 1, 0.2997468755347313, 0.001104402517508103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104067743072021],
[266.1018488613351, 621.2133159641352, 1, 0, 0.2998955268770548, 0.003757959609371587, 0, -0.009324362310153324, 1, 0.2998955268770548, 0.001104701647449259],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104062875205308],
[266.2454113438617, 621.0697534816086, 1, 0, 0.3000573211168217, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000573211168217, 0.001103992980582988],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510524669735],
[266.21027138099, 621.1124293270931, 1, 0, 0.3000151705445542, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000151705445542, 0.001103795866876635],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104005398594313],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104336668540128],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001103826683235889],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209090773394],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106210863164082],
[266.2454113438617, 621.0697534816086, 1, 0, 0.3000573211168217, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000573211168217, 0.001104138630663356],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103680974844395],
[266.1117923487849, 621.2033724766853, 1, 0, 0.299906733140448, 0.00375781919009936, 0, -0.009324013897635448, 1, 0.299906733140448, 0.001104209090773394],
[265.7983839991756, 621.5167808262948, 0, 1, 0.2995535234106548, 0, 0.001608967015613832, 0.003992217308897116, 0.7004464765893452, 1, 0.001104005398594313],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103673396886669],
[266.1751314181183, 621.2460483221698, 1, 0, 0.2999422793763125, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999422793763125, 0.001103680974844395],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103743596569122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.9907056687415, 621.3244591567288, 0, 1, 0.2997702690239272, 0, 0.00160946504722704, 0.003993453039901749, 0.7002297309760728, 1, 0.00110488801299251],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104174621953373],
[266.0591730158506, 621.2559918096198, 0, 1, 0.2998474314007502, 0, 0.001609642423064861, 0.003993893150160727, 0.7001525685992498, 1, 0.00110491150589301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104062875205308],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001104063084503419],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510525394232],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209748548839],
[266.21027138099, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3000642953620493, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6999357046379507, 1, 0.001104005398594313],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104336668539214],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510524678093],
[266.2454113438617, 621.0697534816086, 1, 0, 0.3000573211168217, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000573211168217, 0.001104022517769118],
[266.4698554111886, 620.8453094142817, 1, 0, 0.3003102685206577, 0.003752769702437462, 0, -0.00931148495711071, 1, 0.3003102685206577, 0.001106210863384361],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104336668816243],
[266.71027138099, 620.6048934444802, 0, 1, 0.3005812161831478, 0, 0.00161133115539873, 0.00399808328357424, 0.6994187838168522, 1, 0.001103680973802299],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104023174161756],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103680973180388],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104118548857927],
[266.0007586033058, 621.2509729789584, 0, 1, 0.2998030312422588, 0, 0.00160965542670284, 0.003993925415178042, 0.7001969687577412, 1, 0.001104183881369875],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665303, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334697, 1, 0.001104582986394629],
[266.2762216761477, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000920442157918, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.6999079557842082, 1, 0.00110343233561639],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103680973180388],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104209509807935],
[267.1443210858324, 620.1708437396379, 0, 1, 0.3010703881505036, 0, 0.001612458905629919, 0.004000881491336969, 0.6989296118494964, 1, 0.00110347624415477],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110367339790854],
[266.21027138099, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3000535684373849, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6999464315626152, 1, 0.001103527452983841],
[266.1288429813203, 621.1333491888362, 0, 1, 0.2999438557506831, 0, 0.001609960246549218, 0.003994681743340766, 0.7000561442493169, 1, 0.001104022517769118],
[266.2420808624243, 621.5071336678884, 0, 1, 0.2999068616504344, 0, 0.001608991990322616, 0.003992279276895044, 0.7000931383495657, 1, 0.001104005398594313],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999610874127955, 0.001104336668816243],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510399814004],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001103528088442727],
[266.0758703260066, 621.0792486492736, 0, 1, 0.2999203460983699, 0, 0.001610100485847507, 0.003995029709301898, 0.7000796539016301, 1, 0.001106574921358573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.9949276572, 621.3202371682702, 1, 0, 0.2997750271849797, 0.003759470185419273, 0, -0.009328110396835931, 1, 0.2997750271849797, 0.001104887978593235],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104286952643879],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104088072792492],
[266.4030868485184, 620.912077976952, 0, 1, 0.3002350206658739, 0, 0.001610533979719299, 0.003996105307323159, 0.6997649793341261, 1, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106722818294972],
[266.9406392542539, 620.3745255712164, 0, 1, 0.3008408396882967, 0, 0.001611929501907319, 0.003999567918911774, 0.6991591603117033, 1, 0.001104716841595064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.6443210858325, 620.6708437396379, 0, 1, 0.300506890511986, 0, 0.001611159941032263, 0.003997658461343139, 0.6994931094880139, 1, 0.001103809908331287],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.3413419545361, 621.9738228709342, 0, 1, 0.2990384391849397, 0, 0.001607784706089648, 0.00398928372697709, 0.7009615608150603, 1, 0.001104716838804479],
[265.8446724359736, 621.4704923894968, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.003992514657686559, 0.7003943097396925, 1, 0.001103773521435028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104716832423373],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104186928356046],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103369778454472],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.00110379965113081],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104717292169603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104174648472764],
[265.8663575483223, 621.2887614269579, 0, 1, 0.2996841835905931, 0, 0.001609557523144679, 0.003993682493927514, 0.700315816409407, 1, 0.001105208156144527],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1626757167437, 621.0147575723057, 0, 1, 0.3000106469457793, 0, 0.001610267691397927, 0.003995444584738158, 0.6999893530542207, 1, 0.00110454429963561],
[265.9348083081481, 621.5404023675122, 1, 0, 0.2996532242356205, 0.003760320081308289, 0, -0.009330219184055286, 1, 0.2996532242356205, 0.001103528090028311],
[265.9348083081481, 621.3803565173222, 1, 0, 0.2997072729625397, 0.003760320081308289, 0, -0.009330219184055286, 1, 0.2997072729625396, 0.001103975141398752],
[265.9348083081481, 621.3803565173222, 1, 0, 0.2997072729625397, 0.003760320081308289, 0, -0.009330219184055286, 1, 0.2997072729625396, 0.001103975377088437],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001103672556321043],
[266.0725398445691, 621.110724390586, 0, 1, 0.2999070773432043, 0, 0.00161001889152883, 0.003994827255026473, 0.7000929226567957, 1, 0.001104716830465091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001103352304276456],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104185965409892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104352961757169],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104026745516629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.632659193621, 621.6825056318493, 1, 0, 0.2993667523375073, 0.003764597331652261, 0, -0.009340832026140913, 1, 0.2993667523375072, 0.001104574522206272],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104179888671717],
[265.2044404348843, 622.1107243905859, 0, 1, 0.2988841518188732, 0, 0.001607430897417162, 0.0039884058462669, 0.7011158481811268, 1, 0.001104183586059032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.7762216761477, 621.5389431493226, 1, 0, 0.2995285465772743, 0.003762563835445426, 0, -0.009335786454245577, 1, 0.2995285465772743, 0.001103734610325274],
[266.0516847489896, 621.2634800764807, 1, 0, 0.2998389921593647, 0.003758668173604932, 0, -0.009326120421021584, 1, 0.2998389921593647, 0.00110373577498899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103990844295864],
[266.2353966439085, 621.1857134921893, 0, 1, 0.3000102134183824, 0, 0.001609824531182773, 0.003994345002295272, 0.6999897865816176, 1, 0.001103602173037327],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103693418044288],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001104339691292625],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103778810139264],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001104158440578173],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103691464404111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.8670475435375, 0, 1, 0.2997602412629723, 0, 0.001608060764676535, 0.003989968691838484, 0.7002397587370277, 1, 0.001105371861137723],
[266.21027138099, 621.4859704940089, 0, 1, 0.2998889246378903, 0, 0.001609046780581574, 0.003992415224132027, 0.7001110753621097, 1, 0.001104340351576177],
[266.2295656978028, 621.1915444382951, 0, 1, 0.3000036427541969, 0, 0.001609809420223577, 0.003994307508529226, 0.699996357245803, 1, 0.00110370722880871],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1481372981331, 621.220000182651, 0, 1, 0.2999297879386576, 0, 0.00160973568092782, 0.003994124544372715, 0.7000702120613425, 1, 0.001104209759103029],
[266.0985183798977, 621.650696150415, 0, 1, 0.2997451465171773, 0, 0.001608620413670444, 0.003991357309739727, 0.7002548534828227, 1, 0.001104691852067062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103772305077626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.5942249569178, 620.5773773860259, 1, 0, 0.3004990514268778, 0.003751018988358064, 0, -0.009307141032727626, 1, 0.3004990514268777, 0.001104328535889831],
[266.4381387895856, 620.8052447946213, 0, 1, 0.3002988173473354, 0, 0.001610811133418865, 0.003996792989411043, 0.6997011826526646, 1, 0.00110398156898007],
[266.71027138099, 620.6048934444802, 0, 1, 0.3005812161831478, 0, 0.00161133115539873, 0.00399808328357424, 0.6994187838168522, 1, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209090773394],
[265.8798123988453, 621.4670690482282, 0, 1, 0.2996345825493318, 0, 0.001609095718509256, 0.003992536650388786, 0.7003654174506682, 1, 0.001104005398608921],
[266.2454113438617, 621.0167808262947, 1, 0, 0.3000752355880865, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000752355880865, 0.001104138631041672],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001103510526362876],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103795868535227],
[266.7787221408159, 620.9704923894968, 0, 1, 0.3005113581339098, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509545, 0.6994886418660902, 1, 0.001106210863384361],
[266.2762216761477, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000920442157918, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.6999079557842082, 1, 0.001103119775089491],
[266.3585751246121, 620.9565897008583, 0, 2, 0.3001848561632587, 0, 0.003220837065218177, 0.007991637712968196, 0.4897412355432388, 1, 0.002208614952123773],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103719018280343],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103558494156733],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103826679451566],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209747614221],
[266.21027138099, 621.1633078570251, 0, 1, 0.2999979688482318, 0, 0.001609882598265403, 0.00399448908008562, 0.7000020311517682, 1, 0.001106723809110711],
[266.3087504131951, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001287039488123, 0.003755039961880471, 0, -0.009317117993062419, 1, 0.3001287039488123, 0.001103673160487869],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103528088442727],
[266.2853831036908, 620.8697358715893, 0, 1, 0.3001565086061467, 0, 0.001610643814996362, 0.003996377833913178, 0.6998434913938533, 1, 0.001103866100115021],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2820526222534, 621.033112203217, 1, 0, 0.3000986156645136, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645136, 0.001103222913931469],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510526362876],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103510524678093],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209090773394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 2, 0.3000177185446302, 0, 0.003220068012841663, 0.007989729517101423, 0.4899751943514645, 1, 0.002208206826520212],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103595719895287],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999610874127955, 0.001104336668816243],
[266.21027138099, 621.2109083592982, 0, 1, 0.299981877217421, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700018122782579, 1, 0.001103680973180388],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999610874127955, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104032706179084],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103668601052905],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103680974844395],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103527452983841],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.001104032706209182],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001103668601052905],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510524669735],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001103510524678093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001103699966137325],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001104012946588387],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110368073842186],
[266.21027138099, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3000642953620493, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6999357046379507, 1, 0.001104209087421651],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510399814004],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0491663829965, 621.2659984424738, 1, 0, 0.2998361539727847, 0.003758703752374963, 0, -0.009326208700134933, 1, 0.2998361539727847, 0.001104082831073084],
[266.3087504131951, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001287039488123, 0.003755039961880471, 0, -0.009317117993062419, 1, 0.3001287039488123, 0.001103501561367417],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103510399814004],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103827059873299],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.0731768228773, 0, 1, 0.3000284429061321, 0, 0.001610116226747284, 0.003995068766095443, 0.6999715570938678, 1, 0.001104053225038803],
[266.2454113438617, 621.0167808262948, 1, 0, 0.3000752355880864, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000752355880865, 0.001104138630663356],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104024437923284],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.001104018231225108],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103527852974794],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104032823999294],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001103657562439005],
[266.21027138099, 621.5389431493227, 1, 0, 0.299871030042911, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.299871030042911, 0.001103680736666613],
[266.21027138099, 621.2649392946704, 1, 0, 0.2999636138324545, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.2999636138324545, 0.001103680973180388],
[266.21027138099, 621.1366100660833, 0, 1, 0.3000069949497742, 0, 0.001609951794491085, 0.003994660771840141, 0.6999930050502259, 1, 0.001104024290381348],
[266.21027138099, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3000535684373849, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6999464315626152, 1, 0.001104018231225108],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104209747614221],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103673397917008],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104005398594313],
[265.8446724359736, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7003943097396925, 1, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209509807935],
[266.4381387895856, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3003211407235806, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6996788592764194, 1, 0.001104005398594313],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.001103119889908955],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510399814004],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103826683235889],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104629839128911],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104205413198038],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103680974844395],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103826682966977],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104629839128911],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104205413198038],
[266.4164536772369, 621.0364426846544, 1, 0, 0.3002034865956377, 0.003753521924781336, 0, -0.009313351393794751, 1, 0.3002034865956378, 0.001103510399814004],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.6476515672699, 620.5297817217795, 0, 1, 0.3005572972913909, 0, 0.001611526198187148, 0.003998567229601934, 0.6994427027086092, 1, 0.001104082872131971],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103501926773745],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103680974844395],
[266.4381387895856, 620.8052447946214, 0, 1, 0.3002988173473353, 0, 0.001610811133418865, 0.003996792989411043, 0.6997011826526647, 1, 0.001104209087421651],
[266.1384901397267, 621.2033724766853, 1, 0, 0.2999277971119181, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999277971119181, 0.001103826682966977],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104023174161756],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110347624415477],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103119889004086],
[265.8446724359736, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7003943097396925, 1, 0.001103826679451566],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103673396886669],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104005398594313],
[266.0040890847432, 621.1733442043062, 1, 0, 0.2998318928137986, 0.003759340705779231, 0, -0.009327789128062172, 1, 0.2998318928137986, 0.001104209748548839],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106210863164082],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103119775089491],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103528090132954],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104209509700497],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104053225038803],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104336668816243],
[265.8446724359736, 621.4704923894968, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.003992514657686559, 0.7003943097396925, 1, 0.001103528088442727],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103510526362876],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001103749620222971],
[266.5040890847432, 620.6733442043062, 0, 1, 0.3003954779335715, 0, 0.00161115345026132, 0.003997642356247227, 0.6996045220664285, 1, 0.001104740997633655],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103795514287841],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103476244143799],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104336668539214],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103680973180388],
[266.0175439352662, 621.2709230992623, 0, 1, 0.2998095363781103, 0, 0.001609603737788686, 0.003993797163090981, 0.7001904636218896, 1, 0.001103558494156733],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103673160487869],
[266.21027138099, 621.0464790319354, 0, 1, 0.300037470841554, 0, 0.001610185443058567, 0.003995240507686961, 0.699962529158446, 1, 0.001104053225287349],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.0011035095059244],
[266.4030868485184, 620.912077976952, 0, 2, 0.3002350206658739, 0, 0.003221067959438597, 0.007992210614646318, 0.4896710263024899, 1, 0.002208312450254424],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104131565965844],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110355861427812],
[266.21027138099, 620.8308895898281, 0, 1, 0.3001103929491135, 0, 0.001610744595296607, 0.003996627893022612, 0.6998896070508864, 1, 0.001112987492058855],
[266.2820526222534, 621.033112203217, 1, 0, 0.3000986156645136, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645136, 0.00110367351434356],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103680973089149],
[266.1751314181183, 621.2460483221698, 1, 0, 0.2999422793763125, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999422793763125, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001106210863164082],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103826682966977],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104209087421651],
[266.2419880025931, 621.0731768228771, 0, 1, 0.3000534630273803, 0, 0.001610116226747285, 0.003995068766095443, 0.6999465369726197, 1, 0.001104005398838592],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104138630663356],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103510524678093],
[266.1751314181184, 621.2460483221698, 1, 0, 0.2999422793763126, 0.003756924978949895, 0, -0.009321795154060186, 1, 0.2999422793763126, 0.001103795514287841],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104005398838592],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103119890011099],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.0011035095059244],
[266.316286295808, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3001371968529252, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6998628031470748, 1, 0.001103795514287841],
[266.21027138099, 621.4859704940088, 0, 1, 0.2998889246378904, 0, 0.001609046780581574, 0.003992415224132028, 0.7001110753621096, 1, 0.001104724661854429],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103119890011099],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.00110355861427812],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.00110413903542436],
[266.2420808624243, 621.1260566183598, 0, 1, 0.3000356555716311, 0, 0.001609979148909595, 0.003994728644445354, 0.699964344428369, 1, 0.001104005398594313],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103680973080737],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 2, 0.3000177185446302, 0, 0.003220068012841663, 0.007989729517101423, 0.4899751943514645, 1, 0.002208808240148407],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001103826679471533]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1"],
["epi_isl_453654_England_20200513_null_1"],
["epi_isl_464973_England_20200312_null_10"],
["epi_isl_458278_California_20200420_null_2"],
["epi_isl_465925_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_442675_England_20200405_null_4"],
["epi_isl_442236_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1"],
["epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2"],
["Node666"],
["epi_isl_464916_England_20200310_null_8"],
["epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30"],
["epi_isl_458741_England_20200414_null_7"],
["epi_isl_465876_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_441017_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_447731_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1"],
["epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2"],
["Node680"],
["epi_isl_466605_England_20200416_null_13"],
["epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3"],
["epi_isl_458972_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1"],
["epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1"],
["epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1"],
["Node695"],
["epi_isl_465545_England_20200501_null_21"],
["epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6"],
["epi_isl_453454_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_459062_England_20200408_null_17"],
["Node700"],
["epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1"],
["epi_isl_463299_Louisiana_20200406_null_137"],
["Node705"],
["epi_isl_434184_Washington_20200328_null_1"],
["epi_isl_465241_England_20200419_null_18"],
["epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1"],
["epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3"],
["epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1"],
["epi_isl_463072_Odisha_20200514_null_4"],
["epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8"],
["epi_isl_460070_Minnesota_20200318_null_7"],
["epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1"],
["epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1"],
["epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1"],
["epi_isl_458273_California_20200414_null_3"],
["epi_isl_463052_Odisha_20200512_null_7"],
["epi_isl_458075_Telangana_20200415_null_1"],
["epi_isl_464535_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2"],
["epi_isl_445489_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_440906_England_20200421_null_2"],
["epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1"],
["epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1"],
["epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1"],
["epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2"],
["epi_isl_463123_Virginia_20200512_null_36"],
["Node422"],
["epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_38"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_457165_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1"],
["epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9"],
["Node426"],
["epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1"],
["epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12"],
["Node431"],
["epi_isl_453557_England_20200426_null_6"],
["epi_isl_456803_Scotland_20200505_null_2"],
["Node442"],
["epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1"],
["epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1"],
["epi_isl_461754_Scotland_20200426_null_244"],
["Node436"],
["epi_isl_456299_Southern_20200401_null_3"],
["epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1"],
["epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2"],
["epi_isl_443325_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_443412_England_20200416_null_6"],
["epi_isl_465438_England_20200427_null_1"],
["epi_isl_466551_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1"],
["epi_isl_461371_Zuid_Holland_20200428_null_41"],
["epi_isl_442526_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_457483_England_20200507_null_7"],
["epi_isl_442833_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1"],
["epi_isl_467216_Madrid_20200402_null_80"],
["Node459"],
["epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1"],
["epi_isl_463471_Washington_20200409_null_13"],
["Node456"],
["epi_isl_457371_England_20200428_null_1"],
["epi_isl_440058_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_466491_England_20200414_null_90"],
["Node448"],
["epi_isl_423704_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_441703_England_20200406_null_1"],
["Node453"],
["epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5"],
["epi_isl_457583_England_20200423_null_10"],
["epi_isl_466610_England_20200415_null_4"],
["epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1"],
["epi_isl_467588_New_Mexico_20200312_null_40304"],
["epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1"],
["epi_isl_457683_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_459607_Scotland_20200324_null_3"],
["epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3"],
["epi_isl_467384_New_York_20200510_null_101"],
["Node334"],
["epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1"],
["epi_isl_465996_England_20200326_null_8"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1"],
["epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4"],
["epi_isl_466417_England_20200408_null_9"],
["epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1"],
["epi_isl_434875_Texas_20200324_null_1"],
["epi_isl_465355_England_20200421_null_9"],
["epi_isl_444416_England_20200420_null_3"],
["epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1"],
["epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1"],
["epi_isl_443044_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2"],
["Node361"],
["epi_isl_453770_England_20200422_null_1"],
["epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1"],
["epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3"],
["epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6"],
["Node368"],
["epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3"],
["epi_isl_450111_New_York_20200313_null_4"],
["epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1"],
["epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3"],
["epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2"],
["epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1"],
["epi_isl_467335_British_Columbia_20200401_null_40"],
["epi_isl_440259_England_20200322_null_2"],
["epi_isl_455634_KZN_20200501_null_3"],
["epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1"],
["epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1"],
["epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1"],
["epi_isl_466838_British_Columbia_20200401_null_51"],
["Node301"],
["epi_isl_466222_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_466277_England_20200407_null_61"],
["Node297"],
["epi_isl_458861_England_20200419_null_6"],
["epi_isl_432915_England_20200328_null_3"],
["epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2"],
["epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1"],
["epi_isl_456050_New_York_20200326_null_3"],
["epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1"],
["epi_isl_467074_Andalusia_20200315_null_13"],
["epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5"],
["epi_isl_437584_California_20200315_null_1"],
["epi_isl_465600_England_20200430_null_1"],
["epi_isl_423428_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1"],
["epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3"],
["epi_isl_440734_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1"],
["Node272"],
["epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1"],
["epi_isl_466627_Narayanganj_20200601_null_15"],
["Node268"],
["epi_isl_463300_Louisiana_20200406_null_54"],
["epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_461689_Scotland_20200425_null_10"],
["epi_isl_449330_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_460404_Massachusetts_20200406_null_5"],
["epi_isl_447714_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_467187_Madrid_20200401_null_3"],
["epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2"],
["epi_isl_455106_Stockholm_20200511_null_19"],
["epi_isl_438598_England_20200421_null_5"],
["epi_isl_466189_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_6"],
["epi_isl_442984_England_20200407_null_7"],
["epi_isl_459589_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_442115_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_458525_England_20200507_null_12"],
["Node242"],
["epi_isl_433865_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_449118_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_467206_Madrid_20200401_null_15"],
["epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6"],
["epi_isl_461556_England_20200525_null_4"],
["epi_isl_437566_California_20200324_null_1"],
["epi_isl_466318_England_20200409_null_6"],
["epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_461139_Netherlands_20200420_null_2"],
["epi_isl_432926_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3"],
["epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1"],
["epi_isl_450642_Quebec_20200408_null_4"],
["epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1"],
["Node125"],
["epi_isl_465881_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4"],
["epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_466324_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_467568_New_Mexico_20200403_null_9"],
["Node168"],
["epi_isl_456021_New_York_20200327_null_2"],
["epi_isl_461542_England_20200101_null_2"],
["Node165"],
["epi_isl_461972_England_20200512_null_2"],
["epi_isl_465523_England_20200421_null_1"],
["Node162"],
["epi_isl_453622_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_457132_England_20200326_null_1"],
["Node159"],
["epi_isl_459621_Scotland_20200327_null_42"],
["epi_isl_464008_Ontario_20200428_null_26"],
["Node156"],
["epi_isl_466361_England_20200409_null_4"],
["epi_isl_467717_England_20200521_null_825"],
["epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1"],
["epi_isl_466613_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_459423_England_20200426_null_1"],
["epi_isl_465178_England_20200416_null_1"],
["Node142"],
["epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1"],
["epi_isl_466834_British_Columbia_20200401_null_61"],
["Node153"],
["epi_isl_457320_England_20200509_null_2"],
["epi_isl_459120_Scotland_20200406_null_7"],
["Node172"],
["epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7"],
["epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1"],
["Node184"],
["epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_465579_England_20200502_null_47"],
["Node178"],
["epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1"],
["epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4"],
["Node181"],
["epi_isl_462029_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_466805_British_Columbia_20200401_null_192"],
["Node190"],
["epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17"],
["epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1"],
["Node193"],
["epi_isl_462087_Singapore_20200328_null_8"],
["epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1"],
["Node197"],
["epi_isl_454650_Virgin_Islands_20200425_null_2"],
["epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1"],
["Node200"],
["epi_isl_420520_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_2"],
["Node208"],
["epi_isl_440996_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_467329_British_Columbia_20200401_null_134"],
["Node204"],
["epi_isl_461031_Limburg_20200320_null_7"],
["epi_isl_465264_England_20200419_null_1"],
["Node211"],
["epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1"],
["epi_isl_466430_England_20200410_null_51"],
["epi_isl_445762_Wales_20200412_null_1"],
["epi_isl_457093_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_440915_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_466486_England_20200414_null_29"],
["epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1"],
["epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1"],
["epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5"],
["epi_isl_449680_England_20200415_null_3"],
["Node491"],
["epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4"],
["epi_isl_444359_England_20200428_null_2"],
["epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_26"],
["epi_isl_443011_England_20200410_null_2"],
["epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1"],
["epi_isl_424003_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1"],
["Node506"],
["epi_isl_446853_Wales_20200415_null_1"],
["epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4"],
["epi_isl_464536_England_20200305_null_15"],
["epi_isl_442976_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1"],
["Node514"],
["epi_isl_451232_Louisiana_20200504_null_2"],
["epi_isl_433332_Scotland_20200326_null_9"],
["epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2"],
["epi_isl_459437_England_20200426_null_66"],
["epi_isl_461985_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_432565_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_453618_England_20200505_null_9"],
["epi_isl_458863_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_459046_England_20200410_null_3"],
["epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1"],
["epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_465177_England_20200418_null_19"],
["Node536"],
["epi_isl_444012_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_466450_England_20200414_null_5"],
["epi_isl_423766_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1"],
["Node543"],
["epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2"],
["epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1"],
["epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1"],
["epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1"],
["epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1"],
["epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3"],
["epi_isl_443341_England_20200413_null_2"],
["epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2"],
["epi_isl_465845_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_448986_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1"],
["epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1"],
["epi_isl_432938_England_20200328_null_4"],
["epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2"],
["epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1"],
["epi_isl_465619_England_20200505_null_11"],
["epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3"],
["epi_isl_462096_Dhaka_20200523_null_10"],
["epi_isl_453440_England_20200504_null_4"],
["epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_432893_Scotland_20200405_null_1"],
["epi_isl_453729_England_20200421_null_2"],
["epi_isl_446893_Wales_20200419_null_7"],
["epi_isl_459208_England_20200505_null_12"],
["epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4"],
["epi_isl_465848_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1"],
["epi_isl_457605_England_20200501_null_10"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_453275_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_465657_England_20200511_null_1"],
["Node597"],
["epi_isl_465662_England_20200514_null_15"],
["epi_isl_463229_British_Columbia_20200301_null_3"],
["epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4"],
["epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4"],
["epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1"],
["epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_2"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1"],
["epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7"],
["epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2"],
["epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1"],
["epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3"],
["epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1"],
["epi_isl_462467_Gorazde_20200326_null_5"],
["epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_461566_England_20200526_null_3"],
["epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4"],
["epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9"],
["epi_isl_454574_Istria_20200409_null_14"],
["epi_isl_458412_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_465209_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_457485_England_20200505_null_2"],
["epi_isl_462790_British_Columbia_20200301_null_12"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1"],
["epi_isl_457289_England_20200417_null_2"],
["epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1"],
["epi_isl_444143_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1"],
["epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2"],
["epi_isl_465390_England_20200421_null_5"],
["epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1"],
["epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4"],
["epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_466186_England_20200403_null_4"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_452471_Andalusia_20200306_null_2"],
["epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2"],
["epi_isl_465243_England_20200414_null_5"],
["epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1"],
["epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1"],
["epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1"],
["epi_isl_440142_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1"],
["epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1"],
["epi_isl_462042_England_20200418_null_5"],
["epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1"],
["epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2"],
["epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_457652_England_20200424_null_1"],
["epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1"],
["epi_isl_440327_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103744033970569],
[266.1042564661722, 621.0731768228771, 0, 2, 0.2999447985051186, 0, 0.003220232453494569, 0.007990137532190886, 0.4900772851400391, 1, 0.002209768303956688],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.00110355755910875],
[266.0040890847432, 621.1733442043061, 1, 0, 0.2998318928137986, 0.003759340705779231, 0, -0.009327789128062172, 1, 0.2998318928137986, 0.001104336668539214],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104053225038803],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103826683235889],
[266.1784618995558, 621.0837302706008, 0, 1, 0.2999997793758227, 0, 0.001610088867670561, 0.003995000881932133, 0.7000002206241773, 1, 0.001103743596582628],
[266.21027138099, 621.4249851448606, 0, 1, 0.2999095286310737, 0, 0.001609204689069413, 0.003992807031417234, 0.7000904713689262, 1, 0.00110384171057528],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.2649392946704, 1, 0, 0.2999636138324545, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.2999636138324545, 0.001103736040474671],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103269160197248],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103558615953502],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999610874127955, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.2649392946704, 1, 0, 0.2999636138324545, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.2999636138324545, 0.00110347624415477],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510399814004],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106326066725965],
[265.9983111555446, 621.5310000596784, 0, 1, 0.2997065086124698, 0, 0.001608930206062098, 0.003992125975931217, 0.7002934913875303, 1, 0.001104484847185468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103736040474671],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001103269160197248],
[266.3162862958079, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3001371968529252, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6998628031470748, 1, 0.001103558615953502],
[266.4515936401086, 620.8952878069648, 1, 0, 0.3002789542749989, 0.003753026905707616, 0, -0.009312123137593621, 1, 0.3002789542749988, 0.001103673160487869],
[266.178554759387, 621.1366100660833, 0, 1, 0.29998197406188, 0, 0.001609951794491085, 0.003994660771840141, 0.70001802593812, 1, 0.00110672281825805],
[266.21027138099, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000151705445542, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999848294554458, 1, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1366100660833, 0, 1, 0.3000069949497742, 0, 0.001609951794491085, 0.003994660771840141, 0.6999930050502259, 1, 0.001106723419264677],
[266.2021091025952, 621.2190010335026, 1, 0, 0.2999727029952776, 0.003756544241407932, 0, -0.009320850456629831, 1, 0.2999727029952776, 0.001104336066850628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2420808624243, 621.1260566183598, 0, 1, 0.3000356555716311, 0, 0.001609979148909595, 0.003994728644445354, 0.699964344428369, 1, 0.001104156743208304],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001103179053169658],
[265.9949276572, 621.3202371682702, 1, 0, 0.2997750271849797, 0.003759470185419273, 0, -0.009328110396835931, 1, 0.2997750271849797, 0.001104639643313112],
[266.0667088984634, 621.2484559270069, 0, 1, 0.2998559243048631, 0, 0.001609661948387191, 0.003993941596977231, 0.7001440756951369, 1, 0.001104066995773224],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104155737302012],
[265.8630270668848, 621.4521377585854, 1, 0, 0.2996263758426562, 0.003761335342610177, 0, -0.009332738280906321, 1, 0.2996263758426563, 0.001104901531921938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103945607426433],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679471533],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103795866775229],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104053225287349],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104336668539214],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103826682966977],
[265.7102713809901, 621.6048934444802, 0, 1, 0.2994542209061126, 0, 0.00160873894421701, 0.003991651411293731, 0.7005457790938874, 1, 0.001104209087441765],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665303, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334697, 1, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.2109083592982, 0, 1, 0.299981877217421, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700018122782579, 1, 0.001103680974844395],
[266.1751314181183, 621.140033407352, 1, 0, 0.2999781159724385, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999781159724385, 0.001103680973089149],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104024290573677],
[266.1443210858325, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999433928734684, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000566071265315, 1, 0.001104018228954726],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104209087421651],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103673396886669],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104005398608921],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103680973089149],
[266.4515936401086, 620.8952878069647, 1, 0, 0.300278954274999, 0.003753026905707616, 0, -0.009312123137593621, 1, 0.300278954274999, 0.001103510399814004],
[266.2178072636028, 621.0973575618675, 0, 1, 0.300026211448743, 0, 0.001610053541244361, 0.003994913228941879, 0.6999737885512569, 1, 0.001103648426170733],
[266.2178072636028, 621.0973575618675, 0, 1, 0.300026211448743, 0, 0.001610053541244361, 0.003994913228941879, 0.6999737885512569, 1, 0.001103695903656611],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510399814004],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106574921358573],
[266.0783707906749, 621.2367940347955, 0, 1, 0.2998690672023068, 0, 0.001609692165052268, 0.003994016571474637, 0.7001309327976932, 1, 0.001104880638810995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1443210858324, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999433928734684, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000566071265316, 1, 0.001104175125681025],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103972655994127],
[267.1443210858325, 620.1708437396379, 0, 3, 0.3010703881505036, 0, 0.004837376716889757, 0.01200264447401091, 0.3414289342270476, 1, 0.003325983216202689],
[265.9348083081481, 621.3803565173222, 0, 1, 0.2997072729625397, 0, 0.001609320264973846, 0.00399309380182439, 0.7002927270374604, 1, 0.00110475213128076],
[265.8996683452764, 621.4154964801938, 1, 0, 0.2996676703903481, 0.00376081702629835, 0, -0.009331452218897912, 1, 0.2996676703903481, 0.001104302113433575],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001103530724705691],
[265.9289773620424, 621.2426249809012, 0, 1, 0.2997491992076245, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7002508007923756, 1, 0.001104789425132523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999610874127955, 0.001104169391343402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1418206211641, 621.013298354116, 0, 1, 0.2999946851781395, 0, 0.001610271475104189, 0.003995453972983835, 0.7000053148218605, 1, 0.00110531866895781],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104172816685826],
[266.0733698613383, 620.9217032637517, 0, 1, 0.2999716434995517, 0, 0.001610509013847798, 0.003996043361252563, 0.7000283565004484, 1, 0.001104636862453568],
[266.2111013977592, 620.7839717273308, 0, 1, 0.3001269223061584, 0, 0.001610866332804149, 0.003996929951784562, 0.6998730776938415, 1, 0.001104623042105751],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1418206211641, 621.013298354116, 0, 1, 0.2999946851781395, 0, 0.001610271475104189, 0.003995453972983835, 0.7000053148218605, 1, 0.001104960624316258],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103698773350168],
[265.8446724359736, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7003943097396925, 1, 0.001103826683235889],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001103528088442727],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104024290381348],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104018231225108],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510526362876],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103983373688028],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103256066547491],
[266.1784618995558, 620.9236844204105, 0, 2, 0.3000539036048602, 0, 0.003221007750520682, 0.007992061222469897, 0.4899245378587944, 1, 0.002228915270874067],
[266.1751314181184, 621.140033407352, 1, 0, 0.2999781159724385, 0.003756924978949895, 0, -0.009321795154060186, 1, 0.2999781159724385, 0.001103680974844395],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103558615953502],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001106723813758005],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104336668539214],
[266.0315689355917, 621.3365685451924, 1, 0, 0.2997984237870526, 0.0037589523829862, 0, -0.009326825609878931, 1, 0.2997984237870526, 0.001104158891629421],
[266.0667088984634, 621.2484559270069, 1, 0, 0.2998559243048631, 0.003758455930620094, 0, -0.009325593797349664, 1, 0.2998559243048631, 0.001107315262512122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104218828729323],
[266.1751314181183, 621.1930060626657, 1, 0, 0.2999602083682911, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999602083682911, 0.00110417439370226],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104173191217339],
[266.1399914552467, 621.2811186808513, 0, 1, 0.2999027050578395, 0, 0.001609577323262732, 0.003993731622575421, 0.7000972949421604, 1, 0.001103191160217051],
[266.1399914552467, 621.2811186808513, 1, 0, 0.2999027050578395, 0.003757421026926564, 0, -0.00932302596320623, 1, 0.2999027050578396, 0.001103119433428153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1751314181183, 621.1930060626657, 1, 0, 0.2999602083682911, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999602083682911, 0.001103397367736745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[267.1751314181183, 620.1930060626657, 1, 0, 0.3010871363678009, 0.003742863322241771, 0, -0.009286904948880605, 1, 0.3010871363678009, 0.001103277845592429],
[266.71027138099, 620.6048934444802, 0, 1, 0.3005812161831478, 0, 0.00161133115539873, 0.00399808328357424, 0.6994187838168522, 1, 0.001103675309713574],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209087421651],
[266.1384901397267, 621.2033724766853, 1, 0, 0.2999277971119181, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999277971119181, 0.001104336668539214],
[266.2420808624243, 621.1260566183598, 0, 1, 0.3000356555716311, 0, 0.001609979148909595, 0.003994728644445354, 0.699964344428369, 1, 0.001104005398838592],
[266.3020924052707, 621.0130724201997, 0, 2, 0.3001212004053269, 0, 0.003220544121890446, 0.007990910853180429, 0.4898303341220807, 1, 0.002208762654527724],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1751314181183, 621.140033407352, 1, 0, 0.2999781159724385, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999781159724385, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110367351434356],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104005398838592],
[266.2787221408159, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2999481360078677, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7000518639921323, 1, 0.001104119448556691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104066845842475],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103510525394232],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209748548839],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104005398594313],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103673160487869],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103528090028311],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209747614221],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104005398608921],
[266.4030868485183, 620.912077976952, 0, 1, 0.3002350206658738, 0, 0.001610533979719299, 0.003996105307323159, 0.6997649793341262, 1, 0.001103119889908955],
[266.71027138099, 620.6048934444804, 0, 1, 0.3005812161831476, 0, 0.00161133115539873, 0.003998083283574239, 0.6994187838168524, 1, 0.001103510524678093],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209509807935],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665302, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334698, 1, 0.001104005398838592],
[266.1751314181184, 621.1400334073519, 1, 0, 0.2999781159724386, 0.003756924978949895, 0, -0.009321795154060186, 1, 0.2999781159724386, 0.001103119889908955],
[266.0758703260066, 621.2392944994638, 0, 1, 0.2998662491904352, 0, 0.001609685686102174, 0.00399400049570897, 0.7001337508095649, 1, 0.001103680973180388],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103866100115021],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103222915088252],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510399814004],
[265.9348083081481, 621.316923274116, 0, 1, 0.2997287002572519, 0, 0.001609484568246364, 0.003993501476041506, 0.700271299742748, 1, 0.001104833113441346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665303, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334697, 1, 0.001103777574309755],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104106633921943],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103558615231814],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001103673396886669],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679451566],
[266.1443210858324, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999433928734684, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000566071265316, 1, 0.001104209747614221],
[266.4381387895856, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3003211407235806, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6996788592764194, 1, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103119889908955],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510526362876],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001112419243546117],
[265.9699482710199, 621.3452165544504, 1, 0, 0.2997468755347313, 0.003759823267631023, 0, -0.009328986475029909, 1, 0.2997468755347313, 0.001104402517508103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104067743072021],
[266.1018488613351, 621.2133159641352, 1, 0, 0.2998955268770548, 0.003757959609371587, 0, -0.009324362310153324, 1, 0.2998955268770548, 0.001104701647449259],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104062875205308],
[266.2454113438617, 621.0697534816086, 1, 0, 0.3000573211168217, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000573211168217, 0.001103992980582988],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510524669735],
[266.21027138099, 621.1124293270931, 1, 0, 0.3000151705445542, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000151705445542, 0.001103795866876635],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104005398594313],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104336668540128],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001103826683235889],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209090773394],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106210863164082],
[266.2454113438617, 621.0697534816086, 1, 0, 0.3000573211168217, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000573211168217, 0.001104138630663356],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103680974844395],
[266.1117923487849, 621.2033724766853, 1, 0, 0.299906733140448, 0.00375781919009936, 0, -0.009324013897635448, 1, 0.299906733140448, 0.001104209090773394],
[265.7983839991756, 621.5167808262948, 0, 1, 0.2995535234106548, 0, 0.001608967015613832, 0.003992217308897116, 0.7004464765893452, 1, 0.001104005398594313],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103673396886669],
[266.1751314181183, 621.2460483221698, 1, 0, 0.2999422793763125, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999422793763125, 0.001103680974844395],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103743596569122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.9907056687415, 621.3244591567288, 0, 1, 0.2997702690239272, 0, 0.00160946504722704, 0.003993453039901749, 0.7002297309760728, 1, 0.00110488801299251],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104174621953373],
[266.0591730158506, 621.2559918096198, 0, 1, 0.2998474314007502, 0, 0.001609642423064861, 0.003993893150160727, 0.7001525685992498, 1, 0.00110491150589301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104062875205308],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001104063084503419],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510525394232],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209748548839],
[266.21027138099, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3000642953620493, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6999357046379507, 1, 0.001104005398594313],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104336668539214],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510524678093],
[266.2454113438617, 621.0697534816086, 1, 0, 0.3000573211168217, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000573211168217, 0.001104022517769118],
[266.4698554111886, 620.8453094142817, 1, 0, 0.3003102685206577, 0.003752769702437462, 0, -0.00931148495711071, 1, 0.3003102685206577, 0.001106210863384361],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104336668816243],
[266.71027138099, 620.6048934444802, 0, 1, 0.3005812161831478, 0, 0.00161133115539873, 0.00399808328357424, 0.6994187838168522, 1, 0.001103680973802299],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104023174161756],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104005398594313],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103680973180388],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104118548857927],
[266.0007586033058, 621.2509729789584, 0, 1, 0.2998030312422588, 0, 0.00160965542670284, 0.003993925415178042, 0.7001969687577412, 1, 0.001104183881369875],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998732145665303, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.7001267854334697, 1, 0.001104582986394629],
[266.2762216761477, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000920442157918, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.6999079557842082, 1, 0.00110343233561639],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103680973180388],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104209509807935],
[267.1443210858324, 620.1708437396379, 0, 1, 0.3010703881505036, 0, 0.001612458905629919, 0.004000881491336969, 0.6989296118494964, 1, 0.00110347624415477],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110367339790854],
[266.21027138099, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3000535684373849, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6999464315626152, 1, 0.001103527452983841],
[266.1288429813203, 621.1333491888362, 0, 1, 0.2999438557506831, 0, 0.001609960246549218, 0.003994681743340766, 0.7000561442493169, 1, 0.001104022517769118],
[266.2420808624243, 621.5071336678884, 0, 1, 0.2999068616504344, 0, 0.001608991990322616, 0.003992279276895044, 0.7000931383495657, 1, 0.001104005398594313],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999610874127955, 0.001104336668816243],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510399814004],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001103528088442727],
[266.0758703260066, 621.0792486492736, 0, 1, 0.2999203460983699, 0, 0.001610100485847507, 0.003995029709301898, 0.7000796539016301, 1, 0.001106574921358573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.9949276572, 621.3202371682702, 1, 0, 0.2997750271849797, 0.003759470185419273, 0, -0.009328110396835931, 1, 0.2997750271849797, 0.001104887978593235],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104286952643879],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104088072792492],
[266.4030868485184, 620.912077976952, 0, 1, 0.3002350206658739, 0, 0.001610533979719299, 0.003996105307323159, 0.6997649793341261, 1, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106722818294972],
[266.9406392542539, 620.3745255712164, 0, 1, 0.3008408396882967, 0, 0.001611929501907319, 0.003999567918911774, 0.6991591603117033, 1, 0.001104716841595064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.6443210858325, 620.6708437396379, 0, 1, 0.300506890511986, 0, 0.001611159941032263, 0.003997658461343139, 0.6994931094880139, 1, 0.001103809908331287],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.3413419545361, 621.9738228709342, 0, 1, 0.2990384391849397, 0, 0.001607784706089648, 0.00398928372697709, 0.7009615608150603, 1, 0.001104716838804479],
[265.8446724359736, 621.4704923894968, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.003992514657686559, 0.7003943097396925, 1, 0.001103773521435028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104716832423373],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104186928356046],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103369778454472],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.00110379965113081],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104717292169603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104174648472764],
[265.8663575483223, 621.2887614269579, 0, 1, 0.2996841835905931, 0, 0.001609557523144679, 0.003993682493927514, 0.700315816409407, 1, 0.001105208156144527],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1626757167437, 621.0147575723057, 0, 1, 0.3000106469457793, 0, 0.001610267691397927, 0.003995444584738158, 0.6999893530542207, 1, 0.00110454429963561],
[265.9348083081481, 621.5404023675122, 1, 0, 0.2996532242356205, 0.003760320081308289, 0, -0.009330219184055286, 1, 0.2996532242356205, 0.001103528090028311],
[265.9348083081481, 621.3803565173222, 1, 0, 0.2997072729625397, 0.003760320081308289, 0, -0.009330219184055286, 1, 0.2997072729625396, 0.001103975141398752],
[265.9348083081481, 621.3803565173222, 1, 0, 0.2997072729625397, 0.003760320081308289, 0, -0.009330219184055286, 1, 0.2997072729625396, 0.001103975377088437],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001103672556321043],
[266.0725398445691, 621.110724390586, 0, 1, 0.2999070773432043, 0, 0.00161001889152883, 0.003994827255026473, 0.7000929226567957, 1, 0.001104716830465091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001103352304276456],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104185965409892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104352961757169],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104026745516629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.632659193621, 621.6825056318493, 1, 0, 0.2993667523375073, 0.003764597331652261, 0, -0.009340832026140913, 1, 0.2993667523375072, 0.001104574522206272],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104179888671717],
[265.2044404348843, 622.1107243905859, 0, 1, 0.2988841518188732, 0, 0.001607430897417162, 0.0039884058462669, 0.7011158481811268, 1, 0.001104183586059032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[265.7762216761477, 621.5389431493226, 1, 0, 0.2995285465772743, 0.003762563835445426, 0, -0.009335786454245577, 1, 0.2995285465772743, 0.001103734610325274],
[266.0516847489896, 621.2634800764807, 1, 0, 0.2998389921593647, 0.003758668173604932, 0, -0.009326120421021584, 1, 0.2998389921593647, 0.00110373577498899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103990844295864],
[266.2353966439085, 621.1857134921893, 0, 1, 0.3000102134183824, 0, 0.001609824531182773, 0.003994345002295272, 0.6999897865816176, 1, 0.001103602173037327],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103693418044288],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001104339691292625],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103778810139264],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001104158440578173],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103691464404111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.8670475435375, 0, 1, 0.2997602412629723, 0, 0.001608060764676535, 0.003989968691838484, 0.7002397587370277, 1, 0.001105371861137723],
[266.21027138099, 621.4859704940089, 0, 1, 0.2998889246378903, 0, 0.001609046780581574, 0.003992415224132027, 0.7001110753621097, 1, 0.001104340351576177],
[266.2295656978028, 621.1915444382951, 0, 1, 0.3000036427541969, 0, 0.001609809420223577, 0.003994307508529226, 0.699996357245803, 1, 0.00110370722880871],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1481372981331, 621.220000182651, 0, 1, 0.2999297879386576, 0, 0.00160973568092782, 0.003994124544372715, 0.7000702120613425, 1, 0.001104209759103029],
[266.0985183798977, 621.650696150415, 0, 1, 0.2997451465171773, 0, 0.001608620413670444, 0.003991357309739727, 0.7002548534828227, 1, 0.001104691852067062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103772305077626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.5942249569178, 620.5773773860259, 1, 0, 0.3004990514268778, 0.003751018988358064, 0, -0.009307141032727626, 1, 0.3004990514268777, 0.001104328535889831],
[266.4381387895856, 620.8052447946213, 0, 1, 0.3002988173473354, 0, 0.001610811133418865, 0.003996792989411043, 0.6997011826526646, 1, 0.00110398156898007],
[266.71027138099, 620.6048934444802, 0, 1, 0.3005812161831478, 0, 0.00161133115539873, 0.00399808328357424, 0.6994187838168522, 1, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209090773394],
[265.8798123988453, 621.4670690482282, 0, 1, 0.2996345825493318, 0, 0.001609095718509256, 0.003992536650388786, 0.7003654174506682, 1, 0.001104005398608921],
[266.2454113438617, 621.0167808262947, 1, 0, 0.3000752355880865, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000752355880865, 0.001104138631041672],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001103510526362876],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103795868535227],
[266.7787221408159, 620.9704923894968, 0, 1, 0.3005113581339098, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509545, 0.6994886418660902, 1, 0.001106210863384361],
[266.2762216761477, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000920442157918, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.6999079557842082, 1, 0.001103119775089491],
[266.3585751246121, 620.9565897008583, 0, 2, 0.3001848561632587, 0, 0.003220837065218177, 0.007991637712968196, 0.4897412355432388, 1, 0.002208614952123773],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103719018280343],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103558494156733],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103826679451566],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209747614221],
[266.21027138099, 621.1633078570251, 0, 1, 0.2999979688482318, 0, 0.001609882598265403, 0.00399448908008562, 0.7000020311517682, 1, 0.001106723809110711],
[266.3087504131951, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001287039488123, 0.003755039961880471, 0, -0.009317117993062419, 1, 0.3001287039488123, 0.001103673160487869],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103528088442727],
[266.2853831036908, 620.8697358715893, 0, 1, 0.3001565086061467, 0, 0.001610643814996362, 0.003996377833913178, 0.6998434913938533, 1, 0.001103866100115021],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2820526222534, 621.033112203217, 1, 0, 0.3000986156645136, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645136, 0.001103222913931469],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510526362876],
[266.2820526222534, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001076453886683, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3001076453886683, 0.001103510524678093],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001104209090773394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 2, 0.3000177185446302, 0, 0.003220068012841663, 0.007989729517101423, 0.4899751943514645, 1, 0.002208206826520212],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103595719895287],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999610874127955, 0.001104336668816243],
[266.21027138099, 621.2109083592982, 0, 1, 0.299981877217421, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700018122782579, 1, 0.001103680973180388],
[266.1384901397267, 621.1048934444802, 1, 0, 0.2999610874127955, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999610874127955, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104032706179084],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103668601052905],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103680974844395],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103527452983841],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.001104032706209182],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001103668601052905],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103510524669735],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001103510524678093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001103699966137325],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001104012946588387],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110368073842186],
[266.21027138099, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3000642953620493, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6999357046379507, 1, 0.001104209087421651],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510399814004],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.0491663829965, 621.2659984424738, 1, 0, 0.2998361539727847, 0.003758703752374963, 0, -0.009326208700134933, 1, 0.2998361539727847, 0.001104082831073084],
[266.3087504131951, 621.0064144122751, 1, 0, 0.3001287039488123, 0.003755039961880471, 0, -0.009317117993062419, 1, 0.3001287039488123, 0.001103501561367417],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103510399814004],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103827059873299],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103510524678093],
[266.21027138099, 621.0731768228773, 0, 1, 0.3000284429061321, 0, 0.001610116226747284, 0.003995068766095443, 0.6999715570938678, 1, 0.001104053225038803],
[266.2454113438617, 621.0167808262948, 1, 0, 0.3000752355880864, 0.003755933275817018, 0, -0.009319334510446028, 1, 0.3000752355880865, 0.001104138630663356],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104024437923284],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.001104018231225108],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103527852974794],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104032823999294],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001103657562439005],
[266.21027138099, 621.5389431493227, 1, 0, 0.299871030042911, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.299871030042911, 0.001103680736666613],
[266.21027138099, 621.2649392946704, 1, 0, 0.2999636138324545, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.2999636138324545, 0.001103680973180388],
[266.21027138099, 621.1366100660833, 0, 1, 0.3000069949497742, 0, 0.001609951794491085, 0.003994660771840141, 0.6999930050502259, 1, 0.001104024290381348],
[266.21027138099, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3000535684373849, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6999464315626152, 1, 0.001104018231225108],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104209747614221],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103673397917008],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104005398594313],
[265.8446724359736, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7003943097396925, 1, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104209509807935],
[266.4381387895856, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3003211407235806, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6996788592764194, 1, 0.001104005398594313],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.001103119889908955],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103510399814004],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938084, 0, -0.009323078555386957, 1, 0.2999368214247466, 0.001103826683235889],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104629839128911],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104205413198038],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103680974844395],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001103826682966977],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104629839128911],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104205413198038],
[266.4164536772369, 621.0364426846544, 1, 0, 0.3002034865956377, 0.003753521924781336, 0, -0.009313351393794751, 1, 0.3002034865956378, 0.001103510399814004],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[266.6476515672699, 620.5297817217795, 0, 1, 0.3005572972913909, 0, 0.001611526198187148, 0.003998567229601934, 0.6994427027086092, 1, 0.001104082872131971],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103501926773745],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103680974844395],
[266.4381387895856, 620.8052447946214, 0, 1, 0.3002988173473353, 0, 0.001610811133418865, 0.003996792989411043, 0.6997011826526647, 1, 0.001104209087421651],
[266.1384901397267, 621.2033724766853, 1, 0, 0.2999277971119181, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999277971119181, 0.001103826682966977],
[266.0725398445691, 621.2426249809012, 0, 1, 0.299862495753585, 0, 0.001609677056577924, 0.003993979083874081, 0.7001375042464151, 1, 0.001104023174161756],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110347624415477],
[266.2916997806598, 621.0764377001243, 0, 1, 0.300091572519896, 0, 0.00161010777305133, 0.003995047790531005, 0.699908427480104, 1, 0.001103119889004086],
[265.8446724359736, 621.4704923894967, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.00399251465768656, 0.7003943097396925, 1, 0.001103826679451566],
[266.2820526222534, 621.0331122032169, 1, 0, 0.3000986156645137, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645137, 0.001103673396886669],
[266.6042564661722, 620.7109083592982, 0, 1, 0.3004617378748527, 0, 0.001611055946548873, 0.003997400427105899, 0.6995382621251474, 1, 0.001104005398594313],
[266.0040890847432, 621.1733442043062, 1, 0, 0.2998318928137986, 0.003759340705779231, 0, -0.009327789128062172, 1, 0.2998318928137986, 0.001104209748548839],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001106210863164082],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103119775089491],
[266.1572987256762, 621.2649392946704, 0, 1, 0.2999218267500457, 0, 0.001609619240923707, 0.003993835629935466, 0.7000781732499544, 1, 0.001103528090132954],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104209509700497],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001104053225038803],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104336668816243],
[265.8446724359736, 621.4704923894968, 0, 1, 0.2996056902603075, 0, 0.001609086854880418, 0.003992514657686559, 0.7003943097396925, 1, 0.001103528088442727],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103510526362876],
[266.1384901397267, 621.1766746857436, 1, 0, 0.2999368214247466, 0.003757442222938083, 0, -0.009323078555386954, 1, 0.2999368214247466, 0.001103749620222971],
[266.5040890847432, 620.6733442043062, 0, 1, 0.3003954779335715, 0, 0.00161115345026132, 0.003997642356247227, 0.6996045220664285, 1, 0.001104740997633655],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103826679471533],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103795514287841],
[266.348002917411, 620.9671619080593, 0, 1, 0.3001729413356753, 0, 0.001610391114607861, 0.003995750826115538, 0.6998270586643247, 1, 0.001103476244143799],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104336668539214],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103680973180388],
[266.0175439352662, 621.2709230992623, 0, 1, 0.2998095363781103, 0, 0.001609603737788686, 0.003993797163090981, 0.7001904636218896, 1, 0.001103558494156733],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103673160487869],
[266.21027138099, 621.0464790319354, 0, 1, 0.300037470841554, 0, 0.001610185443058567, 0.003995240507686961, 0.699962529158446, 1, 0.001104053225287349],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.0011035095059244],
[266.4030868485184, 620.912077976952, 0, 2, 0.3002350206658739, 0, 0.003221067959438597, 0.007992210614646318, 0.4896710263024899, 1, 0.002208312450254424],
[266.21027138099, 621.0389431493227, 0, 1, 0.3000400192204341, 0, 0.001610204981557106, 0.003995288987196672, 0.699959980779566, 1, 0.001104131565965844],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.00110355861427812],
[266.21027138099, 620.8308895898281, 0, 1, 0.3001103929491135, 0, 0.001610744595296607, 0.003996627893022612, 0.6998896070508864, 1, 0.001112987492058855],
[266.2820526222534, 621.033112203217, 1, 0, 0.3000986156645136, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000986156645136, 0.00110367351434356],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 1, 0.3000177185446302, 0, 0.001610034006420831, 0.003994864758550712, 0.6999822814553698, 1, 0.001103680973089149],
[266.1751314181183, 621.2460483221698, 1, 0, 0.2999422793763125, 0.003756924978949896, 0, -0.009321795154060187, 1, 0.2999422793763125, 0.001103795750718917],
[266.21027138099, 621.1708437396379, 0, 1, 0.2999954211836052, 0, 0.001609863067589739, 0.003994440619986262, 0.7000045788163949, 1, 0.001106210863164082],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104336668540128],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103826682966977],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001104209087421651],
[266.2419880025931, 621.0731768228771, 0, 1, 0.3000534630273803, 0, 0.001610116226747285, 0.003995068766095443, 0.6999465369726197, 1, 0.001104005398838592],
[266.1042564661722, 621.2109083592982, 0, 1, 0.2998982402363351, 0, 0.001609759240450453, 0.003994183000968241, 0.700101759763665, 1, 0.001104138630663356],
[266.2820526222534, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000743405146151, 0.003755416447155737, 0, -0.009318052139640862, 1, 0.3000743405146151, 0.001103510524678093],
[266.1751314181184, 621.2460483221698, 1, 0, 0.2999422793763126, 0.003756924978949895, 0, -0.009321795154060186, 1, 0.2999422793763126, 0.001103795514287841],
[266.0725398445691, 621.2426249809013, 0, 1, 0.2998624957535849, 0, 0.001609677056577924, 0.00399397908387408, 0.7001375042464151, 1, 0.001104005398838592],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103119890011099],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.0011035095059244],
[266.316286295808, 620.9988785296624, 0, 1, 0.3001371968529252, 0, 0.00161030886620552, 0.003995546748908068, 0.6998628031470748, 1, 0.001103795514287841],
[266.21027138099, 621.4859704940088, 0, 1, 0.2998889246378904, 0, 0.001609046780581574, 0.003992415224132028, 0.7001110753621096, 1, 0.001104724661854429],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 1, 0, 0.3000177185446302, 0.003756429061930665, 0, -0.009320564669849672, 1, 0.3000177185446302, 0.001103119890011099],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.00110355861427812],
[266.3446724359736, 620.9704923894967, 0, 1, 0.3001691878988251, 0, 0.00161038247751837, 0.003995729395509546, 0.6998308121011749, 1, 0.00110413903542436],
[266.2420808624243, 621.1260566183598, 0, 1, 0.3000356555716311, 0, 0.001609979148909595, 0.003994728644445354, 0.699964344428369, 1, 0.001104005398594313],
[266.5758703260065, 620.7392944994638, 0, 1, 0.3004297468289527, 0, 0.001610982273655408, 0.003997217627708749, 0.6995702531710473, 1, 0.001103680973080737],
[266.21027138099, 621.1048934444802, 0, 2, 0.3000177185446302, 0, 0.003220068012841663, 0.007989729517101423, 0.4899751943514645, 1, 0.002208808240148407],
[266.2027354983773, 621.1124293270931, 0, 1, 0.3000092256405172, 0, 0.001610014472071328, 0.003994816289335714, 0.6999907743594829, 1, 0.001103826679471533]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8940546893724309, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3089280560784095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 2.162856799339447, 0, 0, 0.2526551736282304, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.002557407931947803, 2.997442592068055, 0, 1, 0.0008524693106492667, 0, 0.3336177322115317, 0.8277823424377411, 0.9991475306893507, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.999819399844753, 1, 3, 0.333353401225338, 0.9999999999999991, 1.500135462348696, 1.24095113834263, 0.592556916340172, 0.8024929188968718, 0.4030259104453218],
[0.8690694636598586, 2.130552998144689, 1, 3, 0.28972628213253, 1.15065600831119, 1.408085132175748, 0.6387408779254717, 0.6697737029117101, 0.7454910967916162, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 2.162856799339447, 0, 0, 0.2526551736282304, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997097198138807, 2.000290280186122, 1, 2, 0.3332365732712932, 1.000290364473173, 0.9998548809695283, -0.001080534755601995, 0.7408697447924727, 0.703574671561725, 0.4030259104453218],
[0.6612068343291114, 2.0187014652906, 3, 0, 0.2467274101964381, 4.537158184464212, 0, -11.25773322973428, 0.9999999999999999, 0.01501938674592274, 0.4030259104453218],
[0.9920752783272927, 2.007924721672711, 0, 11, 0.3306917594424306, 0, 5.478293026262659, 13.59290528048046, 0.01207502095272099, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.002448271681231308, 2.997551728318771, 0, 2, 0.0008160905604104353, 0, 0.6672111714054505, 1.655504408310171, 0.9983684848829819, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000624195225998, 1.998998517964833, 0, 1, 0.3335833506079803, 0, 0.5002504959423848, 1.241236563152069, 0.6664166493920197, 1, 0.4030259104453218],
[0.9994192560652677, 2.000580743934735, 1, 2, 0.3331397520217556, 1.000581081394228, 0.9997097123240358, -0.002162067121761181, 0.7409988116679451, 0.7034455203335641, 0.4030259104453218],
[0.7247334977193396, 2.211760148054754, 1, 0, 0.2468023381430786, 1.379817551067938, 0, -3.423644771482097, 1, 0.2468023381430786, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997095405052131, 2.00029045949479, 1, 1, 0.3332365135017373, 1.000290543886017, 0.499927395670611, -1.241516079357112, 0.8889534260692064, 0.5554264530726811, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.867509495800815, 2.132490504199188, 3, 0, 0.2891698319336047, 3.458175402714919, 0, -8.580528728026003, 1, 0.02418014761046006, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0, 1.67816407142085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7249140331321142, 2.274708680058717, 0, 2, 0.2416684038110217, 0, 0.8792334673591583, 2.181580500339675, 0.5750668097785236, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027435542768, 2.132097256445726, 1, 0, 0.289300914518092, 1.152202833124772, 0, -2.858880293457188, 1, 0.289300914518092, 0.4030259104453218],
[1.000624499916046, 1.998998029108789, 1, 1, 0.3335834726649238, 0.9993758898406965, 0.5002506182789128, -1.238444622605721, 0.8887220667648099, 0.5558890120946577, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.8679027209489273, 2.000020639058163, 1, 1, 0.3026240983464711, 1.152202863134987, 0.4999948402887052, -1.618278145257777, 0.9084186550999854, 0.5136668517929275, 0.4030259104453218],
[0.724733468752963, 2.211760187794674, 1, 0, 0.2468023273733254, 1.379817606216922, 0, -3.423644908319414, 1, 0.2468023273733253, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8940546893724309, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3089280560784095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7254881093630809, 2.274511890636921, 1, 1, 0.2418293697876934, 1.378382342996521, 0.4396547690590329, -2.329199065390722, 0.941518555908087, 0.4251772954834739, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9846996957339496, 2.015300304266051, 1, 2, 0.3282332319113165, 1.015538041021376, 0.9924079283699493, -0.05739113057487816, 0.7475145996177532, 0.6968514137464041, 0.4030259104453218],
[0.8679027209489275, 2.01534160893421, 1, 0, 0.3010160158657469, 1.152202863134987, 0, -2.858880367919435, 1, 0.3010160158657469, 0.4030259104453218],
[0.9999380365407623, 2.000061963459241, 1, 3, 0.3333126788469204, 1.000061967298946, 1.499953528845326, 1.240345964342657, 0.5926293116795137, 0.8024446552735206, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675182674433656, 2.132042842712578, 2, 1, 0.2892150669996733, 2.305426957629531, 0.4690337266992765, -4.556514068540008, 0.9758085030553563, 0.2025530710495888, 0.4030259104453218],
[0.001447426485735013, 2.998552573514268, 0, 2, 0.0004824754952450039, 0, 0.6669884722601425, 1.654951840498682, 0.9990352817921134, 1, 0.4030259104453218],
[0.9969808196324724, 2.00301918036753, 0, 4, 0.3323269398774905, 0, 1.996985370487589, 4.954980111033131, 0.1987263304051322, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027209489275, 2.132097279051076, 1, 0, 0.2893009069829755, 1.152202863134987, 0, -2.858880367919435, 1, 0.2893009069829755, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687532629, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2659832519636769, 1.379817606216351, 0, -3.423644908317997, 1, 0.2659832519636769, 0.4030259104453218],
[0.7311016597226977, 1.948806639897013, 1, 0, 0.2728084613292343, 1.367798837140233, 0, -3.393823577320101, 1, 0.2728084613292343, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7881527570266891, 2.21184724297331, 1, 1, 0.2627175856755631, 1.268789572940791, 0.4521107880197613, -2.026367942494427, 0.9309794701768032, 0.4564146415279293, 0.4030259104453218],
[0.9988678201948341, 2.000871463055757, 0, 1, 0.3329848783099698, 0, 0.4997822291256965, 1.240074685454998, 0.6670151216900302, 1, 0.4030259104453218],
[0.6611409548546929, 2.23305879941392, 0, 1, 0.2284365320256785, 0, 0.4478162421260273, 1.111135116923909, 0.7715634679743215, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7250401475319685, 2.274959852468034, 0, 2, 0.2416800491773226, 0, 0.8791363934753667, 2.181339637702123, 0.5750491478157077, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.867509187477698, 2.132490812522305, 1, 0, 0.2891697291592324, 1.152725543930574, 0, -2.860177259216101, 1, 0.2891697291592323, 0.4030259104453218],
[1.384549668009553, 1.552103969852171, 0, 1, 0.4714718992252999, 0, 0.6442867355691668, 1.598623609229652, 0.5285281007747001, 1, 0.4030259104453218],
[1.000624195225998, 1.998998517964833, 1, 1, 0.3335833506079803, 0.9993761941506349, 0.5002504959423848, -1.238445681213754, 0.8887221481971533, 0.5558888494131138, 0.4030259104453218],
[0.6610050997275695, 1.47208447919852, 0, 1, 0.3098815475252354, 0, 0.6793088400364442, 1.68552150725457, 0.6901184524747646, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[0.9988678468409422, 2.001132153159061, 0, 1, 0.3329559489469804, 0, 0.4997171218409355, 1.239913139303563, 0.6670440510530196, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9998193094863549, 2.000180690513648, 1, 1, 0.333273103162118, 1.000180723168607, 0.4999548314523521, -1.241175514406835, 0.8889290387086923, 0.5554752450329282, 0.4030259104453218],
[0.8238710338426564, 2.175983841108045, 1, 0, 0.2746369635151753, 1.213782204886913, 0, -3.011672881144911, 1, 0.2746369635151753, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.7879701703642383, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2626567234547462, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.681223299299231, 1, 0, 0.3729640870498784, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3729640870498785, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.274707898606819, 0, 1, 0.2415731189844827, 0, 0.4396168847052697, 1.090790624899319, 0.7584268810155173, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996225999814369, 2.000377400018566, 0, 1, 0.3332075333271453, 0, 0.4999056677958463, 1.240380965192728, 0.6667924666728547, 1, 0.4030259104453218],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7326618685397315, 1.403564629642364, 1, 2, 0.3429701247331303, 1.364886099495119, 1.424943289223248, 0.14901570388308, 0.727800607686768, 0.7163679183535865, 0.4030259104453218],
[0.7244498123832623, 2.275405114489725, 0, 2, 0.2414949489368875, 0, 0.8789643599129, 2.180912782857291, 0.5753299124882549, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9986299304152204, 2.000930636983806, 0, 2, 0.3329254095646252, 0, 0.9995348979286917, 2.480076024949016, 0.4449885092045229, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.6611408414914554, 2.233058839029525, 0, 1, 0.2284364986773975, 0, 0.4478162341815384, 1.111135097211804, 0.7715635013226024, 1, 0.4030259104453218],
[0.9988675475100293, 2.001132452489974, 1, 1, 0.3329558491700095, 1.001133736392571, 0.4997170470928687, -1.244130157154572, 0.8891404025034777, 0.555052100843497, 0.4030259104453218],
[0.6627893419229219, 2.232571180817334, 0, 5, 0.2289142705087511, 0, 2.23957025109028, 5.556889006505006, 0.2725921396096611, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7260708156300464, 2.273490827470535, 1, 3, 0.242058974617212, 1.377276125789813, 1.31955667634594, -0.1432152324402584, 0.7516082722334591, 0.6699789363006357, 0.4030259104453218],
[0.9969944734936453, 2.003005526506358, 1, 1, 0.3323314911645481, 1.00301458692727, 0.4992497458278111, -1.249956461962523, 0.889555779980348, 0.5542187623094441, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.7247334977823632, 2.275266502217639, 1, 0, 0.2415778325941209, 1.379817550947947, 0, -3.423644771184373, 1, 0.2415778325941209, 0.4030259104453218],
[0.9996224997922561, 2.000377500207747, 0, 2, 0.3332074999307518, 0, 0.9998112855160052, 2.480761806136156, 0.4446122381485985, 1, 0.4030259104453218],
[0.6609179642895747, 2.233136725082857, 0, 0, 0.2283709311771482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.6611794347457508, 2.233310684056061, 0, 1, 0.2284269103048275, 0, 0.4477657350314713, 1.111009797203149, 0.7715730896951725, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.000290320402492, 0, 1, 0.2659019678428224, 0, 0.4999274304335899, 1.240434963303469, 0.7340980321571776, 1, 0.4030259104453218],
[0.6610142243792574, 2.233040464993175, 1, 0, 0.2284041925007977, 1.512826748832941, 0, -3.753671189927588, 1, 0.2284041925007977, 0.4030259104453218],
[0.7249144250430091, 2.275085574956994, 0, 1, 0.2416381416810028, 0, 0.4395439059556707, 1.09060954783279, 0.7583618583189972, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131907459, 2.000377286809257, 0, 2, 0.3332075710635816, 0, 0.9998113921749937, 2.480762070781644, 0.4446121432869286, 1, 0.4030259104453218],
[0.9998193408260574, 2.000180659173945, 1, 2, 0.3332731136086855, 1.000180691817577, 0.9999096785717245, -0.0006724462096074473, 0.7408210300800859, 0.7036234034844577, 0.4030259104453218],
[0.7879701703642383, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2626567234547462, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311016497151981, 1.400798940600027, 1, 0, 0.3429342123344957, 1.367798855863, 0, -3.393823623775595, 1, 0.3429342123344956, 0.4030259104453218],
[1.003568287709796, 1.995889615103557, 0, 2, 0.3345832214442799, 0, 1.002059424962853, 2.48633995728868, 0.4427794891834723, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.679908299619715, 0, 0, 0.3731470961681422, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.6610051539070365, 1.472085164313773, 0, 1, 0.3098814655248048, 0, 0.6793085238829644, 1.685520722805055, 0.6901185344751952, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.72566828283447, 2.274331717165533, 0, 1, 0.2418894276114898, 0, 0.4396895986862839, 1.09097104501408, 0.7581105723885102, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.868280511594813, 0, 1, 0.3486409352075482, 0, 0.5352515287687575, 1.328082177588368, 0.6513590647924518, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.455638576893915, 1.269188700795979, 1, 0, 0.5342131550180326, 0.6869837168879033, 0, -1.704564642329878, 1, 0.5342131550180326, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675092119931352, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3025305754432609, 1.152725511355046, 0, -2.860177178388722, 1, 0.3025305754432609, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131908294, 2.000290405741313, 0, 1, 0.3332172211529439, 0, 0.499927409105078, 1.240434910382524, 0.6667827788470562, 1, 0.4030259104453218],
[1.000624310389922, 1.86727843328194, 0, 1, 0.3489045479655257, 0, 0.535538772459549, 1.328794895265685, 0.6510954520344743, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.9997095592123415, 2.000290440787661, 0, 1, 0.3332365197374469, 0, 0.4999274003460351, 1.240434888649324, 0.6667634802625531, 1, 0.4030259104453218],
[0.8680994096847775, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3026741007488951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7324419157885084, 1.40064778596679, 0, 2, 0.3433713618258946, 0, 1.427910728191749, 3.542975007770554, 0.4311611684703802, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8238710338426234, 2.175983841108127, 1, 0, 0.2746369635151598, 1.213782204886962, 0, -3.011672881145031, 1, 0.2746369635151598, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.867902743671264, 2.131937235300557, 1, 1, 0.2893163467901821, 1.152202832969463, 0.4690569607031708, -1.695042066926796, 0.9162960514799832, 0.4949287450603472, 0.4030259104453218],
[0.9991282739234725, 2.000871726076531, 0, 1, 0.3330427579744905, 0, 0.4997821634277776, 1.240074522443347, 0.6669572420255095, 1, 0.4030259104453218],
[0.7882605208960299, 2.21173947910397, 0, 1, 0.2627535069653433, 0, 0.4521328164767058, 1.121845530916669, 0.7372464930346567, 1, 0.4030259104453218],
[0.6610142345031792, 2.233040454869253, 1, 0, 0.2284041959989769, 1.51282672566288, 0, -3.753671132437338, 1, 0.2284041959989769, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.868099409684778, 0, 0, 0.3486629496255526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8680994096847775, 2.131900590315225, 0, 0, 0.2893664698949255, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7255461937746552, 2.274453806225347, 1, 3, 0.2418487312582182, 1.378271995057266, 1.318997990545589, -0.1470724411891595, 0.751959046196637, 0.6696126090552568, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.86812004874511, 1, 0, 0.3486604406386444, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3486604406386444, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9990415287203291, 2.000958471279674, 0, 2, 0.3330138429067761, 0, 0.9995209939169498, 2.480041525897263, 0.4448705337539867, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8665261446626705, 2.133473855337332, 2, 1, 0.2888420482208899, 2.308066539387082, 0.4687191256167917, -4.563844075776445, 0.9759019862449911, 0.2020931589512986, 0.4030259104453218],
[0.2698032977044231, 2.73019670229558, 0, 1, 0.08993443256814093, 0, 0.3662739754828613, 0.9088099945687074, 0.9100655674318591, 1, 0.4030259104453218],
[0.7249141030975264, 2.275085896902477, 0, 2, 0.2416380343658419, 0, 0.8790876875123681, 2.181218787003108, 0.5751128709205039, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687307239, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2659832519576051, 1.379817606259263, 0, -3.423644908424472, 1, 0.2659832519576051, 0.4030259104453218],
[0.867902811780928, 2.132097188219075, 1, 0, 0.289300937260309, 1.15220274254903, 0, -2.858880068717935, 1, 0.289300937260309, 0.4030259104453218],
[0.724733468752963, 2.211556661232346, 1, 2, 0.2468194342759273, 1.379817606216922, 0.9043403838839653, -1.179768372230908, 0.8473128980928991, 0.5727350021697982, 0.4030259104453218],
[0.9999587196135001, 2.000041280386503, 1, 2, 0.3333195732044997, 1.000041282090641, 0.9999793602327574, -0.0001536423745431378, 0.7407590873898393, 0.7036853564865739, 0.4030259104453218],
[0.999622774265756, 2.000377225734247, 0, 2, 0.3332075914219184, 0, 0.9998114227009817, 2.480762146523642, 0.4446121161373593, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334977614435, 2.275266502238559, 1, 0, 0.2415778325871476, 1.379817550987776, 0, -3.423644771283198, 1, 0.2415778325871476, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.21182664458265, 0, 2, 0.2467463273727303, 0, 0.9042299969116163, 2.243602640615565, 0.5673910953264699, 1, 0.4030259104453218],
[0.867902720948878, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3026262762014892, 1.152202863135053, 0, -2.858880367919598, 1, 0.3026262762014892, 0.4030259104453218],
[0.001447083458244785, 2.998552916541758, 0, 2, 0.0004823611527482612, 0, 0.6669883959582102, 1.654951651176035, 0.9990355103667852, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027435541103, 2.132097256445893, 1, 0, 0.2893009145180365, 1.152202833124993, 0, -2.858880293457736, 1, 0.2893009145180365, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.008787512689936708, 2.991212487310066, 0, 2, 0.002929170896645567, 0, 0.6686251840966865, 1.659012899091008, 0.9941502382488506, 1, 0.4030259104453218],
[0.7323070387043985, 1.948922044015752, 0, 1, 0.273123637000633, 0, 0.5131041557411404, 1.273129450099593, 0.726876362999367, 1, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.999819288717243, 0, 1, 0.3333534135743264, 0, 0.5000451819031292, 1.240727131788143, 0.6666465864256736, 1, 0.4030259104453218],
[0.999709641269299, 2.000290358730704, 1, 1, 0.333236547089766, 1.00029044306338, 0.4999274208543183, -1.241515766706384, 0.8889534036836901, 0.5554264978632222, 0.4030259104453218],
[0.999854955282326, 1.680784744710821, 1, 1, 0.3729911764288509, 1.000145065758696, 0.5949601834184007, -1.005356905943312, 0.8608775823062218, 0.6068599351639237, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999996, -3.72184507527712, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.8671149893101017, 2.132885010689901, 1, 0, 0.2890383297700336, 1.153249583190374, 0, -2.861477521174991, 1, 0.2890383297700336, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7315657583837166, 1.947585858216119, 0, 2, 0.2730587376432848, 0, 1.026912365153385, 2.548005819324874, 0.5284435989167747, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675092866744041, 2.132490713325599, 1, 1, 0.289169762224801, 1.152725412120369, 0.4689352191553085, -1.696640774806537, 0.9163808486148519, 0.4947203730644542, 0.4030259104453218],
[0.7249140448475131, 2.27508595515249, 0, 1, 0.2416380149491708, 0, 0.4395438325023522, 1.090609365578208, 0.7583619850508292, 1, 0.4030259104453218],
[0.724733468752963, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2659832519635961, 1.379817606216922, 0, -3.423644908319414, 1, 0.2659832519635961, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.679908299619715, 0, 0, 0.3731470961681422, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 1.499999999999999, 1.240615025092373, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131908294, 2.000377286809174, 0, 1, 0.3332075710636094, 0, 0.4999056960875177, 1.240381035390874, 0.6667924289363906, 1, 0.4030259104453218],
[0.8680832557071579, 2.131916744292845, 1, 1, 0.289361085235719, 1.151963240191034, 0.4690614690639334, -1.694436395844951, 0.916270162351207, 0.494992332822645, 0.4030259104453218],
[0.8235517040576829, 2.176303186154638, 0, 1, 0.2745305137074128, 0, 0.4594948012583319, 1.140112308785842, 0.7254694862925872, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.401747261447588, 0, 1, 0.3428113889967722, 0, 0.7133953655577663, 1.770098018684464, 0.6571886110032279, 1, 0.4030259104453218],
[0.9989986800872194, 2.001001319912783, 1, 2, 0.3329995600290728, 1.00100232355932, 0.9994995905785674, -0.003728626229246355, 0.7411856603341018, 0.7032584497849352, 0.4030259104453218],
[0.9988908513285889, 1.999788365570975, 1, 6, 0.3331102725823992, 1.001110380248188, 3.000317485238941, 4.960492745445913, 0.2637859315660765, 0.9413351190022828, 0.4030259104453218],
[0.7311016597225446, 1.40079893059268, 1, 0, 0.3429342170285919, 1.367798837140519, 0, -3.393823577320812, 1, 0.3429342170285918, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.998934200539499, 0, 4, 0.3334517975819888, 0, 2.001066367727576, 4.965106004019706, 0.1973904995440257, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9986301016152772, 2.001369898384726, 2, 1, 0.3328767005384254, 2.002743555161229, 0.4996577598209528, -3.729501643404137, 0.9631149654763037, 0.258650624236653, 0.4030259104453218],
[0.8679028117802539, 2.132097188219749, 1, 0, 0.2893009372600844, 1.152202742549925, 0, -2.858880068720156, 1, 0.2893009372600843, 0.4030259104453218],
[0.9989986800872375, 2.001001319912765, 0, 1, 0.3329995600290789, 0, 0.4997497952892883, 1.239994209645459, 0.6670004399709211, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997095071189945, 2.000290492881009, 0, 1, 0.3332365023729978, 0, 0.4999273873264802, 1.240434856344813, 0.6667634976270022, 1, 0.4030259104453218],
[0.7879701703642383, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2626567234547462, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.456299357341658, 1.268614687462938, 1, 0, 0.5344386404107985, 0.686672005284277, 0, -1.703791214131969, 1, 0.5344386404107985, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0, 1.67816407142085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.386115744493387, 1.550537867222449, 1, 0, 0.4720051894998619, 0.7214404741975506, 0, -1.790059783998498, 1, 0.4720051894998619, 0.4030259104453218],
[0.8679028117809243, 2.000180602746366, 1, 1, 0.3026072419598611, 1.152202742549035, 0.4999548533902093, -1.61837706275045, 0.9084288571134461, 0.5136433410331682, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.9996226745224479, 2.000377325477555, 0, 1, 0.333207558174149, 0, 0.4999056864240688, 1.240381011413634, 0.6667924418258511, 1, 0.4030259104453218],
[0.2708039693766001, 2.729196030623403, 0, 2, 0.09026798979219994, 0, 0.7328165428788052, 1.818286427463392, 0.8276123303967248, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9995645867560881, 1.681223810091926, 0, 1, 0.3728621729082923, 0, 0.5948048046888664, 1.475847555388286, 0.6271378270917076, 1, 0.4030259104453218],
[0.8669191970265852, 2.132900142807595, 2, 2, 0.2889904686975268, 2.307020085447096, 0.9376904055936462, -3.397621950262241, 0.924383788161836, 0.3289360106018502, 0.4030259104453218],
[0.8226464840783725, 2.177353515921624, 0, 1, 0.2742154946927912, 0, 0.4592731463621436, 1.139562331996649, 0.7257845053072088, 1, 0.4030259104453218],
[0, 1.67816407142085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687530904, 2.275266531246912, 1, 0, 0.2415778229176966, 1.37981760621668, 0, -3.423644908318812, 1, 0.2415778229176966, 0.4030259104453218],
[0.9994577145581298, 2.000542285441873, 0, 1, 0.3331525715193763, 0, 0.499864465388755, 1.240278732542113, 0.6668474284806236, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687532629, 2.27526653124674, 1, 0, 0.2415778229177541, 1.379817606216351, 0, -3.423644908317997, 1, 0.2415778229177541, 0.4030259104453218],
[1.116828825089637, 1.016260404182969, 1, 0, 0.5235734210099036, 0.8953923623163467, 0, -2.22167443608523, 1, 0.5235734210099036, 0.4030259104453218],
[0.7259316630690049, 2.273691023645738, 1, 1, 0.2420076585912418, 1.377540133422921, 0.4398134969088963, -2.32671550937727, 0.941432293183185, 0.4254476103656685, 0.4030259104453218],
[0.9999793603635266, 2.000020639636476, 0, 1, 0.3333264534545085, 0, 0.4999948401441297, 1.240602222302934, 0.6666735465454915, 1, 0.4030259104453218],
[0.9989986800838047, 2.001001319916198, 0, 1, 0.3329995600279345, 0, 0.4997497952884308, 1.239994209643331, 0.6670004399720655, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027436712639, 2.132097256328739, 1, 0, 0.2893009145570877, 1.152202832969463, 0, -2.858880293071831, 1, 0.2893009145570877, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275376188010277, 0, 1, 0.2415193038407169, 0, 0.4394877670203883, 1.090470254219581, 0.7584806961592832, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675091559489084, 2.132490844051095, 1, 0, 0.2891697186496359, 1.152725585825281, 0, -2.860177363166505, 1, 0.2891697186496358, 0.4030259104453218],
[0.9996227742657561, 2.000377225734247, 0, 1, 0.3332075914219184, 0, 0.4999057113504907, 1.240381073261821, 0.6667924085780816, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.6612281135057514, 2.233116763401529, 0, 2, 0.2284551916329678, 0, 0.8956092367304429, 2.222212551398602, 0.5952813913181205, 1, 0.4030259104453218],
[0.867902720948878, 2.000361594066208, 1, 2, 0.3025881249526033, 1.152202863135053, 0.9998192356485546, -0.3780988356756579, 0.78073095916334, 0.6607904943959817, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334773182967, 2.000290320402054, 1, 1, 0.2659549167697474, 1.379817589909413, 0.4999274304336994, -2.18320990455299, 0.9292679822459968, 0.4611778157854914, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996224997922561, 2.000377500207747, 0, 2, 0.3332074999307518, 0, 0.9998112855160052, 2.480761806136156, 0.4446122381485985, 1, 0.4030259104453218],
[1.867534446826937, 1.132088153154501, 1, 0, 0.6225898040768507, 0.535465357385544, 0, -1.328612735577928, 1, 0.6225898040768507, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7317259674796586, 1.400174622835566, 0, 1, 0.3432270579612086, 0, 0.7141966321135346, 1.772086145340844, 0.6567729420387913, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675092622316986, 2.132310060048135, 1, 1, 0.2891871706367968, 1.152725444599248, 0.4689749482199722, -1.696542278444997, 0.9163707803390844, 0.4947451216126777, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275085716423368, 0, 1, 0.2415426916143776, 0, 0.4395438786245322, 1.090609480017947, 0.7584573083856223, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131907459, 2.000377286809257, 0, 1, 0.3332075710635816, 0, 0.4999056960874969, 1.240381035390822, 0.6667924289364184, 1, 0.4030259104453218],
[0.8667769855194553, 2.130590648271363, 1, 2, 0.2891794038701981, 1.153699298327245, 0.9387068330665409, -0.5334457653681596, 0.797490914897324, 0.6408465776251717, 0.4030259104453218],
[0.2705156835150459, 2.729484316484958, 1, 1, 0.0901718945050152, 3.696643340623098, 0.366369571702762, -8.263175350787158, 0.9918690294413764, 0.1722128184514068, 0.4030259104453218],
[1.86753451175739, 1.132088131598145, 1, 0, 0.622589816720502, 0.5354653387684806, 0, -1.328612689384711, 1, 0.622589816720502, 0.4030259104453218],
[0.9998549551985809, 1.680346522291798, 0, 1, 0.3730521617855387, 0, 0.5951153448016875, 1.476618076848005, 0.6269478382144613, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996226435814707, 2.000377356418532, 0, 1, 0.3332075478604899, 0, 0.4999056786917425, 1.240380992227953, 0.6667924521395101, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997095071189944, 2.000290492881009, 1, 1, 0.3332365023729978, 1.00029057729164, 0.4999273873264802, -1.241516182947855, 0.8889534334862111, 0.5554264382322065, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.680346501703212, 1, 0, 0.3730860914305504, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3730860914305504, 0.4030259104453218],
[0.7880887537479458, 2.211911246252053, 2, 1, 0.2626962512493153, 2.537785231026985, 0.4520977058615883, -5.175070562735843, 0.9818715102242865, 0.1707709817099037, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[1.455638586880647, 1.269188660679945, 1, 0, 0.5342131645900895, 0.6869837121746989, 0, -1.704564630635333, 1, 0.5342131645900895, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.002448483142990092, 2.997551516857012, 0, 2, 0.0008161610476633633, 0, 0.6672112184737484, 1.655504525097446, 0.998368344023529, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334977614435, 2.211760147996991, 1, 0, 0.2468023381587329, 1.379817550987776, 0, -3.423644771283198, 1, 0.246802338158733, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.868099409684778, 0, 0, 0.3486629496255526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 2.162856799339447, 0, 0, 0.2526551736282304, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311017086437264, 1.948806590975984, 1, 0, 0.272808479583974, 1.367798745615175, 0, -3.393823350225377, 1, 0.272808479583974, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.862154051900888, 1.137845948099114, 3, 0, 0.6207180173002955, 1.611037495494854, 0, -3.997354645796209, 0.9999999999999997, 0.239156976841723, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581038, 2.275463072841899, 0, 2, 0.241512309052701, 0, 0.8789419717992328, 2.180857232796892, 0.5753035773185653, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.005843962268816226, 2.994156037731186, 0, 3, 0.00194798742293874, 0, 1.001951789484306, 2.486072888904842, 0.9941674143042433, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245575026366169, 2.275149534659729, 1, 1, 0.2415427552184112, 1.380152708875508, 0.439531549362341, -2.333897486823693, 0.9416570974014986, 0.4247426078383211, 0.4030259104453218],
[0.9998549551988031, 1.680784805674685, 1, 1, 0.3729911679266444, 1.000145065842243, 0.5949601618385582, -1.005356959695166, 0.8608775886487177, 0.6068599245020065, 0.4030259104453218],
[0.9984905280059662, 2.001248716443285, 0, 2, 0.3328591076219653, 0, 0.9993760313583092, 2.479681840440613, 0.4450769702829604, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.2694352422436716, 2.730564757756332, 0, 2, 0.08981174741455711, 0, 0.7324492101199508, 1.817374990383705, 0.828442655144542, 1, 0.4030259104453218],
[1.385587924117461, 1.550992571365835, 1, 1, 0.4718372018913189, 0.7217152968743878, 0.6447484136686613, -0.1909725434791086, 0.7773696549113709, 0.7210440586940086, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7246238082259834, 2.275376191774019, 0, 1, 0.2415412694086609, 0, 0.4394877662934234, 1.090470252415814, 0.7584587305913391, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.455638576873301, 1.269188700878786, 1, 0, 0.534213154998274, 0.6869837168976324, 0, -1.704564642354018, 1, 0.534213154998274, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687307239, 2.275266531269279, 1, 0, 0.2415778229102411, 1.379817606259263, 0, -3.423644908424472, 1, 0.2415778229102411, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8932850054107553, 2.001929964163204, 4, 0, 0.3085384038140025, 4.477854185138479, 0, -11.11058636451114, 1, 0.009062268254418582, 0.4030259104453218],
[0.7317256441346459, 1.400174946180579, 0, 1, 0.3432269062913728, 0, 0.714196467182774, 1.772085736109685, 0.6567730937086272, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679028117803018, 2.015501892421199, 1, 1, 0.3009993049243671, 1.152202742549862, 0.4961543344415875, -1.627807024574117, 0.9093994184350478, 0.511398028283782, 0.4030259104453218],
[1.001872937603068, 1.865817048110966, 0, 2, 0.3493658458878388, 0, 1.071916457202964, 2.65967132489957, 0.4233248024972475, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131907459, 2.000290405741378, 1, 1, 0.3332172211529182, 1.000377429208316, 0.4999274091050619, -1.241731628495755, 0.8889662835271271, 0.5554007258329636, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.9997095071189948, 2.000290492881008, 0, 1, 0.333236502372998, 0, 0.4999273873264803, 1.240434856344813, 0.666763497627002, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027435966314, 2.132097256403372, 1, 0, 0.2893009145322102, 1.152202833068543, 0, -2.858880293317671, 1, 0.2893009145322102, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218]
],
"RESOLVED": [
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8940546893724309, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3089280560784095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 2.162856799339447, 0, 0, 0.2526551736282304, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.002557407931947803, 2.997442592068055, 0, 1, 0.0008524693106492667, 0, 0.3336177322115317, 0.8277823424377411, 0.9991475306893507, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.999819399844753, 1, 3, 0.333353401225338, 0.9999999999999991, 1.500135462348696, 1.24095113834263, 0.592556916340172, 0.8024929188968718, 0.4030259104453218],
[0.8690694636598586, 2.130552998144689, 1, 3, 0.28972628213253, 1.15065600831119, 1.408085132175748, 0.6387408779254717, 0.6697737029117101, 0.7454910967916162, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 2.162856799339447, 0, 0, 0.2526551736282304, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997097198138807, 2.000290280186122, 1, 2, 0.3332365732712932, 1.000290364473173, 0.9998548809695283, -0.001080534755601995, 0.7408697447924727, 0.703574671561725, 0.4030259104453218],
[0.6612068343291114, 2.0187014652906, 3, 0, 0.2467274101964381, 4.537158184464212, 0, -11.25773322973428, 0.9999999999999999, 0.01501938674592274, 0.4030259104453218],
[0.9920752783272927, 2.007924721672711, 0, 11, 0.3306917594424306, 0, 5.478293026262659, 13.59290528048046, 0.01207502095272099, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.002448271681231308, 2.997551728318771, 0, 2, 0.0008160905604104353, 0, 0.6672111714054505, 1.655504408310171, 0.9983684848829819, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000624195225998, 1.998998517964833, 0, 1, 0.3335833506079803, 0, 0.5002504959423848, 1.241236563152069, 0.6664166493920197, 1, 0.4030259104453218],
[0.9994192560652677, 2.000580743934735, 1, 2, 0.3331397520217556, 1.000581081394228, 0.9997097123240358, -0.002162067121761181, 0.7409988116679451, 0.7034455203335641, 0.4030259104453218],
[0.7247334977193396, 2.211760148054754, 1, 0, 0.2468023381430786, 1.379817551067938, 0, -3.423644771482097, 1, 0.2468023381430786, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997095405052131, 2.00029045949479, 1, 1, 0.3332365135017373, 1.000290543886017, 0.499927395670611, -1.241516079357112, 0.8889534260692064, 0.5554264530726811, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.867509495800815, 2.132490504199188, 3, 0, 0.2891698319336047, 3.458175402714919, 0, -8.580528728026003, 1, 0.02418014761046006, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0, 1.67816407142085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7249140331321142, 2.274708680058717, 0, 2, 0.2416684038110217, 0, 0.8792334673591583, 2.181580500339675, 0.5750668097785236, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027435542768, 2.132097256445726, 1, 0, 0.289300914518092, 1.152202833124772, 0, -2.858880293457188, 1, 0.289300914518092, 0.4030259104453218],
[1.000624499916046, 1.998998029108789, 1, 1, 0.3335834726649238, 0.9993758898406965, 0.5002506182789128, -1.238444622605721, 0.8887220667648099, 0.5558890120946577, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.8679027209489273, 2.000020639058163, 1, 1, 0.3026240983464711, 1.152202863134987, 0.4999948402887052, -1.618278145257777, 0.9084186550999854, 0.5136668517929275, 0.4030259104453218],
[0.724733468752963, 2.211760187794674, 1, 0, 0.2468023273733254, 1.379817606216922, 0, -3.423644908319414, 1, 0.2468023273733253, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8940546893724309, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3089280560784095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7254881093630809, 2.274511890636921, 1, 1, 0.2418293697876934, 1.378382342996521, 0.4396547690590329, -2.329199065390722, 0.941518555908087, 0.4251772954834739, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9846996957339496, 2.015300304266051, 1, 2, 0.3282332319113165, 1.015538041021376, 0.9924079283699493, -0.05739113057487816, 0.7475145996177532, 0.6968514137464041, 0.4030259104453218],
[0.8679027209489275, 2.01534160893421, 1, 0, 0.3010160158657469, 1.152202863134987, 0, -2.858880367919435, 1, 0.3010160158657469, 0.4030259104453218],
[0.9999380365407623, 2.000061963459241, 1, 3, 0.3333126788469204, 1.000061967298946, 1.499953528845326, 1.240345964342657, 0.5926293116795137, 0.8024446552735206, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675182674433656, 2.132042842712578, 2, 1, 0.2892150669996733, 2.305426957629531, 0.4690337266992765, -4.556514068540008, 0.9758085030553563, 0.2025530710495888, 0.4030259104453218],
[0.001447426485735013, 2.998552573514268, 0, 2, 0.0004824754952450039, 0, 0.6669884722601425, 1.654951840498682, 0.9990352817921134, 1, 0.4030259104453218],
[0.9969808196324724, 2.00301918036753, 0, 4, 0.3323269398774905, 0, 1.996985370487589, 4.954980111033131, 0.1987263304051322, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027209489275, 2.132097279051076, 1, 0, 0.2893009069829755, 1.152202863134987, 0, -2.858880367919435, 1, 0.2893009069829755, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687532629, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2659832519636769, 1.379817606216351, 0, -3.423644908317997, 1, 0.2659832519636769, 0.4030259104453218],
[0.7311016597226977, 1.948806639897013, 1, 0, 0.2728084613292343, 1.367798837140233, 0, -3.393823577320101, 1, 0.2728084613292343, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7881527570266891, 2.21184724297331, 1, 1, 0.2627175856755631, 1.268789572940791, 0.4521107880197613, -2.026367942494427, 0.9309794701768032, 0.4564146415279293, 0.4030259104453218],
[0.9988678201948341, 2.000871463055757, 0, 1, 0.3329848783099698, 0, 0.4997822291256965, 1.240074685454998, 0.6670151216900302, 1, 0.4030259104453218],
[0.6611409548546929, 2.23305879941392, 0, 1, 0.2284365320256785, 0, 0.4478162421260273, 1.111135116923909, 0.7715634679743215, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7250401475319685, 2.274959852468034, 0, 2, 0.2416800491773226, 0, 0.8791363934753667, 2.181339637702123, 0.5750491478157077, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.867509187477698, 2.132490812522305, 1, 0, 0.2891697291592324, 1.152725543930574, 0, -2.860177259216101, 1, 0.2891697291592323, 0.4030259104453218],
[1.384549668009553, 1.552103969852171, 0, 1, 0.4714718992252999, 0, 0.6442867355691668, 1.598623609229652, 0.5285281007747001, 1, 0.4030259104453218],
[1.000624195225998, 1.998998517964833, 1, 1, 0.3335833506079803, 0.9993761941506349, 0.5002504959423848, -1.238445681213754, 0.8887221481971533, 0.5558888494131138, 0.4030259104453218],
[0.6610050997275695, 1.47208447919852, 0, 1, 0.3098815475252354, 0, 0.6793088400364442, 1.68552150725457, 0.6901184524747646, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[0.9988678468409422, 2.001132153159061, 0, 1, 0.3329559489469804, 0, 0.4997171218409355, 1.239913139303563, 0.6670440510530196, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9998193094863549, 2.000180690513648, 1, 1, 0.333273103162118, 1.000180723168607, 0.4999548314523521, -1.241175514406835, 0.8889290387086923, 0.5554752450329282, 0.4030259104453218],
[0.8238710338426564, 2.175983841108045, 1, 0, 0.2746369635151753, 1.213782204886913, 0, -3.011672881144911, 1, 0.2746369635151753, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.7879701703642383, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2626567234547462, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.681223299299231, 1, 0, 0.3729640870498784, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3729640870498785, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.274707898606819, 0, 1, 0.2415731189844827, 0, 0.4396168847052697, 1.090790624899319, 0.7584268810155173, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996225999814369, 2.000377400018566, 0, 1, 0.3332075333271453, 0, 0.4999056677958463, 1.240380965192728, 0.6667924666728547, 1, 0.4030259104453218],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7326618685397315, 1.403564629642364, 1, 2, 0.3429701247331303, 1.364886099495119, 1.424943289223248, 0.14901570388308, 0.727800607686768, 0.7163679183535865, 0.4030259104453218],
[0.7244498123832623, 2.275405114489725, 0, 2, 0.2414949489368875, 0, 0.8789643599129, 2.180912782857291, 0.5753299124882549, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9986299304152204, 2.000930636983806, 0, 2, 0.3329254095646252, 0, 0.9995348979286917, 2.480076024949016, 0.4449885092045229, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.6611408414914554, 2.233058839029525, 0, 1, 0.2284364986773975, 0, 0.4478162341815384, 1.111135097211804, 0.7715635013226024, 1, 0.4030259104453218],
[0.9988675475100293, 2.001132452489974, 1, 1, 0.3329558491700095, 1.001133736392571, 0.4997170470928687, -1.244130157154572, 0.8891404025034777, 0.555052100843497, 0.4030259104453218],
[0.6627893419229219, 2.232571180817334, 0, 5, 0.2289142705087511, 0, 2.23957025109028, 5.556889006505006, 0.2725921396096611, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7260708156300464, 2.273490827470535, 1, 3, 0.242058974617212, 1.377276125789813, 1.31955667634594, -0.1432152324402584, 0.7516082722334591, 0.6699789363006357, 0.4030259104453218],
[0.9969944734936453, 2.003005526506358, 1, 1, 0.3323314911645481, 1.00301458692727, 0.4992497458278111, -1.249956461962523, 0.889555779980348, 0.5542187623094441, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.7247334977823632, 2.275266502217639, 1, 0, 0.2415778325941209, 1.379817550947947, 0, -3.423644771184373, 1, 0.2415778325941209, 0.4030259104453218],
[0.9996224997922561, 2.000377500207747, 0, 2, 0.3332074999307518, 0, 0.9998112855160052, 2.480761806136156, 0.4446122381485985, 1, 0.4030259104453218],
[0.6609179642895747, 2.233136725082857, 0, 0, 0.2283709311771482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.6611794347457508, 2.233310684056061, 0, 1, 0.2284269103048275, 0, 0.4477657350314713, 1.111009797203149, 0.7715730896951725, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.000290320402492, 0, 1, 0.2659019678428224, 0, 0.4999274304335899, 1.240434963303469, 0.7340980321571776, 1, 0.4030259104453218],
[0.6610142243792574, 2.233040464993175, 1, 0, 0.2284041925007977, 1.512826748832941, 0, -3.753671189927588, 1, 0.2284041925007977, 0.4030259104453218],
[0.7249144250430091, 2.275085574956994, 0, 1, 0.2416381416810028, 0, 0.4395439059556707, 1.09060954783279, 0.7583618583189972, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131907459, 2.000377286809257, 0, 2, 0.3332075710635816, 0, 0.9998113921749937, 2.480762070781644, 0.4446121432869286, 1, 0.4030259104453218],
[0.9998193408260574, 2.000180659173945, 1, 2, 0.3332731136086855, 1.000180691817577, 0.9999096785717245, -0.0006724462096074473, 0.7408210300800859, 0.7036234034844577, 0.4030259104453218],
[0.7879701703642383, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2626567234547462, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311016497151981, 1.400798940600027, 1, 0, 0.3429342123344957, 1.367798855863, 0, -3.393823623775595, 1, 0.3429342123344956, 0.4030259104453218],
[1.003568287709796, 1.995889615103557, 0, 2, 0.3345832214442799, 0, 1.002059424962853, 2.48633995728868, 0.4427794891834723, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.679908299619715, 0, 0, 0.3731470961681422, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.6610051539070365, 1.472085164313773, 0, 1, 0.3098814655248048, 0, 0.6793085238829644, 1.685520722805055, 0.6901185344751952, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.72566828283447, 2.274331717165533, 0, 1, 0.2418894276114898, 0, 0.4396895986862839, 1.09097104501408, 0.7581105723885102, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.868280511594813, 0, 1, 0.3486409352075482, 0, 0.5352515287687575, 1.328082177588368, 0.6513590647924518, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.455638576893915, 1.269188700795979, 1, 0, 0.5342131550180326, 0.6869837168879033, 0, -1.704564642329878, 1, 0.5342131550180326, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675092119931352, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3025305754432609, 1.152725511355046, 0, -2.860177178388722, 1, 0.3025305754432609, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131908294, 2.000290405741313, 0, 1, 0.3332172211529439, 0, 0.499927409105078, 1.240434910382524, 0.6667827788470562, 1, 0.4030259104453218],
[1.000624310389922, 1.86727843328194, 0, 1, 0.3489045479655257, 0, 0.535538772459549, 1.328794895265685, 0.6510954520344743, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.9997095592123415, 2.000290440787661, 0, 1, 0.3332365197374469, 0, 0.4999274003460351, 1.240434888649324, 0.6667634802625531, 1, 0.4030259104453218],
[0.8680994096847775, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3026741007488951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7324419157885084, 1.40064778596679, 0, 2, 0.3433713618258946, 0, 1.427910728191749, 3.542975007770554, 0.4311611684703802, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8238710338426234, 2.175983841108127, 1, 0, 0.2746369635151598, 1.213782204886962, 0, -3.011672881145031, 1, 0.2746369635151598, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.867902743671264, 2.131937235300557, 1, 1, 0.2893163467901821, 1.152202832969463, 0.4690569607031708, -1.695042066926796, 0.9162960514799832, 0.4949287450603472, 0.4030259104453218],
[0.9991282739234725, 2.000871726076531, 0, 1, 0.3330427579744905, 0, 0.4997821634277776, 1.240074522443347, 0.6669572420255095, 1, 0.4030259104453218],
[0.7882605208960299, 2.21173947910397, 0, 1, 0.2627535069653433, 0, 0.4521328164767058, 1.121845530916669, 0.7372464930346567, 1, 0.4030259104453218],
[0.6610142345031792, 2.233040454869253, 1, 0, 0.2284041959989769, 1.51282672566288, 0, -3.753671132437338, 1, 0.2284041959989769, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.868099409684778, 0, 0, 0.3486629496255526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8680994096847775, 2.131900590315225, 0, 0, 0.2893664698949255, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7255461937746552, 2.274453806225347, 1, 3, 0.2418487312582182, 1.378271995057266, 1.318997990545589, -0.1470724411891595, 0.751959046196637, 0.6696126090552568, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.86812004874511, 1, 0, 0.3486604406386444, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3486604406386444, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2467292546583041, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9990415287203291, 2.000958471279674, 0, 2, 0.3330138429067761, 0, 0.9995209939169498, 2.480041525897263, 0.4448705337539867, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8665261446626705, 2.133473855337332, 2, 1, 0.2888420482208899, 2.308066539387082, 0.4687191256167917, -4.563844075776445, 0.9759019862449911, 0.2020931589512986, 0.4030259104453218],
[0.2698032977044231, 2.73019670229558, 0, 1, 0.08993443256814093, 0, 0.3662739754828613, 0.9088099945687074, 0.9100655674318591, 1, 0.4030259104453218],
[0.7249141030975264, 2.275085896902477, 0, 2, 0.2416380343658419, 0, 0.8790876875123681, 2.181218787003108, 0.5751128709205039, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687307239, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2659832519576051, 1.379817606259263, 0, -3.423644908424472, 1, 0.2659832519576051, 0.4030259104453218],
[0.867902811780928, 2.132097188219075, 1, 0, 0.289300937260309, 1.15220274254903, 0, -2.858880068717935, 1, 0.289300937260309, 0.4030259104453218],
[0.724733468752963, 2.211556661232346, 1, 2, 0.2468194342759273, 1.379817606216922, 0.9043403838839653, -1.179768372230908, 0.8473128980928991, 0.5727350021697982, 0.4030259104453218],
[0.9999587196135001, 2.000041280386503, 1, 2, 0.3333195732044997, 1.000041282090641, 0.9999793602327574, -0.0001536423745431378, 0.7407590873898393, 0.7036853564865739, 0.4030259104453218],
[0.999622774265756, 2.000377225734247, 0, 2, 0.3332075914219184, 0, 0.9998114227009817, 2.480762146523642, 0.4446121161373593, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334977614435, 2.275266502238559, 1, 0, 0.2415778325871476, 1.379817550987776, 0, -3.423644771283198, 1, 0.2415778325871476, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.21182664458265, 0, 2, 0.2467463273727303, 0, 0.9042299969116163, 2.243602640615565, 0.5673910953264699, 1, 0.4030259104453218],
[0.867902720948878, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3026262762014892, 1.152202863135053, 0, -2.858880367919598, 1, 0.3026262762014892, 0.4030259104453218],
[0.001447083458244785, 2.998552916541758, 0, 2, 0.0004823611527482612, 0, 0.6669883959582102, 1.654951651176035, 0.9990355103667852, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027435541103, 2.132097256445893, 1, 0, 0.2893009145180365, 1.152202833124993, 0, -2.858880293457736, 1, 0.2893009145180365, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.008787512689936708, 2.991212487310066, 0, 2, 0.002929170896645567, 0, 0.6686251840966865, 1.659012899091008, 0.9941502382488506, 1, 0.4030259104453218],
[0.7323070387043985, 1.948922044015752, 0, 1, 0.273123637000633, 0, 0.5131041557411404, 1.273129450099593, 0.726876362999367, 1, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.999819288717243, 0, 1, 0.3333534135743264, 0, 0.5000451819031292, 1.240727131788143, 0.6666465864256736, 1, 0.4030259104453218],
[0.999709641269299, 2.000290358730704, 1, 1, 0.333236547089766, 1.00029044306338, 0.4999274208543183, -1.241515766706384, 0.8889534036836901, 0.5554264978632222, 0.4030259104453218],
[0.999854955282326, 1.680784744710821, 1, 1, 0.3729911764288509, 1.000145065758696, 0.5949601834184007, -1.005356905943312, 0.8608775823062218, 0.6068599351639237, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999996, -3.72184507527712, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.8671149893101017, 2.132885010689901, 1, 0, 0.2890383297700336, 1.153249583190374, 0, -2.861477521174991, 1, 0.2890383297700336, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7315657583837166, 1.947585858216119, 0, 2, 0.2730587376432848, 0, 1.026912365153385, 2.548005819324874, 0.5284435989167747, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675092866744041, 2.132490713325599, 1, 1, 0.289169762224801, 1.152725412120369, 0.4689352191553085, -1.696640774806537, 0.9163808486148519, 0.4947203730644542, 0.4030259104453218],
[0.7249140448475131, 2.27508595515249, 0, 1, 0.2416380149491708, 0, 0.4395438325023522, 1.090609365578208, 0.7583619850508292, 1, 0.4030259104453218],
[0.724733468752963, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2659832519635961, 1.379817606216922, 0, -3.423644908319414, 1, 0.2659832519635961, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.679908299619715, 0, 0, 0.3731470961681422, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 1.499999999999999, 1.240615025092373, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131908294, 2.000377286809174, 0, 1, 0.3332075710636094, 0, 0.4999056960875177, 1.240381035390874, 0.6667924289363906, 1, 0.4030259104453218],
[0.8680832557071579, 2.131916744292845, 1, 1, 0.289361085235719, 1.151963240191034, 0.4690614690639334, -1.694436395844951, 0.916270162351207, 0.494992332822645, 0.4030259104453218],
[0.8235517040576829, 2.176303186154638, 0, 1, 0.2745305137074128, 0, 0.4594948012583319, 1.140112308785842, 0.7254694862925872, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.401747261447588, 0, 1, 0.3428113889967722, 0, 0.7133953655577663, 1.770098018684464, 0.6571886110032279, 1, 0.4030259104453218],
[0.9989986800872194, 2.001001319912783, 1, 2, 0.3329995600290728, 1.00100232355932, 0.9994995905785674, -0.003728626229246355, 0.7411856603341018, 0.7032584497849352, 0.4030259104453218],
[0.9988908513285889, 1.999788365570975, 1, 6, 0.3331102725823992, 1.001110380248188, 3.000317485238941, 4.960492745445913, 0.2637859315660765, 0.9413351190022828, 0.4030259104453218],
[0.7311016597225446, 1.40079893059268, 1, 0, 0.3429342170285919, 1.367798837140519, 0, -3.393823577320812, 1, 0.3429342170285918, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.998934200539499, 0, 4, 0.3334517975819888, 0, 2.001066367727576, 4.965106004019706, 0.1973904995440257, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9986301016152772, 2.001369898384726, 2, 1, 0.3328767005384254, 2.002743555161229, 0.4996577598209528, -3.729501643404137, 0.9631149654763037, 0.258650624236653, 0.4030259104453218],
[0.8679028117802539, 2.132097188219749, 1, 0, 0.2893009372600844, 1.152202742549925, 0, -2.858880068720156, 1, 0.2893009372600843, 0.4030259104453218],
[0.9989986800872375, 2.001001319912765, 0, 1, 0.3329995600290789, 0, 0.4997497952892883, 1.239994209645459, 0.6670004399709211, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997095071189945, 2.000290492881009, 0, 1, 0.3332365023729978, 0, 0.4999273873264802, 1.240434856344813, 0.6667634976270022, 1, 0.4030259104453218],
[0.7879701703642383, 2.212029829635761, 0, 0, 0.2626567234547462, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.456299357341658, 1.268614687462938, 1, 0, 0.5344386404107985, 0.686672005284277, 0, -1.703791214131969, 1, 0.5344386404107985, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0, 1.67816407142085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.386115744493387, 1.550537867222449, 1, 0, 0.4720051894998619, 0.7214404741975506, 0, -1.790059783998498, 1, 0.4720051894998619, 0.4030259104453218],
[0.8679028117809243, 2.000180602746366, 1, 1, 0.3026072419598611, 1.152202742549035, 0.4999548533902093, -1.61837706275045, 0.9084288571134461, 0.5136433410331682, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.9996226745224479, 2.000377325477555, 0, 1, 0.333207558174149, 0, 0.4999056864240688, 1.240381011413634, 0.6667924418258511, 1, 0.4030259104453218],
[0.2708039693766001, 2.729196030623403, 0, 2, 0.09026798979219994, 0, 0.7328165428788052, 1.818286427463392, 0.8276123303967248, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9995645867560881, 1.681223810091926, 0, 1, 0.3728621729082923, 0, 0.5948048046888664, 1.475847555388286, 0.6271378270917076, 1, 0.4030259104453218],
[0.8669191970265852, 2.132900142807595, 2, 2, 0.2889904686975268, 2.307020085447096, 0.9376904055936462, -3.397621950262241, 0.924383788161836, 0.3289360106018502, 0.4030259104453218],
[0.8226464840783725, 2.177353515921624, 0, 1, 0.2742154946927912, 0, 0.4592731463621436, 1.139562331996649, 0.7257845053072088, 1, 0.4030259104453218],
[0, 1.67816407142085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687530904, 2.275266531246912, 1, 0, 0.2415778229176966, 1.37981760621668, 0, -3.423644908318812, 1, 0.2415778229176966, 0.4030259104453218],
[0.9994577145581298, 2.000542285441873, 0, 1, 0.3331525715193763, 0, 0.499864465388755, 1.240278732542113, 0.6668474284806236, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687532629, 2.27526653124674, 1, 0, 0.2415778229177541, 1.379817606216351, 0, -3.423644908317997, 1, 0.2415778229177541, 0.4030259104453218],
[1.116828825089637, 1.016260404182969, 1, 0, 0.5235734210099036, 0.8953923623163467, 0, -2.22167443608523, 1, 0.5235734210099036, 0.4030259104453218],
[0.7259316630690049, 2.273691023645738, 1, 1, 0.2420076585912418, 1.377540133422921, 0.4398134969088963, -2.32671550937727, 0.941432293183185, 0.4254476103656685, 0.4030259104453218],
[0.9999793603635266, 2.000020639636476, 0, 1, 0.3333264534545085, 0, 0.4999948401441297, 1.240602222302934, 0.6666735465454915, 1, 0.4030259104453218],
[0.9989986800838047, 2.001001319916198, 0, 1, 0.3329995600279345, 0, 0.4997497952884308, 1.239994209643331, 0.6670004399720655, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027436712639, 2.132097256328739, 1, 0, 0.2893009145570877, 1.152202832969463, 0, -2.858880293071831, 1, 0.2893009145570877, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275376188010277, 0, 1, 0.2415193038407169, 0, 0.4394877670203883, 1.090470254219581, 0.7584806961592832, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675091559489084, 2.132490844051095, 1, 0, 0.2891697186496359, 1.152725585825281, 0, -2.860177363166505, 1, 0.2891697186496358, 0.4030259104453218],
[0.9996227742657561, 2.000377225734247, 0, 1, 0.3332075914219184, 0, 0.4999057113504907, 1.240381073261821, 0.6667924085780816, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.6612281135057514, 2.233116763401529, 0, 2, 0.2284551916329678, 0, 0.8956092367304429, 2.222212551398602, 0.5952813913181205, 1, 0.4030259104453218],
[0.867902720948878, 2.000361594066208, 1, 2, 0.3025881249526033, 1.152202863135053, 0.9998192356485546, -0.3780988356756579, 0.78073095916334, 0.6607904943959817, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334773182967, 2.000290320402054, 1, 1, 0.2659549167697474, 1.379817589909413, 0.4999274304336994, -2.18320990455299, 0.9292679822459968, 0.4611778157854914, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996224997922561, 2.000377500207747, 0, 2, 0.3332074999307518, 0, 0.9998112855160052, 2.480761806136156, 0.4446122381485985, 1, 0.4030259104453218],
[1.867534446826937, 1.132088153154501, 1, 0, 0.6225898040768507, 0.535465357385544, 0, -1.328612735577928, 1, 0.6225898040768507, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7317259674796586, 1.400174622835566, 0, 1, 0.3432270579612086, 0, 0.7141966321135346, 1.772086145340844, 0.6567729420387913, 1, 0.4030259104453218],
[0.8675092622316986, 2.132310060048135, 1, 1, 0.2891871706367968, 1.152725444599248, 0.4689749482199722, -1.696542278444997, 0.9163707803390844, 0.4947451216126777, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275085716423368, 0, 1, 0.2415426916143776, 0, 0.4395438786245322, 1.090609480017947, 0.7584573083856223, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131907459, 2.000377286809257, 0, 1, 0.3332075710635816, 0, 0.4999056960874969, 1.240381035390822, 0.6667924289364184, 1, 0.4030259104453218],
[0.8667769855194553, 2.130590648271363, 1, 2, 0.2891794038701981, 1.153699298327245, 0.9387068330665409, -0.5334457653681596, 0.797490914897324, 0.6408465776251717, 0.4030259104453218],
[0.2705156835150459, 2.729484316484958, 1, 1, 0.0901718945050152, 3.696643340623098, 0.366369571702762, -8.263175350787158, 0.9918690294413764, 0.1722128184514068, 0.4030259104453218],
[1.86753451175739, 1.132088131598145, 1, 0, 0.622589816720502, 0.5354653387684806, 0, -1.328612689384711, 1, 0.622589816720502, 0.4030259104453218],
[0.9998549551985809, 1.680346522291798, 0, 1, 0.3730521617855387, 0, 0.5951153448016875, 1.476618076848005, 0.6269478382144613, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996226435814707, 2.000377356418532, 0, 1, 0.3332075478604899, 0, 0.4999056786917425, 1.240380992227953, 0.6667924521395101, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.9997095071189944, 2.000290492881009, 1, 1, 0.3332365023729978, 1.00029057729164, 0.4999273873264802, -1.241516182947855, 0.8889534334862111, 0.5554264382322065, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.680346501703212, 1, 0, 0.3730860914305504, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3730860914305504, 0.4030259104453218],
[0.7880887537479458, 2.211911246252053, 2, 1, 0.2626962512493153, 2.537785231026985, 0.4520977058615883, -5.175070562735843, 0.9818715102242865, 0.1707709817099037, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[1.455638586880647, 1.269188660679945, 1, 0, 0.5342131645900895, 0.6869837121746989, 0, -1.704564630635333, 1, 0.5342131645900895, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.002448483142990092, 2.997551516857012, 0, 2, 0.0008161610476633633, 0, 0.6672112184737484, 1.655504525097446, 0.998368344023529, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334977614435, 2.211760147996991, 1, 0, 0.2468023381587329, 1.379817550987776, 0, -3.423644771283198, 1, 0.246802338158733, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 1.868099409684778, 0, 0, 0.3486629496255526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 2.162856799339447, 0, 0, 0.2526551736282304, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311017086437264, 1.948806590975984, 1, 0, 0.272808479583974, 1.367798745615175, 0, -3.393823350225377, 1, 0.272808479583974, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.862154051900888, 1.137845948099114, 3, 0, 0.6207180173002955, 1.611037495494854, 0, -3.997354645796209, 0.9999999999999997, 0.239156976841723, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581038, 2.275463072841899, 0, 2, 0.241512309052701, 0, 0.8789419717992328, 2.180857232796892, 0.5753035773185653, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.005843962268816226, 2.994156037731186, 0, 3, 0.00194798742293874, 0, 1.001951789484306, 2.486072888904842, 0.9941674143042433, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245575026366169, 2.275149534659729, 1, 1, 0.2415427552184112, 1.380152708875508, 0.439531549362341, -2.333897486823693, 0.9416570974014986, 0.4247426078383211, 0.4030259104453218],
[0.9998549551988031, 1.680784805674685, 1, 1, 0.3729911679266444, 1.000145065842243, 0.5949601618385582, -1.005356959695166, 0.8608775886487177, 0.6068599245020065, 0.4030259104453218],
[0.9984905280059662, 2.001248716443285, 0, 2, 0.3328591076219653, 0, 0.9993760313583092, 2.479681840440613, 0.4450769702829604, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.2694352422436716, 2.730564757756332, 0, 2, 0.08981174741455711, 0, 0.7324492101199508, 1.817374990383705, 0.828442655144542, 1, 0.4030259104453218],
[1.385587924117461, 1.550992571365835, 1, 1, 0.4718372018913189, 0.7217152968743878, 0.6447484136686613, -0.1909725434791086, 0.7773696549113709, 0.7210440586940086, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7246238082259834, 2.275376191774019, 0, 1, 0.2415412694086609, 0, 0.4394877662934234, 1.090470252415814, 0.7584587305913391, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.240615025092373, 0.6666666666666667, 1, 0.4030259104453218],
[1.455638576873301, 1.269188700878786, 1, 0, 0.534213154998274, 0.6869837168976324, 0, -1.704564642354018, 1, 0.534213154998274, 0.4030259104453218],
[1.455734817191089, 1.268802109967014, 0, 0, 0.5343054089964309, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7247334687307239, 2.275266531269279, 1, 0, 0.2415778229102411, 1.379817606259263, 0, -3.423644908424472, 1, 0.2415778229102411, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.948710409586724, 0, 0, 0.2728443693900818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.481230050184747, 1, 0.3333333333333333, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.7245369271581037, 2.275463072841899, 0, 0, 0.241512309052701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218],
[0.8932850054107553, 2.001929964163204, 4, 0, 0.3085384038140025, 4.477854185138479, 0, -11.11058636451114, 1, 0.009062268254418582, 0.4030259104453218],
[0.7317256441346459, 1.400174946180579, 0, 1, 0.3432269062913728, 0, 0.714196467182774, 1.772085736109685, 0.6567730937086272, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679028117803018, 2.015501892421199, 1, 1, 0.3009993049243671, 1.152202742549862, 0.4961543344415875, -1.627807024574117, 0.9093994184350478, 0.511398028283782, 0.4030259104453218],
[1.001872937603068, 1.865817048110966, 0, 2, 0.3493658458878388, 0, 1.071916457202964, 2.65967132489957, 0.4233248024972475, 1, 0.4030259104453218],
[0.9996227131907459, 2.000290405741378, 1, 1, 0.3332172211529182, 1.000377429208316, 0.4999274091050619, -1.241731628495755, 0.8889662835271271, 0.5554007258329636, 0.4030259104453218],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.240615025092373, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4030259104453218],
[0.9997095071189948, 2.000290492881008, 0, 1, 0.333236502372998, 0, 0.4999273873264803, 1.240434856344813, 0.666763497627002, 1, 0.4030259104453218],
[0.8679027435966314, 2.132097256403372, 1, 0, 0.2893009145322102, 1.152202833068543, 0, -2.858880293317671, 1, 0.2893009145322102, 0.4030259104453218],
[0.7311978900329864, 1.400702700282238, 0, 0, 0.3429793553013984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4030259104453218]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node125":{
"Global MG94xREV":0.001104286952643879,
"Nucleotide GTR":0.001090469944938942,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node142":{
"Global MG94xREV":0.001103672556321043,
"Nucleotide GTR":0.001089863236037123,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node153":{
"Global MG94xREV":0.001103352304276456,
"Nucleotide GTR":0.00108954699103523,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.001104174648472764,
"Nucleotide GTR":0.00109035904593484,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node159":{
"Global MG94xREV":0.00110379965113081,
"Nucleotide GTR":0.001089988740617137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "L", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "CTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.001104186928356046,
"Nucleotide GTR":0.001090371172170338,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACT", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.001103773521435028,
"Nucleotide GTR":0.001089962937860117,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "I", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"Global MG94xREV":0.001103809908331287,
"Nucleotide GTR":0.001089998869477949,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node172":{
"Global MG94xREV":0.001104352961757169,
"Nucleotide GTR":0.001090535128136084,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACT", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node178":{
"Global MG94xREV":0.001103734610325274,
"Nucleotide GTR":0.001089924513612136,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node181":{
"Global MG94xREV":0.001103990844295864,
"Nucleotide GTR":0.001090177541543989,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "G", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GGT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node184":{
"Global MG94xREV":0.001104179888671717,
"Nucleotide GTR":0.001090364220567621,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAT", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node190":{
"Global MG94xREV":0.001103693418044288,
"Nucleotide GTR":0.001089883836735286,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node193":{
"Global MG94xREV":0.001103778810139264,
"Nucleotide GTR":0.001089968160391274,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node197":{
"Global MG94xREV":0.001103691464404111,
"Nucleotide GTR":0.001089881907539356,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node200":{
"Global MG94xREV":0.001104340351576177,
"Nucleotide GTR":0.001090522675735611,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.001103772305077626,
"Nucleotide GTR":0.001089961736721966,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node208":{
"Global MG94xREV":0.001104209759103029,
"Nucleotide GTR":0.001090393717255514,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node211":{
"Global MG94xREV":0.00110398156898007,
"Nucleotide GTR":0.001090168382282369,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001104582986394629,
"Nucleotide GTR":0.001090762274670005,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node268":{
"Global MG94xREV":0.001104062875205308,
"Nucleotide GTR":0.001090248671191648,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTT", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node272":{
"Global MG94xREV":0.001104174621953373,
"Nucleotide GTR":0.001090359019747263,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"Global MG94xREV":0.001104062875205308,
"Nucleotide GTR":0.001090248671191648,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.001104067743072021,
"Nucleotide GTR":0.001090253478150866,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.001104066845842475,
"Nucleotide GTR":0.001090252592147593,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"Global MG94xREV":0.001103222915088252,
"Nucleotide GTR":0.001089419220784392,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCC", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node368":{
"Global MG94xREV":0.001103777574309755,
"Nucleotide GTR":0.001089966940024652,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node404":{
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.001104175125681025,
"Nucleotide GTR":0.001090359517172198,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.001103530724705691,
"Nucleotide GTR":0.001089723179040692,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.001104169391343402,
"Nucleotide GTR":0.001090353854583487,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node436":{
"Global MG94xREV":0.001104960624316258,
"Nucleotide GTR":0.00109113518752804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node442":{
"Global MG94xREV":0.001104172816685826,
"Nucleotide GTR":0.0010903572370675,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.001103397367736745,
"Nucleotide GTR":0.001089591490654593,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node453":{
"Global MG94xREV":0.001103675309713574,
"Nucleotide GTR":0.001089865954978784,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node456":{
"Global MG94xREV":0.001104173191217339,
"Nucleotide GTR":0.001090357606912819,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node459":{
"Global MG94xREV":0.001104218828729323,
"Nucleotide GTR":0.001090402673401254,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node491":{
"Global MG94xREV":0.001103719018280343,
"Nucleotide GTR":0.001089909116657262,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "S", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AGT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.001103222913931469,
"Nucleotide GTR":0.001089419219642084,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAC", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node514":{
"Global MG94xREV":0.001103595719895287,
"Nucleotide GTR":0.001089787361000509,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "R", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CGT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node536":{
"Global MG94xREV":0.001104012946588387,
"Nucleotide GTR":0.001090199367289238,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.001103501561367417,
"Nucleotide GTR":0.00108969438059858,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATC", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.001103501926773745,
"Nucleotide GTR":0.001089694741432887,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTC", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node666":{
"Global MG94xREV":0.001103736040474671,
"Nucleotide GTR":0.001089925925867285,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGG", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node680":{
"Global MG94xREV":0.001103736040474671,
"Nucleotide GTR":0.001089925925867285,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "R", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "AGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.001104156743208304,
"Nucleotide GTR":0.001090341364703795,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "N", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAT", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node700":{
"Global MG94xREV":0.001104155737302012,
"Nucleotide GTR":0.001090340371383555,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node705":{
"Global MG94xREV":0.001103945607426433,
"Nucleotide GTR":0.001090132870685205,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826683235889,
"Nucleotide GTR":0.001090015434492372,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "I", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ATA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "I", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATT", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "H", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "CAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106210863164082,
"Nucleotide GTR":0.001092369783195666,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "F", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TTC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106723419264677,
"Nucleotide GTR":0.001092875926115726,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "S", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "AGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "V", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106722818294972,
"Nucleotide GTR":0.001092875332665446,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACA", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826679471533,
"Nucleotide GTR":0.001090015430775115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "V", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GTT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAG", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826679451566,
"Nucleotide GTR":0.001090015430755398,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "L", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CTT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103744033970569,
"Nucleotide GTR":0.001089933819347335,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "F", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "TTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103680973180388,
"Nucleotide GTR":0.001089871547583431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "D", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "GAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110370722880871,
"Nucleotide GTR":0.001089897474697306,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "A", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GCT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420520_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826682966977,
"Nucleotide GTR":0.001090015434226824,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "F", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "TTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826679451566,
"Nucleotide GTR":0.001090015430755398,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "I", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ATA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "CTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATC", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAC", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510526362876,
"Nucleotide GTR":0.001089703233422639,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCC", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "M", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "ATG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423704_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAC", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423766_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103528088442727,
"Nucleotide GTR":0.001089720575763054,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "R", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "AGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424003_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "C", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TGT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104026745516629,
"Nucleotide GTR":0.001090212993563173,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACA", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104024437923284,
"Nucleotide GTR":0.001090210714842792,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "I", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATT", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104183586059032,
"Nucleotide GTR":0.001090367871692657,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104880638810995,
"Nucleotide GTR":0.001091056202813688,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "H", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAT", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAC", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104833113441346,
"Nucleotide GTR":0.001091009272088752,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "T", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "ACA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "A", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398608921,
"Nucleotide GTR":0.001090191913751249,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "I", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATT", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680973180388,
"Nucleotide GTR":0.001089871547583431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "M", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATG", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106210863384361,
"Nucleotide GTR":0.001092369783413189,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "L", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CTA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103528090132954,
"Nucleotide GTR":0.001089720577432134,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "R", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "AGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103827059873299,
"Nucleotide GTR":0.001090015806417237,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "S", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "TCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103826679471533,
"Nucleotide GTR":0.001090015430775115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "L", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CTC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACG", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103866100115021,
"Nucleotide GTR":0.001090054358181468,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "E", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAA", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106210863164082,
"Nucleotide GTR":0.001092369783195666,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTT", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106210863384361,
"Nucleotide GTR":0.001092369783413189,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATT", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103528088442727,
"Nucleotide GTR":0.001089720575763054,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "I", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "ATA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104024290573677,
"Nucleotide GTR":0.001090210569336844,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "L", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CTC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110454429963561,
"Nucleotide GTR":0.001090724071965646,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "L", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "TTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104024290381348,
"Nucleotide GTR":0.001090210569146922,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "F", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103680973089149,
"Nucleotide GTR":0.001089871547493335,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "V", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "GTA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432565_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCG", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432565_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432893_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCC", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432893_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432915_England_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103510524669735,
"Nucleotide GTR":0.001089703231750685,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "A", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GCT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432915_England_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432926_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTC", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432926_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432938_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104018231225108,
"Nucleotide GTR":0.001090204585803774,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "Y", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432938_England_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433332_Scotland_20200326_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001103680973180388,
"Nucleotide GTR":0.001089871547583431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "C", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TGT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433332_Scotland_20200326_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433865_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110343233561639,
"Nucleotide GTR":0.001089626021010766,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "L", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "CTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433865_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510525394232,
"Nucleotide GTR":0.001089703232466115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTC", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "T", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ACG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208808240148407,
"Nucleotide GTR":0.00218117129270482,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "G", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "A", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GGT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GCT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434184_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826679471533,
"Nucleotide GTR":0.001090015430775115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "V", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GTT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434184_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001112987492058855,
"Nucleotide GTR":0.001099061621870444,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "Q", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "CAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTT", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104789425132523,
"Nucleotide GTR":0.001090966130414749,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104053225038803,
"Nucleotide GTR":0.001090239141769505,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "C", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TGT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011035095059244,
"Nucleotide GTR":0.001089702225752047,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGC", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103826679471533,
"Nucleotide GTR":0.001090015430775115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "I", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ATA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434875_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "T", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ACG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434875_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110491150589301,
"Nucleotide GTR":0.001091086683682039,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTT", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTG", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106574921358573,
"Nucleotide GTR":0.001092729286238195,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "E", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GAA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104082831073084,
"Nucleotide GTR":0.001090268377368545,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATA", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00110347624415477,
"Nucleotide GTR":0.00108966938015878,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "L", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "CTG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104716830465091,
"Nucleotide GTR":0.001090894444062929,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103527452983841,
"Nucleotide GTR":0.001089719948255128,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "Y", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TAT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437566_California_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437584_California_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "G", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GGT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437584_California_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001112419243546117,
"Nucleotide GTR":0.001098500483370244,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "P", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "CCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103826682966977,
"Nucleotide GTR":0.001090015434226824,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGT", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110417439370226,
"Nucleotide GTR":0.001090358794352062,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "F", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "TTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438598_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001103680973802299,
"Nucleotide GTR":0.001089871548197562,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "V", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "GTG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438598_England_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680973089149,
"Nucleotide GTR":0.001089871547493335,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "S", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AGT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGC", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001107315262512122,
"Nucleotide GTR":0.001093460364129694,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTA", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104032823999294,
"Nucleotide GTR":0.001090218995990932,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "T", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "ACA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440058_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103119433428153,
"Nucleotide GTR":0.001089317033902694,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGC", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440058_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440142_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398838592,
"Nucleotide GTR":0.001090191913978046,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "F", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "TTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440142_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440259_England_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "L", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "TTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440259_England_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440327_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680973080737,
"Nucleotide GTR":0.001089871547485027,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "V", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "GTA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440327_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440734_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103743596569122,
"Nucleotide GTR":0.001089933387418724,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACG", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440734_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440906_England_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103648426170733,
"Nucleotide GTR":0.001089839407806954,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "L", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "CTC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440906_England_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440915_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510526362876,
"Nucleotide GTR":0.001089703233422639,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "P", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "CCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440915_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440996_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104691852067062,
"Nucleotide GTR":0.001090869778198447,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "H", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAT", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440996_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441017_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTC", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441017_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441703_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103277845592429,
"Nucleotide GTR":0.001089473463989677,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441703_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442115_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104183881369875,
"Nucleotide GTR":0.001090368163308525,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "L", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "CTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442115_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442236_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103743596582628,
"Nucleotide GTR":0.001089933387432058,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "K", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAG", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442236_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442526_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106723813758005,
"Nucleotide GTR":0.00109287631567309,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "T", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "ACA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442526_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442675_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103826683235889,
"Nucleotide GTR":0.001090015434492372,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTT", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442675_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442833_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104158891629421,
"Nucleotide GTR":0.001090343486243537,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442833_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442976_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "R", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CGT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442976_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001103680973180388,
"Nucleotide GTR":0.001089871547583431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTG", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442984_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443011_England_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001106723809110711,
"Nucleotide GTR":0.001092876311083945,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "S", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "AGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443011_England_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443044_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103866100115021,
"Nucleotide GTR":0.001090054358181468,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCA", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443044_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104024290381348,
"Nucleotide GTR":0.001090210569146922,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "Y", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "TAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443325_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443341_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103527852974794,
"Nucleotide GTR":0.001089720343241333,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "N", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443341_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443412_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001103983373688028,
"Nucleotide GTR":0.001090170164409544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "V", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GTA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443412_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444012_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110368073842186,
"Nucleotide GTR":0.001089871315762239,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACG", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444012_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444143_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011035095059244,
"Nucleotide GTR":0.001089702225752047,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCC", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444143_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444359_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103826679451566,
"Nucleotide GTR":0.001090015430755398,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAT", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444359_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444416_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104005398838592,
"Nucleotide GTR":0.001090191913978046,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "C", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "TGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444416_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103528090028311,
"Nucleotide GTR":0.0010897205773288,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "T", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "ACT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103826682966977,
"Nucleotide GTR":0.001090015434226824,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGT", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104336066850628,
"Nucleotide GTR":0.001090518444621205,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "N", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAT", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445489_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "CTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445489_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAC", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445762_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398608921,
"Nucleotide GTR":0.001090191913751249,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "F", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTT", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445762_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103528088442727,
"Nucleotide GTR":0.001089720575763054,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "H", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CAT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680973089149,
"Nucleotide GTR":0.001089871547493335,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAG", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446853_Wales_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510526362876,
"Nucleotide GTR":0.001089703233422639,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAC", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446853_Wales_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446893_Wales_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104629839128911,
"Nucleotide GTR":0.001090808541175689,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "H", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CAT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446893_Wales_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510526362876,
"Nucleotide GTR":0.001089703233422639,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGC", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106574921358573,
"Nucleotide GTR":0.001092729286238195,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTA", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104302113433575,
"Nucleotide GTR":0.001090484916034512,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAG", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208312450254424,
"Nucleotide GTR":0.002180681706210023,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "R", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "A", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CGA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "GCA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002208614952123773,
"Nucleotide GTR":0.002180980423129594,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "L", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "CTT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680973180388,
"Nucleotide GTR":0.001089871547583431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGG", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524669735,
"Nucleotide GTR":0.001089703231750685,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "P", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208206826520212,
"Nucleotide GTR":0.002180577404056173,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "P", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "H", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CCT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CAT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447714_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCC", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447714_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447731_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106326066725965,
"Nucleotide GTR":0.001092483545312915,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCT", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447731_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448986_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680736666613,
"Nucleotide GTR":0.001089871314028954,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGG", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448986_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449118_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103680973180388,
"Nucleotide GTR":0.001089871547583431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "A", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "GCA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449118_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449330_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "Y", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "TAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449330_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449680_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "S", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AGT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449680_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450111_New_York_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGC", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450111_New_York_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826679471533,
"Nucleotide GTR":0.001090015430775115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "I", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ATC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110373577498899,
"Nucleotide GTR":0.001089925663703401,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "G", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GGT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510525394232,
"Nucleotide GTR":0.001089703232466115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "L", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "CTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110384171057528,
"Nucleotide GTR":0.001090030273807388,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "L", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGG", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGG", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450642_Quebec_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450642_Quebec_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826683235889,
"Nucleotide GTR":0.001090015434492372,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "I", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ATT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110488801299251,
"Nucleotide GTR":0.001091063484728314,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451232_Louisiana_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104336668816243,
"Nucleotide GTR":0.001090519039054933,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAT", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451232_Louisiana_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103558494156733,
"Nucleotide GTR":0.001089750601036104,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTC", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110355861427812,
"Nucleotide GTR":0.001089750719654514,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "T", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ACA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCC", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104138630663356,
"Nucleotide GTR":0.001090323478785788,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAA", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001104336668540128,
"Nucleotide GTR":0.001090519038782272,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "V", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GTT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104724661854429,
"Nucleotide GTR":0.001090902177464723,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "K", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "AAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452471_Andalusia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104336668540128,
"Nucleotide GTR":0.001090519038782272,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "I", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ATT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452471_Andalusia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104131565965844,
"Nucleotide GTR":0.001090316502482853,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "Y", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "TAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673160487869,
"Nucleotide GTR":0.00108986383264452,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGC", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453275_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTC", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453275_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453440_England_20200504_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "L", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "TTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453440_England_20200504_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453454_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104066995773224,
"Nucleotide GTR":0.001090252740202386,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "A", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GCT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453454_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453557_England_20200426_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453557_England_20200426_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453618_England_20200505_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001103527452983841,
"Nucleotide GTR":0.001089719948255128,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "R", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "AGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453618_England_20200505_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453622_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103369778454472,
"Nucleotide GTR":0.001089564246573652,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "L", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "CTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453622_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453654_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002209768303956688,
"Nucleotide GTR":0.002182119344047497,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "Y", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "I", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "TAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "ATT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453654_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453729_England_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103826683235889,
"Nucleotide GTR":0.001090015434492372,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAT", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453729_England_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453770_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510524678093,
"Nucleotide GTR":0.001089703231758939,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGC", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453770_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104018231225108,
"Nucleotide GTR":0.001090204585803774,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "N", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "AAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104629839128911,
"Nucleotide GTR":0.001090808541175689,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "H", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CAT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001106210863164082,
"Nucleotide GTR":0.001092369783195666,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCT", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104018231225108,
"Nucleotide GTR":0.001090204585803774,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "I", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATA", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103119775089491,
"Nucleotide GTR":0.001089317371289114,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "G", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GGC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454574_Istria_20200409_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001103749620222971,
"Nucleotide GTR":0.001089939335703691,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTT", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454574_Istria_20200409_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103528088442727,
"Nucleotide GTR":0.001089720575763054,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "I", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "ATT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398838592,
"Nucleotide GTR":0.001090191913978046,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "I", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "ATT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454650_Virgin_Islands_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454650_Virgin_Islands_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110347624415477,
"Nucleotide GTR":0.00108966938015878,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACC", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104053225038803,
"Nucleotide GTR":0.001090239141769505,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "A", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "GCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104119448556691,
"Nucleotide GTR":0.001090304536688583,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "H", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAC", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455106_Stockholm_20200511_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001104336668816243,
"Nucleotide GTR":0.001090519039054933,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCT", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455106_Stockholm_20200511_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104053225287349,
"Nucleotide GTR":0.001090239142014941,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "G", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GGT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104138630663356,
"Nucleotide GTR":0.001090323478785788,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGA", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673396886669,
"Nucleotide GTR":0.001089864066085462,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGC", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "C", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "TGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455634_KZN_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103119889908955,
"Nucleotide GTR":0.001089317484671938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "D", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "GAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455634_KZN_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103119889908955,
"Nucleotide GTR":0.001089317484671938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "R", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CGA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00110367351434356,
"Nucleotide GTR":0.001089864182072713,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAC", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103673396886669,
"Nucleotide GTR":0.001089864066085462,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "H", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "CAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456021_New_York_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "I", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456021_New_York_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "G", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GGT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456050_New_York_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104336668540128,
"Nucleotide GTR":0.001090519038782272,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "I", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ATT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456050_New_York_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103119890011099,
"Nucleotide GTR":0.001089317484772804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "V", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "GTA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456299_Southern_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103698773350168,
"Nucleotide GTR":0.001089889125034758,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAT", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456299_Southern_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "N", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAT", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456803_Scotland_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110531866895781,
"Nucleotide GTR":0.00109148875226013,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "S", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "TCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456803_Scotland_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103119889908955,
"Nucleotide GTR":0.001089317484671938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAG", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104636862453568,
"Nucleotide GTR":0.001090815476623431,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104339691292625,
"Nucleotide GTR":0.001090522023713627,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104623042105751,
"Nucleotide GTR":0.001090801829197925,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "L", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "CTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457093_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104138631041672,
"Nucleotide GTR":0.001090323479159369,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGA", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457093_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457132_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "L", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "CTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457132_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457165_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110475213128076,
"Nucleotide GTR":0.00109092930318938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457165_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457289_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103673160487869,
"Nucleotide GTR":0.00108986383264452,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "T", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ACA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457289_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457320_England_20200509_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104185965409892,
"Nucleotide GTR":0.001090370221272714,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACT", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457320_England_20200509_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457371_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103191160217051,
"Nucleotide GTR":0.00108938786323501,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457371_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457483_England_20200507_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104336668539214,
"Nucleotide GTR":0.00109051903878137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "I", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ATT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457483_England_20200507_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457485_England_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103476244143799,
"Nucleotide GTR":0.001089669380147947,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "A", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GCT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457485_England_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457583_England_20200423_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001104336668539214,
"Nucleotide GTR":0.00109051903878137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGT", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457583_England_20200423_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457605_England_20200501_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001104205413198038,
"Nucleotide GTR":0.001090389425727152,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "L", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CTT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457605_England_20200501_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457652_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110413903542436,
"Nucleotide GTR":0.001090323878482358,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "I", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATA", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457652_England_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457683_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110367351434356,
"Nucleotide GTR":0.001089864182072713,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTC", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457683_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104484847185468,
"Nucleotide GTR":0.001090665363393678,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "I", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "R", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ATT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "AGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673396886669,
"Nucleotide GTR":0.001089864066085462,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTC", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002208762654527724,
"Nucleotide GTR":0.002181126277458413,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "G", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "GGT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458075_Telangana_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673396886669,
"Nucleotide GTR":0.001089864066085462,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTC", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458075_Telangana_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673397917008,
"Nucleotide GTR":0.001089864067102909,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCC", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104402517508103,
"Nucleotide GTR":0.001090584063837864,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAA", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458273_California_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104018228954726,
"Nucleotide GTR":0.001090204583561799,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "H", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CAC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458273_California_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458278_California_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104336668539214,
"Nucleotide GTR":0.00109051903878137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "TTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458278_California_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458412_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104740997633655,
"Nucleotide GTR":0.001090918308848174,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "L", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTA", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458412_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458525_England_20200507_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458525_England_20200507_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458741_England_20200414_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104336668540128,
"Nucleotide GTR":0.001090519038782272,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAT", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458741_England_20200414_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458861_England_20200419_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001103992980582988,
"Nucleotide GTR":0.001090179651101562,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAA", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458861_England_20200419_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458863_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104032706209182,
"Nucleotide GTR":0.001090218879674628,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "I", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATA", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458863_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458972_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673160487869,
"Nucleotide GTR":0.00108986383264452,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "CTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458972_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459046_England_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103668601052905,
"Nucleotide GTR":0.001089859330257904,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "I", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATT", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459046_England_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459062_England_20200408_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459062_England_20200408_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459120_Scotland_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACT", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459120_Scotland_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459208_England_20200505_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001104205413198038,
"Nucleotide GTR":0.001090389425727152,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "L", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CTT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459208_England_20200505_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAT", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104574522206272,
"Nucleotide GTR":0.001090753916386869,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAT", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459423_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103975141398752,
"Nucleotide GTR":0.001090162035123933,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCC", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459423_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459437_England_20200426_null_66":{
"Global MG94xREV":0.001104032706179084,
"Nucleotide GTR":0.001090218879644906,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "T", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "ACT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459437_England_20200426_null_66",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459589_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104118548857927,
"Nucleotide GTR":0.001090303648246989,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "F", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "TTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459589_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459607_Scotland_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104005398838592,
"Nucleotide GTR":0.001090191913978046,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "F", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "TTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459607_Scotland_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459621_Scotland_20200327_null_42":{
"Global MG94xREV":0.001104717292169603,
"Nucleotide GTR":0.001090894899990525,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459621_Scotland_20200327_null_42",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104138630663356,
"Nucleotide GTR":0.001090323478785788,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "I", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "ATT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103119890011099,
"Nucleotide GTR":0.001089317484772804,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACG", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460070_Minnesota_20200318_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104336668540128,
"Nucleotide GTR":0.001090519038782272,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "V", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GTT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460070_Minnesota_20200318_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104106633921943,
"Nucleotide GTR":0.001090291882392508,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "S", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "TCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460404_Massachusetts_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104336668539214,
"Nucleotide GTR":0.00109051903878137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAT", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460404_Massachusetts_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001103510526362876,
"Nucleotide GTR":0.001089703233422639,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAC", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103826679471533,
"Nucleotide GTR":0.001090015430775115,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAT", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103119775089491,
"Nucleotide GTR":0.001089317371289114,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "A", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "GCA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103673160487869,
"Nucleotide GTR":0.00108986383264452,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATC", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAT", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461031_Limburg_20200320_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461031_Limburg_20200320_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104336668539214,
"Nucleotide GTR":0.00109051903878137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "F", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TTT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461139_Netherlands_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104336668816243,
"Nucleotide GTR":0.001090519039054933,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAT", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461139_Netherlands_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103119889908955,
"Nucleotide GTR":0.001089317484671938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "G", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GGA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103510399814004,
"Nucleotide GTR":0.001089703108457168,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "A", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GCT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAC", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461371_Zuid_Holland_20200428_null_41":{
"Global MG94xREV":0.001103558615953502,
"Nucleotide GTR":0.001089750721308934,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACC", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461371_Zuid_Holland_20200428_null_41",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461542_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104716838804479,
"Nucleotide GTR":0.001090894452297974,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "I", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461542_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461556_England_20200525_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00110367339790854,
"Nucleotide GTR":0.001089864067094548,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCC", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461556_England_20200525_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461566_England_20200526_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104336668816243,
"Nucleotide GTR":0.001090519039054933,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "S", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "TCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461566_England_20200526_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461689_Scotland_20200425_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001104209748548839,
"Nucleotide GTR":0.00109039370683338,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "V", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GTC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461689_Scotland_20200425_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461754_Scotland_20200426_null_244":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461754_Scotland_20200426_null_244",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461972_England_20200512_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACT", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461972_England_20200512_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461985_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103668601052905,
"Nucleotide GTR":0.001089859330257904,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "S", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "TCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461985_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462029_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103602173037327,
"Nucleotide GTR":0.001089793733399846,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462029_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462042_England_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001103795514287841,
"Nucleotide GTR":0.001089984655534982,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "V", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "GTT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462042_England_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462087_Singapore_20200328_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462087_Singapore_20200328_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462096_Dhaka_20200523_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001104209509807935,
"Nucleotide GTR":0.00109039347107964,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "V", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GTT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462096_Dhaka_20200523_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104209748548839,
"Nucleotide GTR":0.00109039370683338,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "TTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104023174161756,
"Nucleotide GTR":0.001090209466893642,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "D", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GAT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "N", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAT", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462467_Gorazde_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104209509700497,
"Nucleotide GTR":0.001090393470973545,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCT", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462467_Gorazde_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103695903656611,
"Nucleotide GTR":0.001089886291247247,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "V", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "GTC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462790_British_Columbia_20200301_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001104336668539214,
"Nucleotide GTR":0.00109051903878137,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462790_British_Columbia_20200301_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "I", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATT", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104901531921938,
"Nucleotide GTR":0.001091076834506823,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_38":{
"Global MG94xREV":0.001103972655994127,
"Nucleotide GTR":0.001090159580817073,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001104639643313112,
"Nucleotide GTR":0.001090818222688434,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103119889004086,
"Nucleotide GTR":0.00108931748377839,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "R", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AGG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463052_Odisha_20200512_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001104209087421651,
"Nucleotide GTR":0.001090393053978318,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "F", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TTT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463052_Odisha_20200512_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104209087421651,
"Nucleotide GTR":0.001090393053978318,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "V", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GTA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "F", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "TTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110672281825805,
"Nucleotide GTR":0.001092875332628985,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "N", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "AAT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463072_Odisha_20200514_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104209087441765,
"Nucleotide GTR":0.001090393053998181,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "M", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463072_Odisha_20200514_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103558494156733,
"Nucleotide GTR":0.001089750601036104,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "S", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TCG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103795750718917,
"Nucleotide GTR":0.001089984889007798,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAG", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463123_Virginia_20200512_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463123_Virginia_20200512_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463229_British_Columbia_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104209087421651,
"Nucleotide GTR":0.001090393053978318,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "L", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TTA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463229_British_Columbia_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463299_Louisiana_20200406_null_137":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463299_Louisiana_20200406_null_137",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463300_Louisiana_20200406_null_54":{
"Global MG94xREV":0.001104063084503419,
"Nucleotide GTR":0.001090248877870989,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463300_Louisiana_20200406_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001105371861137723,
"Nucleotide GTR":0.00109154127889133,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104209747614221,
"Nucleotide GTR":0.001090393705910456,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "I", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ATT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463471_Washington_20200409_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463471_Washington_20200409_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001103558615953502,
"Nucleotide GTR":0.001089750721308934,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "T", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ACT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103795750718917,
"Nucleotide GTR":0.001089984889007798,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "C", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TGC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103795750718917,
"Nucleotide GTR":0.001089984889007798,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "R", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CGA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003325983216202689,
"Nucleotide GTR":0.00328436800412875,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "L", "V", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "E", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "CTG", "GTA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GAA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104887978593235,
"Nucleotide GTR":0.001091063450759446,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAT", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAT", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464008_Ontario_20200428_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464008_Ontario_20200428_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104158440578173,
"Nucleotide GTR":0.00109034304083591,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464535_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104005398608921,
"Nucleotide GTR":0.001090191913751249,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "V", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GTT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464535_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464536_England_20200305_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001104209090773394,
"Nucleotide GTR":0.001090393057288122,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAT", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464536_England_20200305_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464916_England_20200310_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001103269160197248,
"Nucleotide GTR":0.001089464887267493,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "L", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464916_England_20200310_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464973_England_20200312_null_10":{
"Global MG94xREV":0.00110355755910875,
"Nucleotide GTR":0.001089749677687584,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAC", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464973_England_20200312_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465177_England_20200418_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001103699966137325,
"Nucleotide GTR":0.001089890302897581,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "L", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "CTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465177_England_20200418_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465178_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103975377088437,
"Nucleotide GTR":0.001090162267864633,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGC", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465178_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465209_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103795514287841,
"Nucleotide GTR":0.001089984655534982,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "D", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "GAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465209_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465241_England_20200419_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001103795866775229,
"Nucleotide GTR":0.001089985003611994,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "R", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AGG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465241_England_20200419_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465243_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104209087421651,
"Nucleotide GTR":0.001090393053978318,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTT", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465243_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465264_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104328535889831,
"Nucleotide GTR":0.001090511007888943,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465264_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465355_England_20200421_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001104209509807935,
"Nucleotide GTR":0.00109039347107964,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTT", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465355_England_20200421_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_465390_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00110355861427812,
"Nucleotide GTR":0.001089750719654514,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACC", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465390_England_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465438_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103256066547491,
"Nucleotide GTR":0.001089451957447488,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAC", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465438_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465523_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104716832423373,
"Nucleotide GTR":0.001090894445996709,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACT", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465523_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465545_England_20200501_null_21":{
"Global MG94xREV":0.001103179053169658,
"Nucleotide GTR":0.001089375907672851,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465545_England_20200501_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465579_England_20200502_null_47":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465579_England_20200502_null_47",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465600_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104209090773394,
"Nucleotide GTR":0.001090393057288122,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATT", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465600_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465619_England_20200505_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001104005398594313,
"Nucleotide GTR":0.001090191913736822,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTT", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465619_England_20200505_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465657_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104082872131971,
"Nucleotide GTR":0.001090268417913697,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "L", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTA", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465657_England_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465662_England_20200514_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001103680974844395,
"Nucleotide GTR":0.001089871549226619,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "R", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AGG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465662_England_20200514_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465845_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103657562439005,
"Nucleotide GTR":0.001089848429760837,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "S", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "TCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465845_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465848_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103826682966977,
"Nucleotide GTR":0.001090015434226824,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "F", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TTT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465848_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465876_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00110347624415477,
"Nucleotide GTR":0.00108966938015878,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGC", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465876_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465881_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104088072792492,
"Nucleotide GTR":0.001090273553502756,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAT", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465881_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465925_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104053225038803,
"Nucleotide GTR":0.001090239141769505,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTG", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465925_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465996_England_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001104209748548839,
"Nucleotide GTR":0.00109039370683338,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAT", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465996_England_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466186_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001103795750718917,
"Nucleotide GTR":0.001089984889007798,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTG", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466186_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466189_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104023174161756,
"Nucleotide GTR":0.001090209466893642,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "N", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "AAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466189_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466222_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104701647449259,
"Nucleotide GTR":0.001090879451019321,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAA", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466222_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466277_England_20200407_null_61":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466277_England_20200407_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466318_England_20200409_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001104022517769118,
"Nucleotide GTR":0.001090208818713889,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "K", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AAG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466318_England_20200409_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466324_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001104716841595064,
"Nucleotide GTR":0.001090894455053643,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466324_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466361_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001105208156144527,
"Nucleotide GTR":0.001091379622200114,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "E", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466361_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466417_England_20200408_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001104209747614221,
"Nucleotide GTR":0.001090393705910456,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAT", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466417_England_20200408_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466430_England_20200410_null_51":{
"Global MG94xREV":0.001104209090773394,
"Nucleotide GTR":0.001090393057288122,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "V", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GTT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466430_England_20200410_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466450_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001104209087421651,
"Nucleotide GTR":0.001090393053978318,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "Y", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466450_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466486_England_20200414_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001103795868535227,
"Nucleotide GTR":0.001089985005349972,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "D", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "GAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466486_England_20200414_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466491_England_20200414_null_90":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466491_England_20200414_null_90",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466551_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002228915270874067,
"Nucleotide GTR":0.002201026741178429,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "G", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "K", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GGA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAG", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466551_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466605_England_20200416_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001103269160197248,
"Nucleotide GTR":0.001089464887267493,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "I", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ATT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466605_England_20200416_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466610_England_20200415_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001104005398838592,
"Nucleotide GTR":0.001090191913978046,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "N", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAT", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466610_England_20200415_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466613_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103528090028311,
"Nucleotide GTR":0.0010897205773288,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGG", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466613_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466627_Narayanganj_20200601_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTT", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466627_Narayanganj_20200601_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "R", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "AGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466805_British_Columbia_20200401_null_192":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466805_British_Columbia_20200401_null_192",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466834_British_Columbia_20200401_null_61":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466834_British_Columbia_20200401_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466838_British_Columbia_20200401_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466838_British_Columbia_20200401_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467074_Andalusia_20200315_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001104209090773394,
"Nucleotide GTR":0.001090393057288122,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTT", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467074_Andalusia_20200315_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001104053225287349,
"Nucleotide GTR":0.001090239142014941,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "C", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TGC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467187_Madrid_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001104022517769118,
"Nucleotide GTR":0.001090208818713889,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAA", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467187_Madrid_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103558615231814,
"Nucleotide GTR":0.001089750720596275,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTC", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467206_Madrid_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001104209509807935,
"Nucleotide GTR":0.00109039347107964,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCT", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467206_Madrid_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467216_Madrid_20200402_null_80":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467216_Madrid_20200402_null_80",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001103795866876635,
"Nucleotide GTR":0.001089985003712132,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCG", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103795514287841,
"Nucleotide GTR":0.001089984655534982,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTG", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467329_British_Columbia_20200401_null_134":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467329_British_Columbia_20200401_null_134",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467335_British_Columbia_20200401_null_40":{
"Global MG94xREV":0.001104209747614221,
"Nucleotide GTR":0.001090393705910456,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "F", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "TTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467335_British_Columbia_20200401_null_40",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_26":{
"Global MG94xREV":0.001104209747614221,
"Nucleotide GTR":0.001090393705910456,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAT", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467384_New_York_20200510_null_101":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467384_New_York_20200510_null_101",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467568_New_Mexico_20200403_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "L", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CTA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467568_New_Mexico_20200403_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467588_New_Mexico_20200312_null_40304":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467588_New_Mexico_20200312_null_40304",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30":{
"Global MG94xREV":0.001103558615953502,
"Nucleotide GTR":0.001089750721308934,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAC", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467717_England_20200521_null_825":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467717_England_20200521_null_825",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":9297.081710968752,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02589515167580973],
[0.01165632768380822],
[0.01089680596894546],
[0.0408589993327671],
[0.01716211896615115],
[0.007725279423824899],
[0.007221903263258648],
[0.02707947094366313],
[0.01529102492536087],
[0.006883033526225216],
[0.006434537776182224],
[0.0241271410588526],
[0.02416468268490802],
[0.01087738211680997],
[0.01016861618789282],
[0.03812855649814653],
[0.01605234670565753],
[0.007225731505177318],
[0.006754905689978791],
[0.02532840245722553],
[0.010638759227881],
[0.004788883465979613],
[0.004476841707972821],
[0.01678650357547547],
[0.009478872209736474],
[0.004266777114607372],
[0.003988755600548064],
[0.01495636087178456],
[0.01497963284195412],
[0.006742864887409191],
[0.006303502470591843],
[0.02363580704052242],
[0.02850065192736728],
[0.01282915590635038],
[0.01199321316704593],
[0.04497012153713571],
[0.01888892504334201],
[0.008502576183238405],
[0.00794855167237851],
[0.02980413420260321],
[0.01682956657162658],
[0.007575585777263462],
[0.00708196359567108],
[0.0265547488552931],
[0.02659606781840975],
[0.01197183493934783],
[0.01119175489614364],
[0.0419649489159693],
[0.01132202056495463],
[0.03968715046949666],
[0.01666990403357281],
[0.00750371599694],
[0.007014776821889542],
[0.02630282325866102],
[0.006685625974761006],
[0.006249993222917973],
[0.02343516711711419],
[0.02347163203760813],
[0.01056541540012341],
[0.009876977099432341],
[0.0370350175882334]
],
"Log Likelihood":-4227.923719243542,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6207921996361747, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":419
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":10025.4494722725,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2810274436572014],
[0.1773432684620689],
[0.2036426771144187],
[0.3379866107663109]
],
"Log Likelihood":-4292.141645917721,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2557555430933646,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.08730037528551114,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.04553224893929531,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.580133365506772,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4026948668713852
},
"display order":0,
"estimated parameters":719
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-15/sequences.3C.compressed.fas",
"number of sequences":357,
"number of sites":306,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1,epi_isl_453654_England_20200513_null_1,epi_isl_464973_England_20200312_null_10,epi_isl_458278_California_20200420_null_2,epi_isl_465925_England_20200328_null_1,epi_isl_442675_England_20200405_null_4,epi_isl_442236_England_20200407_null_1,(epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1,epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2)Node666,epi_isl_464916_England_20200310_null_8,epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30,epi_isl_458741_England_20200414_null_7,epi_isl_465876_England_20200329_null_3,epi_isl_441017_England_20200406_null_1,epi_isl_447731_France_20200301_null_1,(epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1,epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2)Node680,epi_isl_466605_England_20200416_null_13,epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3,epi_isl_458972_England_20200409_null_1,epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1,epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,(epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1,epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1)Node695,epi_isl_465545_England_20200501_null_21,(epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6,epi_isl_453454_England_20200501_null_1,epi_isl_459062_England_20200408_null_17)Node700,(epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1,epi_isl_463299_Louisiana_20200406_null_137)Node705,epi_isl_434184_Washington_20200328_null_1,epi_isl_465241_England_20200419_null_18,epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1,epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3,epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1,epi_isl_463072_Odisha_20200514_null_4,epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8,epi_isl_460070_Minnesota_20200318_null_7,epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1,epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_458273_California_20200414_null_3,epi_isl_463052_Odisha_20200512_null_7,epi_isl_458075_Telangana_20200415_null_1,epi_isl_464535_England_20200305_null_1,epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2,epi_isl_445489_Wales_20200404_null_1,epi_isl_440906_England_20200421_null_2,epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1,epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1,epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1,(epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2,epi_isl_463123_Virginia_20200512_null_36)Node422,epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_38,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,(epi_isl_457165_England_20200406_null_1,epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1,epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9)Node426,(epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1,epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12)Node431,(epi_isl_453557_England_20200426_null_6,epi_isl_456803_Scotland_20200505_null_2)Node442,(epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1,epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1,epi_isl_461754_Scotland_20200426_null_244)Node436,epi_isl_456299_Southern_20200401_null_3,epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1,epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2,epi_isl_443325_England_20200415_null_1,epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1,epi_isl_423089_England_20200323_null_1,epi_isl_443412_England_20200416_null_6,epi_isl_465438_England_20200427_null_1,epi_isl_466551_England_20200414_null_1,epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_461371_Zuid_Holland_20200428_null_41,epi_isl_442526_England_20200413_null_1,epi_isl_457483_England_20200507_null_7,(epi_isl_442833_England_20200408_null_1,epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_467216_Madrid_20200402_null_80)Node459,(epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1,epi_isl_463471_Washington_20200409_null_13)Node456,(epi_isl_457371_England_20200428_null_1,epi_isl_440058_England_20200330_null_1,epi_isl_466491_England_20200414_null_90)Node448,(epi_isl_423704_England_20200323_null_1,epi_isl_441703_England_20200406_null_1)Node453,epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5,epi_isl_457583_England_20200423_null_10,epi_isl_466610_England_20200415_null_4,epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1,epi_isl_467588_New_Mexico_20200312_null_40304,epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1,epi_isl_457683_England_20200414_null_1,epi_isl_459607_Scotland_20200324_null_3,(epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3,epi_isl_467384_New_York_20200510_null_101)Node334,epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1,epi_isl_465996_England_20200326_null_8,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1,epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4,epi_isl_466417_England_20200408_null_9,epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1,epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1,epi_isl_434875_Texas_20200324_null_1,epi_isl_465355_England_20200421_null_9,epi_isl_444416_England_20200420_null_3,epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1,epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1,(epi_isl_443044_England_20200408_null_1,epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2)Node361,epi_isl_453770_England_20200422_null_1,epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1,(epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3,epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6)Node368,epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3,epi_isl_450111_New_York_20200313_null_4,epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1,epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3,epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2,epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1,epi_isl_467335_British_Columbia_20200401_null_40,epi_isl_440259_England_20200322_null_2,epi_isl_455634_KZN_20200501_null_3,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1,epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1,(epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1,epi_isl_466838_British_Columbia_20200401_null_51)Node301,(epi_isl_466222_England_20200404_null_1,epi_isl_466277_England_20200407_null_61)Node297,epi_isl_458861_England_20200419_null_6,epi_isl_432915_England_20200328_null_3,epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2,epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1,epi_isl_456050_New_York_20200326_null_3,epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1,epi_isl_467074_Andalusia_20200315_null_13,epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5,epi_isl_437584_California_20200315_null_1,epi_isl_465600_England_20200430_null_1,epi_isl_423428_England_20200330_null_1,epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1,epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3,epi_isl_440734_England_20200403_null_1,(epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1)Node272,(epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1,epi_isl_466627_Narayanganj_20200601_null_15)Node268,epi_isl_463300_Louisiana_20200406_null_54,epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_461689_Scotland_20200425_null_10,epi_isl_449330_England_20200414_null_1,epi_isl_460404_Massachusetts_20200406_null_5,epi_isl_447714_France_20200301_null_1,epi_isl_467187_Madrid_20200401_null_3,epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2,epi_isl_455106_Stockholm_20200511_null_19,epi_isl_438598_England_20200421_null_5,epi_isl_466189_England_20200403_null_1,epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1,epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_6,epi_isl_442984_England_20200407_null_7,epi_isl_459589_Scotland_20200325_null_1,(epi_isl_442115_England_20200406_null_1,epi_isl_458525_England_20200507_null_12)Node242,epi_isl_433865_England_20200408_null_1,epi_isl_449118_England_20200408_null_1,epi_isl_467206_Madrid_20200401_null_15,epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6,epi_isl_461556_England_20200525_null_4,epi_isl_437566_California_20200324_null_1,epi_isl_466318_England_20200409_null_6,epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1,epi_isl_461139_Netherlands_20200420_null_2,epi_isl_432926_England_20200328_null_1,epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3,epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1,(epi_isl_450642_Quebec_20200408_null_4,epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1)Node125,epi_isl_465881_England_20200330_null_2,epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4,epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1,(epi_isl_466324_England_20200409_null_2,epi_isl_467568_New_Mexico_20200403_null_9)Node168,(epi_isl_456021_New_York_20200327_null_2,epi_isl_461542_England_20200101_null_2)Node165,(epi_isl_461972_England_20200512_null_2,epi_isl_465523_England_20200421_null_1)Node162,(epi_isl_453622_England_20200507_null_1,epi_isl_457132_England_20200326_null_1)Node159,(epi_isl_459621_Scotland_20200327_null_42,epi_isl_464008_Ontario_20200428_null_26)Node156,(epi_isl_466361_England_20200409_null_4,epi_isl_467717_England_20200521_null_825,epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1,epi_isl_466613_England_20200410_null_1,epi_isl_459423_England_20200426_null_1,epi_isl_465178_England_20200416_null_1)Node142,(epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1,epi_isl_466834_British_Columbia_20200401_null_61)Node153,(epi_isl_457320_England_20200509_null_2,epi_isl_459120_Scotland_20200406_null_7)Node172,epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,(epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7,epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1)Node184,(epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_465579_England_20200502_null_47)Node178,(epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1,epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4)Node181,(epi_isl_462029_England_20200418_null_1,epi_isl_466805_British_Columbia_20200401_null_192)Node190,(epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17,epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1)Node193,(epi_isl_462087_Singapore_20200328_null_8,epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1)Node197,(epi_isl_454650_Virgin_Islands_20200425_null_2,epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1)Node200,((epi_isl_420520_England_20200324_null_1,epi_isl_423505_England_20200330_null_2)Node208,epi_isl_440996_England_20200402_null_2,epi_isl_467329_British_Columbia_20200401_null_134)Node204,(epi_isl_461031_Limburg_20200320_null_7,epi_isl_465264_England_20200419_null_1)Node211,epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1,epi_isl_466430_England_20200410_null_51,epi_isl_445762_Wales_20200412_null_1,epi_isl_457093_England_20200409_null_2,epi_isl_440915_England_20200419_null_1,epi_isl_466486_England_20200414_null_29,epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1,epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1,(epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5,epi_isl_449680_England_20200415_null_3)Node491,epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4,epi_isl_444359_England_20200428_null_2,epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_26,epi_isl_443011_England_20200410_null_2,epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1,epi_isl_424003_England_20200320_null_1,(epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1)Node506,epi_isl_446853_Wales_20200415_null_1,epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4,epi_isl_464536_England_20200305_null_15,(epi_isl_442976_England_20200411_null_1,epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1)Node514,epi_isl_451232_Louisiana_20200504_null_2,epi_isl_433332_Scotland_20200326_null_9,epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2,epi_isl_459437_England_20200426_null_66,epi_isl_461985_England_20200507_null_1,epi_isl_432565_England_20200402_null_2,epi_isl_453618_England_20200505_null_9,epi_isl_458863_England_20200419_null_1,epi_isl_459046_England_20200410_null_3,epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1,epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1,(epi_isl_421871_England_20200327_null_2,epi_isl_465177_England_20200418_null_19)Node536,epi_isl_444012_England_20200326_null_1,epi_isl_466450_England_20200414_null_5,epi_isl_423766_England_20200323_null_1,(epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1,epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1)Node543,epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2,epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1,epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1,epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1,epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1,epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3,epi_isl_443341_England_20200413_null_2,epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2,epi_isl_465845_England_20200327_null_1,epi_isl_448986_England_20200419_null_1,epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1,epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1,epi_isl_432938_England_20200328_null_4,epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2,epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1,epi_isl_465619_England_20200505_null_11,epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3,epi_isl_462096_Dhaka_20200523_null_10,epi_isl_453440_England_20200504_null_4,epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_432893_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_453729_England_20200421_null_2,epi_isl_446893_Wales_20200419_null_7,epi_isl_459208_England_20200505_null_12,epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4,epi_isl_465848_England_20200328_null_1,epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1,epi_isl_457605_England_20200501_null_10,epi_isl_421670_India_20200312_null_1,(epi_isl_453275_England_20200403_null_1,epi_isl_465657_England_20200511_null_1)Node597,epi_isl_465662_England_20200514_null_15,epi_isl_463229_British_Columbia_20200301_null_3,epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4,epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4,epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1,epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_2,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1,epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1,epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7,epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2,epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1,epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3,epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1,epi_isl_462467_Gorazde_20200326_null_5,epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1,epi_isl_461566_England_20200526_null_3,epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4,epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9,epi_isl_454574_Istria_20200409_null_14,epi_isl_458412_England_20200411_null_1,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_465209_England_20200418_null_1,epi_isl_457485_England_20200505_null_2,epi_isl_462790_British_Columbia_20200301_null_12,epi_isl_420510_England_20200323_null_2,epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1,epi_isl_457289_England_20200417_null_2,epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1,epi_isl_444143_England_20200408_null_1,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2,epi_isl_465390_England_20200421_null_5,epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1,epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4,epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_466186_England_20200403_null_4,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_452471_Andalusia_20200306_null_2,epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2,epi_isl_465243_England_20200414_null_5,epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1,epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1,epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1,epi_isl_440142_England_20200313_null_1,epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1,epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1,epi_isl_462042_England_20200418_null_5,epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1,epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2,epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1,epi_isl_457652_England_20200424_null_1,epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1,epi_isl_440327_England_20200320_null_1,epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1,epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node125":"test",
"Node142":"test",
"Node153":"test",
"Node156":"test",
"Node159":"test",
"Node162":"test",
"Node165":"test",
"Node168":"test",
"Node172":"test",
"Node178":"test",
"Node181":"test",
"Node184":"test",
"Node190":"test",
"Node193":"test",
"Node197":"test",
"Node200":"test",
"Node204":"test",
"Node208":"test",
"Node211":"test",
"Node242":"test",
"Node268":"test",
"Node272":"test",
"Node297":"test",
"Node301":"test",
"Node334":"test",
"Node361":"test",
"Node368":"test",
"Node422":"test",
"Node426":"test",
"Node431":"test",
"Node436":"test",
"Node442":"test",
"Node448":"test",
"Node453":"test",
"Node456":"test",
"Node459":"test",
"Node491":"test",
"Node506":"test",
"Node514":"test",
"Node536":"test",
"Node543":"test",
"Node597":"test",
"Node666":"test",
"Node680":"test",
"Node695":"test",
"Node700":"test",
"Node705":"test",
"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425132_North_Rhine_Westphalia_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_430811_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_432565_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_432893_Scotland_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_432915_England_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_432926_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_432938_England_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_433332_Scotland_20200326_null_9":"test",
"epi_isl_433865_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434109_Washington_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434184_Washington_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_434203_Washington_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_434261_Washington_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_434367_Antwerp_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_434875_Texas_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434956_Texas_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434957_Texas_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_435354_Utah_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_436541_Florida_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436597_Wisconsin_20200413_null_6":"test",
"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_437584_California_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_437613_Thailand_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_437760_Jeddah_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_437764_Virginia_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_438054_Vienna_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_438598_England_20200421_null_5":"test",
"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_439198_Scotland_20200422_null_4":"test",
"epi_isl_439211_Scotland_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_2":"test",
"epi_isl_440058_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_440142_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_440259_England_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_440327_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_440734_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_440906_England_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_440915_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_440996_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_441017_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_441703_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442115_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442236_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_442526_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_442675_England_20200405_null_4":"test",
"epi_isl_442833_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442976_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":"test",
"epi_isl_443011_England_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_443044_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443341_England_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_443412_England_20200416_null_6":"test",
"epi_isl_444012_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_444143_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_444359_England_20200428_null_2":"test",
"epi_isl_444416_England_20200420_null_3":"test",
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_445239_Uppsala_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_445489_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_445677_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445762_Wales_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_445908_Wales_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_446303_Wales_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_446853_Wales_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_446893_Wales_20200419_null_7":"test",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_447004_Bangkok_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_447132_Liege_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_447539_Gujarat_20200505_null_5":"test",
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_447568_Telangana_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_447714_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_447731_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_448986_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_449118_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_449330_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_449680_England_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_450111_New_York_20200313_null_4":"test",
"epi_isl_450312_Quebec_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_450513_Beirut_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_450518_Latvia_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_450642_Quebec_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_451126_South_Australia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_451204_Louisiana_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_451232_Louisiana_20200504_null_2":"test",
"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_451493_New_South_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452056_Denmark_20200415_null_5":"test",
"epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_6":"test",
"epi_isl_452337_Beijing_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_452471_Andalusia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_452570_Andalusia_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_452614_Andalusia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_453275_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453440_England_20200504_null_4":"test",
"epi_isl_453454_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_453557_England_20200426_null_6":"test",
"epi_isl_453618_England_20200505_null_9":"test",
"epi_isl_453622_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_453654_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_453729_England_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_453770_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_454167_Portugal_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_454351_Portugal_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_454420_Beirut_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_454555_Maharashtra_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_454574_Istria_20200409_null_14":"test",
"epi_isl_454605_Istria_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454650_Virgin_Islands_20200425_null_2":"test",
"epi_isl_454829_North_Carolina_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_455047_New_South_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_455097_New_South_Wales_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_455106_Stockholm_20200511_null_19":"test",
"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_455326_Canary_Islands_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_455342_LaRioja_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_455381_Hubei_20200315_null_8":"test",
"epi_isl_455450_Mazowieckie_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_455634_KZN_20200501_null_3":"test",
"epi_isl_455637_KZN_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_455671_West_Bengal_20200503_null_4":"test",
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_455792_Selangor_20200209_null_17":"test",
"epi_isl_456021_New_York_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_456036_New_York_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_456050_New_York_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_456063_New_York_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_456299_Southern_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_456411_Victoria_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_456803_Scotland_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_456820_Scotland_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_456830_Scotland_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456879_Scotland_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_456917_Scotland_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_457093_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_457132_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_457165_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_457289_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_457320_England_20200509_null_2":"test",
"epi_isl_457371_England_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_457483_England_20200507_null_7":"test",
"epi_isl_457485_England_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_457583_England_20200423_null_10":"test",
"epi_isl_457605_England_20200501_null_10":"test",
"epi_isl_457652_England_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_457683_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_457820_Maryland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_457998_South_Batinah_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_458075_Telangana_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_458117_Muscat_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_458273_California_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_458278_California_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_458412_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_458525_England_20200507_null_12":"test",
"epi_isl_458741_England_20200414_null_7":"test",
"epi_isl_458861_England_20200419_null_6":"test",
"epi_isl_458863_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458972_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_459046_England_20200410_null_3":"test",
"epi_isl_459062_England_20200408_null_17":"test",
"epi_isl_459120_Scotland_20200406_null_7":"test",
"epi_isl_459208_England_20200505_null_12":"test",
"epi_isl_459380_Northern_Ireland_20200411_null_7":"test",
"epi_isl_459401_Northern_Ireland_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_459423_England_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_459437_England_20200426_null_66":"test",
"epi_isl_459589_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_459607_Scotland_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_459621_Scotland_20200327_null_42":"test",
"epi_isl_459966_Morocco_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_459998_Michigan_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_460070_Minnesota_20200318_null_7":"test",
"epi_isl_460364_Massachusetts_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_460404_Massachusetts_20200406_null_5":"test",
"epi_isl_460414_Massachusetts_20200406_null_9":"test",
"epi_isl_460663_Netherlands_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_460861_Gelderland_20200521_null_3":"test",
"epi_isl_460927_Gelderland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_460940_Gelderland_20200416_null_12":"test",
"epi_isl_461031_Limburg_20200320_null_7":"test",
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_3":"test",
"epi_isl_461139_Netherlands_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_461173_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_461186_Noord_Brabant_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_461276_Zeeland_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_461371_Zuid_Holland_20200428_null_41":"test",
"epi_isl_461542_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_461556_England_20200525_null_4":"test",
"epi_isl_461566_England_20200526_null_3":"test",
"epi_isl_461689_Scotland_20200425_null_10":"test",
"epi_isl_461754_Scotland_20200426_null_244":"test",
"epi_isl_461972_England_20200512_null_2":"test",
"epi_isl_461985_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_462029_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_462042_England_20200418_null_5":"test",
"epi_isl_462087_Singapore_20200328_null_8":"test",
"epi_isl_462096_Dhaka_20200523_null_10":"test",
"epi_isl_462207_Antheit_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_462209_Mol_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_462435_Kraljevo_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_462467_Gorazde_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_462477_Andalusia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_462790_British_Columbia_20200301_null_12":"test",
"epi_isl_462808_British_Columbia_20200301_null_7":"test",
"epi_isl_462855_Minnesota_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_38":"test",
"epi_isl_463026_Odisha_20200510_null_6":"test",
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_2":"test",
"epi_isl_463052_Odisha_20200512_null_7":"test",
"epi_isl_463061_Odisha_20200513_null_5":"test",
"epi_isl_463063_Odisha_20200513_null_9":"test",
"epi_isl_463070_Odisha_20200514_null_1":"test",
"epi_isl_463072_Odisha_20200514_null_4":"test",
"epi_isl_463084_Odisha_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_463085_Odisha_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_463123_Virginia_20200512_null_36":"test",
"epi_isl_463229_British_Columbia_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_463299_Louisiana_20200406_null_137":"test",
"epi_isl_463300_Louisiana_20200406_null_54":"test",
"epi_isl_463337_Washington_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_463420_Washington_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_463471_Washington_20200409_null_13":"test",
"epi_isl_463482_Washington_20200428_null_3":"test",
"epi_isl_463686_Washington_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_463687_Washington_20200506_null_4":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_463961_Quebec_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_464008_Ontario_20200428_null_26":"test",
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_464535_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_464536_England_20200305_null_15":"test",
"epi_isl_464916_England_20200310_null_8":"test",
"epi_isl_464973_England_20200312_null_10":"test",
"epi_isl_465177_England_20200418_null_19":"test",
"epi_isl_465178_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465209_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465241_England_20200419_null_18":"test",
"epi_isl_465243_England_20200414_null_5":"test",
"epi_isl_465264_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465355_England_20200421_null_9":"test",
"epi_isl_465390_England_20200421_null_5":"test",
"epi_isl_465438_England_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_465523_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465545_England_20200501_null_21":"test",
"epi_isl_465579_England_20200502_null_47":"test",
"epi_isl_465600_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_465619_England_20200505_null_11":"test",
"epi_isl_465657_England_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_465662_England_20200514_null_15":"test",
"epi_isl_465845_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_465848_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_465876_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_465881_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_465925_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_465996_England_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_466186_England_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_466189_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_466222_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_466277_England_20200407_null_61":"test",
"epi_isl_466318_England_20200409_null_6":"test",
"epi_isl_466324_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_466361_England_20200409_null_4":"test",
"epi_isl_466417_England_20200408_null_9":"test",
"epi_isl_466430_England_20200410_null_51":"test",
"epi_isl_466450_England_20200414_null_5":"test",
"epi_isl_466486_England_20200414_null_29":"test",
"epi_isl_466491_England_20200414_null_90":"test",
"epi_isl_466551_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_466605_England_20200416_null_13":"test",
"epi_isl_466610_England_20200415_null_4":"test",
"epi_isl_466613_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466627_Narayanganj_20200601_null_15":"test",
"epi_isl_466681_Nebraska_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_466805_British_Columbia_20200401_null_192":"test",
"epi_isl_466834_British_Columbia_20200401_null_61":"test",
"epi_isl_466838_British_Columbia_20200401_null_51":"test",
"epi_isl_467074_Andalusia_20200315_null_13":"test",
"epi_isl_467143_Basque_Country_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_467187_Madrid_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_467190_Madrid_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_467206_Madrid_20200401_null_15":"test",
"epi_isl_467216_Madrid_20200402_null_80":"test",
"epi_isl_467243_Madrid_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_467287_Galicia_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_467329_British_Columbia_20200401_null_134":"test",
"epi_isl_467335_British_Columbia_20200401_null_40":"test",
"epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_26":"test",
"epi_isl_467384_New_York_20200510_null_101":"test",
"epi_isl_467568_New_Mexico_20200403_null_9":"test",
"epi_isl_467588_New_Mexico_20200312_null_40304":"test",
"epi_isl_467646_New_Mexico_20200402_null_30":"test",
"epi_isl_467717_England_20200521_null_825":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":14
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":9
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":24
}
}
}