{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835397868497],
[230.7088009829677, 611.7490085976073, 0, 1, 0.2738520533127091, 0, 0.001634657328325601, 0.003387003936779419, 0.7261479466872909, 1, 0.001162104417156028],
[231.059427905653, 611.1749760044808, 1, 0, 0.2743409991718967, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.2743409991718968, 0.001162135308093045],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161760399876347],
[231.059427905653, 611.3515906052064, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162134370674365],
[230.9853953125265, 611.5151491017272, 0, 1, 0.274166464157146, 0, 0.001635282464332944, 0.003388299216273905, 0.725833535842854, 1, 0.001162115170978439],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161835397868497],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161499488664848],
[230.9111774769377, 611.4998410339217, 0, 1, 0.2741074990746468, 0, 0.001635323401407928, 0.003388384037741823, 0.7258925009253532, 1, 0.00116133783625556],
[231.0178157205739, 611.4827286936797, 0, 1, 0.2742049453287753, 0, 0.001635369165922831, 0.003388478861647394, 0.7257950546712246, 1, 0.001161760399952088],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162115170978439],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162134370674365],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162466670437791],
[229.7287203958542, 609.620307589679, 0, 1, 0.2736986792576756, 0, 0.001640365302057943, 0.003398830837235846, 0.7263013207423243, 1, 0.001163254142712848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7813539459275, 611.6296645649319, 0, 1, 0.273953389586336, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162185398602937],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 0, 1, 0.2741832196316368, 0, 0.001635614365898278, 0.003388986915089388, 0.7258167803683632, 1, 0.001161918793923439],
[231.059427905653, 611.3515906052065, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162700763978375],
[230.7965534015382, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739705405227702, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739705405227701, 0.001162466670457502],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161747788603636],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.8959780213271, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161876544002123],
[231.4358167215825, 610.7517961188357, 0, 2, 0.2748031592877822, 0, 0.003274652670216387, 0.006785068217917604, 0.5259104577789818, 1, 0.002329881795897455],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 2, 0.2741630433026868, 0, 0.003270897087056934, 0.006777286663505218, 0.5268392877076175, 1, 0.002327073839528122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7813539459275, 611.629664564932, 0, 1, 0.2739533895863359, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001164221238817554],
[230.9579685466533, 611.629664564932, 0, 1, 0.2741055760499954, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7258944239500046, 1, 0.001161799360498497],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161835397868497],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162466670525499],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.734562876212, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2739705017721897, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7260294982278104, 1, 0.001163056346951992],
[230.932206653409, 611.4760695269092, 0, 1, 0.2741333545540545, 0, 0.001635386975607543, 0.00338851576324823, 0.7258666454459455, 1, 0.001161835397940755],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335566578],
[231.1193836917683, 611.28889248855, 1, 0, 0.2743555473359298, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743555473359298, 0.001161876544063306],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161832885245521],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764104974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161976077912225],
[231.1319808686128, 611.2790376422467, 1, 0, 0.2743696079346014, 0.004326532383108208, 0, -0.008964559091538401, 1, 0.2743696079346014, 0.001164221238026986],
[231.2583343832245, 611.5906936023089, 0, 1, 0.2743769366809945, 0, 0.001635080472055477, 0.003387880689022277, 0.7256230633190055, 1, 0.001161760399952088],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162700764104974],
[230.318705226609, 612.1818391876446, 0, 2, 0.2733751411243746, 0, 0.003267003154902418, 0.006769218450486894, 0.5279836855360226, 1, 0.002327640009096567],
[230.6471803242234, 611.5404325161948, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001161736498161941],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161760399952088],
[229.8585439268644, 609.5056835142794, 0, 1, 0.273848391928261, 0, 0.001640673790331558, 0.003399470023797506, 0.726151608071739, 1, 0.001166007213459364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.734562876212, 611.6296645649319, 0, 1, 0.2739130596477442, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7260869403522558, 1, 0.001162391687399775],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161898908061616],
[230.8565091876535, 611.6440352266001, 1, 0, 0.2740134836923529, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740134836923529, 0.001161760399952088],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001162115170978439],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161160436176608],
[230.7965534015382, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2740239383660659, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2740239383660659, 0.001162466598592548],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162700764104974],
[231.0851897988972, 611.102423041521, 0, 1, 0.2743868305299859, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7256131694700141, 1, 0.001161747788563446],
[231.0178157205739, 611.3932027902856, 0, 1, 0.2742340860272067, 0, 0.001635608631951067, 0.003388975034371979, 0.7257659139727932, 1, 0.001161799360498497],
[230.8565091876535, 611.7311239239317, 1, 0, 0.2739851620360548, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2739851620360547, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.2764353634806, 0, 1, 0.2742205346568773, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7257794653431227, 1, 0.001162700764104974],
[230.9853953125265, 611.5151491017272, 0, 1, 0.274166464157146, 0, 0.001635282464332944, 0.003388299216273905, 0.725833535842854, 1, 0.001161747788563446],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753486, 0, -0.008977587706156765, 1, 0.2739714323888121, 0.001162571829787085],
[230.8959780213271, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162466598592548],
[231.0474944500475, 611.2129132368339, 0, 1, 0.2743183608553777, 0, 0.001636091087644476, 0.003389974680783849, 0.7256816391446224, 1, 0.001161760399952088],
[231.0178157205739, 611.3932027902856, 0, 1, 0.2742340860272067, 0, 0.001635608631951067, 0.003388975034371979, 0.7257659139727932, 1, 0.001161898907895111],
[231.1813742170945, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2744129991888736, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7255870008111265, 1, 0.001170281750766112],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161996984485795],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161941733129112],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161522036323531],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161884759825161],
[228.7309589503917, 607.7121486305336, 0.5, 8.5, 0.2734566844742182, 0.00218597430926892, 0.01398688510531601, 0.02445144351124385, 0.151951416358863, 0.9435903242856679, 0.0101097617765056],
[228.7795933745027, 607.6782162060724, 0, 2, 0.2735100213712149, 0, 0.003291215558929582, 0.00681938646205596, 0.5277876890480526, 1, 0.001686703406948027],
[228.4772371516998, 608.0273634985908, 0, 0, 0.2731332702463128, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001174246562952605],
[228.4772371516998, 608.0273634985908, 0, 1, 0.2731332702463128, 0, 0.001644662822814417, 0.003407735284344327, 0.7268667297536873, 1, 0.001167196309022819],
[228.4772371516998, 608.0273634985908, 0, 0, 0.2731332702463128, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006892431222949963],
[228.5240282214153, 607.9805724288752, 0, 1, 0.2731892066627762, 0, 0.001644789398458921, 0.003407997548611466, 0.7268107933372238, 1, 0.001180562923772342],
[230.7999761528684, 611.611042357991, 0, 2, 0.2739754954307892, 0, 0.003270052143416585, 0.006775535943408334, 0.5271115812349682, 1, 0.001642827332845707],
[229.8843058201086, 609.4799216210353, 0, 1, 0.2738790840788222, 0, 0.001640743139397107, 0.003399613714804761, 0.7261209159211779, 1, 0.001174393720744327],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162383057920888],
[230.4053349965799, 609.0056835142794, 0, 1, 0.2744845253584186, 0, 0.001642020800576901, 0.003402261024042512, 0.7255154746415814, 1, 0.001163093299558438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161876815644678],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162053699329575],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835397868497],
[230.8565091876535, 611.5545093232059, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161760399876347],
[230.9305417807801, 611.3909508266853, 0, 1, 0.2741596217210585, 0, 0.001635614656461404, 0.00338898751713511, 0.7258403782789415, 1, 0.001161601097610961],
[231.1193836917683, 611.2916348190912, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161475117993626],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764045572],
[230.9579685466533, 611.2129132368339, 1, 0, 0.2742412181926162, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2742412181926162, 0.001164235970654192],
[230.9579685466533, 611.302439140228, 0, 1, 0.2742120684277898, 0, 0.001635851480335101, 0.003389478215325267, 0.7257879315722102, 1, 0.001161799360564125],
[230.932206653409, 611.4760695269092, 0, 1, 0.2741333545540545, 0, 0.001635386975607543, 0.00338851576324823, 0.7258666454459455, 1, 0.001161835335498159],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835335652263],
[230.895978021327, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162333563068168],
[230.895978021327, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741096271856712, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258903728143288, 1, 0.001162344585736653],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162466598592548],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001170565606021463],
[229.8585439268644, 609.552474583995, 0, 1, 0.2738331268686947, 0, 0.001640547847307939, 0.003399209070318499, 0.7261668731313053, 1, 0.001161943393549597],
[230.0819495973057, 609.3415260386233, 1, 0, 0.2740952049536148, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740952049536148, 0.001160425115285676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161349601069747],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162251034311096],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161760399952088],
[231.6468104576415, 611.2022175278918, 0, 1, 0.2748378449356383, 0, 0.001636119718355514, 0.0033900340035112, 0.7251621550643617, 1, 0.001164221238817554],
[230.4579685466533, 611.9530499642062, 0, 1, 0.2735695088058519, 0, 0.001634112290245945, 0.003385874619894771, 0.7264304911941482, 1, 0.001161972549689262],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161799360498497],
[230.5199590719795, 611.89105943888, 1, 0, 0.273643095836368, 0.004338019163398132, 0, -0.008988359657803102, 1, 0.273643095836368, 0.001162541860295951],
[230.9579685466533, 611.629664564932, 0, 1, 0.2741055760499954, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7258944239500046, 1, 0.001161760399952088],
[230.0769559551315, 609.5131143625163, 0, 1, 0.2740348702171822, 0, 0.001640653788140211, 0.003399428579331033, 0.7259651297828178, 1, 0.001162314333068353],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9853953125265, 611.5151491017272, 0, 1, 0.274166464157146, 0, 0.001635282464332944, 0.003388299216273905, 0.725833535842854, 1, 0.001162653506258116],
[231.3085954693385, 611.102423041521, 0, 1, 0.2745792616509523, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7254207383490476, 1, 0.001161876544002123],
[230.8565091876536, 611.7311239239316, 1, 0, 0.2739851620360548, 0.004331695058193668, 0, -0.008975256135215852, 1, 0.2739851620360548, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670437791],
[230.8565091876535, 611.5545093232059, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.2129132368339, 0, 1, 0.2742412181926162, 0, 0.001636091087644476, 0.003389974680783849, 0.7257587818073838, 1, 0.001161832885181648],
[230.6471803242234, 611.5404325161948, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001162466670437791],
[230.0694924722362, 609.3415260386233, 0, 1, 0.2740844322968102, 0, 0.001641115790189252, 0.003400385845867442, 0.7259155677031898, 1, 0.001162605006999164],
[229.8078677834812, 609.6499417970938, 0, 1, 0.2737574958035138, 0, 0.001640285566258324, 0.003398665624954021, 0.7262425041964862, 1, 0.001163070211607833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9455114215838, 611.4655070892757, 0, 1, 0.2741482558357666, 0, 0.00163541522523526, 0.003388574296372346, 0.7258517441642334, 1, 0.001162178507140397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162618075345663],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162026028538238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001161540976688244],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.00116160315019804],
[229.9524763814613, 609.5053331991137, 0, 1, 0.2739297600868759, 0, 0.001640674733314137, 0.003399471977653919, 0.726070239913124, 1, 0.001161517206687103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.0178157205739, 611.3932027902857, 0, 1, 0.2742340860272067, 0, 0.001635608631951066, 0.003388975034371978, 0.7257659139727933, 1, 0.00116160315019804],
[230.1556123238503, 609.3021972567246, 0, 1, 0.2741717447823194, 0, 0.001641221719702182, 0.003400605331426342, 0.7258282552176806, 1, 0.001160638901334016],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.00116160315019804],
[229.2112055887605, 609.7997926509319, 0, 1, 0.273192134631921, 0, 0.001639882486107093, 0.00339783044437189, 0.726807865368079, 1, 0.001163131916429807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.6471803242234, 611.5404325161948, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001162026028538238],
[229.8327820336202, 609.5010464963024, 0, 1, 0.2738276168806015, 0, 0.001640686272400136, 0.003399495886597419, 0.7261723831193985, 1, 0.001162477939807953],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 0, 1, 0.2741832196316368, 0, 0.001635614365898278, 0.003388986915089388, 0.7258167803683632, 1, 0.001162026028538238],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162480381060995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162015191004964],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001163233165084973],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162004353471687],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162612870272508],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161971840871849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162489870319461],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161928490738701],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.00116295812797227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161820115405709],
[229.8327820336202, 609.718609686386, 0, 1, 0.2737566565910361, 0, 0.001640100833586757, 0.003398282859541964, 0.7262433434089639, 1, 0.001162706251045817],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4998410339218, 0, 1, 0.2741478159738797, 0, 0.001635323401407927, 0.003388384037741822, 0.7258521840261203, 1, 0.001162615033162912],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162467038984832],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162581809196524],
[230.1860112350716, 609.2717983455034, 0, 1, 0.2742079573362731, 0, 0.001641303606560375, 0.003400775000693571, 0.7257920426637269, 1, 0.001161279331063223],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161343263938381],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162501961480191],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161957106536549],
[229.8327820336202, 609.9782567484062, 0, 1, 0.2736720183708772, 0, 0.001639402698271036, 0.003396836325750583, 0.7263279816291228, 1, 0.001161217159366055],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.6296645649319, 0, 1, 0.2741055760499955, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7258944239500045, 1, 0.001161474293203981],
[229.50995174339, 609.6250275469548, 0, 1, 0.273507787671402, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.726492212328598, 1, 0.001162436944556849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2740239383660659, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2740239383660659, 0.001162652738562594],
[229.8876355653666, 610.446192964556, 0, 1, 0.2735670370042478, 0, 0.001638146017659025, 0.00339423248817166, 0.7264329629957522, 1, 0.001163254152969475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9853953125265, 611.8636326730068, 0, 1, 0.2740531075471456, 0, 0.001634351098187301, 0.003386369429065777, 0.7259468924528544, 1, 0.001162143905035225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162737885609046],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162106961627413],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162511589917631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162276340730544],
[230.4795528321687, 608.9782567484062, 0, 1, 0.2745576373246502, 0, 0.001642094752839658, 0.003402414252857354, 0.7254423626753499, 1, 0.0011623897029444],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162374369430531],
[229.6110412358079, 610.3315688891565, 0, 1, 0.273365154318873, 0, 0.001638453671698591, 0.003394869946203457, 0.726634845681127, 1, 0.001163562394896258],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162925565018375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162063581657796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5836144699347, 609.920986180356, 1, 0, 0.2734751117410153, 0.004355711544610061, 0, -0.00902501820622021, 1, 0.2734751117410152, 0.001162125197004992],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162001384478873],
[229.7450296150498, 609.7595710352409, 1, 0, 0.2736673860239556, 0.004352651292067359, 0, -0.009018677374273316, 1, 0.2736673860239556, 0.001162461272404068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162888685900664],
[230.7599992558534, 612.1826108691109, 0, 1, 0.2737552906735178, 0, 0.001633499518355002, 0.003384604958803722, 0.7262447093264822, 1, 0.00116254108853302],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001161998379236314],
[230.4471762942127, 612.0574243560778, 0, 1, 0.273526312041906, 0, 0.0016338336244382, 0.003385297225372064, 0.726473687958094, 1, 0.001163094616168649],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162466461680382],
[230.6210485643973, 611.8835520858933, 1, 0, 0.2737326874967704, 0.004336117653722165, 0, -0.008984419736789246, 1, 0.2737326874967704, 0.001161662821504522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.607755843529, 610.020825857414, 0, 1, 0.2725971435171656, 0, 0.001639288295763429, 0.003396599284178061, 0.7274028564828343, 1, 0.001162049365681646],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0711573448652, 611.9954338307515, 0, 1, 0.2732220465173197, 0, 0.001633999119471457, 0.003385640130468713, 0.7267779534826804, 1, 0.001162330247425223],
[230.9596334192822, 611.5449672310083, 0, 1, 0.2741345664356196, 0, 0.001635202730108078, 0.003388134007254965, 0.7258654335643804, 1, 0.001161609819747982],
[230.109006496597, 612.3955941536935, 0, 1, 0.2731249257499442, 0, 0.001632931408303093, 0.003383427836877924, 0.7268750742500558, 1, 0.001162289974339965],
[230.9596334192822, 611.5449672310083, 0, 1, 0.2741345664356196, 0, 0.001635202730108078, 0.003388134007254965, 0.7258654335643804, 1, 0.001161609890076666],
[230.636248020008, 611.8683526302826, 0, 1, 0.273750728295122, 0, 0.001634338490790099, 0.003386343306585415, 0.7262492717048781, 1, 0.001162515351365634],
[230.6830390897235, 611.821561560567, 0, 1, 0.2738062663535248, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7261937336464752, 1, 0.001162515351365634],
[230.3324121670383, 612.3336036283673, 0, 1, 0.2733377255633407, 0, 0.001633096720602177, 0.003383770363350044, 0.7266622744366593, 1, 0.001161787378939995],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162876428868145],
[230.236227748841, 612.2683729014497, 0, 1, 0.2732759293790588, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7267240706209412, 1, 0.001162602000843601],
[230.236227748841, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2733484127641591, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.726651587235841, 1, 0.001162986224098108],
[230.2982182741672, 612.2063823761233, 1, 0, 0.2733495082358133, 0.004342195990459259, 0, -0.008997014028021338, 1, 0.2733495082358133, 0.001162602026516983],
[230.6488451968524, 611.6323497829968, 0, 1, 0.2738382936382314, 0, 0.001634969112334875, 0.00338764995209317, 0.7261617063617687, 1, 0.001162986224098108],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001162220020390414],
[230.4128423495667, 612.0917583007239, 0, 1, 0.273485559807889, 0, 0.001633741978124618, 0.003385107334549373, 0.726514440192111, 1, 0.001164005230611993],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001162220031720326],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001163218065110291],
[230.2362277488409, 612.2683729014495, 0, 1, 0.2732759293790588, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7267240706209412, 1, 0.001164992992082162],
[230.2830188185565, 612.2215818317341, 0, 1, 0.2733314674374617, 0, 0.001633395537948946, 0.003384389511787057, 0.7266685325625384, 1, 0.001162220031720326],
[230.6210485643973, 611.8835520858933, 1, 0, 0.2737326874967704, 0.004336117653722165, 0, -0.008984419736789246, 1, 0.2737326874967704, 0.001162284734177439],
[230.2362277488409, 612.2683729014495, 0, 1, 0.2732759293790588, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7267240706209412, 1, 0.001163218065110291],
[230.3257536522351, 612.2683729014495, 0, 1, 0.2733531440508567, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7266468559491432, 1, 0.001164005229776702],
[230.4596334192822, 612.0574243560777, 0, 1, 0.2735370533954573, 0, 0.0016338336244382, 0.003385297225372065, 0.7264629466045427, 1, 0.001162207698708159],
[230.6830390897235, 611.821561560567, 0, 1, 0.2738062663535248, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7261937336464752, 1, 0.001162398991629371],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162207777136574],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001163218065111402],
[230.4720905443517, 612.0325101059389, 0, 1, 0.2735558836906777, 0, 0.001633900133551576, 0.003385435032008926, 0.7264441163093223, 1, 0.001162207698708159],
[230.4596334192822, 611.821561560567, 0, 1, 0.2736136515843687, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7263863484156312, 1, 0.001164005229776702],
[230.4720905443517, 612.0325101059389, 0, 1, 0.2735558836906777, 0, 0.001633900133551576, 0.003385435032008926, 0.7264441163093223, 1, 0.001162284733862799],
[230.4596334192822, 611.9981761612928, 0, 1, 0.2735562906515385, 0, 0.001633991797610274, 0.003385624959599431, 0.7264437093484615, 1, 0.001162401022070908],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001162207698708159],
[230.4596334192822, 612.0917583007239, 0, 1, 0.273525906768507, 0, 0.001633741978124618, 0.003385107334549373, 0.726474093231493, 1, 0.001163218062509248],
[230.6830390897235, 611.821561560567, 0, 1, 0.2738062663535248, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7261937336464752, 1, 0.001162207777136574],
[230.2104658555967, 612.3409258644094, 0, 1, 0.2732301769576799, 0, 0.001633077192396299, 0.00338372990097971, 0.7267698230423201, 1, 0.00116315474800423],
[229.9726456533958, 612.5319549968947, 1, 0, 0.2729630740008904, 0.004348343243861941, 0, -0.00900975111432957, 1, 0.2729630740008904, 0.001159487380311525],
[230.0490507104817, 612.5023410095245, 0, 1, 0.2730385979671265, 0, 0.001632646821156313, 0.003382838173362643, 0.7269614020328735, 1, 0.001171156866275646],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.2982182741672, 612.2063823761234, 1, 0, 0.2733495082358132, 0.004342195990459259, 0, -0.008997014028021338, 1, 0.2733495082358133, 0.001162332513280796],
[230.295475943626, 612.2091247066645, 1, 0, 0.2733462532618475, 0.004342247696801434, 0, -0.008997121163371034, 1, 0.2733462532618476, 0.001162617835107956],
[230.7088009829677, 611.7490085976073, 0, 1, 0.2738520533127091, 0, 0.001634657328325601, 0.003387003936779419, 0.7261479466872909, 1, 0.001162289900058685],
[231.059427905653, 611.1749760044808, 1, 0, 0.2743409991718967, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.2743409991718968, 0.001161793261304025],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3859706927376, 610.0718388878374, 0, 1, 0.2732549129626271, 0, 0.001639151221638099, 0.00339631526709749, 0.7267450870373729, 1, 0.001162495109818889],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161906815672118],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162665698942772],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162625887392474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.2795933745027, 609.1782162060723, 0, 1, 0.2743194366010594, 0, 0.001641555744110392, 0.003401297428764408, 0.7256805633989406, 1, 0.001161809223244741],
[231.1813742170945, 611.229644293765, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739682, 0.7255717587529223, 1, 0.001161089639726645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.00116292783051226],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161906815672118],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162584929556354],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162625887392474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.50995174339, 609.947857837185, 0, 1, 0.273402604781367, 0, 0.001639484403709362, 0.003397005619116521, 0.726597395218633, 1, 0.001161796232770956],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753486, 0, -0.008977587706156765, 1, 0.2739714323888121, 0.001161787602805778],
[229.6298633156207, 609.8279462649543, 0, 1, 0.2735454488538888, 0, 0.001639806778493431, 0.003397673578476468, 0.7264545511461111, 1, 0.001161233589287161],
[229.81704035398, 609.5939781568795, 0, 1, 0.2737836831850056, 0, 0.001640436152311612, 0.003398977638699332, 0.7262163168149944, 1, 0.001161239001838933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.8565091876535, 611.554509323206, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161057322263676],
[229.7088009829677, 609.7490085976073, 0, 1, 0.2736394829631033, 0, 0.001640019066697543, 0.003398113438850015, 0.7263605170368967, 1, 0.001162651670243715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.8959780213271, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162253890478538],
[230.9455114215838, 611.4655070892758, 0, 1, 0.2741482558357665, 0, 0.001635415225235259, 0.003388574296372346, 0.7258517441642335, 1, 0.00116255062838993],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8876355653666, 610.0504474699532, 0, 1, 0.2736959309364946, 0, 0.001639208698472847, 0.00339643435888645, 0.7263040690635054, 1, 0.001162801633955223],
[230.9853953125265, 611.6657599257054, 0, 1, 0.2741174611541628, 0, 0.001634879807758837, 0.003387464913342007, 0.7258825388458372, 1, 0.001162242332723263],
[231.059427905653, 611.3515906052065, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162160694849866],
[230.4795528321687, 608.9782567484062, 0, 1, 0.2745576373246502, 0, 0.001642094752839658, 0.003402414252857354, 0.7254423626753499, 1, 0.001162588082371155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162028616234562],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162126123916276],
[230.0357007516196, 609.068879627504, 0, 1, 0.2741442558300481, 0, 0.001641850426854156, 0.003401908010319292, 0.7258557441699519, 1, 0.001163096961451951],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.059427905653, 611.1749760044808, 1, 0, 0.2743409991718967, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.2743409991718968, 0.001161930056691734],
[229.7365976154229, 609.4978062947108, 1, 0, 0.27374544769023, 0.00435281104699736, 0, -0.009019008385897255, 1, 0.27374544769023, 0.001163044329363642],
[229.5336788974234, 609.9668655168302, 1, 0, 0.2734169506198193, 0.004356659139536953, 0, -0.009026981619403046, 1, 0.2734169506198193, 0.001162582502400639],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161840185716723],
[230.1315281882497, 609.3262813923252, 0, 1, 0.274143054673864, 0, 0.001641156849028366, 0.003400470919630188, 0.725856945326136, 1, 0.001163047025250261],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162011349825676],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.00116197266068186],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162925457590145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161877216845068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001161222436355958],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161730130309483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 0, 1, 0.2740992726131687, 0, 0.001641149341164735, 0.003400455363364519, 0.7259007273868312, 1, 0.001161843372066113],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162320695707749],
[229.1315281882497, 610.3262813923253, 0, 1, 0.2729518095766272, 0, 0.001638467866267728, 0.003394899357298195, 0.7270481904233728, 1, 0.001162532291860092],
[228.7933131999467, 610.1796958362389, 0, 1, 0.272706405016277, 0, 0.001638861481009328, 0.00339571492558659, 0.7272935949837229, 1, 0.001165167627273163],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162344504262365],
[229.7313226746205, 609.5557147855866, 0, 1, 0.2737219954806137, 0, 0.001640539126684677, 0.003399191001219362, 0.7262780045193863, 1, 0.001161804001456468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 1, 0, 0.2741832196316368, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741832196316368, 0.001164248274306412],
[231.1471803242234, 611.0404325161949, 0, 1, 0.2744604370808079, 0, 0.001636552913335234, 0.003390931581906549, 0.7255395629191921, 1, 0.001162412096699191],
[229.50995174339, 609.947857837185, 0, 1, 0.273402604781367, 0, 0.001639484403709362, 0.003397005619116521, 0.726597395218633, 1, 0.001162666119481161],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.6144651093214, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001161796741319334],
[229.7176157341912, 609.6934027766684, 1, 0, 0.273665237492018, 0.004353170725736206, 0, -0.009019753638913493, 1, 0.2736652374920181, 0.001161790029507247],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.8565091876535, 611.554509323206, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161028613572068],
[229.9205344521906, 609.4904840586689, 1, 0, 0.2739069768944379, 0.004349328790412753, 0, -0.009011793163136763, 1, 0.273906976894438, 0.001162435393527076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.00116256818123927],
[229.50995174339, 609.947857837185, 0, 1, 0.273402604781367, 0, 0.001639484403709362, 0.003397005619116521, 0.726597395218633, 1, 0.001162989229027327],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.6144651093214, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162354989619493],
[229.9205344521906, 609.4904840586689, 1, 0, 0.2739069768944379, 0.004349328790412753, 0, -0.009011793163136763, 1, 0.273906976894438, 0.00116303290058849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161774919062385],
[230.0819495973057, 609.2670783882276, 0, 1, 0.2741195163465077, 0, 0.00164131632164572, 0.003400801346303365, 0.7258804836534923, 1, 0.001162026853790898],
[230.0819495973057, 609.2050878629013, 0, 1, 0.2741397630702887, 0, 0.001641483336109375, 0.003401147399654179, 0.7258602369297114, 1, 0.001162960417519017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 0, 1, 0.2741832196316368, 0, 0.001635614365898278, 0.003388986915089388, 0.7258167803683632, 1, 0.001162182617860463],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162709472490536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162022552337631],
[230.8839359535267, 611.616608460727, 0, 2, 0.2740460376960921, 0, 0.003270022383848368, 0.006775474281693085, 0.5270091553847437, 1, 0.002329724412450789],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161882962783882],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.00116176001812842],
[229.0318938481809, 610.4727068021097, 0, 1, 0.2728179138872736, 0, 0.00163807487027288, 0.003394085071050783, 0.7271820861127265, 1, 0.001163422639280295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5044670823077, 609.9533424982673, 0, 1, 0.2733960712057427, 0, 0.001639469661571435, 0.003396975073461276, 0.7266039287942573, 1, 0.001163032297549678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.001162175318137958],
[230.564562920198, 608.8464555906614, 1, 0, 0.2746742154150258, 0.004337179952264025, 0, -0.008986620815437942, 1, 0.2746742154150258, 0.001162858580599197],
[230.7287203958542, 608.6822981150052, 0, 1, 0.2748697781036684, 0, 0.001642893185980347, 0.00340406860337101, 0.7251302218963316, 1, 0.001170606390506043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001161968508993569],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700763906664],
[231.059427905653, 611.3515906052065, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162134370674549],
[230.9853953125265, 611.8636326730068, 0, 1, 0.2740531075471456, 0, 0.001634351098187301, 0.003386369429065777, 0.7259468924528544, 1, 0.001162104417156028],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161760399876347],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670525499],
[230.8959780213271, 611.5150404895323, 0, 1, 0.2740894562721708, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001161747788563446],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161876544002123],
[230.7813539459275, 611.6296645649319, 0, 1, 0.273953389586336, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162466670437791],
[231.1193836917683, 611.28889248855, 1, 0, 0.2743555473359298, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743555473359298, 0.001161835335498159],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162571829787085],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 1, 0, 0.2741832196316368, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741832196316368, 0.001164235969794875],
[231.3702161280828, 611.0875934524922, 1, 0, 0.2746371551155452, 0.004322077477104555, 0, -0.008955328542780019, 1, 0.2746371551155452, 0.001161835397872404],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162700764104974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164221238026986],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.001162571829863346],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.2739714323888121, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162466598592548],
[230.7965534015382, 611.6144651093214, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162466598592548],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164235969794875],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.001162466670437791],
[229.5977041619605, 609.8133143488989, 1, 0, 0.2735223854569765, 0.004355444248234252, 0, -0.009024464369118412, 1, 0.2735223854569765, 0.001162386966507681],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.2739714323888121, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162214134201935],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162672742858987],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162466670437791],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 1, 0, 0.2741832196316368, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741832196316368, 0.001163056348387928],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335652263],
[230.9455114215838, 611.4655070892757, 0, 1, 0.2741482558357666, 0, 0.00163541522523526, 0.003388574296372346, 0.7258517441642334, 1, 0.001161972624832467],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164235970654192],
[231.3702161280828, 611.0875934524922, 1, 0, 0.2746371551155452, 0.004322077477104555, 0, -0.008955328542780019, 1, 0.2746371551155452, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670437791],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 0, 1, 0.2740992726131687, 0, 0.001641149341164735, 0.003400455363364519, 0.7259007273868312, 1, 0.001160834921819636],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161641488025312],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162672742858987],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835335652263],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161835397868497],
[230.432206653409, 612.025602927166, 0, 1, 0.2735237349964525, 0, 0.001633918573368907, 0.003385473239242215, 0.7264762650035475, 1, 0.001164235970654192],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753486, 0, -0.008977587706156765, 1, 0.2739714323888121, 0.001161843810649635],
[230.6471803242234, 611.5404325161949, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001162466670525499],
[230.7965534015382, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2740239383660659, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2740239383660659, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162571829917285],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164235970654192],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[231.3959780213271, 611.0150404895325, 1, 0, 0.2746829907690057, 0.004321596289404101, 0, -0.008954331523644861, 1, 0.2746829907690056, 0.001164235970654192],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001161374985407473],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161698806389269],
[229.5770200452675, 609.8339984655919, 0, 1, 0.2734977442308824, 0, 0.001639790504491563, 0.003397639858804803, 0.7265022557691176, 1, 0.001162386966642819],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.00116221407820974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764104974],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161760399952088],
[230.5457209652237, 611.8185064759202, 1, 0, 0.2736888788185535, 0.004337534419694753, 0, -0.008987355270643036, 1, 0.2736888788185535, 0.00116257175640872],
[230.7088009829677, 611.7490085976073, 0, 1, 0.2738520533127091, 0, 0.001634657328325601, 0.003387003936779419, 0.7261479466872909, 1, 0.001161747788603636],
[231.0199590719795, 611.4405928391368, 0, 1, 0.2742205062871041, 0, 0.001635481863179288, 0.003388712369945843, 0.7257794937128959, 1, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764104974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161843810583158],
[231.0047596163688, 611.4062588944907, 0, 1, 0.2742185875307268, 0, 0.00163557370480332, 0.003388902665451063, 0.7257814124692732, 1, 0.001164235970517453],
[230.9455114215838, 611.4655070892757, 0, 1, 0.2741482558357666, 0, 0.00163541522523526, 0.003388574296372346, 0.7258517441642334, 1, 0.001162700763906664],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335498159],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162541860336201],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161799360498497],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162700764045572],
[230.895978021327, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162466670525499],
[230.8307472944093, 611.7416863615653, 0, 1, 0.2739595292630453, 0, 0.001634676894340265, 0.003387044477489417, 0.7260404707369547, 1, 0.001161876544002123],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161832862863067],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161835397868497],
[231.3085954693385, 611.102423041521, 0, 1, 0.2745792616509523, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7254207383490476, 1, 0.001161835397940755],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161747788563446],
[231.107341623968, 611.3036768868914, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426334, 0.7256596405487438, 1, 0.00116197262500507],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700837555398],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161843810649635],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161747788603636],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161876544002123],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161832862863067],
[230.4801203717241, 612.1543038095767, 0, 1, 0.2735232667424635, 0, 0.00163357505415999, 0.003384761468712208, 0.7264767332575366, 1, 0.001163619048912065],
[231.3085954693385, 611.102423041521, 0, 1, 0.2745792616509523, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7254207383490476, 1, 0.001161760399876347],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835397940755],
[231.1568750242247, 611.2541434866347, 0, 1, 0.274399159014852, 0, 0.00163598073020157, 0.003389746020570423, 0.725600840985148, 1, 0.001161799360498497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161747788603636],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.6351382564231, 609.625269430458, 0, 1, 0.2736160745260575, 0, 0.001640351950853759, 0.003398803173590168, 0.7263839254739425, 1, 0.001161798422369018],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161898384716699],
[230.9579685466533, 611.302439140228, 0, 1, 0.2742120684277898, 0, 0.001635851480335101, 0.003389478215325267, 0.7257879315722102, 1, 0.00116147861101686],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[231.3959780213271, 611.0150404895325, 1, 0, 0.2746829907690057, 0.004321596289404101, 0, -0.008954331523644861, 1, 0.2746829907690056, 0.001162344585736653],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162334034566076],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161760399952088],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162571829787085],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001163056348388326],
[230.8565091876535, 611.5545093232059, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161760399792864],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164221238026986],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[231.0320011397798, 611.2894914676856, 0, 1, 0.2742800737810975, 0, 0.001635886129171031, 0.003389550007585127, 0.7257199262189025, 1, 0.001164235969794981],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161835335652263],
[231.395978021327, 611.0150404895325, 1, 0, 0.2746829907690056, 0.004321596289404102, 0, -0.008954331523644863, 1, 0.2746829907690056, 0.001162333821499794],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162333921353564],
[230.607341623968, 611.8036768868915, 0, 1, 0.2737468249544213, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455787, 1, 0.001162466670525499],
[230.8565091876535, 611.7311239239316, 1, 0, 0.2739851620360548, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2739851620360547, 0.001161760399876347],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162104417156028],
[230.7813539459275, 611.6296645649319, 0, 1, 0.2739533895863359, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162134370680186],
[230.9579685466533, 611.4655070892757, 1, 0, 0.2741589891857033, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741589891857033, 0.001161760399952088],
[231.1568750242247, 611.2541434866347, 0, 1, 0.274399159014852, 0, 0.00163598073020157, 0.003389746020570423, 0.725600840985148, 1, 0.001161760399952088],
[231.134583147379, 611.2764353634806, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161799360498497],
[231.8959780213271, 610.5150404895325, 0, 1, 0.2752765252658405, 0, 0.001637961284619892, 0.003393849721998008, 0.7247234747341595, 1, 0.001162541857182835],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835397940755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001162395913018324],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001161934617696752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161223282261921],
[231.0178157205739, 611.4827286936797, 0, 1, 0.2742049453287753, 0, 0.001635369165922831, 0.003388478861647394, 0.7257950546712246, 1, 0.001161799360564125]
],
"NAMES": [
["epi_isl_442452_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1"],
["epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2"],
["epi_isl_443517_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_442426_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_448295_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_442943_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5"],
["epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3"],
["epi_isl_441065_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_456909_Scotland_20200403_null_7"],
["Node779"],
["epi_isl_451744_Vaud_20200325_null_1"],
["epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1"],
["epi_isl_437525_Oregon_20200420_null_4"],
["epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3"],
["epi_isl_440980_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_461449_Washington_20200411_null_32209"],
["epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1"],
["epi_isl_441313_England_20200402_null_5"],
["epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1"],
["epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1"],
["epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3"],
["epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1"],
["epi_isl_435645_California_20200313_null_1"],
["epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1"],
["epi_isl_456219_Southern_20200321_null_4"],
["epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1"],
["epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1"],
["epi_isl_434066_Washington_20200402_null_59"],
["epi_isl_442615_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_457520_England_20200511_null_8"],
["epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1"],
["epi_isl_451472_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_460327_Massachusetts_20200403_null_16"],
["epi_isl_435418_Baranya_20200402_null_1"],
["epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1"],
["epi_isl_440194_England_20200318_null_1"],
["Node511"],
["epi_isl_442243_England_20200406_null_2"],
["epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1"],
["epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_448208_Scotland_20200422_null_2"],
["epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2"],
["epi_isl_457264_England_20200507_null_4"],
["epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1"],
["epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1"],
["epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1"],
["epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1"],
["epi_isl_421980_England_20200331_null_6"],
["epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1"],
["epi_isl_458337_England_20200501_null_3"],
["epi_isl_456175_Auckland_20200317_null_2"],
["epi_isl_433999_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_459037_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5"],
["epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_2"],
["epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2"],
["epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_452095_Denmark_20200414_null_1"],
["Node553"],
["epi_isl_459207_England_20200507_null_10"],
["Node552"],
["epi_isl_438405_England_20200330_null_1"],
["Node551"],
["epi_isl_432991_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2"],
["Node558"],
["epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2"],
["epi_isl_460316_Massachusetts_20200322_null_5"],
["Node565"],
["epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_441093_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1"],
["epi_isl_452584_Andalusia_20200328_null_1"],
["epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1"],
["epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1"],
["epi_isl_445296_Coyhaique_20200321_null_1"],
["epi_isl_460146_Massachusetts_20200321_null_1"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_443396_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_448292_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1"],
["epi_isl_453696_England_20200420_null_2"],
["epi_isl_439428_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2"],
["epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1"],
["epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2"],
["epi_isl_461221_Noord_Holland_20200519_null_57"],
["Node488"],
["epi_isl_459209_England_20200506_null_52"],
["epi_isl_451612_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_435150_Abruzzo_20200408_null_2"],
["epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2"],
["epi_isl_457396_England_20200430_null_4"],
["epi_isl_429053_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1"],
["epi_isl_459306_England_20200501_null_7"],
["epi_isl_441893_England_20200430_null_1"],
["epi_isl_458237_California_20200429_null_8"],
["Node618"],
["epi_isl_440892_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_457972_Montevideo_20200421_null_8"],
["epi_isl_456519_Victoria_20200512_null_9"],
["epi_isl_430952_Idaho_20200328_null_1"],
["epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_460793_Noord_Holland_20200330_null_3"],
["epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1"],
["epi_isl_423831_England_20200323_null_24"],
["epi_isl_453757_England_20200422_null_1"],
["Node379"],
["epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_432822_England_20200406_null_1"],
["Node346"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1"],
["Node343"],
["epi_isl_418764_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3"],
["Node340"],
["epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_442320_England_20200405_null_2"],
["Node337"],
["epi_isl_421841_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_460561_Michigan_20200429_null_17"],
["Node334"],
["epi_isl_440086_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1"],
["Node331"],
["epi_isl_433038_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_456138_Cali_20200316_null_2"],
["Node328"],
["epi_isl_439926_England_20200324_null_4"],
["epi_isl_444640_New_York_20200330_null_1"],
["Node325"],
["epi_isl_454236_Portugal_20200320_null_4"],
["epi_isl_454400_Pennsylvania_20200101_null_2"],
["Node322"],
["epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2"],
["epi_isl_456630_Victoria_20200429_null_9"],
["Node297"],
["epi_isl_440236_England_20200319_null_3"],
["epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_273"],
["Node294"],
["epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1"],
["epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2"],
["Node291"],
["epi_isl_425459_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_444112_England_20200406_null_3"],
["Node288"],
["epi_isl_444410_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_461064_Netherlands_20200324_null_5"],
["Node285"],
["epi_isl_440617_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1"],
["Node282"],
["epi_isl_444373_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_459432_England_20200429_null_16"],
["Node279"],
["epi_isl_440722_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_460790_Noord_Holland_20200414_null_23"],
["Node276"],
["epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8"],
["epi_isl_461366_Zuid_Holland_20200511_null_49"],
["Node273"],
["epi_isl_449276_Scotland_20200419_null_2"],
["epi_isl_455400_Hubei_20200302_null_1"],
["Node270"],
["epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1"],
["epi_isl_460421_Massachusetts_20200325_null_21"],
["Node267"],
["epi_isl_458431_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_459082_England_20200410_null_39"],
["Node264"],
["epi_isl_452914_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_455768_Odisha_20200507_null_3"],
["Node260"],
["epi_isl_458565_England_20200507_null_18"],
["Node259"],
["epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1"],
["Node255"],
["epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1"],
["epi_isl_423274_England_20200320_null_2"],
["Node252"],
["epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_439605_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_442215_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1"],
["epi_isl_461466_Washington_20200529_null_3988"],
["epi_isl_423110_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_443445_England_20200416_null_1"],
["Node234"],
["epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_433005_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_439498_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_422000_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1"],
["epi_isl_443056_England_20200411_null_2"],
["epi_isl_420495_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_440938_England_20200426_null_1"],
["epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9"],
["epi_isl_459069_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_442599_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1"],
["epi_isl_440751_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1"],
["epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_458221_Malle_20200330_null_3"],
["epi_isl_440451_England_20200311_null_2"],
["epi_isl_456208_Auckland_20200320_null_1"],
["epi_isl_421929_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1"],
["epi_isl_439717_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_443621_England_20200416_null_9"],
["epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2"],
["epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1"],
["epi_isl_439596_England_20200324_null_8"],
["epi_isl_449538_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1"],
["epi_isl_443658_England_20200417_null_2"],
["epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_446904_Wales_20200416_null_1"],
["epi_isl_456829_Scotland_20200506_null_1"],
["epi_isl_458709_England_20200326_null_8"],
["epi_isl_459574_Scotland_20200324_null_115"],
["Node245"],
["epi_isl_459724_Scotland_20200324_null_10"],
["Node163"],
["epi_isl_458077_Telangana_20200418_null_4"],
["epi_isl_457270_England_20200417_null_9"],
["epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2"],
["Node308"],
["epi_isl_451547_New_South_Wales_20200401_null_4"],
["epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1"],
["Node302"],
["epi_isl_458545_England_20200508_null_1"],
["epi_isl_459510_Scotland_20200327_null_1"],
["Node305"],
["epi_isl_457556_England_20200512_null_22"],
["epi_isl_457805_Washington_DC_20200313_null_1"],
["Node319"],
["epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3"],
["epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24"],
["Node313"],
["epi_isl_443748_England_20200327_null_7"],
["epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1"],
["Node316"],
["epi_isl_455941_Bangkok_20200315_null_3"],
["epi_isl_442367_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_460459_Massachusetts_20200327_null_49"],
["Node355"],
["epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2"],
["epi_isl_457664_England_20200501_null_41"],
["Node351"],
["epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1"],
["epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1"],
["Node361"],
["epi_isl_434637_Florida_20200327_null_2"],
["epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1"],
["epi_isl_445675_Wales_20200406_null_9"],
["Node366"],
["epi_isl_459351_Northern_Ireland_20200419_null_1"],
["epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_7"],
["epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1"],
["Node371"],
["epi_isl_442797_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_440918_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_459429_England_20200429_null_101"],
["Node374"],
["epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1"],
["epi_isl_456685_England_20200101_null_4"],
["Node385"],
["epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1"],
["epi_isl_443788_England_20200326_null_9"],
["epi_isl_459293_England_20200502_null_28"],
["Node397"],
["epi_isl_461034_Limburg_20200407_null_37"],
["epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1"],
["Node391"],
["epi_isl_459453_England_20200426_null_36"],
["epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1"],
["Node394"],
["epi_isl_459408_Northern_Ireland_20200421_null_1"],
["epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1"],
["epi_isl_459405_Northern_Ireland_20200410_null_71"],
["Node401"],
["epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1"],
["epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5"],
["Node406"],
["epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1"],
["epi_isl_444415_England_20200420_null_5"],
["epi_isl_460055_Minnesota_20200323_null_8"],
["Node411"],
["epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2"],
["epi_isl_456887_Scotland_20200510_null_5"],
["Node414"],
["epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2"],
["epi_isl_459024_England_20200410_null_4"],
["Node426"],
["epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1"],
["epi_isl_461145_Netherlands_20200513_null_14"],
["Node420"],
["epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_446221_Wales_20200406_null_7"],
["Node423"],
["epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1"],
["epi_isl_449373_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_461288_Zeeland_20200402_null_12"],
["Node435"],
["epi_isl_443052_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_453430_England_20200405_null_20"],
["Node431"],
["epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1"],
["epi_isl_421815_England_20200325_null_5"],
["epi_isl_453093_Scotland_20200419_null_3"],
["epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3"],
["epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1"],
["Node444"],
["epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_10"],
["Node443"],
["epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1"],
["epi_isl_457993_Dakhiliyah_20200324_null_14"],
["Node448"],
["epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3"],
["epi_isl_459562_Scotland_20200323_null_18"],
["epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_436730_Abruzzo_20200427_null_1"],
["epi_isl_455966_Li_ge_20200509_null_9"],
["epi_isl_457802_Maryland_20200310_null_8"],
["epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_439745_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_423187_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1"],
["epi_isl_453002_England_20200517_null_36"],
["epi_isl_440200_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_449465_England_20200402_null_3"],
["epi_isl_458750_England_20200418_null_4"],
["epi_isl_456848_Scotland_20200507_null_33"],
["epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3"],
["epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1"],
["epi_isl_458888_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1"],
["epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5"],
["Node641"],
["epi_isl_457816_Maryland_20200324_null_6"],
["epi_isl_452929_England_20200512_null_5"],
["epi_isl_436959_LA_20200405_null_2"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_1"],
["epi_isl_458825_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_457247_England_20200513_null_1"],
["epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_2"],
["epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1"],
["epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1"],
["epi_isl_453245_England_20200405_null_3"],
["epi_isl_458229_Scherpenheuvel_Zichem_20200319_null_39"],
["epi_isl_458234_Leuven_20200331_null_1"],
["Node664"],
["epi_isl_430013_Amman_20200402_null_3"],
["epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2"],
["epi_isl_456613_Victoria_20200515_null_1"],
["epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_2"],
["epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1"],
["epi_isl_458196_Frameries_20200329_null_16"],
["epi_isl_459484_England_20200427_null_15"],
["epi_isl_457240_England_20200429_null_20"],
["epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4"],
["epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_446178_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_453410_England_20200409_null_5"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1"],
["Node687"],
["epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1"],
["epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2"],
["Node690"],
["epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1"],
["epi_isl_424010_England_20200320_null_6"],
["epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1"],
["epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1"],
["epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3"],
["epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_1"],
["epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1"],
["epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4"],
["epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6"],
["epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_453489_England_20200323_null_8"],
["epi_isl_449717_England_20200415_null_2"],
["epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_440879_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_449249_Scotland_20200427_null_4"],
["epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1"],
["epi_isl_433563_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1"],
["epi_isl_452199_Maharashtra_20200420_null_2"],
["epi_isl_454138_Portugal_20200323_null_5"],
["epi_isl_457454_England_20200508_null_2"],
["epi_isl_433575_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_459205_England_20200503_null_3"],
["epi_isl_448528_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1"],
["epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1"],
["epi_isl_438715_England_20200425_null_3"],
["epi_isl_456860_Scotland_20200510_null_10"],
["epi_isl_448409_England_20200429_null_6"],
["epi_isl_420241_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1"],
["epi_isl_442949_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_448788_England_20200408_null_140"],
["epi_isl_453312_England_20200403_null_1"],
["Node76"],
["epi_isl_448721_England_20200101_null_2"],
["epi_isl_443642_England_20200415_null_3"],
["epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1"],
["epi_isl_437703_Makkah_20200414_null_1"],
["epi_isl_448342_England_20200423_null_1"],
["epi_isl_423168_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2"],
["epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1"],
["epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1"],
["epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2"],
["epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_442823_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1"],
["epi_isl_461203_Noord_Brabant_20200101_null_4"],
["epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1"],
["epi_isl_444935_Unknown_20200328_null_1"],
["epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_445073_Luxembourg_20200423_null_2"],
["epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1"],
["epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1"],
["epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_446527_Wales_20200412_null_3"],
["epi_isl_457486_England_20200506_null_1"],
["epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1"],
["epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4"],
["epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_457166_England_20200403_null_8"],
["epi_isl_457510_England_20200506_null_13"],
["epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1"],
["Node101"],
["epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3"],
["Node100"],
["epi_isl_442886_England_20200410_null_3"]
],
"RESOLVED": [
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835397868497],
[230.7088009829677, 611.7490085976073, 0, 1, 0.2738520533127091, 0, 0.001634657328325601, 0.003387003936779419, 0.7261479466872909, 1, 0.001162104417156028],
[231.059427905653, 611.1749760044808, 1, 0, 0.2743409991718967, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.2743409991718968, 0.001162135308093045],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161760399876347],
[231.059427905653, 611.3515906052064, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162134370674365],
[230.9853953125265, 611.5151491017272, 0, 1, 0.274166464157146, 0, 0.001635282464332944, 0.003388299216273905, 0.725833535842854, 1, 0.001162115170978439],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161835397868497],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161499488664848],
[230.9111774769377, 611.4998410339217, 0, 1, 0.2741074990746468, 0, 0.001635323401407928, 0.003388384037741823, 0.7258925009253532, 1, 0.00116133783625556],
[231.0178157205739, 611.4827286936797, 0, 1, 0.2742049453287753, 0, 0.001635369165922831, 0.003388478861647394, 0.7257950546712246, 1, 0.001161760399952088],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162115170978439],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162134370674365],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162466670437791],
[229.7287203958542, 609.620307589679, 0, 1, 0.2736986792576756, 0, 0.001640365302057943, 0.003398830837235846, 0.7263013207423243, 1, 0.001163254142712848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7813539459275, 611.6296645649319, 0, 1, 0.273953389586336, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162185398602937],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 0, 1, 0.2741832196316368, 0, 0.001635614365898278, 0.003388986915089388, 0.7258167803683632, 1, 0.001161918793923439],
[231.059427905653, 611.3515906052065, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162700763978375],
[230.7965534015382, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739705405227702, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739705405227701, 0.001162466670457502],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161747788603636],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.8959780213271, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161876544002123],
[231.4358167215825, 610.7517961188357, 0, 2, 0.2748031592877822, 0, 0.003274652670216387, 0.006785068217917604, 0.5259104577789818, 1, 0.002329881795897455],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 2, 0.2741630433026868, 0, 0.003270897087056934, 0.006777286663505218, 0.5268392877076175, 1, 0.002327073839528122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7813539459275, 611.629664564932, 0, 1, 0.2739533895863359, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001164221238817554],
[230.9579685466533, 611.629664564932, 0, 1, 0.2741055760499954, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7258944239500046, 1, 0.001161799360498497],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161835397868497],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162466670525499],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.734562876212, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2739705017721897, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7260294982278104, 1, 0.001163056346951992],
[230.932206653409, 611.4760695269092, 0, 1, 0.2741333545540545, 0, 0.001635386975607543, 0.00338851576324823, 0.7258666454459455, 1, 0.001161835397940755],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335566578],
[231.1193836917683, 611.28889248855, 1, 0, 0.2743555473359298, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743555473359298, 0.001161876544063306],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161832885245521],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764104974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161976077912225],
[231.1319808686128, 611.2790376422467, 1, 0, 0.2743696079346014, 0.004326532383108208, 0, -0.008964559091538401, 1, 0.2743696079346014, 0.001164221238026986],
[231.2583343832245, 611.5906936023089, 0, 1, 0.2743769366809945, 0, 0.001635080472055477, 0.003387880689022277, 0.7256230633190055, 1, 0.001161760399952088],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162700764104974],
[230.318705226609, 612.1818391876446, 0, 2, 0.2733751411243746, 0, 0.003267003154902418, 0.006769218450486894, 0.5279836855360226, 1, 0.002327640009096567],
[230.6471803242234, 611.5404325161948, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001161736498161941],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161760399952088],
[229.8585439268644, 609.5056835142794, 0, 1, 0.273848391928261, 0, 0.001640673790331558, 0.003399470023797506, 0.726151608071739, 1, 0.001166007213459364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.734562876212, 611.6296645649319, 0, 1, 0.2739130596477442, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7260869403522558, 1, 0.001162391687399775],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161898908061616],
[230.8565091876535, 611.6440352266001, 1, 0, 0.2740134836923529, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740134836923529, 0.001161760399952088],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001162115170978439],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161160436176608],
[230.7965534015382, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2740239383660659, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2740239383660659, 0.001162466598592548],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162700764104974],
[231.0851897988972, 611.102423041521, 0, 1, 0.2743868305299859, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7256131694700141, 1, 0.001161747788563446],
[231.0178157205739, 611.3932027902856, 0, 1, 0.2742340860272067, 0, 0.001635608631951067, 0.003388975034371979, 0.7257659139727932, 1, 0.001161799360498497],
[230.8565091876535, 611.7311239239317, 1, 0, 0.2739851620360548, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2739851620360547, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.2764353634806, 0, 1, 0.2742205346568773, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7257794653431227, 1, 0.001162700764104974],
[230.9853953125265, 611.5151491017272, 0, 1, 0.274166464157146, 0, 0.001635282464332944, 0.003388299216273905, 0.725833535842854, 1, 0.001161747788563446],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753486, 0, -0.008977587706156765, 1, 0.2739714323888121, 0.001162571829787085],
[230.8959780213271, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162466598592548],
[231.0474944500475, 611.2129132368339, 0, 1, 0.2743183608553777, 0, 0.001636091087644476, 0.003389974680783849, 0.7256816391446224, 1, 0.001161760399952088],
[231.0178157205739, 611.3932027902856, 0, 1, 0.2742340860272067, 0, 0.001635608631951067, 0.003388975034371979, 0.7257659139727932, 1, 0.001161898907895111],
[231.1813742170945, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2744129991888736, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7255870008111265, 1, 0.001170281750766112],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161996984485795],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161941733129112],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161522036323531],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161884759825161],
[228.7309589503917, 607.7121486305336, 0.5, 8.5, 0.2734566844742182, 0.00218597430926892, 0.01398688510531601, 0.02445144351124385, 0.151951416358863, 0.9435903242856679, 0.0101097617765056],
[228.7795933745027, 607.6782162060724, 0, 2, 0.2735100213712149, 0, 0.003291215558929582, 0.00681938646205596, 0.5277876890480526, 1, 0.001686703406948027],
[228.4772371516998, 608.0273634985908, 0, 0, 0.2731332702463128, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001174246562952605],
[228.4772371516998, 608.0273634985908, 0, 1, 0.2731332702463128, 0, 0.001644662822814417, 0.003407735284344327, 0.7268667297536873, 1, 0.001167196309022819],
[228.4772371516998, 608.0273634985908, 0, 0, 0.2731332702463128, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006892431222949963],
[228.5240282214153, 607.9805724288752, 0, 1, 0.2731892066627762, 0, 0.001644789398458921, 0.003407997548611466, 0.7268107933372238, 1, 0.001180562923772342],
[230.7999761528684, 611.611042357991, 0, 2, 0.2739754954307892, 0, 0.003270052143416585, 0.006775535943408334, 0.5271115812349682, 1, 0.001642827332845707],
[229.8843058201086, 609.4799216210353, 0, 1, 0.2738790840788222, 0, 0.001640743139397107, 0.003399613714804761, 0.7261209159211779, 1, 0.001174393720744327],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162383057920888],
[230.4053349965799, 609.0056835142794, 0, 1, 0.2744845253584186, 0, 0.001642020800576901, 0.003402261024042512, 0.7255154746415814, 1, 0.001163093299558438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161876815644678],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162053699329575],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835397868497],
[230.8565091876535, 611.5545093232059, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161760399876347],
[230.9305417807801, 611.3909508266853, 0, 1, 0.2741596217210585, 0, 0.001635614656461404, 0.00338898751713511, 0.7258403782789415, 1, 0.001161601097610961],
[231.1193836917683, 611.2916348190912, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161475117993626],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764045572],
[230.9579685466533, 611.2129132368339, 1, 0, 0.2742412181926162, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2742412181926162, 0.001164235970654192],
[230.9579685466533, 611.302439140228, 0, 1, 0.2742120684277898, 0, 0.001635851480335101, 0.003389478215325267, 0.7257879315722102, 1, 0.001161799360564125],
[230.932206653409, 611.4760695269092, 0, 1, 0.2741333545540545, 0, 0.001635386975607543, 0.00338851576324823, 0.7258666454459455, 1, 0.001161835335498159],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835335652263],
[230.895978021327, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162333563068168],
[230.895978021327, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741096271856712, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258903728143288, 1, 0.001162344585736653],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162466598592548],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001170565606021463],
[229.8585439268644, 609.552474583995, 0, 1, 0.2738331268686947, 0, 0.001640547847307939, 0.003399209070318499, 0.7261668731313053, 1, 0.001161943393549597],
[230.0819495973057, 609.3415260386233, 1, 0, 0.2740952049536148, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740952049536148, 0.001160425115285676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161349601069747],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162251034311096],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161760399952088],
[231.6468104576415, 611.2022175278918, 0, 1, 0.2748378449356383, 0, 0.001636119718355514, 0.0033900340035112, 0.7251621550643617, 1, 0.001164221238817554],
[230.4579685466533, 611.9530499642062, 0, 1, 0.2735695088058519, 0, 0.001634112290245945, 0.003385874619894771, 0.7264304911941482, 1, 0.001161972549689262],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161799360498497],
[230.5199590719795, 611.89105943888, 1, 0, 0.273643095836368, 0.004338019163398132, 0, -0.008988359657803102, 1, 0.273643095836368, 0.001162541860295951],
[230.9579685466533, 611.629664564932, 0, 1, 0.2741055760499954, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7258944239500046, 1, 0.001161760399952088],
[230.0769559551315, 609.5131143625163, 0, 1, 0.2740348702171822, 0, 0.001640653788140211, 0.003399428579331033, 0.7259651297828178, 1, 0.001162314333068353],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9853953125265, 611.5151491017272, 0, 1, 0.274166464157146, 0, 0.001635282464332944, 0.003388299216273905, 0.725833535842854, 1, 0.001162653506258116],
[231.3085954693385, 611.102423041521, 0, 1, 0.2745792616509523, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7254207383490476, 1, 0.001161876544002123],
[230.8565091876536, 611.7311239239316, 1, 0, 0.2739851620360548, 0.004331695058193668, 0, -0.008975256135215852, 1, 0.2739851620360548, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670437791],
[230.8565091876535, 611.5545093232059, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.2129132368339, 0, 1, 0.2742412181926162, 0, 0.001636091087644476, 0.003389974680783849, 0.7257587818073838, 1, 0.001161832885181648],
[230.6471803242234, 611.5404325161948, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001162466670437791],
[230.0694924722362, 609.3415260386233, 0, 1, 0.2740844322968102, 0, 0.001641115790189252, 0.003400385845867442, 0.7259155677031898, 1, 0.001162605006999164],
[229.8078677834812, 609.6499417970938, 0, 1, 0.2737574958035138, 0, 0.001640285566258324, 0.003398665624954021, 0.7262425041964862, 1, 0.001163070211607833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9455114215838, 611.4655070892757, 0, 1, 0.2741482558357666, 0, 0.00163541522523526, 0.003388574296372346, 0.7258517441642334, 1, 0.001162178507140397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162618075345663],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162026028538238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001161540976688244],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.00116160315019804],
[229.9524763814613, 609.5053331991137, 0, 1, 0.2739297600868759, 0, 0.001640674733314137, 0.003399471977653919, 0.726070239913124, 1, 0.001161517206687103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.0178157205739, 611.3932027902857, 0, 1, 0.2742340860272067, 0, 0.001635608631951066, 0.003388975034371978, 0.7257659139727933, 1, 0.00116160315019804],
[230.1556123238503, 609.3021972567246, 0, 1, 0.2741717447823194, 0, 0.001641221719702182, 0.003400605331426342, 0.7258282552176806, 1, 0.001160638901334016],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.00116160315019804],
[229.2112055887605, 609.7997926509319, 0, 1, 0.273192134631921, 0, 0.001639882486107093, 0.00339783044437189, 0.726807865368079, 1, 0.001163131916429807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.6471803242234, 611.5404325161948, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001162026028538238],
[229.8327820336202, 609.5010464963024, 0, 1, 0.2738276168806015, 0, 0.001640686272400136, 0.003399495886597419, 0.7261723831193985, 1, 0.001162477939807953],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 0, 1, 0.2741832196316368, 0, 0.001635614365898278, 0.003388986915089388, 0.7258167803683632, 1, 0.001162026028538238],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162480381060995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162015191004964],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001163233165084973],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162004353471687],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162612870272508],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161971840871849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162489870319461],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161928490738701],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.00116295812797227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161820115405709],
[229.8327820336202, 609.718609686386, 0, 1, 0.2737566565910361, 0, 0.001640100833586757, 0.003398282859541964, 0.7262433434089639, 1, 0.001162706251045817],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4998410339218, 0, 1, 0.2741478159738797, 0, 0.001635323401407927, 0.003388384037741822, 0.7258521840261203, 1, 0.001162615033162912],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162467038984832],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162581809196524],
[230.1860112350716, 609.2717983455034, 0, 1, 0.2742079573362731, 0, 0.001641303606560375, 0.003400775000693571, 0.7257920426637269, 1, 0.001161279331063223],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161343263938381],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162501961480191],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161957106536549],
[229.8327820336202, 609.9782567484062, 0, 1, 0.2736720183708772, 0, 0.001639402698271036, 0.003396836325750583, 0.7263279816291228, 1, 0.001161217159366055],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.6296645649319, 0, 1, 0.2741055760499955, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.7258944239500045, 1, 0.001161474293203981],
[229.50995174339, 609.6250275469548, 0, 1, 0.273507787671402, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.726492212328598, 1, 0.001162436944556849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2740239383660659, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2740239383660659, 0.001162652738562594],
[229.8876355653666, 610.446192964556, 0, 1, 0.2735670370042478, 0, 0.001638146017659025, 0.00339423248817166, 0.7264329629957522, 1, 0.001163254152969475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9853953125265, 611.8636326730068, 0, 1, 0.2740531075471456, 0, 0.001634351098187301, 0.003386369429065777, 0.7259468924528544, 1, 0.001162143905035225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162737885609046],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162106961627413],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162511589917631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162276340730544],
[230.4795528321687, 608.9782567484062, 0, 1, 0.2745576373246502, 0, 0.001642094752839658, 0.003402414252857354, 0.7254423626753499, 1, 0.0011623897029444],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162374369430531],
[229.6110412358079, 610.3315688891565, 0, 1, 0.273365154318873, 0, 0.001638453671698591, 0.003394869946203457, 0.726634845681127, 1, 0.001163562394896258],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162925565018375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162063581657796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5836144699347, 609.920986180356, 1, 0, 0.2734751117410153, 0.004355711544610061, 0, -0.00902501820622021, 1, 0.2734751117410152, 0.001162125197004992],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162001384478873],
[229.7450296150498, 609.7595710352409, 1, 0, 0.2736673860239556, 0.004352651292067359, 0, -0.009018677374273316, 1, 0.2736673860239556, 0.001162461272404068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162888685900664],
[230.7599992558534, 612.1826108691109, 0, 1, 0.2737552906735178, 0, 0.001633499518355002, 0.003384604958803722, 0.7262447093264822, 1, 0.00116254108853302],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001161998379236314],
[230.4471762942127, 612.0574243560778, 0, 1, 0.273526312041906, 0, 0.0016338336244382, 0.003385297225372064, 0.726473687958094, 1, 0.001163094616168649],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162466461680382],
[230.6210485643973, 611.8835520858933, 1, 0, 0.2737326874967704, 0.004336117653722165, 0, -0.008984419736789246, 1, 0.2737326874967704, 0.001161662821504522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[228.607755843529, 610.020825857414, 0, 1, 0.2725971435171656, 0, 0.001639288295763429, 0.003396599284178061, 0.7274028564828343, 1, 0.001162049365681646],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0711573448652, 611.9954338307515, 0, 1, 0.2732220465173197, 0, 0.001633999119471457, 0.003385640130468713, 0.7267779534826804, 1, 0.001162330247425223],
[230.9596334192822, 611.5449672310083, 0, 1, 0.2741345664356196, 0, 0.001635202730108078, 0.003388134007254965, 0.7258654335643804, 1, 0.001161609819747982],
[230.109006496597, 612.3955941536935, 0, 1, 0.2731249257499442, 0, 0.001632931408303093, 0.003383427836877924, 0.7268750742500558, 1, 0.001162289974339965],
[230.9596334192822, 611.5449672310083, 0, 1, 0.2741345664356196, 0, 0.001635202730108078, 0.003388134007254965, 0.7258654335643804, 1, 0.001161609890076666],
[230.636248020008, 611.8683526302826, 0, 1, 0.273750728295122, 0, 0.001634338490790099, 0.003386343306585415, 0.7262492717048781, 1, 0.001162515351365634],
[230.6830390897235, 611.821561560567, 0, 1, 0.2738062663535248, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7261937336464752, 1, 0.001162515351365634],
[230.3324121670383, 612.3336036283673, 0, 1, 0.2733377255633407, 0, 0.001633096720602177, 0.003383770363350044, 0.7266622744366593, 1, 0.001161787378939995],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162876428868145],
[230.236227748841, 612.2683729014497, 0, 1, 0.2732759293790588, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7267240706209412, 1, 0.001162602000843601],
[230.236227748841, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2733484127641591, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.726651587235841, 1, 0.001162986224098108],
[230.2982182741672, 612.2063823761233, 1, 0, 0.2733495082358133, 0.004342195990459259, 0, -0.008997014028021338, 1, 0.2733495082358133, 0.001162602026516983],
[230.6488451968524, 611.6323497829968, 0, 1, 0.2738382936382314, 0, 0.001634969112334875, 0.00338764995209317, 0.7261617063617687, 1, 0.001162986224098108],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001162220020390414],
[230.4128423495667, 612.0917583007239, 0, 1, 0.273485559807889, 0, 0.001633741978124618, 0.003385107334549373, 0.726514440192111, 1, 0.001164005230611993],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001162220031720326],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001163218065110291],
[230.2362277488409, 612.2683729014495, 0, 1, 0.2732759293790588, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7267240706209412, 1, 0.001164992992082162],
[230.2830188185565, 612.2215818317341, 0, 1, 0.2733314674374617, 0, 0.001633395537948946, 0.003384389511787057, 0.7266685325625384, 1, 0.001162220031720326],
[230.6210485643973, 611.8835520858933, 1, 0, 0.2737326874967704, 0.004336117653722165, 0, -0.008984419736789246, 1, 0.2737326874967704, 0.001162284734177439],
[230.2362277488409, 612.2683729014495, 0, 1, 0.2732759293790588, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7267240706209412, 1, 0.001163218065110291],
[230.3257536522351, 612.2683729014495, 0, 1, 0.2733531440508567, 0, 0.001633270709805158, 0.003384130868334938, 0.7266468559491432, 1, 0.001164005229776702],
[230.4596334192822, 612.0574243560777, 0, 1, 0.2735370533954573, 0, 0.0016338336244382, 0.003385297225372065, 0.7264629466045427, 1, 0.001162207698708159],
[230.6830390897235, 611.821561560567, 0, 1, 0.2738062663535248, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7261937336464752, 1, 0.001162398991629371],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 1, 0, 0.2735410978662918, 0.004339154693441127, 0, -0.008990712471851226, 1, 0.2735410978662918, 0.001162207777136574],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001163218065111402],
[230.4720905443517, 612.0325101059389, 0, 1, 0.2735558836906777, 0, 0.001633900133551576, 0.003385435032008926, 0.7264441163093223, 1, 0.001162207698708159],
[230.4596334192822, 611.821561560567, 0, 1, 0.2736136515843687, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7263863484156312, 1, 0.001164005229776702],
[230.4720905443517, 612.0325101059389, 0, 1, 0.2735558836906777, 0, 0.001633900133551576, 0.003385435032008926, 0.7264441163093223, 1, 0.001162284733862799],
[230.4596334192822, 611.9981761612928, 0, 1, 0.2735562906515385, 0, 0.001633991797610274, 0.003385624959599431, 0.7264437093484615, 1, 0.001162401022070908],
[230.4596334192822, 612.0449672310083, 0, 1, 0.2735410978662918, 0, 0.001633866878318049, 0.003385366127288087, 0.7264589021337082, 1, 0.001162207698708159],
[230.4596334192822, 612.0917583007239, 0, 1, 0.273525906768507, 0, 0.001633741978124618, 0.003385107334549373, 0.726474093231493, 1, 0.001163218062509248],
[230.6830390897235, 611.821561560567, 0, 1, 0.2738062663535248, 0, 0.001634463482210908, 0.00338660228834692, 0.7261937336464752, 1, 0.001162207777136574],
[230.2104658555967, 612.3409258644094, 0, 1, 0.2732301769576799, 0, 0.001633077192396299, 0.00338372990097971, 0.7267698230423201, 1, 0.00116315474800423],
[229.9726456533958, 612.5319549968947, 1, 0, 0.2729630740008904, 0.004348343243861941, 0, -0.00900975111432957, 1, 0.2729630740008904, 0.001159487380311525],
[230.0490507104817, 612.5023410095245, 0, 1, 0.2730385979671265, 0, 0.001632646821156313, 0.003382838173362643, 0.7269614020328735, 1, 0.001171156866275646],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.2982182741672, 612.2063823761234, 1, 0, 0.2733495082358132, 0.004342195990459259, 0, -0.008997014028021338, 1, 0.2733495082358133, 0.001162332513280796],
[230.295475943626, 612.2091247066645, 1, 0, 0.2733462532618475, 0.004342247696801434, 0, -0.008997121163371034, 1, 0.2733462532618476, 0.001162617835107956],
[230.7088009829677, 611.7490085976073, 0, 1, 0.2738520533127091, 0, 0.001634657328325601, 0.003387003936779419, 0.7261479466872909, 1, 0.001162289900058685],
[231.059427905653, 611.1749760044808, 1, 0, 0.2743409991718967, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.2743409991718968, 0.001161793261304025],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.3859706927376, 610.0718388878374, 0, 1, 0.2732549129626271, 0, 0.001639151221638099, 0.00339631526709749, 0.7267450870373729, 1, 0.001162495109818889],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161906815672118],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162665698942772],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162625887392474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.2795933745027, 609.1782162060723, 0, 1, 0.2743194366010594, 0, 0.001641555744110392, 0.003401297428764408, 0.7256805633989406, 1, 0.001161809223244741],
[231.1813742170945, 611.229644293765, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739682, 0.7255717587529223, 1, 0.001161089639726645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.00116292783051226],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161906815672118],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162584929556354],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162625887392474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.50995174339, 609.947857837185, 0, 1, 0.273402604781367, 0, 0.001639484403709362, 0.003397005619116521, 0.726597395218633, 1, 0.001161796232770956],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753486, 0, -0.008977587706156765, 1, 0.2739714323888121, 0.001161787602805778],
[229.6298633156207, 609.8279462649543, 0, 1, 0.2735454488538888, 0, 0.001639806778493431, 0.003397673578476468, 0.7264545511461111, 1, 0.001161233589287161],
[229.81704035398, 609.5939781568795, 0, 1, 0.2737836831850056, 0, 0.001640436152311612, 0.003398977638699332, 0.7262163168149944, 1, 0.001161239001838933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.8565091876535, 611.554509323206, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161057322263676],
[229.7088009829677, 609.7490085976073, 0, 1, 0.2736394829631033, 0, 0.001640019066697543, 0.003398113438850015, 0.7263605170368967, 1, 0.001162651670243715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.8959780213271, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162253890478538],
[230.9455114215838, 611.4655070892758, 0, 1, 0.2741482558357665, 0, 0.001635415225235259, 0.003388574296372346, 0.7258517441642335, 1, 0.00116255062838993],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.8876355653666, 610.0504474699532, 0, 1, 0.2736959309364946, 0, 0.001639208698472847, 0.00339643435888645, 0.7263040690635054, 1, 0.001162801633955223],
[230.9853953125265, 611.6657599257054, 0, 1, 0.2741174611541628, 0, 0.001634879807758837, 0.003387464913342007, 0.7258825388458372, 1, 0.001162242332723263],
[231.059427905653, 611.3515906052065, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162160694849866],
[230.4795528321687, 608.9782567484062, 0, 1, 0.2745576373246502, 0, 0.001642094752839658, 0.003402414252857354, 0.7254423626753499, 1, 0.001162588082371155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162028616234562],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162126123916276],
[230.0357007516196, 609.068879627504, 0, 1, 0.2741442558300481, 0, 0.001641850426854156, 0.003401908010319292, 0.7258557441699519, 1, 0.001163096961451951],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.059427905653, 611.1749760044808, 1, 0, 0.2743409991718967, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.2743409991718968, 0.001161930056691734],
[229.7365976154229, 609.4978062947108, 1, 0, 0.27374544769023, 0.00435281104699736, 0, -0.009019008385897255, 1, 0.27374544769023, 0.001163044329363642],
[229.5336788974234, 609.9668655168302, 1, 0, 0.2734169506198193, 0.004356659139536953, 0, -0.009026981619403046, 1, 0.2734169506198193, 0.001162582502400639],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161840185716723],
[230.1315281882497, 609.3262813923252, 0, 1, 0.274143054673864, 0, 0.001641156849028366, 0.003400470919630188, 0.725856945326136, 1, 0.001163047025250261],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162011349825676],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.00116197266068186],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162925457590145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161877216845068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001161222436355958],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161730130309483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 0, 1, 0.2740992726131687, 0, 0.001641149341164735, 0.003400455363364519, 0.7259007273868312, 1, 0.001161843372066113],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162320695707749],
[229.1315281882497, 610.3262813923253, 0, 1, 0.2729518095766272, 0, 0.001638467866267728, 0.003394899357298195, 0.7270481904233728, 1, 0.001162532291860092],
[228.7933131999467, 610.1796958362389, 0, 1, 0.272706405016277, 0, 0.001638861481009328, 0.00339571492558659, 0.7272935949837229, 1, 0.001165167627273163],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162344504262365],
[229.7313226746205, 609.5557147855866, 0, 1, 0.2737219954806137, 0, 0.001640539126684677, 0.003399191001219362, 0.7262780045193863, 1, 0.001161804001456468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 1, 0, 0.2741832196316368, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741832196316368, 0.001164248274306412],
[231.1471803242234, 611.0404325161949, 0, 1, 0.2744604370808079, 0, 0.001636552913335234, 0.003390931581906549, 0.7255395629191921, 1, 0.001162412096699191],
[229.50995174339, 609.947857837185, 0, 1, 0.273402604781367, 0, 0.001639484403709362, 0.003397005619116521, 0.726597395218633, 1, 0.001162666119481161],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.6144651093214, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001161796741319334],
[229.7176157341912, 609.6934027766684, 1, 0, 0.273665237492018, 0.004353170725736206, 0, -0.009019753638913493, 1, 0.2736652374920181, 0.001161790029507247],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.8565091876535, 611.554509323206, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161028613572068],
[229.9205344521906, 609.4904840586689, 1, 0, 0.2739069768944379, 0.004349328790412753, 0, -0.009011793163136763, 1, 0.273906976894438, 0.001162435393527076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.00116256818123927],
[229.50995174339, 609.947857837185, 0, 1, 0.273402604781367, 0, 0.001639484403709362, 0.003397005619116521, 0.726597395218633, 1, 0.001162989229027327],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.6144651093214, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162354989619493],
[229.9205344521906, 609.4904840586689, 1, 0, 0.2739069768944379, 0.004349328790412753, 0, -0.009011793163136763, 1, 0.273906976894438, 0.00116303290058849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161774919062385],
[230.0819495973057, 609.2670783882276, 0, 1, 0.2741195163465077, 0, 0.00164131632164572, 0.003400801346303365, 0.7258804836534923, 1, 0.001162026853790898],
[230.0819495973057, 609.2050878629013, 0, 1, 0.2741397630702887, 0, 0.001641483336109375, 0.003401147399654179, 0.7258602369297114, 1, 0.001162960417519017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 0, 1, 0.2741832196316368, 0, 0.001635614365898278, 0.003388986915089388, 0.7258167803683632, 1, 0.001162182617860463],
[229.8327820336202, 609.6250275469548, 0, 1, 0.2737871747818432, 0, 0.001640352601703147, 0.003398804522147694, 0.7262128252181568, 1, 0.001162709472490536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162022552337631],
[230.8839359535267, 611.616608460727, 0, 2, 0.2740460376960921, 0, 0.003270022383848368, 0.006775474281693085, 0.5270091553847437, 1, 0.002329724412450789],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161882962783882],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.00116176001812842],
[229.0318938481809, 610.4727068021097, 0, 1, 0.2728179138872736, 0, 0.00163807487027288, 0.003394085071050783, 0.7271820861127265, 1, 0.001163422639280295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.5044670823077, 609.9533424982673, 0, 1, 0.2733960712057427, 0, 0.001639469661571435, 0.003396975073461276, 0.7266039287942573, 1, 0.001163032297549678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.001162175318137958],
[230.564562920198, 608.8464555906614, 1, 0, 0.2746742154150258, 0.004337179952264025, 0, -0.008986620815437942, 1, 0.2746742154150258, 0.001162858580599197],
[230.7287203958542, 608.6822981150052, 0, 1, 0.2748697781036684, 0, 0.001642893185980347, 0.00340406860337101, 0.7251302218963316, 1, 0.001170606390506043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001161968508993569],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700763906664],
[231.059427905653, 611.3515906052065, 1, 0, 0.274283482561873, 0.004327890919942568, 0, -0.008967373974833208, 1, 0.274283482561873, 0.001162134370674549],
[230.9853953125265, 611.8636326730068, 0, 1, 0.2740531075471456, 0, 0.001634351098187301, 0.003386369429065777, 0.7259468924528544, 1, 0.001162104417156028],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161760399876347],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670525499],
[230.8959780213271, 611.5150404895323, 0, 1, 0.2740894562721708, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001161747788563446],
[231.134583147379, 611.2764353634805, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161876544002123],
[230.7813539459275, 611.6296645649319, 0, 1, 0.273953389586336, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162466670437791],
[231.1193836917683, 611.28889248855, 1, 0, 0.2743555473359298, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743555473359298, 0.001161835335498159],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162571829787085],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 1, 0, 0.2741832196316368, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741832196316368, 0.001164235969794875],
[231.3702161280828, 611.0875934524922, 1, 0, 0.2746371551155452, 0.004322077477104555, 0, -0.008955328542780019, 1, 0.2746371551155452, 0.001161835397872404],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162700764104974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164221238026986],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.001162571829863346],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.2739714323888121, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162466598592548],
[230.7965534015382, 611.6144651093214, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162466598592548],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164235969794875],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.001162466670437791],
[229.5977041619605, 609.8133143488989, 1, 0, 0.2735223854569765, 0.004355444248234252, 0, -0.009024464369118412, 1, 0.2735223854569765, 0.001162386966507681],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.2739714323888121, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2739714323888121, 0.001162214134201935],
[231.2813539459275, 611.1296645649319, 0, 1, 0.2745469240831708, 0, 0.001636313957549267, 0.003390436466402057, 0.7254530759168292, 1, 0.001162672742858987],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162466670437791],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161760399952088],
[230.9579685466533, 611.39105943888, 1, 0, 0.2741832196316368, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741832196316368, 0.001163056348387928],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.607341623968, 611.8036768868914, 0, 1, 0.2737468249544214, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455786, 1, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335652263],
[230.9455114215838, 611.4655070892757, 0, 1, 0.2741482558357666, 0, 0.00163541522523526, 0.003388574296372346, 0.7258517441642334, 1, 0.001161972624832467],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164235970654192],
[231.3702161280828, 611.0875934524922, 1, 0, 0.2746371551155452, 0.004322077477104555, 0, -0.008955328542780019, 1, 0.2746371551155452, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670437791],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 0, 1, 0.2740992726131687, 0, 0.001641149341164735, 0.003400455363364519, 0.7259007273868312, 1, 0.001160834921819636],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161641488025312],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162672742858987],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835335652263],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835335652263],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161835397868497],
[230.432206653409, 612.025602927166, 0, 1, 0.2735237349964525, 0, 0.001633918573368907, 0.003385473239242215, 0.7264762650035475, 1, 0.001164235970654192],
[230.7965534015382, 611.6144651093213, 1, 0, 0.273971432388812, 0.004332820335753486, 0, -0.008977587706156765, 1, 0.2739714323888121, 0.001161843810649635],
[230.6471803242234, 611.5404325161949, 1, 0, 0.2738667451380902, 0.004335626382227124, 0, -0.008983401824069009, 1, 0.2738667451380903, 0.001162466670525499],
[230.7965534015382, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2740239383660659, 0.004332820335753485, 0, -0.008977587706156764, 1, 0.2740239383660659, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162571829917285],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164235970654192],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[231.3959780213271, 611.0150404895325, 1, 0, 0.2746829907690057, 0.004321596289404101, 0, -0.008954331523644861, 1, 0.2746829907690056, 0.001164235970654192],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001161374985407473],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161698806389269],
[229.5770200452675, 609.8339984655919, 0, 1, 0.2734977442308824, 0, 0.001639790504491563, 0.003397639858804803, 0.7265022557691176, 1, 0.001162386966642819],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.793811070997, 611.6172074398625, 1, 0, 0.2739681770532562, 0.004332871819047084, 0, -0.008977694379350634, 1, 0.2739681770532562, 0.00116221407820974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764104974],
[231.4579685466533, 610.9530499642062, 0, 1, 0.2747565777995217, 0, 0.001636786983972969, 0.003391416575401979, 0.7252434222004783, 1, 0.001161760399952088],
[230.5457209652237, 611.8185064759202, 1, 0, 0.2736888788185535, 0.004337534419694753, 0, -0.008987355270643036, 1, 0.2736888788185535, 0.00116257175640872],
[230.7088009829677, 611.7490085976073, 0, 1, 0.2738520533127091, 0, 0.001634657328325601, 0.003387003936779419, 0.7261479466872909, 1, 0.001161747788603636],
[231.0199590719795, 611.4405928391368, 0, 1, 0.2742205062871041, 0, 0.001635481863179288, 0.003388712369945843, 0.7257794937128959, 1, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700764104974],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161843810583158],
[231.0047596163688, 611.4062588944907, 0, 1, 0.2742185875307268, 0, 0.00163557370480332, 0.003388902665451063, 0.7257814124692732, 1, 0.001164235970517453],
[230.9455114215838, 611.4655070892757, 0, 1, 0.2741482558357666, 0, 0.00163541522523526, 0.003388574296372346, 0.7258517441642334, 1, 0.001162700763906664],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835335498159],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162541860336201],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161799360498497],
[231.107341623968, 611.3036768868915, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426333, 0.7256596405487439, 1, 0.001162700764045572],
[230.895978021327, 611.5150404895325, 0, 1, 0.2740894562721707, 0, 0.001635282754778159, 0.003388299818075316, 0.7259105437278293, 1, 0.001162466670525499],
[230.8307472944093, 611.7416863615653, 0, 1, 0.2739595292630453, 0, 0.001634676894340265, 0.003387044477489417, 0.7260404707369547, 1, 0.001161876544002123],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161832862863067],
[231.1813742170945, 611.2296442937649, 0, 1, 0.2744282412470777, 0, 0.001636046303276788, 0.003389881887739683, 0.7255717587529223, 1, 0.001161835397868497],
[231.3085954693385, 611.102423041521, 0, 1, 0.2745792616509523, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7254207383490476, 1, 0.001161835397940755],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161747788563446],
[231.107341623968, 611.3036768868914, 0, 1, 0.2743403594512562, 0, 0.001635848168119277, 0.003389471352426334, 0.7256596405487438, 1, 0.00116197262500507],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162700837555398],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161843810649635],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161747788603636],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466670525499],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161876544002123],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161832862863067],
[230.4801203717241, 612.1543038095767, 0, 1, 0.2735232667424635, 0, 0.00163357505415999, 0.003384761468712208, 0.7264767332575366, 1, 0.001163619048912065],
[231.3085954693385, 611.102423041521, 0, 1, 0.2745792616509523, 0, 0.001636386900616258, 0.003390587604167006, 0.7254207383490476, 1, 0.001161760399876347],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835397940755],
[231.1568750242247, 611.2541434866347, 0, 1, 0.274399159014852, 0, 0.00163598073020157, 0.003389746020570423, 0.725600840985148, 1, 0.001161799360498497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161747788603636],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[229.6351382564231, 609.625269430458, 0, 1, 0.2736160745260575, 0, 0.001640351950853759, 0.003398803173590168, 0.7263839254739425, 1, 0.001161798422369018],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001161898384716699],
[230.9579685466533, 611.302439140228, 0, 1, 0.2742120684277898, 0, 0.001635851480335101, 0.003389478215325267, 0.7257879315722102, 1, 0.00116147861101686],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[231.3959780213271, 611.0150404895325, 1, 0, 0.2746829907690057, 0.004321596289404101, 0, -0.008954331523644861, 1, 0.2746829907690056, 0.001162344585736653],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162334034566076],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161760399952088],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162571829787085],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001163056348388326],
[230.8565091876535, 611.5545093232059, 1, 0, 0.2740426040435006, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2740426040435007, 0.001161760399792864],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161799360564125],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001164221238026986],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161835397868497],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162466670525499],
[231.0320011397798, 611.2894914676856, 0, 1, 0.2742800737810975, 0, 0.001635886129171031, 0.003389550007585127, 0.7257199262189025, 1, 0.001164235969794981],
[231.1193836917683, 611.2916348190911, 1, 0, 0.2743546542165616, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743546542165616, 0.001161876544002123],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001162466598592548],
[231.1193836917683, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2743020949414721, 0.004326768201033484, 0, -0.00896504770540715, 1, 0.2743020949414721, 0.001161835335652263],
[231.395978021327, 611.0150404895325, 1, 0, 0.2746829907690056, 0.004321596289404102, 0, -0.008954331523644863, 1, 0.2746829907690056, 0.001162333821499794],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001162333921353564],
[230.607341623968, 611.8036768868915, 0, 1, 0.2737468249544213, 0, 0.001634511261992427, 0.003386701287877463, 0.7262531750455787, 1, 0.001162466670525499],
[230.8565091876535, 611.7311239239316, 1, 0, 0.2739851620360548, 0.004331695058193669, 0, -0.008975256135215853, 1, 0.2739851620360547, 0.001161760399876347],
[230.734562876212, 611.6764556346475, 0, 1, 0.273897845358296, 0, 0.001634851220425749, 0.00338740568049361, 0.726102154641704, 1, 0.001162104417156028],
[230.7813539459275, 611.6296645649319, 0, 1, 0.2739533895863359, 0, 0.001634976290287238, 0.003387664824783911, 0.726046610413664, 1, 0.001162134370680186],
[230.9579685466533, 611.4655070892757, 1, 0, 0.2741589891857033, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741589891857033, 0.001161760399952088],
[231.1568750242247, 611.2541434866347, 0, 1, 0.274399159014852, 0, 0.00163598073020157, 0.003389746020570423, 0.725600840985148, 1, 0.001161760399952088],
[231.134583147379, 611.2764353634806, 0, 1, 0.2743726970190377, 0, 0.001635921069663637, 0.003389622404156543, 0.7256273029809623, 1, 0.001161799360498497],
[231.8959780213271, 610.5150404895325, 0, 1, 0.2752765252658405, 0, 0.001637961284619892, 0.003393849721998008, 0.7247234747341595, 1, 0.001162541857182835],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 0, 1, 0.2741630433026868, 0, 0.001635448543528467, 0.003388643331752609, 0.7258369566973133, 1, 0.001161835397940755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001162395913018324],
[230.0819495973057, 609.3290689135538, 1, 0, 0.2740992726131687, 0.00434627749699714, 0, -0.009005470894468055, 1, 0.2740992726131688, 0.001161934617696752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[230.9579685466533, 611.4530499642062, 1, 0, 0.2741630433026868, 0.004329792153493077, 0, -0.008971313323716135, 1, 0.2741630433026867, 0.001161223282261921],
[231.0178157205739, 611.4827286936797, 0, 1, 0.2742049453287753, 0, 0.001635369165922831, 0.003388478861647394, 0.7257950546712246, 1, 0.001161799360564125]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.5542640934585379, 2.445735906541465, 0, 2, 0.1847546978195125, 0, 0.8177497801993743, 1.694374519259546, 0.6646249027273544, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.998796198587916, 2.001203801412087, 1, 2, 0.3329320661959717, 1.0012052522965, 0.9993984613604883, -0.003743664135087645, 0.7412756024460205, 0.7031683587586468, 0.4826263443555187],
[0.7013979244636048, 2.118825255137768, 0, 3, 0.2487029854717898, 0, 1.415878913433537, 2.933695870506716, 0.4240674992532976, 1, 0.4826263443555187],
[0.8209194674358452, 1.999881684399788, 1, 1, 0.2910235153944236, 1.218146285558942, 0.5000295806499792, -1.487935155856255, 0.9153053134874716, 0.4973523442763189, 0.4826263443555187],
[0.9991554706531333, 2.00084452934687, 1, 1, 0.3330518235510441, 1.000845243179537, 0.4997889567793792, -1.038186771733835, 0.8890764828293243, 0.5551801299314123, 0.4826263443555187],
[0.9747203198909692, 2.025279680109032, 1, 1, 0.3249067732969896, 1.025935316616626, 0.493758965648717, -1.102667430387699, 0.8944355886657386, 0.5442491352597179, 0.4826263443555187],
[0.4984791892887451, 2.322321950388641, 0, 2, 0.1767154664953645, 0, 0.8612070344791339, 1.784417789354532, 0.6777974231079452, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999420719943802, 1, 0, 0.33339771021477, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.33339771021477, 0.4826263443555187],
[0.9949293742743121, 2.005070625725691, 0, 2, 0.3316431247581036, 0, 0.9974710986931665, 2.066756426289063, 0.4467009126831118, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301253581699, 2.123772592657709, 1, 2, 0.2919348309244062, 1.142034714247591, 0.941720411551776, -0.4150504941111484, 0.7940830074632517, 0.6450070782445521, 0.4826263443555187],
[0.8748532584645849, 2.125146741535417, 1, 0, 0.2916177528215281, 1.143048837418808, 0, -2.36839296235516, 1, 0.291617752821528, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.254136231549002, 1.29944101901843, 0, 1, 0.4911291527484903, 0, 0.7695616694903004, 1.594528932145104, 0.5088708472515098, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.9991554707053286, 2.000844529294674, 0, 1, 0.3330518235684426, 0, 0.4997889567924171, 1.035560869475156, 0.6669481764315575, 1, 0.4826263443555187],
[0.6467707985485557, 2.353229201451446, 0, 0, 0.2155902661828518, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -4.143992600882001, 1, 0.1111111111111109, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.876018949347591, 0, 0, 0.3477028550965719, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994618991505301, 2.000538100849473, 1, 1, 0.3331539663835097, 1.000538390557886, 0.4998655109719619, -1.037392354233179, 0.8890084346829353, 0.5553163674499546, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9990367898069775, 2.000963210193025, 0, 2, 0.3330122632689922, 0, 0.999518626735305, 2.070998896817423, 0.4448726409495521, 1, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.4984012504779732, 1.626635795893071, 0, 1, 0.2345376760979768, 0, 0.6147657653451372, 1.273792391432905, 0.7654623239020232, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537267286386844, 2.446273271361318, 0, 1, 0.1845755762128946, 0, 0.408785073894673, 0.8470011607852642, 0.8154244237871053, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7017326457336036, 1.422248404918808, 0, 1, 0.3303855491168606, 0, 0.7031120559119818, 1.456845578645093, 0.6696144508831394, 1, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.998923495158026, 2.000538163493339, 0, 3, 0.3330342604236414, 0, 1.499596485958259, 3.10715837105984, 0.2966952390918467, 1, 0.4826263443555187],
[1.050710336731983, 1.855933837503285, 0, 2, 0.3614857112699122, 0, 1.077624621948011, 2.232834229940413, 0.4077004969124899, 1, 0.4826263443555187],
[3.11511611660165, 7.552858995997052, 0, 0, 0.2920063164491966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.106696957701018],
[0.8736826495779314, 2.126317350422071, 2, 0, 0.2912275498593103, 2.289160716383898, 0, -4.743132535462312, 1, 0.08481348579705683, 0.4826263443555187],
[0.5537264677535433, 2.446160836394073, 0, 2, 0.1845824231423514, 0, 0.8176077264601429, 1.694080184437395, 0.6649058246483992, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537267825011086, 2.446273217498894, 0, 1, 0.1845755941670361, 0, 0.4087850828953664, 0.8470011794346677, 0.8154244058329639, 1, 0.4826263443555187],
[0.9677323005179963, 1.954041439995094, 1, 42, 0.3312139770097507, 1.033343621438214, 21.49391468386947, 42.39422754626779, 6.848071653033365e-07, 0.999999969285101, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7010096161300772, 1.818716929125178, 1, 0, 0.2782086085690949, 1.426513955001786, 0, -2.955731637291163, 1, 0.2782086085690949, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446272527840551, 0, 1, 0.1844293440177765, 0, 0.4087851981409246, 0.8470014182230378, 0.8155706559822234, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.254198275247503, 1.299415524046316, 1, 0, 0.4911464198675389, 0.7973220978976869, 0, -1.652048437103866, 1, 0.4911464198675389, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674332, 2.44642274943257, 1, 0, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0, -3.742921693977027, 1, 0.1845257501891442, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999991, 2.071996300441, 0.4444444444444445, 1, 0.4826263443555187],
[0.001138360290928792, 2.998861639709076, 0, 2, 0.0003794534303095966, 0, 0.66691973164658, 1.38185521666282, 0.9992412371242865, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.6480457143396967, 2.351954285660305, 0, 1, 0.2160152381132321, 0, 0.4251783319501266, 0.8809679308283388, 0.7839847618867679, 1, 0.4826263443555187],
[0.6470832504702914, 2.35291674952971, 0, 2, 0.2156944168234304, 0, 0.8500088243240016, 1.761215139341537, 0.615135247801939, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999552005303037, 1, 0, 0.3333831179563007, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333831179563007, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537264677535433, 2.446273532246459, 0, 1, 0.1845754892511809, 0, 0.4087850302994044, 0.847001070456029, 0.8154245107488191, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999701345163808, 0, 3, 0.3333665205078582, 0, 1.500224024580156, 3.108458628762794, 0.2962520489330037, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.002259460739132566, 2.997740539260872, 0, 1, 0.0007531535797108542, 0, 0.3335845737491883, 0.6911860026925069, 0.9992468464202892, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674332, 2.44642274943257, 1, 0, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0, -3.742921693977027, 1, 0.1845257501891442, 0.4826263443555187],
[0.9999700081885631, 2.00002999181144, 1, 1, 0.3333233360628541, 1.000029992710973, 0.499992502159577, -1.036075830504294, 0.8888955536359298, 0.5555422257616377, 0.4826263443555187],
[0.7019742510323341, 2.119405713210921, 0, 1, 0.2488052867493217, 0, 0.4718303785663528, 0.9776307988251606, 0.7511947132506783, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.4986454760927311, 2.322518286392621, 1, 1, 0.1767516947167366, 2.00543281338029, 0.4305671158151433, -3.263115899046423, 0.9687588384147614, 0.3222622278482349, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5543535141673197, 2.445646485832683, 1, 0, 0.1847845047224397, 1.803903059047212, 0, -3.737680464700031, 1, 0.1847845047224397, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999996, -3.107994450661501, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.9973091437218117, 2.002690856278191, 1, 1, 0.3324363812406035, 1.002698116521971, 0.4993281898027956, -1.042980625915389, 0.8894860524276522, 0.5543588149088591, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.9995746305347751, 2.000425369465228, 0, 1, 0.3331915435115914, 0, 0.4998936802462815, 1.035777856084133, 0.6668084564884086, 1, 0.4826263443555187],
[0.9991553005846255, 2.000266615044178, 0, 2, 0.3331159565709718, 0, 0.9998667102464379, 2.071720124564735, 0.44473432738025, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772368060436, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2167849982475741, 1.806432659279249, 0, -3.742921787022406, 1, 0.216784998247574, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674332, 2.44642274943257, 1, 1, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0.4087600968524114, -2.895972285530925, 0.9659502475171335, 0.3350017478954219, 0.4826263443555187],
[0.002336579072301426, 2.997663420927704, 0, 1, 0.0007788596907671406, 0, 0.3335931555953418, 0.6912037842459877, 0.9992211403092328, 1, 0.4826263443555187],
[0.9998207595341156, 2.000179240465887, 1, 2, 0.3332735865113715, 1.000179272598789, 0.9999103877981227, -0.000557128312224544, 0.7408203995999139, 0.7036240341348425, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.003905672939360517, 2.996094327060644, 0, 1, 0.001301890979786837, 0, 0.3337678627031287, 0.6915657767269832, 0.9986981090202132, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999991, 2.071996300441, 0.4444444444444445, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.001563056690645175, 2.99843694330936, 0, 2, 0.0005210188968817241, 0, 0.6670141936660539, 1.382050941617702, 0.9989582336669275, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.6467707985485557, 2.353229201451446, 0, 0, 0.2155902661828518, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.051916417233258, 1.854726716864995, 1, 1, 0.3619007799385737, 0.9506458722549377, 0.5391629887611036, -0.8525910122940202, 0.869027825479852, 0.5928293853569995, 0.4826263443555187],
[0.5537264330373285, 2.446273566962674, 0, 1, 0.1845754776791093, 0, 0.4087850244981445, 0.8470010584358398, 0.8154245223208907, 1, 0.4826263443555187],
[0.01182587047636735, 2.987549018215668, 0, 6, 0.003942778383906641, 0, 2.008335248532102, 4.161263205003776, 0.9765752899872185, 1, 0.4826263443555187],
[0.9987667950852176, 2.001233204914786, 0, 2, 0.3329222650284055, 0, 0.9993837775069108, 2.070719489715073, 0.4449927044948329, 1, 0.4826263443555187],
[0.5551371586338348, 2.444862841366168, 1, 2, 0.1850457195446114, 1.801356627722329, 0.818041800202754, -2.037424684789341, 0.9099468858635353, 0.4587477240829275, 0.4826263443555187],
[0.9963468752858889, 2.00299011677733, 0.5, 3.5, 0.3321890397519187, 0.5018332594825787, 1.747387553579772, 2.580783889367788, 0.3967587230217604, 0.8011094402508331, 0.4826263443555187],
[0.5503541128624102, 2.529012706010134, 0, 3, 0.1787231418775606, 0, 1.186233660618065, 2.523033772184829, 0.5539476909883273, 1, 0.4701616259344965],
[1.022616213618798, 1.803900947437924, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4798091233019287],
[1.004362918663049, 2.01034724337101, 1, 1, 0.3331540561714875, 0.9956560337085553, 0.4974265034547813, -1.037391656055884, 0.8890083748564852, 0.5553164871994605, 0.480271387711002],
[1.00082282894481, 2.006533531642225, 1, 1, 0.3327915647314406, 0.9991778475460263, 0.4983719355945979, -1.040212483453709, 0.8892497744435995, 0.5548329039064805, 0.4814457814317464],
[0.5542979450141728, 2.445588196430234, 1, 2, 0.1847729943334734, 1.804083902880843, 0.8177991711439201, -2.043578315340351, 0.910193513258155, 0.4582041504770611, 0.4826263443555187],
[0.4985452141061962, 2.322833990922421, 0, 2, 0.176702661314589, 0, 0.861017191850968, 1.784024436131306, 0.6778185078864803, 1, 0.4826263443555187],
[1.871467362642867, 1.127994874501288, 1, 1, 0.6239342971107804, 0.5343400691678696, 0.8865288509773794, 0.7297338529661278, 0.6107059928888764, 0.8585745871104372, 0.4826263443555187],
[0.7013979121194167, 2.119550281092216, 0, 1, 0.2486390617903831, 0, 0.4717981964951048, 0.9775641176925943, 0.7513609382096169, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301605529095, 2.124369839447093, 1, 1, 0.2918767201843029, 1.14203466834509, 0.4707278278156448, -1.390945290037749, 0.9148079802144544, 0.4985614205830599, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353341976516657, 0, 1, 0.1903261064360873, 0, 0.4249276178212606, 0.8804484520808601, 0.8096738935639127, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.553577283856707, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2167850126786178, 1.806432505743587, 0, -3.742921468897081, 1, 0.2167850126786178, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.876048935681268, 1, 0, 0.3476992298683277, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3476992298683277, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.254198275247487, 1.299415524046359, 1, 0, 0.4911464198675274, 0.7973220978976971, 0, -1.652048437103887, 1, 0.4911464198675274, 0.4826263443555187],
[1.87421530702712, 1.125246592123411, 2, 0, 0.6248505132063559, 1.067113256679351, 0, -2.211054719991165, 1, 0.3904381638542463, 0.4826263443555187],
[0.9731098815912188, 2.026890118408783, 3, 0, 0.3243699605304061, 3.082899533498141, 0, -6.387756428039441, 0.9999999999999999, 0.03412886801896842, 0.4826263443555187],
[0.9994618991504894, 2.000538100849514, 0, 1, 0.3331539663834961, 0, 0.4998655109719517, 1.035719489451935, 0.6668460336165039, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.8208040626044767, 2.000144130607158, 0, 1, 0.2909674359067174, 0, 0.4999639699447274, 1.035923496079272, 0.7090325640932826, 1, 0.4826263443555187],
[0.999574601367586, 2.000425398632417, 0, 1, 0.333191533789195, 0, 0.499893672957585, 1.03577784098198, 0.6668084662108049, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 1, 0.1843962197058146, 0, 0.4086951794327153, 0.8468148997926578, 0.8156037802941853, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994617907895728, 2.00053820921043, 0, 2, 0.3331539302631906, 0, 0.999730967792591, 2.071438866702551, 0.4446836807234296, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999991, 2.071996300441, 0.4444444444444445, 1, 0.4826263443555187],
[0.6180294752121903, 2.38197052478781, 0, 0, 0.20600982507073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8209481932116328, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2910185288716655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994618991837868, 2.000538100816216, 1, 1, 0.3331539663945953, 1.000538390524594, 0.4998655109802717, -1.037392354146979, 0.889008434675549, 0.5553163674647394, 0.4826263443555187],
[0.001982674755839598, 2.998017325244165, 0, 2, 0.0006608915852798649, 0, 0.6671075524345462, 1.382244380640632, 0.9986786536071278, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9998799544578255, 2.000120045542177, 1, 2, 0.3332933181526082, 1.000120059954837, 0.9999399808314281, -0.0003731232774894267, 0.7407940927136984, 0.70365034692691, 0.4826263443555187],
[1.052439553895092, 1.852269634156985, 2, 1, 0.3623218318116269, 1.900346668459937, 0.5398782021577143, -2.81888562904485, 0.952435437099671, 0.2987022036213407, 0.4826263443555187],
[0.9991554706530694, 2.000844529346933, 0, 1, 0.3330518235510229, 0, 0.4997889567793634, 1.035560869448109, 0.6669481764489771, 1, 0.4826263443555187],
[1.000905568691147, 1.999094431308856, 2, 1, 0.3336351895637154, 1.998190501243126, 0.5002264947260523, -3.103775879697159, 0.9628622530748142, 0.2596618252952771, 0.4826263443555187],
[0.9989241403407331, 2.00107585965927, 1, 4, 0.3329747134469107, 1.001077018379894, 1.998924718766581, 2.067536743604776, 0.4616139250806521, 0.8679581834547879, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7010096079396109, 2.119938585272022, 1, 0, 0.2485014115560611, 1.42651397166891, 0, -2.955731671825383, 1, 0.2485014115560611, 0.4826263443555187],
[0.9994615513331501, 2.000538448666853, 0, 1, 0.3331538504443831, 0, 0.4998654240644034, 1.035719309379816, 0.6668461495556169, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.001274918237803, 0, 1, 0.2165576616638182, 0, 0.4996814734881789, 1.035338164466415, 0.7834423383361817, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 3, 0.1843962197058146, 0, 1.226085538298146, 2.540444699377973, 0.542547404444148, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674331, 2.44642274943257, 1, 1, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0.4087600968524114, -2.895972285530926, 0.9659502475171335, 0.3350017478954219, 0.4826263443555187],
[0.7014884325501417, 1.42249261810227, 1, 1, 0.3302705701327557, 1.425540256401193, 0.7029913458068328, -1.497118669639191, 0.8909213505041844, 0.5514624907696959, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.6470831298453853, 2.352916870154616, 0, 2, 0.2156943766151283, 0, 0.8500087807473518, 1.76121504905088, 0.6151353108731321, 1, 0.4826263443555187],
[0.9997014087164043, 1.999999907162464, 1, 2, 0.3332669834241502, 1.00029868046698, 1.00000004641877, -0.0006187686430760583, 0.7408292028834236, 0.7036152283532131, 0.4826263443555187],
[0.003061735538731632, 2.996938264461273, 0, 3, 0.001020578512910542, 0, 1.001021621157511, 2.074113095699817, 0.9969413881397565, 1, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9989236828935021, 2.0010763171065, 0, 2, 0.3329745609645004, 0, 0.9994621309056034, 2.070881837667291, 0.444922936320501, 1, 0.4826263443555187],
[0.299590170872472, 2.700409829127531, 0, 1, 0.09986339029082389, 0, 0.3703141609150074, 0.7672895714168092, 0.9001366097091761, 1, 0.4826263443555187],
[0.9746903557919112, 2.02530964420809, 1, 0, 0.3248967852639703, 1.025966856097109, 0, -2.125799530208297, 1, 0.3248967852639703, 0.4826263443555187],
[0.9994616261917938, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3332136732353331, 1.000538663810693, 0.4999999999999996, -1.03711425964344, 0.8889686479690166, 0.5553959944396829, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999850460713108, 2, 0, 0.3333499496379183, 1.999999999999998, 0, -4.143992600882001, 1, 0.1111221889236027, 0.4826263443555187],
[0.8760189493475904, 2.123981050652412, 0, 0, 0.2920063164491966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301605529095, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3045002700849917, 1.14203466834509, 0, -2.366291607786394, 1, 0.3045002700849917, 0.4826263443555187],
[1.002421813643843, 1.880562317635228, 0, 0, 0.3477028550965719, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4814603371420593],
[0.998922194108166, 2.000852065468485, 0, 3, 0.3329991218236338, 0, 1.499361223038532, 3.106670907160535, 0.2967421350745594, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 3, 1, 0.3333333333333333, 2.999999999999997, 0.4999999999999996, -5.179990751102501, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9987233306899536, 2.001276669310049, 2, 1, 0.3329077768966509, 2.002556602556114, 0.499681036278085, -3.113952613351253, 0.9631046340873106, 0.2586920319294317, 0.4826263443555187],
[0.9999699893944803, 2.000030010605523, 1, 1, 0.3333233297981598, 1.000030011506183, 0.4999924974611972, -1.036075879182927, 0.8888955578122674, 0.5555422174085867, 0.4826263443555187],
[0.003899873448255443, 2.996100126551749, 0, 3, 0.001299957816085145, 0, 1.001301649906053, 2.074693314230813, 0.9961051940259292, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537264665904608, 2.446273533409542, 0, 1, 0.1845754888634867, 0, 0.4087850301050472, 0.8470010700533216, 0.8154245111365133, 1, 0.4826263443555187],
[1.051106112850927, 1.85499253577905, 1, 2, 0.3616897565904895, 0.9513787311993543, 1.078171454291082, 0.2627140531689003, 0.7021736917057932, 0.7399268955906337, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.8209481932116328, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2910185288716655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9983859302770285, 2.001614069722974, 0, 2, 0.3327953100923425, 0, 0.9991936159185785, 2.070325475607562, 0.4451620982347734, 1, 0.4826263443555187],
[0.6476211063236933, 2.352378893676308, 0, 2, 0.2158737021078977, 0, 0.8502031732117743, 1.761617829517997, 0.614854051045974, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994622319178746, 2.000537768082128, 0, 2, 0.3331540773059579, 0, 0.9997311882381288, 2.07143932346489, 0.4446834846136683, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.001563282122876149, 2.998436717877129, 0, 2, 0.0005210940409587154, 0, 0.6670142438143518, 1.38205104552479, 0.9989580834570821, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994622319178562, 2.000537768082147, 0, 1, 0.3331540773059517, 0, 0.4998655941190597, 1.035719661732435, 0.6668459226940483, 1, 0.4826263443555187],
[0.4987776486016677, 2.022684317518843, 1, 1, 0.1978128781252571, 2.004901388030355, 0.494392521531321, -3.12976878316933, 0.9608700652478023, 0.3564958214983163, 0.4826263443555187],
[0.5535772367852354, 2.000425154433815, 1, 1, 0.2167489109205601, 1.80643265934715, 0.4998937339812807, -2.707143819740245, 0.9530199096147511, 0.3865177314558712, 0.4826263443555187],
[0.8757793914763738, 2.02527965593864, 1, 1, 0.301882649460974, 1.141840068095479, 0.4937589715414082, -1.342821634445783, 0.9088668659544227, 0.5126321648763708, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.6467707985485557, 2.353229201451446, 0, 0, 0.2155902661828518, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301605529095, 2.124369839447093, 1, 0, 0.2918767201843029, 1.14203466834509, 0, -2.366291607786394, 1, 0.2918767201843029, 0.4826263443555187],
[0.8749198301558767, 2.124542094256605, 2, 1, 0.2916922608801747, 2.285923728170246, 0.4706896618821329, -3.761158269783448, 0.9751815462739337, 0.2056162177200314, 0.4826263443555187],
[0.2987461546295331, 2.70125384537047, 0, 0, 0.09958205154317762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9995746916237419, 2.000425308376261, 0, 1, 0.3331915638745803, 0, 0.4998936955120294, 1.035777887714706, 0.6668084361254196, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 1, 0.1843962197058146, 0, 0.4086951794327153, 0.8468148997926578, 0.8156037802941853, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.00051845749773, 1.999481542502273, 1, 1, 0.3335061524992431, 0.9994818111611585, 0.5001296479829163, -1.03465583472253, 0.8887736462451516, 0.5557859512436378, 0.4826263443555187],
[0.4992564106516222, 1.628945140619023, 0, 2, 0.2345907559147961, 0, 1.227788431991007, 2.543973088809625, 0.5858513109310833, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.3000100185797736, 2.699989981420229, 1, 1, 0.1000033395265911, 3.333222019497649, 0.3703717446662477, -6.139014808211269, 0.9899993320835294, 0.1900060111367116, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.875270376555426, 1.124191522595065, 1, 0, 0.625202266141984, 0.5332564373127042, 0, -1.104905365298272, 1, 0.625202266141984, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.874074514148815, 2.125925485851187, 3, 0, 0.2913581713829381, 3.432201661801613, 0, -7.111509145620402, 1, 0.02473327397290781, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674537, 2.353172175594388, 1, 1, 0.1904454665355911, 1.806432614373031, 0.424958279879121, -2.862409710225578, 0.963730524276041, 0.3446214573472233, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.5535772367851838, 2.352834022120615, 1, 0, 0.1904676205368106, 1.806432659347319, 0, -3.742921787163446, 1, 0.1904676205368107, 0.4826263443555187],
[0.8760189493475904, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3045942898068561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5533015328697767, 2.446698467130226, 0, 1, 0.1844338442899254, 0, 0.4087140338028318, 0.8468539659777863, 0.8155661557100746, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.9998506879784678, 2.000149312021535, 2, 1, 0.3332835626594889, 2.000298668637883, 0.4999626747811681, -3.108690628689587, 0.9629795507105812, 0.2591929008381665, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537303775341715, 2.352800942931028, 0, 1, 0.190512441285355, 0, 0.4250253311928032, 0.8806509138252, 0.8094875587146451, 1, 0.4826263443555187],
[1.252984156239298, 1.301131698787275, 0, 2, 0.4905745186826154, 0, 1.537123414842716, 3.184914028875347, 0.259514321015449, 1, 0.4826263443555187],
[1.000905578469513, 1.99909442153049, 2, 1, 0.3336351928231706, 1.998190481721768, 0.5002264971728589, -3.103775834179202, 0.9628622519863606, 0.2596618296431834, 0.4826263443555187],
[0.8760189493475904, 2.123981050652412, 0, 0, 0.2920063164491966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.8756301605288513, 2.000029997878959, 1, 1, 0.3044970936390719, 1.142034668376468, 0.4999925006427426, -1.3303089962714, 0.9072815199653583, 0.516275707243502, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674331, 2.44642274943257, 1, 0, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0, -3.742921693977028, 1, 0.1845257501891442, 0.4826263443555187],
[0.8206253000442235, 2.00053881304201, 0, 1, 0.2908818016781358, 0, 0.4998653330196602, 1.035719120735445, 0.7091181983218642, 1, 0.4826263443555187],
[1.875025909078607, 1.124861378516158, 2, 0, 0.6250321193173748, 1.066651927483395, 0, -2.210098847603858, 1, 0.390665150178369, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772368060436, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2167849982475741, 1.806432659279249, 0, -3.742921787022406, 1, 0.216784998247574, 0.4826263443555187],
[0.5541153680961529, 2.44588463190385, 1, 1, 0.1847051226987174, 1.804678335191878, 0.4088500279024244, -2.892151088754575, 0.9658840176488519, 0.3352942630462865, 0.4826263443555187],
[0.8748525405444184, 2.000000000000002, 1, 0, 0.304312144086091, 1.143049775425814, 0, -2.368394905902205, 1, 0.304312144086091, 0.4826263443555187],
[1.254198275247487, 1.299415524046359, 1, 0, 0.4911464198675274, 0.7973220978976971, 0, -1.652048437103887, 1, 0.4911464198675274, 0.4826263443555187],
[0.9994607297270469, 2.000539270272956, 0, 1, 0.333153576575682, 0, 0.4998652187735153, 1.035718884017856, 0.6668464234243181, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.4985795542979873, 1.625401496354424, 1, 0, 0.2347382309012792, 2.005697970122392, 0, -4.155798773895624, 1, 0.2347382309012792, 0.4826263443555187],
[0.4983351273710254, 2.02139141788423, 0, 0, 0.1977734958221598, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8207037911460237, 2.000460058028065, 1, 0, 0.2909096511307875, 1.218466407476452, 0, -2.524657888502848, 1, 0.2909096511307875, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000425140176406, 0, 1, 0.2166297265743228, 0, 0.4998937375441181, 1.035777974805038, 0.7833702734256772, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5538998916731607, 2.445884634412367, 2, 2, 0.1846465593967026, 3.610760771154183, 0.8177000549662096, -5.787211470848576, 0.9783056554032421, 0.1576901476948867, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.876048901216079, 1, 0, 0.3476992340349883, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3476992340349883, 0.4826263443555187],
[0.5007203100760909, 1.625372403059342, 0, 2, 0.2355119826066563, 0, 1.230487238638676, 2.549565006199202, 0.5844419287380054, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.519726545255254, 0, 0, 0.3968684625254438, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.869069366158695, 1.125094344227329, 1, 3, 0.6242375323952224, 0.5350256218982373, 2.666443054658037, 4.416289035373764, 0.1524166375005622, 0.9800632851795398, 0.4826263443555187],
[0.9993728826394938, 2.000627117360509, 1, 3, 0.3331242942131643, 1.000627510883475, 1.499529809411958, 1.033723716832529, 0.5929642176585719, 0.8022212691834835, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999552117610618, 1, 1, 0.3333831054739532, 0.9999999999999991, 0.5001119956777913, -1.03576609559045, 0.8888557049845429, 0.5556219159324495, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.4985333031912943, 2.323061771589333, 0, 1, 0.1766849211097571, 0, 0.4304663837310902, 0.8919247545550357, 0.8233150788902429, 1, 0.4826263443555187],
[0.5533672473956499, 2.446416789928095, 0, 2, 0.184469028606918, 0, 0.8175221851951009, 1.693902943252693, 0.6650907653013438, 1, 0.4826263443555187],
[0.8748527206668167, 2.125147279333186, 1, 0, 0.2916175735556054, 1.143049540084639, 0, -2.368394418276161, 1, 0.2916175735556054, 0.4826263443555187],
[0.3018970405105096, 2.697024467171888, 0, 2, 0.1006685369180667, 0, 0.7415579741095969, 1.536505378917609, 0.8087970804890908, 1, 0.4826263443555187],
[0.5548017155852442, 2.445198284414758, 0, 2, 0.1849339051950812, 0, 0.8179295776328775, 1.694747058876594, 0.6643327389005408, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.8760860594759717, 2.123375599175393, 1, 1, 0.2920810996030143, 1.141440374702626, 0.4709482393921958, -1.389257223837999, 0.914688631254694, 0.4988508304607226, 0.4826263443555187],
[0.7004653936280543, 2.120482799583579, 1, 1, 0.2483084926244528, 1.427622276698794, 0.4715907151882488, -1.980893858554685, 0.9383428924905723, 0.4349598777394775, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301871859864, 2.124369812814016, 1, 0, 0.2918767290619952, 1.142034633609082, 0, -2.366291535813513, 1, 0.2918767290619952, 0.4826263443555187],
[0.6476213694293164, 2.352378630570685, 0, 2, 0.215873789809772, 0, 0.8502032683041343, 1.761618026549015, 0.6148539135072896, 1, 0.4826263443555187],
[0.7005212990301768, 2.120426894181456, 1, 0, 0.2483283105715733, 1.427508344691918, 0, -2.957792009050314, 1, 0.2483283105715732, 0.4826263443555187],
[1.050255494951398, 1.856275239369838, 0, 1, 0.3613433302285947, 0, 0.5387132138547928, 1.116211786105813, 0.6386566697714053, 1, 0.4826263443555187],
[1.052516197778061, 1.854014303805427, 1, 0, 0.3621211603334788, 0.9501041429206255, 0, -1.968612269165205, 1, 0.3621211603334789, 0.4826263443555187],
[0.9983865791669629, 2.00161342083304, 0, 1, 0.3327955263889873, 0, 0.4995969699203034, 1.035163073386403, 0.6672044736110128, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994617907895728, 2.00053820921043, 0, 1, 0.3331539302631906, 0, 0.4998654838962955, 1.035719433351276, 0.6668460697368094, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7012538453704674, 2.119694347841165, 0, 0, 0.2485879914625778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.35280371715367, 0, 1, 0.1903613593877627, 0, 0.4250248300396944, 0.8806498754378126, 0.8096386406122372, 1, 0.4826263443555187],
[0.972742314030142, 2.02725768596986, 2, 1, 0.3242474380100471, 2.056042973718142, 0.4932772024596322, -3.238044896503462, 0.9659097913159695, 0.2472287858001769, 0.4826263443555187],
[0.7008964766906574, 2.120483874203877, 0, 1, 0.248423250154285, 0, 0.4715904761951769, 0.977133721999617, 0.751576749845715, 1, 0.4826263443555187],
[0.9991555990224396, 2.000844400977563, 1, 1, 0.3330518663408129, 1.000845114593149, 0.4997889888446221, -1.038186438864249, 0.8890764543269014, 0.555180187008527, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 4, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 1.999999999999998, 2.071996300441, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.4826263443555187],
[0.9995746013675538, 2.000425398632449, 1, 1, 0.3331915337891843, 1.000425579673457, 0.4998936729575769, -1.037100258967985, 0.888983401811211, 0.5553664693895793, 0.4826263443555187],
[1.000306238998724, 1.999155992919153, 1, 1, 0.3334951940232037, 0.9996938547548895, 0.5002110908512983, -1.034926438942287, 0.8887809555634258, 0.555771343609833, 0.4826263443555187],
[0.4986454754816113, 1.626390247695886, 1, 1, 0.234652749618723, 2.005432815838068, 0.6148585810919022, -2.881264669882633, 0.9449380870963731, 0.4142435863338187, 0.4826263443555187]
],
"RESOLVED": [
[0.5542640934585379, 2.445735906541465, 0, 2, 0.1847546978195125, 0, 0.8177497801993743, 1.694374519259546, 0.6646249027273544, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.998796198587916, 2.001203801412087, 1, 2, 0.3329320661959717, 1.0012052522965, 0.9993984613604883, -0.003743664135087645, 0.7412756024460205, 0.7031683587586468, 0.4826263443555187],
[0.7013979244636048, 2.118825255137768, 0, 3, 0.2487029854717898, 0, 1.415878913433537, 2.933695870506716, 0.4240674992532976, 1, 0.4826263443555187],
[0.8209194674358452, 1.999881684399788, 1, 1, 0.2910235153944236, 1.218146285558942, 0.5000295806499792, -1.487935155856255, 0.9153053134874716, 0.4973523442763189, 0.4826263443555187],
[0.9991554706531333, 2.00084452934687, 1, 1, 0.3330518235510441, 1.000845243179537, 0.4997889567793792, -1.038186771733835, 0.8890764828293243, 0.5551801299314123, 0.4826263443555187],
[0.9747203198909692, 2.025279680109032, 1, 1, 0.3249067732969896, 1.025935316616626, 0.493758965648717, -1.102667430387699, 0.8944355886657386, 0.5442491352597179, 0.4826263443555187],
[0.4984791892887451, 2.322321950388641, 0, 2, 0.1767154664953645, 0, 0.8612070344791339, 1.784417789354532, 0.6777974231079452, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999420719943802, 1, 0, 0.33339771021477, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.33339771021477, 0.4826263443555187],
[0.9949293742743121, 2.005070625725691, 0, 2, 0.3316431247581036, 0, 0.9974710986931665, 2.066756426289063, 0.4467009126831118, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301253581699, 2.123772592657709, 1, 2, 0.2919348309244062, 1.142034714247591, 0.941720411551776, -0.4150504941111484, 0.7940830074632517, 0.6450070782445521, 0.4826263443555187],
[0.8748532584645849, 2.125146741535417, 1, 0, 0.2916177528215281, 1.143048837418808, 0, -2.36839296235516, 1, 0.291617752821528, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.254136231549002, 1.29944101901843, 0, 1, 0.4911291527484903, 0, 0.7695616694903004, 1.594528932145104, 0.5088708472515098, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.9991554707053286, 2.000844529294674, 0, 1, 0.3330518235684426, 0, 0.4997889567924171, 1.035560869475156, 0.6669481764315575, 1, 0.4826263443555187],
[0.6467707985485557, 2.353229201451446, 0, 0, 0.2155902661828518, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -4.143992600882001, 1, 0.1111111111111109, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.876018949347591, 0, 0, 0.3477028550965719, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994618991505301, 2.000538100849473, 1, 1, 0.3331539663835097, 1.000538390557886, 0.4998655109719619, -1.037392354233179, 0.8890084346829353, 0.5553163674499546, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9990367898069775, 2.000963210193025, 0, 2, 0.3330122632689922, 0, 0.999518626735305, 2.070998896817423, 0.4448726409495521, 1, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.4984012504779732, 1.626635795893071, 0, 1, 0.2345376760979768, 0, 0.6147657653451372, 1.273792391432905, 0.7654623239020232, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537267286386844, 2.446273271361318, 0, 1, 0.1845755762128946, 0, 0.408785073894673, 0.8470011607852642, 0.8154244237871053, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7017326457336036, 1.422248404918808, 0, 1, 0.3303855491168606, 0, 0.7031120559119818, 1.456845578645093, 0.6696144508831394, 1, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.998923495158026, 2.000538163493339, 0, 3, 0.3330342604236414, 0, 1.499596485958259, 3.10715837105984, 0.2966952390918467, 1, 0.4826263443555187],
[1.050710336731983, 1.855933837503285, 0, 2, 0.3614857112699122, 0, 1.077624621948011, 2.232834229940413, 0.4077004969124899, 1, 0.4826263443555187],
[3.11511611660165, 7.552858995997052, 0, 0, 0.2920063164491966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.106696957701018],
[0.8736826495779314, 2.126317350422071, 2, 0, 0.2912275498593103, 2.289160716383898, 0, -4.743132535462312, 1, 0.08481348579705683, 0.4826263443555187],
[0.5537264677535433, 2.446160836394073, 0, 2, 0.1845824231423514, 0, 0.8176077264601429, 1.694080184437395, 0.6649058246483992, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537267825011086, 2.446273217498894, 0, 1, 0.1845755941670361, 0, 0.4087850828953664, 0.8470011794346677, 0.8154244058329639, 1, 0.4826263443555187],
[0.9677323005179963, 1.954041439995094, 1, 42, 0.3312139770097507, 1.033343621438214, 21.49391468386947, 42.39422754626779, 6.848071653033365e-07, 0.999999969285101, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7010096161300772, 1.818716929125178, 1, 0, 0.2782086085690949, 1.426513955001786, 0, -2.955731637291163, 1, 0.2782086085690949, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446272527840551, 0, 1, 0.1844293440177765, 0, 0.4087851981409246, 0.8470014182230378, 0.8155706559822234, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.254198275247503, 1.299415524046316, 1, 0, 0.4911464198675389, 0.7973220978976869, 0, -1.652048437103866, 1, 0.4911464198675389, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674332, 2.44642274943257, 1, 0, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0, -3.742921693977027, 1, 0.1845257501891442, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999991, 2.071996300441, 0.4444444444444445, 1, 0.4826263443555187],
[0.001138360290928792, 2.998861639709076, 0, 2, 0.0003794534303095966, 0, 0.66691973164658, 1.38185521666282, 0.9992412371242865, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.6480457143396967, 2.351954285660305, 0, 1, 0.2160152381132321, 0, 0.4251783319501266, 0.8809679308283388, 0.7839847618867679, 1, 0.4826263443555187],
[0.6470832504702914, 2.35291674952971, 0, 2, 0.2156944168234304, 0, 0.8500088243240016, 1.761215139341537, 0.615135247801939, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999552005303037, 1, 0, 0.3333831179563007, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333831179563007, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537264677535433, 2.446273532246459, 0, 1, 0.1845754892511809, 0, 0.4087850302994044, 0.847001070456029, 0.8154245107488191, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999701345163808, 0, 3, 0.3333665205078582, 0, 1.500224024580156, 3.108458628762794, 0.2962520489330037, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.002259460739132566, 2.997740539260872, 0, 1, 0.0007531535797108542, 0, 0.3335845737491883, 0.6911860026925069, 0.9992468464202892, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674332, 2.44642274943257, 1, 0, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0, -3.742921693977027, 1, 0.1845257501891442, 0.4826263443555187],
[0.9999700081885631, 2.00002999181144, 1, 1, 0.3333233360628541, 1.000029992710973, 0.499992502159577, -1.036075830504294, 0.8888955536359298, 0.5555422257616377, 0.4826263443555187],
[0.7019742510323341, 2.119405713210921, 0, 1, 0.2488052867493217, 0, 0.4718303785663528, 0.9776307988251606, 0.7511947132506783, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.4986454760927311, 2.322518286392621, 1, 1, 0.1767516947167366, 2.00543281338029, 0.4305671158151433, -3.263115899046423, 0.9687588384147614, 0.3222622278482349, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5543535141673197, 2.445646485832683, 1, 0, 0.1847845047224397, 1.803903059047212, 0, -3.737680464700031, 1, 0.1847845047224397, 0.4826263443555187],
[1.05152378648847, 1.85489407408042, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999996, -3.107994450661501, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.9973091437218117, 2.002690856278191, 1, 1, 0.3324363812406035, 1.002698116521971, 0.4993281898027956, -1.042980625915389, 0.8894860524276522, 0.5543588149088591, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.9995746305347751, 2.000425369465228, 0, 1, 0.3331915435115914, 0, 0.4998936802462815, 1.035777856084133, 0.6668084564884086, 1, 0.4826263443555187],
[0.9991553005846255, 2.000266615044178, 0, 2, 0.3331159565709718, 0, 0.9998667102464379, 2.071720124564735, 0.44473432738025, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772368060436, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2167849982475741, 1.806432659279249, 0, -3.742921787022406, 1, 0.216784998247574, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674332, 2.44642274943257, 1, 1, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0.4087600968524114, -2.895972285530925, 0.9659502475171335, 0.3350017478954219, 0.4826263443555187],
[0.002336579072301426, 2.997663420927704, 0, 1, 0.0007788596907671406, 0, 0.3335931555953418, 0.6912037842459877, 0.9992211403092328, 1, 0.4826263443555187],
[0.9998207595341156, 2.000179240465887, 1, 2, 0.3332735865113715, 1.000179272598789, 0.9999103877981227, -0.000557128312224544, 0.7408203995999139, 0.7036240341348425, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.003905672939360517, 2.996094327060644, 0, 1, 0.001301890979786837, 0, 0.3337678627031287, 0.6915657767269832, 0.9986981090202132, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999991, 2.071996300441, 0.4444444444444445, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.001563056690645175, 2.99843694330936, 0, 2, 0.0005210188968817241, 0, 0.6670141936660539, 1.382050941617702, 0.9989582336669275, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.6467707985485557, 2.353229201451446, 0, 0, 0.2155902661828518, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.051916417233258, 1.854726716864995, 1, 1, 0.3619007799385737, 0.9506458722549377, 0.5391629887611036, -0.8525910122940202, 0.869027825479852, 0.5928293853569995, 0.4826263443555187],
[0.5537264330373285, 2.446273566962674, 0, 1, 0.1845754776791093, 0, 0.4087850244981445, 0.8470010584358398, 0.8154245223208907, 1, 0.4826263443555187],
[0.01182587047636735, 2.987549018215668, 0, 6, 0.003942778383906641, 0, 2.008335248532102, 4.161263205003776, 0.9765752899872185, 1, 0.4826263443555187],
[0.9987667950852176, 2.001233204914786, 0, 2, 0.3329222650284055, 0, 0.9993837775069108, 2.070719489715073, 0.4449927044948329, 1, 0.4826263443555187],
[0.5551371586338348, 2.444862841366168, 1, 2, 0.1850457195446114, 1.801356627722329, 0.818041800202754, -2.037424684789341, 0.9099468858635353, 0.4587477240829275, 0.4826263443555187],
[0.9963468752858889, 2.00299011677733, 0.5, 3.5, 0.3321890397519187, 0.5018332594825787, 1.747387553579772, 2.580783889367788, 0.3967587230217604, 0.8011094402508331, 0.4826263443555187],
[0.5503541128624102, 2.529012706010134, 0, 3, 0.1787231418775606, 0, 1.186233660618065, 2.523033772184829, 0.5539476909883273, 1, 0.4701616259344965],
[1.022616213618798, 1.803900947437924, 0, 0, 0.3617937395563106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4798091233019287],
[1.004362918663049, 2.01034724337101, 1, 1, 0.3331540561714875, 0.9956560337085553, 0.4974265034547813, -1.037391656055884, 0.8890083748564852, 0.5553164871994605, 0.480271387711002],
[1.00082282894481, 2.006533531642225, 1, 1, 0.3327915647314406, 0.9991778475460263, 0.4983719355945979, -1.040212483453709, 0.8892497744435995, 0.5548329039064805, 0.4814457814317464],
[0.5542979450141728, 2.445588196430234, 1, 2, 0.1847729943334734, 1.804083902880843, 0.8177991711439201, -2.043578315340351, 0.910193513258155, 0.4582041504770611, 0.4826263443555187],
[0.4985452141061962, 2.322833990922421, 0, 2, 0.176702661314589, 0, 0.861017191850968, 1.784024436131306, 0.6778185078864803, 1, 0.4826263443555187],
[1.871467362642867, 1.127994874501288, 1, 1, 0.6239342971107804, 0.5343400691678696, 0.8865288509773794, 0.7297338529661278, 0.6107059928888764, 0.8585745871104372, 0.4826263443555187],
[0.7013979121194167, 2.119550281092216, 0, 1, 0.2486390617903831, 0, 0.4717981964951048, 0.9775641176925943, 0.7513609382096169, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301605529095, 2.124369839447093, 1, 1, 0.2918767201843029, 1.14203466834509, 0.4707278278156448, -1.390945290037749, 0.9148079802144544, 0.4985614205830599, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353341976516657, 0, 1, 0.1903261064360873, 0, 0.4249276178212606, 0.8804484520808601, 0.8096738935639127, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.553577283856707, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2167850126786178, 1.806432505743587, 0, -3.742921468897081, 1, 0.2167850126786178, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.876048935681268, 1, 0, 0.3476992298683277, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3476992298683277, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.254198275247487, 1.299415524046359, 1, 0, 0.4911464198675274, 0.7973220978976971, 0, -1.652048437103887, 1, 0.4911464198675274, 0.4826263443555187],
[1.87421530702712, 1.125246592123411, 2, 0, 0.6248505132063559, 1.067113256679351, 0, -2.211054719991165, 1, 0.3904381638542463, 0.4826263443555187],
[0.9731098815912188, 2.026890118408783, 3, 0, 0.3243699605304061, 3.082899533498141, 0, -6.387756428039441, 0.9999999999999999, 0.03412886801896842, 0.4826263443555187],
[0.9994618991504894, 2.000538100849514, 0, 1, 0.3331539663834961, 0, 0.4998655109719517, 1.035719489451935, 0.6668460336165039, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.8208040626044767, 2.000144130607158, 0, 1, 0.2909674359067174, 0, 0.4999639699447274, 1.035923496079272, 0.7090325640932826, 1, 0.4826263443555187],
[0.999574601367586, 2.000425398632417, 0, 1, 0.333191533789195, 0, 0.499893672957585, 1.03577784098198, 0.6668084662108049, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 1, 0.1843962197058146, 0, 0.4086951794327153, 0.8468148997926578, 0.8156037802941853, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994617907895728, 2.00053820921043, 0, 2, 0.3331539302631906, 0, 0.999730967792591, 2.071438866702551, 0.4446836807234296, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999991, 2.071996300441, 0.4444444444444445, 1, 0.4826263443555187],
[0.6180294752121903, 2.38197052478781, 0, 0, 0.20600982507073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8209481932116328, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2910185288716655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994618991837868, 2.000538100816216, 1, 1, 0.3331539663945953, 1.000538390524594, 0.4998655109802717, -1.037392354146979, 0.889008434675549, 0.5553163674647394, 0.4826263443555187],
[0.001982674755839598, 2.998017325244165, 0, 2, 0.0006608915852798649, 0, 0.6671075524345462, 1.382244380640632, 0.9986786536071278, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9998799544578255, 2.000120045542177, 1, 2, 0.3332933181526082, 1.000120059954837, 0.9999399808314281, -0.0003731232774894267, 0.7407940927136984, 0.70365034692691, 0.4826263443555187],
[1.052439553895092, 1.852269634156985, 2, 1, 0.3623218318116269, 1.900346668459937, 0.5398782021577143, -2.81888562904485, 0.952435437099671, 0.2987022036213407, 0.4826263443555187],
[0.9991554706530694, 2.000844529346933, 0, 1, 0.3330518235510229, 0, 0.4997889567793634, 1.035560869448109, 0.6669481764489771, 1, 0.4826263443555187],
[1.000905568691147, 1.999094431308856, 2, 1, 0.3336351895637154, 1.998190501243126, 0.5002264947260523, -3.103775879697159, 0.9628622530748142, 0.2596618252952771, 0.4826263443555187],
[0.9989241403407331, 2.00107585965927, 1, 4, 0.3329747134469107, 1.001077018379894, 1.998924718766581, 2.067536743604776, 0.4616139250806521, 0.8679581834547879, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7010096079396109, 2.119938585272022, 1, 0, 0.2485014115560611, 1.42651397166891, 0, -2.955731671825383, 1, 0.2485014115560611, 0.4826263443555187],
[0.9994615513331501, 2.000538448666853, 0, 1, 0.3331538504443831, 0, 0.4998654240644034, 1.035719309379816, 0.6668461495556169, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.001274918237803, 0, 1, 0.2165576616638182, 0, 0.4996814734881789, 1.035338164466415, 0.7834423383361817, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 3, 0.1843962197058146, 0, 1.226085538298146, 2.540444699377973, 0.542547404444148, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674331, 2.44642274943257, 1, 1, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0.4087600968524114, -2.895972285530926, 0.9659502475171335, 0.3350017478954219, 0.4826263443555187],
[0.7014884325501417, 1.42249261810227, 1, 1, 0.3302705701327557, 1.425540256401193, 0.7029913458068328, -1.497118669639191, 0.8909213505041844, 0.5514624907696959, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.6470831298453853, 2.352916870154616, 0, 2, 0.2156943766151283, 0, 0.8500087807473518, 1.76121504905088, 0.6151353108731321, 1, 0.4826263443555187],
[0.9997014087164043, 1.999999907162464, 1, 2, 0.3332669834241502, 1.00029868046698, 1.00000004641877, -0.0006187686430760583, 0.7408292028834236, 0.7036152283532131, 0.4826263443555187],
[0.003061735538731632, 2.996938264461273, 0, 3, 0.001020578512910542, 0, 1.001021621157511, 2.074113095699817, 0.9969413881397565, 1, 0.4826263443555187],
[0, 2.00332974525795, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9989236828935021, 2.0010763171065, 0, 2, 0.3329745609645004, 0, 0.9994621309056034, 2.070881837667291, 0.444922936320501, 1, 0.4826263443555187],
[0.299590170872472, 2.700409829127531, 0, 1, 0.09986339029082389, 0, 0.3703141609150074, 0.7672895714168092, 0.9001366097091761, 1, 0.4826263443555187],
[0.9746903557919112, 2.02530964420809, 1, 0, 0.3248967852639703, 1.025966856097109, 0, -2.125799530208297, 1, 0.3248967852639703, 0.4826263443555187],
[0.9994616261917938, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3332136732353331, 1.000538663810693, 0.4999999999999996, -1.03711425964344, 0.8889686479690166, 0.5553959944396829, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999850460713108, 2, 0, 0.3333499496379183, 1.999999999999998, 0, -4.143992600882001, 1, 0.1111221889236027, 0.4826263443555187],
[0.8760189493475904, 2.123981050652412, 0, 0, 0.2920063164491966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301605529095, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3045002700849917, 1.14203466834509, 0, -2.366291607786394, 1, 0.3045002700849917, 0.4826263443555187],
[1.002421813643843, 1.880562317635228, 0, 0, 0.3477028550965719, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4814603371420593],
[0.998922194108166, 2.000852065468485, 0, 3, 0.3329991218236338, 0, 1.499361223038532, 3.106670907160535, 0.2967421350745594, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 3, 1, 0.3333333333333333, 2.999999999999997, 0.4999999999999996, -5.179990751102501, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9987233306899536, 2.001276669310049, 2, 1, 0.3329077768966509, 2.002556602556114, 0.499681036278085, -3.113952613351253, 0.9631046340873106, 0.2586920319294317, 0.4826263443555187],
[0.9999699893944803, 2.000030010605523, 1, 1, 0.3333233297981598, 1.000030011506183, 0.4999924974611972, -1.036075879182927, 0.8888955578122674, 0.5555422174085867, 0.4826263443555187],
[0.003899873448255443, 2.996100126551749, 0, 3, 0.001299957816085145, 0, 1.001301649906053, 2.074693314230813, 0.9961051940259292, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537264665904608, 2.446273533409542, 0, 1, 0.1845754888634867, 0, 0.4087850301050472, 0.8470010700533216, 0.8154245111365133, 1, 0.4826263443555187],
[1.051106112850927, 1.85499253577905, 1, 2, 0.3616897565904895, 0.9513787311993543, 1.078171454291082, 0.2627140531689003, 0.7021736917057932, 0.7399268955906337, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.8209481932116328, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2910185288716655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9983859302770285, 2.001614069722974, 0, 2, 0.3327953100923425, 0, 0.9991936159185785, 2.070325475607562, 0.4451620982347734, 1, 0.4826263443555187],
[0.6476211063236933, 2.352378893676308, 0, 2, 0.2158737021078977, 0, 0.8502031732117743, 1.761617829517997, 0.614854051045974, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994622319178746, 2.000537768082128, 0, 2, 0.3331540773059579, 0, 0.9997311882381288, 2.07143932346489, 0.4446834846136683, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.001563282122876149, 2.998436717877129, 0, 2, 0.0005210940409587154, 0, 0.6670142438143518, 1.38205104552479, 0.9989580834570821, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994622319178562, 2.000537768082147, 0, 1, 0.3331540773059517, 0, 0.4998655941190597, 1.035719661732435, 0.6668459226940483, 1, 0.4826263443555187],
[0.4987776486016677, 2.022684317518843, 1, 1, 0.1978128781252571, 2.004901388030355, 0.494392521531321, -3.12976878316933, 0.9608700652478023, 0.3564958214983163, 0.4826263443555187],
[0.5535772367852354, 2.000425154433815, 1, 1, 0.2167489109205601, 1.80643265934715, 0.4998937339812807, -2.707143819740245, 0.9530199096147511, 0.3865177314558712, 0.4826263443555187],
[0.8757793914763738, 2.02527965593864, 1, 1, 0.301882649460974, 1.141840068095479, 0.4937589715414082, -1.342821634445783, 0.9088668659544227, 0.5126321648763708, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.9999999999999991, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4826263443555187],
[0.6467707985485557, 2.353229201451446, 0, 0, 0.2155902661828518, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301605529095, 2.124369839447093, 1, 0, 0.2918767201843029, 1.14203466834509, 0, -2.366291607786394, 1, 0.2918767201843029, 0.4826263443555187],
[0.8749198301558767, 2.124542094256605, 2, 1, 0.2916922608801747, 2.285923728170246, 0.4706896618821329, -3.761158269783448, 0.9751815462739337, 0.2056162177200314, 0.4826263443555187],
[0.2987461546295331, 2.70125384537047, 0, 0, 0.09958205154317762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9995746916237419, 2.000425308376261, 0, 1, 0.3331915638745803, 0, 0.4998936955120294, 1.035777887714706, 0.6668084361254196, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 1, 0.1843962197058146, 0, 0.4086951794327153, 0.8468148997926578, 0.8156037802941853, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.00051845749773, 1.999481542502273, 1, 1, 0.3335061524992431, 0.9994818111611585, 0.5001296479829163, -1.03465583472253, 0.8887736462451516, 0.5557859512436378, 0.4826263443555187],
[0.4992564106516222, 1.628945140619023, 0, 2, 0.2345907559147961, 0, 1.227788431991007, 2.543973088809625, 0.5858513109310833, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.3000100185797736, 2.699989981420229, 1, 1, 0.1000033395265911, 3.333222019497649, 0.3703717446662477, -6.139014808211269, 0.9899993320835294, 0.1900060111367116, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.875270376555426, 1.124191522595065, 1, 0, 0.625202266141984, 0.5332564373127042, 0, -1.104905365298272, 1, 0.625202266141984, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.353229201451446, 0, 0, 0.1903334914853453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.874074514148815, 2.125925485851187, 3, 0, 0.2913581713829381, 3.432201661801613, 0, -7.111509145620402, 1, 0.02473327397290781, 0.4826263443555187],
[1.254442504487911, 1.298746154629532, 0, 0, 0.4913238588963232, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2166657983310421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674537, 2.353172175594388, 1, 1, 0.1904454665355911, 1.806432614373031, 0.424958279879121, -2.862409710225578, 0.963730524276041, 0.3446214573472233, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.5535772367851838, 2.352834022120615, 1, 0, 0.1904676205368106, 1.806432659347319, 0, -3.742921787163446, 1, 0.1904676205368107, 0.4826263443555187],
[0.8760189493475904, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3045942898068561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5533015328697767, 2.446698467130226, 0, 1, 0.1844338442899254, 0, 0.4087140338028318, 0.8468539659777863, 0.8155661557100746, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.9998506879784678, 2.000149312021535, 2, 1, 0.3332835626594889, 2.000298668637883, 0.4999626747811681, -3.108690628689587, 0.9629795507105812, 0.2591929008381665, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5537303775341715, 2.352800942931028, 0, 1, 0.190512441285355, 0, 0.4250253311928032, 0.8806509138252, 0.8094875587146451, 1, 0.4826263443555187],
[1.252984156239298, 1.301131698787275, 0, 2, 0.4905745186826154, 0, 1.537123414842716, 3.184914028875347, 0.259514321015449, 1, 0.4826263443555187],
[1.000905578469513, 1.99909442153049, 2, 1, 0.3336351928231706, 1.998190481721768, 0.5002264971728589, -3.103775834179202, 0.9628622519863606, 0.2596618296431834, 0.4826263443555187],
[0.8760189493475904, 2.123981050652412, 0, 0, 0.2920063164491966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[0.8756301605288513, 2.000029997878959, 1, 1, 0.3044970936390719, 1.142034668376468, 0.4999925006427426, -1.3303089962714, 0.9072815199653583, 0.516275707243502, 0.4826263443555187],
[0.5535772505674331, 2.44642274943257, 1, 0, 0.1845257501891442, 1.806432614373098, 0, -3.742921693977028, 1, 0.1845257501891442, 0.4826263443555187],
[0.8206253000442235, 2.00053881304201, 0, 1, 0.2908818016781358, 0, 0.4998653330196602, 1.035719120735445, 0.7091181983218642, 1, 0.4826263443555187],
[1.875025909078607, 1.124861378516158, 2, 0, 0.6250321193173748, 1.066651927483395, 0, -2.210098847603858, 1, 0.390665150178369, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5535772368060436, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2167849982475741, 1.806432659279249, 0, -3.742921787022406, 1, 0.216784998247574, 0.4826263443555187],
[0.5541153680961529, 2.44588463190385, 1, 1, 0.1847051226987174, 1.804678335191878, 0.4088500279024244, -2.892151088754575, 0.9658840176488519, 0.3352942630462865, 0.4826263443555187],
[0.8748525405444184, 2.000000000000002, 1, 0, 0.304312144086091, 1.143049775425814, 0, -2.368394905902205, 1, 0.304312144086091, 0.4826263443555187],
[1.254198275247487, 1.299415524046359, 1, 0, 0.4911464198675274, 0.7973220978976971, 0, -1.652048437103887, 1, 0.4911464198675274, 0.4826263443555187],
[0.9994607297270469, 2.000539270272956, 0, 1, 0.333153576575682, 0, 0.4998652187735153, 1.035718884017856, 0.6668464234243181, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3333333333333333, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999996, 1.0359981502205, 0.6666666666666667, 1, 0.4826263443555187],
[0.4985795542979873, 1.625401496354424, 1, 0, 0.2347382309012792, 2.005697970122392, 0, -4.155798773895624, 1, 0.2347382309012792, 0.4826263443555187],
[0.4983351273710254, 2.02139141788423, 0, 0, 0.1977734958221598, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.446811340882558, 0, 0, 0.1843962197058146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8207037911460237, 2.000460058028065, 1, 0, 0.2909096511307875, 1.218466407476452, 0, -2.524657888502848, 1, 0.2909096511307875, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.000425140176406, 0, 1, 0.2166297265743228, 0, 0.4998937375441181, 1.035777974805038, 0.7833702734256772, 1, 0.4826263443555187],
[0, 3.000000000000005, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5538998916731607, 2.445884634412367, 2, 2, 0.1846465593967026, 3.610760771154183, 0.8177000549662096, -5.787211470848576, 0.9783056554032421, 0.1576901476948867, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.876048901216079, 1, 0, 0.3476992340349883, 0.9999999999999991, 0, -2.071996300441, 1, 0.3476992340349883, 0.4826263443555187],
[0.5007203100760909, 1.625372403059342, 0, 2, 0.2355119826066563, 0, 1.230487238638676, 2.549565006199202, 0.5844419287380054, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.519726545255254, 0, 0, 0.3968684625254438, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.869069366158695, 1.125094344227329, 1, 3, 0.6242375323952224, 0.5350256218982373, 2.666443054658037, 4.416289035373764, 0.1524166375005622, 0.9800632851795398, 0.4826263443555187],
[0.9993728826394938, 2.000627117360509, 1, 3, 0.3331242942131643, 1.000627510883475, 1.499529809411958, 1.033723716832529, 0.5929642176585719, 0.8022212691834835, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 1.999552117610618, 1, 1, 0.3333831054739532, 0.9999999999999991, 0.5001119956777913, -1.03576609559045, 0.8888557049845429, 0.5556219159324495, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.4985333031912943, 2.323061771589333, 0, 1, 0.1766849211097571, 0, 0.4304663837310902, 0.8919247545550357, 0.8233150788902429, 1, 0.4826263443555187],
[0.5533672473956499, 2.446416789928095, 0, 2, 0.184469028606918, 0, 0.8175221851951009, 1.693902943252693, 0.6650907653013438, 1, 0.4826263443555187],
[0.8748527206668167, 2.125147279333186, 1, 0, 0.2916175735556054, 1.143049540084639, 0, -2.368394418276161, 1, 0.2916175735556054, 0.4826263443555187],
[0.3018970405105096, 2.697024467171888, 0, 2, 0.1006685369180667, 0, 0.7415579741095969, 1.536505378917609, 0.8087970804890908, 1, 0.4826263443555187],
[0.5548017155852442, 2.445198284414758, 0, 2, 0.1849339051950812, 0, 0.8179295776328775, 1.694747058876594, 0.6643327389005408, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 0.4999999999999996, -1.0359981502205, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4826263443555187],
[0.8760860594759717, 2.123375599175393, 1, 1, 0.2920810996030143, 1.141440374702626, 0.4709482393921958, -1.389257223837999, 0.914688631254694, 0.4988508304607226, 0.4826263443555187],
[0.7004653936280543, 2.120482799583579, 1, 1, 0.2483084926244528, 1.427622276698794, 0.4715907151882488, -1.980893858554685, 0.9383428924905723, 0.4349598777394775, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.8756301871859864, 2.124369812814016, 1, 0, 0.2918767290619952, 1.142034633609082, 0, -2.366291535813513, 1, 0.2918767290619952, 0.4826263443555187],
[0.6476213694293164, 2.352378630570685, 0, 2, 0.215873789809772, 0, 0.8502032683041343, 1.761618026549015, 0.6148539135072896, 1, 0.4826263443555187],
[0.7005212990301768, 2.120426894181456, 1, 0, 0.2483283105715733, 1.427508344691918, 0, -2.957792009050314, 1, 0.2483283105715732, 0.4826263443555187],
[1.050255494951398, 1.856275239369838, 0, 1, 0.3613433302285947, 0, 0.5387132138547928, 1.116211786105813, 0.6386566697714053, 1, 0.4826263443555187],
[1.052516197778061, 1.854014303805427, 1, 0, 0.3621211603334788, 0.9501041429206255, 0, -1.968612269165205, 1, 0.3621211603334789, 0.4826263443555187],
[0.9983865791669629, 2.00161342083304, 0, 1, 0.3327955263889873, 0, 0.4995969699203034, 1.035163073386403, 0.6672044736110128, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.9994617907895728, 2.00053820921043, 0, 1, 0.3331539302631906, 0, 0.4998654838962955, 1.035719433351276, 0.6668460697368094, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.7012538453704674, 2.119694347841165, 0, 0, 0.2485879914625778, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4826263443555187],
[0.5531886591174444, 2.35280371715367, 0, 1, 0.1903613593877627, 0, 0.4250248300396944, 0.8806498754378126, 0.8096386406122372, 1, 0.4826263443555187],
[0.972742314030142, 2.02725768596986, 2, 1, 0.3242474380100471, 2.056042973718142, 0.4932772024596322, -3.238044896503462, 0.9659097913159695, 0.2472287858001769, 0.4826263443555187],
[0.7008964766906574, 2.120483874203877, 0, 1, 0.248423250154285, 0, 0.4715904761951769, 0.977133721999617, 0.751576749845715, 1, 0.4826263443555187],
[0.9991555990224396, 2.000844400977563, 1, 1, 0.3330518663408129, 1.000845114593149, 0.4997889888446221, -1.038186438864249, 0.8890764543269014, 0.555180187008527, 0.4826263443555187],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 4, 0.3333333333333333, 0.9999999999999991, 1.999999999999998, 2.071996300441, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.4826263443555187],
[0.9995746013675538, 2.000425398632449, 1, 1, 0.3331915337891843, 1.000425579673457, 0.4998936729575769, -1.037100258967985, 0.888983401811211, 0.5553664693895793, 0.4826263443555187],
[1.000306238998724, 1.999155992919153, 1, 1, 0.3334951940232037, 0.9996938547548895, 0.5002110908512983, -1.034926438942287, 0.8887809555634258, 0.555771343609833, 0.4826263443555187],
[0.4986454754816113, 1.626390247695886, 1, 1, 0.234652749618723, 2.005432815838068, 0.6148585810919022, -2.881264669882633, 0.9449380870963731, 0.4142435863338187, 0.4826263443555187]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node100":{
"Global MG94xREV":0.001161223282261921,
"Nucleotide GTR":0.001149264315274191,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCG", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node101":{
"Global MG94xREV":0.001161934617696752,
"Nucleotide GTR":0.001149968324954265,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCA", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node163":{
"Global MG94xREV":0.001162289900058685,
"Nucleotide GTR":0.001150319948407441,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"Global MG94xREV":0.001162330247425223,
"Nucleotide GTR":0.001150359880252836,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "R", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CGA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.001162332513280796,
"Nucleotide GTR":0.001150362122773284,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node252":{
"Global MG94xREV":0.001162888685900664,
"Nucleotide GTR":0.001150912567597211,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"Global MG94xREV":0.001162001384478873,
"Nucleotide GTR":0.001150034404132414,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node259":{
"Global MG94xREV":0.001162063581657796,
"Nucleotide GTR":0.001150095960767851,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node260":{
"Global MG94xREV":0.001162925565018375,
"Nucleotide GTR":0.001150949066911867,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node264":{
"Global MG94xREV":0.001162374369430531,
"Nucleotide GTR":0.00115040354786353,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node267":{
"Global MG94xREV":0.001162276340730544,
"Nucleotide GTR":0.001150306528721314,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node270":{
"Global MG94xREV":0.001162106961627413,
"Nucleotide GTR":0.001150138893984777,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTT", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node273":{
"Global MG94xREV":0.001162143905035225,
"Nucleotide GTR":0.001150175456927435,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.001162652738562594,
"Nucleotide GTR":0.001150679050184952,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node279":{
"Global MG94xREV":0.001161474293203981,
"Nucleotide GTR":0.001149512741156498,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.001161957106536549,
"Nucleotide GTR":0.001149990582190636,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTT", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node285":{
"Global MG94xREV":0.001161343263938381,
"Nucleotide GTR":0.001149383061308092,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "V", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "GTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node288":{
"Global MG94xREV":0.001162581809196524,
"Nucleotide GTR":0.001150608851291618,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node291":{
"Global MG94xREV":0.001162615033162912,
"Nucleotide GTR":0.00115064173309787,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.001161820115405709,
"Nucleotide GTR":0.001149855001875817,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"Global MG94xREV":0.001161928490738701,
"Nucleotide GTR":0.001149962261095268,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node302":{
"Global MG94xREV":0.001162625887392474,
"Nucleotide GTR":0.001150652475544131,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node305":{
"Global MG94xREV":0.001161089639726645,
"Nucleotide GTR":0.001149132049069109,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "G", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node308":{
"Global MG94xREV":0.001161906815672118,
"Nucleotide GTR":0.001149940809251392,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node313":{
"Global MG94xREV":0.001162625887392474,
"Nucleotide GTR":0.001150652475544131,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.001161787602805778,
"Nucleotide GTR":0.001149822824109947,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node319":{
"Global MG94xREV":0.001161906815672118,
"Nucleotide GTR":0.001149940809251392,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.001161971840871849,
"Nucleotide GTR":0.001150005164782998,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.001162004353471687,
"Nucleotide GTR":0.001150037342548776,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCT", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"Node328":{
"Global MG94xREV":0.001162015191004964,
"Nucleotide GTR":0.001150048068470699,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "V", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GTC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node331":{
"Global MG94xREV":0.001162026028538238,
"Nucleotide GTR":0.001150058794392619,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "S", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "TCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.001162026028538238,
"Nucleotide GTR":0.001150058794392619,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node337":{
"Global MG94xREV":0.00116160315019804,
"Nucleotide GTR":0.001149640271104707,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node340":{
"Global MG94xREV":0.00116160315019804,
"Nucleotide GTR":0.001149640271104707,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node343":{
"Global MG94xREV":0.00116160315019804,
"Nucleotide GTR":0.001149640271104707,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node346":{
"Global MG94xREV":0.001162026028538238,
"Nucleotide GTR":0.001150058794392619,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.001162253890478538,
"Nucleotide GTR":0.001150284309675334,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node355":{
"Global MG94xREV":0.001161057322263676,
"Nucleotide GTR":0.001149100064430567,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"Global MG94xREV":0.001162242332723263,
"Nucleotide GTR":0.001150272870948688,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node366":{
"Global MG94xREV":0.001162028616234562,
"Nucleotide GTR":0.001150061355439309,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node371":{
"Global MG94xREV":0.001161930056691734,
"Nucleotide GTR":0.001149963810921186,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.001161840185716723,
"Nucleotide GTR":0.00114987486549085,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node379":{
"Global MG94xREV":0.001162178507140397,
"Nucleotide GTR":0.001150209702679578,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node385":{
"Global MG94xREV":0.001162011349825676,
"Nucleotide GTR":0.001150044266850155,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.001161730130309483,
"Nucleotide GTR":0.001149765943499552,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node394":{
"Global MG94xREV":0.001162320695707749,
"Nucleotide GTR":0.001150350426904622,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node397":{
"Global MG94xREV":0.001161877216845068,
"Nucleotide GTR":0.001149911515250642,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node401":{
"Global MG94xREV":0.001162344504262365,
"Nucleotide GTR":0.001150373990264602,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.001164248274306412,
"Nucleotide GTR":0.001152258154154125,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node411":{
"Global MG94xREV":0.001161796741319334,
"Nucleotide GTR":0.001149831868509665,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.001161028613572068,
"Nucleotide GTR":0.001149071651398114,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAG", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node420":{
"Global MG94xREV":0.001162354989619493,
"Nucleotide GTR":0.001150384367637295,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.001161774919062385,
"Nucleotide GTR":0.001149810270991277,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.00116256818123927,
"Nucleotide GTR":0.001150595363683162,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.001162022552337631,
"Nucleotide GTR":0.00115005535399199,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node435":{
"Global MG94xREV":0.001162182617860463,
"Nucleotide GTR":0.001150213771065009,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node443":{
"Global MG94xREV":0.001162175318137958,
"Nucleotide GTR":0.00115020654651938,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node444":{
"Global MG94xREV":0.001163032297549678,
"Nucleotide GTR":0.001151054700248177,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.001161968508993569,
"Nucleotide GTR":0.001150001867218382,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node474":{
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node488":{
"Global MG94xREV":0.001161349601069747,
"Nucleotide GTR":0.001149389333175914,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node511":{
"Global MG94xREV":0.001162391687399775,
"Nucleotide GTR":0.001150420687482042,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "C", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "TGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.001642827332845707,
"Nucleotide GTR":0.001625908521330171,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "M", "-", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "ATG", "---", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.0006892431222949963,
"Nucleotide GTR":0.000682144887294066,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "M", "-", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "ATG", "---", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.001174246562952605,
"Nucleotide GTR":0.001162153474486059,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "M", "-", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "ATG", "---", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node558":{
"Global MG94xREV":0.001162383057920888,
"Nucleotide GTR":0.001150412146874654,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "S", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "AGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.001161876815644678,
"Nucleotide GTR":0.00114991111818205,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.001162653506258116,
"Nucleotide GTR":0.00115067980997429,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.001162214134201935,
"Nucleotide GTR":0.00115024496283248,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node664":{
"Global MG94xREV":0.001161641488025312,
"Nucleotide GTR":0.001149678214106266,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"Node687":{
"Global MG94xREV":0.001161698806389269,
"Nucleotide GTR":0.00114973494217167,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACG", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node690":{
"Global MG94xREV":0.00116221407820974,
"Nucleotide GTR":0.001150244907416923,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node76":{
"Global MG94xREV":0.001161898384716699,
"Nucleotide GTR":0.001149932465122958,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node779":{
"Global MG94xREV":0.001162185398602937,
"Nucleotide GTR":0.001150216523169745,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTG", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235969794981,
"Nucleotide GTR":0.00115224597636186,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "K", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAA", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164992992082162,
"Nucleotide GTR":0.001152995202383949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "D", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GAT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "N", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "AAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162602000843601,
"Nucleotide GTR":0.001150628834993124,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "F", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TTT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161998379236314,
"Nucleotide GTR":0.001150031429839626,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACC", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163218062509248,
"Nucleotide GTR":0.00115123855208987,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "F", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TTT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235970654192,
"Nucleotide GTR":0.001152245977212223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGA", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397940755,
"Nucleotide GTR":0.001149870127022242,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TCG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162706251045817,
"Nucleotide GTR":0.001150732011564844,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002327073839528122,
"Nucleotide GTR":0.002303108251126622,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "L", "T", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CTT", "ACT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "I", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ATA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002329724412450789,
"Nucleotide GTR":0.002305731526875207,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "N", "V", "S", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAT", "GTA", "TCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "V", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GTA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161747788603636,
"Nucleotide GTR":0.001149783419938104,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "F", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "TTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164221238817554,
"Nucleotide GTR":0.001152231397092788,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "S", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "TCT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162104417156028,
"Nucleotide GTR":0.001150136375717868,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "F", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTT", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "T", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ACT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "A", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GCG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418764_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161517206687103,
"Nucleotide GTR":0.001149555212691085,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418764_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399876347,
"Nucleotide GTR":0.001149795901332439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACG", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700763978375,
"Nucleotide GTR":0.001150726581006483,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAA", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163056348387928,
"Nucleotide GTR":0.001151078503396611,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCA", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "I", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ATT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001163096961451951,
"Nucleotide GTR":0.00115111869820318,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162461272404068,
"Nucleotide GTR":0.001150489555858636,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAC", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162115170978439,
"Nucleotide GTR":0.001150147018791032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "I", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163218065111402,
"Nucleotide GTR":0.001151238554665228,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "V", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GTT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161374985407473,
"Nucleotide GTR":0.001149414456090656,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACA", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164221238026986,
"Nucleotide GTR":0.001152231396310363,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCT", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "F", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "TTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420241_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397940755,
"Nucleotide GTR":0.001149870127022242,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTC", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420241_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162134370674549,
"Nucleotide GTR":0.001150166020757268,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_420495_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162876428868145,
"Nucleotide GTR":0.001150900436794892,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTA", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420495_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162412096699191,
"Nucleotide GTR":0.001150440886594372,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "L", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTA", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "R", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AGG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCA", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399876347,
"Nucleotide GTR":0.001149795901332439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTG", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162053699329575,
"Nucleotide GTR":0.001150086180213714,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "I", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATT", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421815_England_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001161882962783882,
"Nucleotide GTR":0.001149917202014366,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "T", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "ACC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421815_England_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421841_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163131916429807,
"Nucleotide GTR":0.001151153293193916,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421841_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164005229776702,
"Nucleotide GTR":0.001152017612641324,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "S", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGT", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421929_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421980_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001161747788563446,
"Nucleotide GTR":0.001149783419898327,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "N", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAT", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421980_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162515351365634,
"Nucleotide GTR":0.001150543077882941,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "T", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ACT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001160638901334016,
"Nucleotide GTR":0.001148685952648134,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116197266068186,
"Nucleotide GTR":0.001150005976150119,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATT", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161601097610961,
"Nucleotide GTR":0.001149638239656389,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "K", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAG", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTC", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423110_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162049365681646,
"Nucleotide GTR":0.001150081891196266,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "Q", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CAA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423110_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACG", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423168_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162571829787085,
"Nucleotide GTR":0.001150598974656065,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "L", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CTC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423274_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423274_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423831_England_20200323_null_24":{
"Global MG94xREV":0.001163070211607833,
"Nucleotide GTR":0.001151092223844845,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423831_England_20200323_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00116257175640872,
"Nucleotide GTR":0.001150598902033394,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "TTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424010_England_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162588082371155,
"Nucleotide GTR":0.001150615059861372,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0101097617765056,
"Nucleotide GTR":0.01000564544574831,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "N", "T", "S", "L", "-", "-", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "AAT", "ACT", "AGT", "TTG", "---", "---", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 2, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCG", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544063306,
"Nucleotide GTR":0.001149910849397586,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGC", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162571829787085,
"Nucleotide GTR":0.001150598974656065,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "F", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "TTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425459_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425459_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162651670243715,
"Nucleotide GTR":0.001150677992868258,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162801633955223,
"Nucleotide GTR":0.001150826412164404,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161884759825161,
"Nucleotide GTR":0.001149918980548645,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "F", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TTT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCC", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161499488664848,
"Nucleotide GTR":0.001149537677139546,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "T", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ACT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "S", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TCA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162584929556354,
"Nucleotide GTR":0.00115061193951613,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163422639280295,
"Nucleotide GTR":0.001151441022007836,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "F", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "TTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTC", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164221238817554,
"Nucleotide GTR":0.001152231397092788,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "L", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CTG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360564125,
"Nucleotide GTR":0.001149834460779917,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTG", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360498497,
"Nucleotide GTR":0.001149834460714965,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "R", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CGA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161609819747982,
"Nucleotide GTR":0.001149646871967663,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "V", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "GTG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162134370674365,
"Nucleotide GTR":0.001150166020757085,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161972624832467,
"Nucleotide GTR":0.001150005940669925,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "I", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "ATC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161747788563446,
"Nucleotide GTR":0.001149783419898327,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162135308093045,
"Nucleotide GTR":0.001150166948521671,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTA", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429053_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360498497,
"Nucleotide GTR":0.001149834460714965,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "D", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "GAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429053_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162115170978439,
"Nucleotide GTR":0.001150147018791032,
"amino-acid": [
["R", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["CGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430013_Amman_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162672742858987,
"Nucleotide GTR":0.001150698848465223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTT", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430013_Amman_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360498497,
"Nucleotide GTR":0.001149834460714965,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "V", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "GTT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162571829917285,
"Nucleotide GTR":0.001150598974784925,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "V", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GTT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAC", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430952_Idaho_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360564125,
"Nucleotide GTR":0.001149834460779917,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAG", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430952_Idaho_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162401022070908,
"Nucleotide GTR":0.001150429926019187,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "C", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TGT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001161799360564125,
"Nucleotide GTR":0.001149834460779917,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "V", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "GTG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162541860336201,
"Nucleotide GTR":0.001150569313848385,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCC", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432822_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162618075345663,
"Nucleotide GTR":0.001150644743950416,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432822_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432991_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001174393720744327,
"Nucleotide GTR":0.001162299116759448,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "-", "-", "-", "S", "L", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "---", "---", "---", "AGT", "TTG", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432991_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433005_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162289974339965,
"Nucleotide GTR":0.001150320021923726,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "I", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "ATA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433005_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433038_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162480381060995,
"Nucleotide GTR":0.001150508467723267,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "V", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GTC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433038_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433563_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161747788563446,
"Nucleotide GTR":0.001149783419898327,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "F", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "TTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433563_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433575_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161843810649635,
"Nucleotide GTR":0.001149878453092048,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "V", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GTC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433575_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433999_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161898907895111,
"Nucleotide GTR":0.001149932982913369,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "R", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AGA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433999_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434066_Washington_20200402_null_59":{
"Global MG94xREV":0.001161976077912225,
"Nucleotide GTR":0.001150009358187818,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAC", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434066_Washington_20200402_null_59",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161843810583158,
"Nucleotide GTR":0.001149878453026255,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "V", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GTC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434637_Florida_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162160694849866,
"Nucleotide GTR":0.001150192073830594,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAA", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434637_Florida_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162026853790898,
"Nucleotide GTR":0.001150059611146337,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "D", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "GAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001166007213459364,
"Nucleotide GTR":0.001153998978707082,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "-", "R", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "---", "CGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435150_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "S", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435150_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435418_Baranya_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "S", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AGT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435418_Baranya_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235970654192,
"Nucleotide GTR":0.001152245977212223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "M", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "ATG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435645_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335566578,
"Nucleotide GTR":0.001149870065290429,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACC", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435645_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161662821504522,
"Nucleotide GTR":0.001149699327880638,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTC", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399876347,
"Nucleotide GTR":0.001149795901332439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "S", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AGT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "S", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "AGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162386966507681,
"Nucleotide GTR":0.0011504160152085,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAT", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436730_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "V", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GTT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436730_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "G", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GGT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436959_LA_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161540976688244,
"Nucleotide GTR":0.001149578737894639,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700764045572,
"Nucleotide GTR":0.001150726581072988,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "T", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "ACC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162207698708159,
"Nucleotide GTR":0.001150238593615239,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "V", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "GTC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700763906664,
"Nucleotide GTR":0.001150726580935509,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "T", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "ACT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437525_Oregon_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162466670457502,
"Nucleotide GTR":0.001150494898319711,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437525_Oregon_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162344585736653,
"Nucleotide GTR":0.001150374070899819,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTA", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437703_Makkah_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162334034566076,
"Nucleotide GTR":0.001150363628391464,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTT", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437703_Makkah_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438405_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001180562923772342,
"Nucleotide GTR":0.001168404785670916,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "-", "-", "-", "-", "I", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "---", "---", "---", "---", "ATT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438405_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001161832862863067,
"Nucleotide GTR":0.001149867618052289,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACG", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438715_England_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "V", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "GTG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163093299558438,
"Nucleotide GTR":0.001151115074022022,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "I", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATT", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "Y", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TAT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001170565606021463,
"Nucleotide GTR":0.001158510426235439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "L", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "CTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439428_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001161799360564125,
"Nucleotide GTR":0.001149834460779917,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "V", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "GTG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439428_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439498_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161609890076666,
"Nucleotide GTR":0.001149646941572059,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "V", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "GTG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439498_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439596_England_20200324_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001164005229776702,
"Nucleotide GTR":0.001152017612641324,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "Y", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "TAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439596_England_20200324_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439605_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163094616168649,
"Nucleotide GTR":0.001151116377072999,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "I", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "ATC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439605_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439717_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162398991629371,
"Nucleotide GTR":0.001150427916488343,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "R", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "CGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439717_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439745_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335498159,
"Nucleotide GTR":0.001149870065222714,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGC", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439745_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439926_England_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163233165084973,
"Nucleotide GTR":0.001151253499130302,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCT", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439926_England_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440086_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162477939807953,
"Nucleotide GTR":0.001150506051611697,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "S", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "TCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440086_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440194_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "C", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "TGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440194_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440200_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "I", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "ATA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440200_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440236_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116295812797227,
"Nucleotide GTR":0.001150981294513126,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440236_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440451_England_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162284734177439,
"Nucleotide GTR":0.001150314835727506,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAC", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440451_England_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440617_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTT", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440617_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162436944556849,
"Nucleotide GTR":0.001150465478554035,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440722_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440751_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162220031720326,
"Nucleotide GTR":0.001150250799614724,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "V", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GTT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440751_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440879_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161832862863067,
"Nucleotide GTR":0.001149867618052289,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "G", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GGT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440879_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440892_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "T", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ACA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440892_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440918_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162582502400639,
"Nucleotide GTR":0.001150609537356705,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGG", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440918_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440938_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162986224098108,
"Nucleotide GTR":0.001151009101288372,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "Y", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TAT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440938_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440980_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTC", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440980_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441065_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163254142712848,
"Nucleotide GTR":0.001151274260718106,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "S", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "TCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441065_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441093_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161760399876347,
"Nucleotide GTR":0.001149795901332439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAG", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441093_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441313_England_20200402_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "V", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GTA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441313_England_20200402_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "I", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ATA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161804001456468,
"Nucleotide GTR":0.001149839053877594,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165167627273163,
"Nucleotide GTR":0.00115316803907804,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "Q", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CAA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441893_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162314333068353,
"Nucleotide GTR":0.001150344129791465,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "K", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AAA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441893_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442215_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162466461680382,
"Nucleotide GTR":0.001150494691692701,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCC", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442215_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442243_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161898908061616,
"Nucleotide GTR":0.001149932983078158,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442243_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442320_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442320_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442367_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161239001838933,
"Nucleotide GTR":0.001149279872961663,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442367_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442426_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "L", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "CTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442426_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442452_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "A", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GCT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442452_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442599_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162220020390414,
"Nucleotide GTR":0.001150250788401494,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "V", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GTT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442599_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442615_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164221238026986,
"Nucleotide GTR":0.001152231396310363,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATT", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442615_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442797_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163044329363642,
"Nucleotide GTR":0.001151066608151374,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442797_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442823_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164221238026986,
"Nucleotide GTR":0.001152231396310363,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACT", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442823_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442886_England_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001161799360564125,
"Nucleotide GTR":0.001149834460779917,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "R", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AGG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442886_England_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442943_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162134370674365,
"Nucleotide GTR":0.001150166020757085,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "I", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATA", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442943_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442949_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161747788603636,
"Nucleotide GTR":0.001149783419938104,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "V", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GTT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442949_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443052_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162709472490536,
"Nucleotide GTR":0.001150735199833211,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443052_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443056_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161787378939995,
"Nucleotide GTR":0.001149822602549668,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "S", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TCA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443056_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "S", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "AGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443396_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "A", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GCA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443396_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "R", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CGA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443445_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443517_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162115170978439,
"Nucleotide GTR":0.001150147018791032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "N", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAT", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443517_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443621_England_20200416_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162207777136574,
"Nucleotide GTR":0.001150238671235952,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACG", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443621_England_20200416_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443642_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGT", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443642_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162207698708159,
"Nucleotide GTR":0.001150238593615239,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "A", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "GCA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443658_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443748_England_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443748_England_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443788_England_20200326_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162925457590145,
"Nucleotide GTR":0.001150948960589996,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443788_England_20200326_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444112_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162467038984832,
"Nucleotide GTR":0.001150495263051726,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444112_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444373_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161217159366055,
"Nucleotide GTR":0.001149258255435542,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444373_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444410_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161279331063223,
"Nucleotide GTR":0.001149319786851649,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "V", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "GTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444410_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444415_England_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162666119481161,
"Nucleotide GTR":0.001150692293298874,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444415_England_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGG", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444640_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCT", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444640_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235970517453,
"Nucleotide GTR":0.001152245977076891,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "I", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "ATT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162333821499794,
"Nucleotide GTR":0.001150363417519465,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTA", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161522036323531,
"Nucleotide GTR":0.00114955999258905,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCC", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001164235970654192,
"Nucleotide GTR":0.001152245977212223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCA", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444935_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTC", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444935_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445073_Luxembourg_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAC", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445073_Luxembourg_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235969794875,
"Nucleotide GTR":0.001152245976361756,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCA", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445296_Coyhaique_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360564125,
"Nucleotide GTR":0.001149834460779917,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "E", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "GAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445296_Coyhaique_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360498497,
"Nucleotide GTR":0.001149834460714965,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "C", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TGT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAC", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446178_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235970654192,
"Nucleotide GTR":0.001152245977212223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTA", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446178_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116303290058849,
"Nucleotide GTR":0.001151055297076535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446221_Wales_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446221_Wales_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161799360498497,
"Nucleotide GTR":0.001149834460714965,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "R", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AGA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446527_Wales_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162104417156028,
"Nucleotide GTR":0.001150136375717868,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "F", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "TTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446527_Wales_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGT", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446904_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116315474800423,
"Nucleotide GTR":0.001151175889635226,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "F", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTT", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446904_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTC", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACG", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162541860295951,
"Nucleotide GTR":0.001150569313808551,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTC", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001170606390506043,
"Nucleotide GTR":0.001158550790697176,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "P", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "CCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002329881795897455,
"Nucleotide GTR":0.002305887289493675,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "S", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "L", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "TCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "TTA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163218065110291,
"Nucleotide GTR":0.001151238554664127,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "V", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GTT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161475117993626,
"Nucleotide GTR":0.00114951355745197,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAC", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164005230611993,
"Nucleotide GTR":0.001152017613468011,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "F", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "TTT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002327640009096567,
"Nucleotide GTR":0.002303668589944614,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "T", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "I", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "ACA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116255062838993,
"Nucleotide GTR":0.001150577991603489,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "I", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "ATC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "S", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "TCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116254108853302,
"Nucleotide GTR":0.001150568549993691,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "R", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CGG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "P", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "CCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448208_Scotland_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161160436176608,
"Nucleotide GTR":0.001149202116415187,
"amino-acid": [
["G", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["GGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448208_Scotland_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448292_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162333563068168,
"Nucleotide GTR":0.001150363161749321,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "F", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TTC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448292_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448295_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116133783625556,
"Nucleotide GTR":0.001149377689522771,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "S", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "AGT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448295_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448342_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAC", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448342_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448409_England_20200429_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001161760399876347,
"Nucleotide GTR":0.001149795901332439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "V", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "GTA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448409_England_20200429_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448528_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "L", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CTT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448528_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448721_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116147861101686,
"Nucleotide GTR":0.001149517014501976,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "E", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "GAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448721_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448788_England_20200408_null_140":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448788_England_20200408_null_140",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449249_Scotland_20200427_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "L", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "CTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449249_Scotland_20200427_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449276_Scotland_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTT", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449276_Scotland_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449373_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162960417519017,
"Nucleotide GTR":0.001150983560480759,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449373_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449465_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162571829863346,
"Nucleotide GTR":0.001150598974731539,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATT", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449465_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449538_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162284733862799,
"Nucleotide GTR":0.001150314835416108,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "T", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ACC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449538_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449717_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162700764045572,
"Nucleotide GTR":0.001150726581072988,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "I", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATA", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449717_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162344585736653,
"Nucleotide GTR":0.001150374070899819,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "Y", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TAC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162571829787085,
"Nucleotide GTR":0.001150598974656065,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAT", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "R", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "CGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161996984485795,
"Nucleotide GTR":0.001150030049453076,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "T", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ACG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAC", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162511589917631,
"Nucleotide GTR":0.001150539355172561,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162333921353564,
"Nucleotide GTR":0.001150363516344881,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTT", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161972549689262,
"Nucleotide GTR":0.001150005866300589,
"amino-acid": [
["S", "A", "M", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "ATG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001161941733129112,
"Nucleotide GTR":0.001149975367107678,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGC", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "N", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "AAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235969794875,
"Nucleotide GTR":0.001152245976361756,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCA", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162207777136574,
"Nucleotide GTR":0.001150238671235952,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "G", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GGT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451472_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161736498161941,
"Nucleotide GTR":0.001149772245772083,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "TTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451472_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451547_New_South_Wales_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451547_New_South_Wales_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162858580599197,
"Nucleotide GTR":0.001150882772338018,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451612_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCT", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451612_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162700763906664,
"Nucleotide GTR":0.001150726580935509,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "I", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "ATC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451744_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161918793923439,
"Nucleotide GTR":0.001149952664143568,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "S", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "TCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451744_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116197262500507,
"Nucleotide GTR":0.001150005940840751,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "I", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATA", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162386966642819,
"Nucleotide GTR":0.001150416015342244,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "I", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ATT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452095_Denmark_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001686703406948027,
"Nucleotide GTR":0.001669332733564273,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "S", "L", "-", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "AGT", "TTG", "---", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452095_Denmark_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452199_Maharashtra_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTT", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452199_Maharashtra_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162605006999164,
"Nucleotide GTR":0.001150631810189511,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "L", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "CTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162989229027327,
"Nucleotide GTR":0.001151012075271044,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452584_Andalusia_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTC", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452584_Andalusia_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCC", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399792864,
"Nucleotide GTR":0.001149795901249817,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAG", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "I", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ATT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452914_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163562394896258,
"Nucleotide GTR":0.001151579338337467,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "H", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAT", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452914_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452929_England_20200512_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "F", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "TTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452929_England_20200512_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453002_England_20200517_null_36":{
"Global MG94xREV":0.001161835397872404,
"Nucleotide GTR":0.001149870126954594,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "CTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453002_England_20200517_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162665698942772,
"Nucleotide GTR":0.001150691877091439,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453093_Scotland_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116176001812842,
"Nucleotide GTR":0.001149795523515978,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "F", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "TTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453093_Scotland_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453245_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "V", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453245_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453312_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161798422369018,
"Nucleotide GTR":0.001149833532246901,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "E", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "GAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453312_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453410_England_20200409_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTT", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453410_England_20200409_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453430_England_20200405_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453430_England_20200405_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163047025250261,
"Nucleotide GTR":0.001151069276274152,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453489_England_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001161799360498497,
"Nucleotide GTR":0.001149834460714965,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCG", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453489_England_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453696_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "F", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "TTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453696_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453757_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453757_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161832885181648,
"Nucleotide GTR":0.001149867640141019,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "G", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GGA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454138_Portugal_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTT", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454138_Portugal_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161835397868497,
"Nucleotide GTR":0.001149870126950727,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAC", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454236_Portugal_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162612870272508,
"Nucleotide GTR":0.001150639592482195,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454236_Portugal_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454400_Pennsylvania_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454400_Pennsylvania_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162207698708159,
"Nucleotide GTR":0.001150238593615239,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "C", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TGC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164235970654192,
"Nucleotide GTR":0.001152245977212223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTA", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162125197004992,
"Nucleotide GTR":0.001150156941563609,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTT", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "L", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CTT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "N", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "AAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162435393527076,
"Nucleotide GTR":0.001150463943497688,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162602026516983,
"Nucleotide GTR":0.001150628860402105,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTT", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001160425115285676,
"Nucleotide GTR":0.001148474368295482,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCG", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161796232770956,
"Nucleotide GTR":0.00114983136519862,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163056346951992,
"Nucleotide GTR":0.001151078501975465,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "Y", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TAT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163056348388326,
"Nucleotide GTR":0.001151078503397006,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTA", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455400_Hubei_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162737885609046,
"Nucleotide GTR":0.001150763320336554,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTT", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455400_Hubei_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001161835335498159,
"Nucleotide GTR":0.001149870065222714,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTC", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835397940755,
"Nucleotide GTR":0.001149870127022242,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "T", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ACA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "L", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CTT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162395913018324,
"Nucleotide GTR":0.001150424869582663,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCA", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCT", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455768_Odisha_20200507_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455768_Odisha_20200507_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455941_Bangkok_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001161233589287161,
"Nucleotide GTR":0.001149274516151564,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455941_Bangkok_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455966_Li_ge_20200509_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001161747788563446,
"Nucleotide GTR":0.001149783419898327,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "F", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "TTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455966_Li_ge_20200509_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456138_Cali_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "V", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GTC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456138_Cali_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456175_Auckland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "G", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "GGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456175_Auckland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456208_Auckland_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163218065110291,
"Nucleotide GTR":0.001151238554664127,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "F", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "TTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456208_Auckland_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456219_Southern_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001161832885245521,
"Nucleotide GTR":0.001149867640204236,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "V", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "GTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456219_Southern_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456519_Victoria_20200512_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCT", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456519_Victoria_20200512_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "R", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CGA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456613_Victoria_20200515_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "A", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GCG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456613_Victoria_20200515_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456630_Victoria_20200429_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001162489870319461,
"Nucleotide GTR":0.001150517859255713,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456630_Victoria_20200429_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456685_England_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456685_England_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456829_Scotland_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001159487380311525,
"Nucleotide GTR":0.001147546290672996,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456829_Scotland_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456848_Scotland_20200507_null_33":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTT", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456848_Scotland_20200507_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456860_Scotland_20200510_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001163619048912065,
"Nucleotide GTR":0.001151635408896576,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "I", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "ATA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456860_Scotland_20200510_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001161790029507247,
"Nucleotide GTR":0.001149825225819805,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAG", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456887_Scotland_20200510_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAG", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456887_Scotland_20200510_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456909_Scotland_20200403_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456909_Scotland_20200403_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457166_England_20200403_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001162541857182835,
"Nucleotide GTR":0.001150569310727493,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "L", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "CTG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457166_England_20200403_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457240_England_20200429_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAT", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457240_England_20200429_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457247_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCC", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457247_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457264_England_20200507_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162700764104974,
"Nucleotide GTR":0.001150726581131778,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "S", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "AGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457264_England_20200507_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457270_England_20200417_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457270_England_20200417_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457396_England_20200430_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "V", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "GTG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457396_England_20200430_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457454_England_20200508_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162700837555398,
"Nucleotide GTR":0.001150726653825764,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "N", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "AAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457454_England_20200508_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457486_England_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162134370680186,
"Nucleotide GTR":0.001150166020762846,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "I", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "ATT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457486_England_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457510_England_20200506_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001161835397940755,
"Nucleotide GTR":0.001149870127022242,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "A", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GCT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457510_England_20200506_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457520_England_20200511_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "R", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CGG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457520_England_20200511_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457556_England_20200512_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457556_England_20200512_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457664_England_20200501_null_41":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457664_England_20200501_null_41",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457802_Maryland_20200310_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001161876544002123,
"Nucleotide GTR":0.001149910849337032,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "T", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ACT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457802_Maryland_20200310_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457805_Washington_DC_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116292783051226,
"Nucleotide GTR":0.00115095130907435,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457805_Washington_DC_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457816_Maryland_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001162672742858987,
"Nucleotide GTR":0.001150698848465223,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "I", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATT", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457816_Maryland_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457972_Montevideo_20200421_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTG", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457972_Montevideo_20200421_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457993_Dakhiliyah_20200324_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "I", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATT", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457993_Dakhiliyah_20200324_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458077_Telangana_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001161793261304025,
"Nucleotide GTR":0.00114982842433362,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTA", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458077_Telangana_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCG", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335652263,
"Nucleotide GTR":0.001149870065375232,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "CTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458196_Frameries_20200329_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001161843810649635,
"Nucleotide GTR":0.001149878453092048,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458196_Frameries_20200329_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458221_Malle_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162220031720326,
"Nucleotide GTR":0.001150250799614724,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "I", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ATT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458221_Malle_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458229_Scherpenheuvel_Zichem_20200319_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458229_Scherpenheuvel_Zichem_20200319_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458234_Leuven_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001160834921819636,
"Nucleotide GTR":0.00114887995439838,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "D", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "GAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458234_Leuven_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458237_California_20200429_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "N", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAT", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458237_California_20200429_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458337_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "F", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "TTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458337_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458431_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011623897029444,
"Nucleotide GTR":0.001150418723463768,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458431_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458545_England_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "G", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458545_England_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458565_England_20200507_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCT", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458565_England_20200507_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458709_England_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001171156866275646,
"Nucleotide GTR":0.001159095597340387,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "F", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTC", "---", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458709_England_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458750_England_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAT", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458750_England_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458825_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "I", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ATA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458825_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458888_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATT", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458888_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459024_England_20200410_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTT", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459024_England_20200410_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459037_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001170281750766112,
"Nucleotide GTR":0.001158229494290084,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "S", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TCT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459037_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459069_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162986224098108,
"Nucleotide GTR":0.001151009101288372,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "L", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTA", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459069_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459082_England_20200410_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459082_England_20200410_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459205_England_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001161747788603636,
"Nucleotide GTR":0.001149783419938104,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTT", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459205_England_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459207_England_20200507_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001167196309022819,
"Nucleotide GTR":0.001155175828258244,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "M", "-", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "ATG", "---", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459207_England_20200507_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459209_England_20200506_null_52":{
"Global MG94xREV":0.001162251034311096,
"Nucleotide GTR":0.001150281482922402,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459209_England_20200506_null_52",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459293_England_20200502_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459293_England_20200502_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459306_England_20200501_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "C", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TGT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459306_England_20200501_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459351_Northern_Ireland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162126123916276,
"Nucleotide GTR":0.001150157858929009,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATA", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459351_Northern_Ireland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459405_Northern_Ireland_20200410_null_71":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459405_Northern_Ireland_20200410_null_71",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459408_Northern_Ireland_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162532291860092,
"Nucleotide GTR":0.001150559843914125,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459408_Northern_Ireland_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459429_England_20200429_null_101":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459429_England_20200429_null_101",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459432_England_20200429_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459432_England_20200429_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459453_England_20200426_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459453_England_20200426_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459484_England_20200427_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "TTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459484_England_20200427_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459510_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161809223244741,
"Nucleotide GTR":0.00114984422188879,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "G", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459510_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459562_Scotland_20200323_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001162104417156028,
"Nucleotide GTR":0.001150136375717868,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "H"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_459562_Scotland_20200323_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459574_Scotland_20200324_null_115":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459574_Scotland_20200324_null_115",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162501961480191,
"Nucleotide GTR":0.00115052982589449,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTT", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459724_Scotland_20200324_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001162617835107956,
"Nucleotide GTR":0.00115064450618682,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATT", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459724_Scotland_20200324_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAT", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460055_Minnesota_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460055_Minnesota_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460146_Massachusetts_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161835335498159,
"Nucleotide GTR":0.001149870065222714,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "S", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TCG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460146_Massachusetts_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460316_Massachusetts_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460316_Massachusetts_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460327_Massachusetts_20200403_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001161760399952088,
"Nucleotide GTR":0.001149795901407401,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "V", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "GTT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460327_Massachusetts_20200403_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001162495109818889,
"Nucleotide GTR":0.001150523044795664,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460421_Massachusetts_20200325_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460421_Massachusetts_20200325_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460459_Massachusetts_20200327_null_49":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460459_Massachusetts_20200327_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460561_Michigan_20200429_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460561_Michigan_20200429_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460790_Noord_Holland_20200414_null_23":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460790_Noord_Holland_20200414_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460793_Noord_Holland_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466670437791,
"Nucleotide GTR":0.001150494898300202,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "TTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460793_Noord_Holland_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161843372066113,
"Nucleotide GTR":0.00114987801902532,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "V", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GTT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461034_Limburg_20200407_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461034_Limburg_20200407_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161222436355958,
"Nucleotide GTR":0.001149263478079869,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161943393549597,
"Nucleotide GTR":0.001149977010428165,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "S", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "TCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461064_Netherlands_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "V", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "GTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461064_Netherlands_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161747788603636,
"Nucleotide GTR":0.001149783419938104,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "F", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTT", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162515351365634,
"Nucleotide GTR":0.001150543077882941,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "L", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "CTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461145_Netherlands_20200513_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461145_Netherlands_20200513_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466598592548,
"Nucleotide GTR":0.001150494827194863,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "F", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "TTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "F", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "TTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461203_Noord_Brabant_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001162466670525499,
"Nucleotide GTR":0.001150494898387008,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461203_Noord_Brabant_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461221_Noord_Holland_20200519_null_57":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461221_Noord_Holland_20200519_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461288_Zeeland_20200402_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461288_Zeeland_20200402_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001163254152969475,
"Nucleotide GTR":0.001151274270869105,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461366_Zuid_Holland_20200511_null_49":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461366_Zuid_Holland_20200511_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_273":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_273",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461449_Washington_20200411_null_32209":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461449_Washington_20200411_null_32209",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461466_Washington_20200529_null_3988":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461466_Washington_20200529_null_3988",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10114.02639462165,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01643883270275011],
[0.01048652203860648],
[0.01336508260052877],
[0.03066910780038295],
[0.01386979166386406],
[0.008847700964172398],
[0.01127640353737873],
[0.02587617645361992],
[0.01129865287177364],
[0.00720754170863952],
[0.009186018961108704],
[0.02107933143364625],
[0.02871458177752631],
[0.01831736474749956],
[0.02334549929643573],
[0.05357135873951312],
[0.0072725278907833],
[0.004639229888282822],
[0.00591270303266165],
[0.01356799146854334],
[0.006135985963159685],
[0.003914216611042556],
[0.004988672901306118],
[0.01144760205110542],
[0.004998515991011101],
[0.003188611323436353],
[0.004063888252159848],
[0.009325481227423854],
[0.01270331054675813],
[0.008103589130726757],
[0.01032803227744921],
[0.02369993098811021],
[0.01381262448958816],
[0.008811233360677125],
[0.01122992554103606],
[0.02576952251643268],
[0.01165400411731939],
[0.00743422438953561],
[0.009474926259747076],
[0.02174229247557105],
[0.009493621121279962],
[0.006056091020247892],
[0.007718493931920397],
[0.01771177399571798],
[0.02412724447291134],
[0.01539104907696421],
[0.01961590711058611],
[0.04501299301757119],
[0.01227084340761314],
[0.0358875724367157],
[0.01622978915000787],
[0.01035317073182584],
[0.01319512622953653],
[0.03027910570169657],
[0.008433932178366814],
[0.01074905481494692],
[0.02466605936717442],
[0.03360047642201397],
[0.02143413360780664],
[0.02731782425903082],
[0.06268672795475173]
],
"Log Likelihood":-4565.951166863585,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6736549192607624, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":489
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":10851.90853115576,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2413599357871804],
[0.1653078775369797],
[0.1973569544776975],
[0.3959752321981424]
],
"Log Likelihood":-4617.087327865828,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2037779889461923,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1272588119798663,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.06267433031929058,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.098347573389186,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.587440982285384
},
"display order":0,
"estimated parameters":807
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-06/sequences.nsp6.compressed.fas",
"number of sequences":401,
"number of sites":291,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_442452_England_20200406_null_1,epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1,epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1,epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1,epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2,epi_isl_443517_England_20200416_null_1,epi_isl_442426_England_20200408_null_1,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_448295_England_20200415_null_1,epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_442943_England_20200408_null_1,epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5,epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3,(epi_isl_441065_England_20200401_null_1,epi_isl_456909_Scotland_20200403_null_7)Node779,epi_isl_451744_Vaud_20200325_null_1,epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1,epi_isl_437525_Oregon_20200420_null_4,epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1,epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3,epi_isl_440980_England_20200331_null_1,epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_461449_Washington_20200411_null_32209,epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1,epi_isl_441313_England_20200402_null_5,epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1,epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1,epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3,epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1,epi_isl_435645_California_20200313_null_1,epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1,epi_isl_456219_Southern_20200321_null_4,epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1,epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1,epi_isl_434066_Washington_20200402_null_59,epi_isl_442615_England_20200408_null_1,epi_isl_457520_England_20200511_null_8,epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1,epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1,epi_isl_451472_New_York_20200320_null_1,epi_isl_460327_Massachusetts_20200403_null_16,epi_isl_435418_Baranya_20200402_null_1,(epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_440194_England_20200318_null_1)Node511,epi_isl_442243_England_20200406_null_2,epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1,epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_448208_Scotland_20200422_null_2,epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2,epi_isl_457264_England_20200507_null_4,epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1,epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_421980_England_20200331_null_6,epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1,epi_isl_458337_England_20200501_null_3,epi_isl_456175_Auckland_20200317_null_2,epi_isl_433999_England_20200413_null_1,epi_isl_459037_England_20200409_null_1,epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1,epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5,epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_2,epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2,(((epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_452095_Denmark_20200414_null_1)Node553,epi_isl_459207_England_20200507_null_10)Node552,epi_isl_438405_England_20200330_null_1)Node551,(epi_isl_432991_England_20200401_null_1,epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2)Node558,(epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2,epi_isl_460316_Massachusetts_20200322_null_5)Node565,epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,epi_isl_441093_England_20200401_null_2,epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_452584_Andalusia_20200328_null_1,epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1,epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1,epi_isl_445296_Coyhaique_20200321_null_1,epi_isl_460146_Massachusetts_20200321_null_1,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_443396_England_20200415_null_1,epi_isl_448292_England_20200413_null_1,epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1,epi_isl_453696_England_20200420_null_2,epi_isl_439428_England_20200331_null_3,epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2,(epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1,epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2,epi_isl_461221_Noord_Holland_20200519_null_57)Node488,epi_isl_459209_England_20200506_null_52,epi_isl_451612_New_South_Wales_20200320_null_1,epi_isl_435150_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1,epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2,epi_isl_457396_England_20200430_null_4,epi_isl_429053_California_20200408_null_1,epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1,epi_isl_459306_England_20200501_null_7,(epi_isl_441893_England_20200430_null_1,epi_isl_458237_California_20200429_null_8)Node618,epi_isl_440892_England_20200421_null_1,epi_isl_457972_Montevideo_20200421_null_8,epi_isl_456519_Victoria_20200512_null_9,epi_isl_430952_Idaho_20200328_null_1,epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_460793_Noord_Holland_20200330_null_3,(epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1,epi_isl_423831_England_20200323_null_24,epi_isl_453757_England_20200422_null_1)Node379,(epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_432822_England_20200406_null_1)Node346,(epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1)Node343,(epi_isl_418764_England_20200318_null_1,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3)Node340,(epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2,epi_isl_442320_England_20200405_null_2)Node337,(epi_isl_421841_England_20200323_null_1,epi_isl_460561_Michigan_20200429_null_17)Node334,(epi_isl_440086_England_20200323_null_2,epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1)Node331,(epi_isl_433038_England_20200403_null_2,epi_isl_456138_Cali_20200316_null_2)Node328,(epi_isl_439926_England_20200324_null_4,epi_isl_444640_New_York_20200330_null_1)Node325,(epi_isl_454236_Portugal_20200320_null_4,epi_isl_454400_Pennsylvania_20200101_null_2)Node322,(epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2,epi_isl_456630_Victoria_20200429_null_9)Node297,(epi_isl_440236_England_20200319_null_3,epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_273)Node294,(epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1,epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2)Node291,(epi_isl_425459_England_20200331_null_1,epi_isl_444112_England_20200406_null_3)Node288,(epi_isl_444410_England_20200420_null_1,epi_isl_461064_Netherlands_20200324_null_5)Node285,(epi_isl_440617_England_20200401_null_1,epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1)Node282,(epi_isl_444373_England_20200429_null_1,epi_isl_459432_England_20200429_null_16)Node279,(epi_isl_440722_England_20200405_null_2,epi_isl_460790_Noord_Holland_20200414_null_23)Node276,(epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8,epi_isl_461366_Zuid_Holland_20200511_null_49)Node273,(epi_isl_449276_Scotland_20200419_null_2,epi_isl_455400_Hubei_20200302_null_1)Node270,(epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1,epi_isl_460421_Massachusetts_20200325_null_21)Node267,(epi_isl_458431_England_20200501_null_1,epi_isl_459082_England_20200410_null_39)Node264,((epi_isl_452914_England_20200507_null_1,epi_isl_455768_Odisha_20200507_null_3)Node260,epi_isl_458565_England_20200507_null_18)Node259,((epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1,epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1)Node255,(epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1,epi_isl_423274_England_20200320_null_2)Node252,epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,epi_isl_439605_England_20200328_null_2,epi_isl_442215_England_20200405_null_2,epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1,epi_isl_461466_Washington_20200529_null_3988,(epi_isl_423110_England_20200324_null_1,epi_isl_443445_England_20200416_null_1)Node234,epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1,epi_isl_433005_England_20200402_null_1,epi_isl_439498_England_20200401_null_1,epi_isl_422000_England_20200402_null_1,epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1,epi_isl_443056_England_20200411_null_2,epi_isl_420495_England_20200319_null_1,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_440938_England_20200426_null_1,epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9,epi_isl_459069_England_20200410_null_1,epi_isl_442599_England_20200407_null_1,epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1,epi_isl_440751_England_20200403_null_1,epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1,epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_458221_Malle_20200330_null_3,epi_isl_440451_England_20200311_null_2,epi_isl_456208_Auckland_20200320_null_1,epi_isl_421929_England_20200329_null_1,epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1,epi_isl_439717_England_20200408_null_1,epi_isl_443621_England_20200416_null_9,epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2,epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1,epi_isl_439596_England_20200324_null_8,epi_isl_449538_England_20200330_null_3,epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1,epi_isl_443658_England_20200417_null_2,epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1,epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1,epi_isl_446904_Wales_20200416_null_1,(epi_isl_456829_Scotland_20200506_null_1,epi_isl_458709_England_20200326_null_8,epi_isl_459574_Scotland_20200324_null_115)Node245,epi_isl_459724_Scotland_20200324_null_10)Node163,epi_isl_458077_Telangana_20200418_null_4,(epi_isl_457270_England_20200417_null_9,epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2)Node308,(epi_isl_451547_New_South_Wales_20200401_null_4,epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1)Node302,(epi_isl_458545_England_20200508_null_1,epi_isl_459510_Scotland_20200327_null_1)Node305,(epi_isl_457556_England_20200512_null_22,epi_isl_457805_Washington_DC_20200313_null_1)Node319,(epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3,epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24)Node313,(epi_isl_443748_England_20200327_null_7,epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1)Node316,(epi_isl_455941_Bangkok_20200315_null_3,epi_isl_442367_England_20200417_null_1,epi_isl_460459_Massachusetts_20200327_null_49)Node355,(epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2,epi_isl_457664_England_20200501_null_41)Node351,epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1,(epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1)Node361,epi_isl_434637_Florida_20200327_null_2,(epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1,epi_isl_445675_Wales_20200406_null_9)Node366,epi_isl_459351_Northern_Ireland_20200419_null_1,(epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_7,epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1)Node371,(epi_isl_442797_England_20200407_null_2,epi_isl_440918_England_20200419_null_1,epi_isl_459429_England_20200429_null_101)Node374,(epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1,epi_isl_456685_England_20200101_null_4)Node385,epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1,(epi_isl_443788_England_20200326_null_9,epi_isl_459293_England_20200502_null_28)Node397,(epi_isl_461034_Limburg_20200407_null_37,epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1)Node391,(epi_isl_459453_England_20200426_null_36,epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1)Node394,(epi_isl_459408_Northern_Ireland_20200421_null_1,epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1,epi_isl_459405_Northern_Ireland_20200410_null_71)Node401,(epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1,epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5)Node406,epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1,(epi_isl_444415_England_20200420_null_5,epi_isl_460055_Minnesota_20200323_null_8)Node411,(epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2,epi_isl_456887_Scotland_20200510_null_5)Node414,(epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2,epi_isl_459024_England_20200410_null_4)Node426,(epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1,epi_isl_461145_Netherlands_20200513_null_14)Node420,(epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1,epi_isl_446221_Wales_20200406_null_7)Node423,(epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1,epi_isl_449373_England_20200328_null_1,epi_isl_461288_Zeeland_20200402_null_12)Node435,(epi_isl_443052_England_20200412_null_1,epi_isl_453430_England_20200405_null_20)Node431,epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1,epi_isl_421815_England_20200325_null_5,epi_isl_453093_Scotland_20200419_null_3,((epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3,epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1)Node444,epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_10)Node443,(epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1,epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1,epi_isl_457993_Dakhiliyah_20200324_null_14)Node448,epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3,epi_isl_459562_Scotland_20200323_null_18,epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1,epi_isl_436730_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_455966_Li_ge_20200509_null_9,epi_isl_457802_Maryland_20200310_null_8,epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_439745_England_20200408_null_1,epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1,epi_isl_453002_England_20200517_null_36,epi_isl_440200_England_20200315_null_1,epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1,epi_isl_449465_England_20200402_null_3,epi_isl_458750_England_20200418_null_4,epi_isl_456848_Scotland_20200507_null_33,epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3,epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1,epi_isl_458888_England_20200414_null_1,(epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1,epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5)Node641,epi_isl_457816_Maryland_20200324_null_6,epi_isl_452929_England_20200512_null_5,epi_isl_436959_LA_20200405_null_2,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_458825_England_20200331_null_1,epi_isl_457247_England_20200513_null_1,epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_2,epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1,epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1,epi_isl_453245_England_20200405_null_3,(epi_isl_458229_Scherpenheuvel_Zichem_20200319_null_39,epi_isl_458234_Leuven_20200331_null_1)Node664,epi_isl_430013_Amman_20200402_null_3,epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2,epi_isl_456613_Victoria_20200515_null_1,epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_2,epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1,epi_isl_458196_Frameries_20200329_null_16,epi_isl_459484_England_20200427_null_15,epi_isl_457240_England_20200429_null_20,epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1,epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_446178_Wales_20200404_null_1,epi_isl_453410_England_20200409_null_5,(epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1)Node687,(epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1,epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2)Node690,epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1,epi_isl_424010_England_20200320_null_6,epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1,epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1,epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3,epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_1,epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1,epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4,epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6,epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1,epi_isl_453489_England_20200323_null_8,epi_isl_449717_England_20200415_null_2,epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_440879_England_20200421_null_1,epi_isl_449249_Scotland_20200427_null_4,epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1,epi_isl_433563_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1,epi_isl_452199_Maharashtra_20200420_null_2,epi_isl_454138_Portugal_20200323_null_5,epi_isl_457454_England_20200508_null_2,epi_isl_433575_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_459205_England_20200503_null_3,epi_isl_448528_England_20200405_null_1,epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1,epi_isl_438715_England_20200425_null_3,epi_isl_456860_Scotland_20200510_null_10,epi_isl_448409_England_20200429_null_6,epi_isl_420241_England_20200326_null_1,epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1,epi_isl_442949_England_20200411_null_1,(epi_isl_448788_England_20200408_null_140,epi_isl_453312_England_20200403_null_1)Node76,epi_isl_448721_England_20200101_null_2,epi_isl_443642_England_20200415_null_3,epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1,epi_isl_437703_Makkah_20200414_null_1,epi_isl_448342_England_20200423_null_1,epi_isl_423168_England_20200325_null_2,epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2,epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1,epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2,epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1,epi_isl_442823_England_20200411_null_1,epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1,epi_isl_461203_Noord_Brabant_20200101_null_4,epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1,epi_isl_444935_Unknown_20200328_null_1,epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_445073_Luxembourg_20200423_null_2,epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1,epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1,epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1,epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1,epi_isl_446527_Wales_20200412_null_3,epi_isl_457486_England_20200506_null_1,epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1,epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4,epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1,epi_isl_457166_England_20200403_null_8,epi_isl_457510_England_20200506_null_13,((epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1,epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1)Node101,epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3)Node100,epi_isl_442886_England_20200410_null_3)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node100":"test",
"Node101":"test",
"Node163":"test",
"Node234":"test",
"Node245":"test",
"Node252":"test",
"Node255":"test",
"Node259":"test",
"Node260":"test",
"Node264":"test",
"Node267":"test",
"Node270":"test",
"Node273":"test",
"Node276":"test",
"Node279":"test",
"Node282":"test",
"Node285":"test",
"Node288":"test",
"Node291":"test",
"Node294":"test",
"Node297":"test",
"Node302":"test",
"Node305":"test",
"Node308":"test",
"Node313":"test",
"Node316":"test",
"Node319":"test",
"Node322":"test",
"Node325":"test",
"Node328":"test",
"Node331":"test",
"Node334":"test",
"Node337":"test",
"Node340":"test",
"Node343":"test",
"Node346":"test",
"Node351":"test",
"Node355":"test",
"Node361":"test",
"Node366":"test",
"Node371":"test",
"Node374":"test",
"Node379":"test",
"Node385":"test",
"Node391":"test",
"Node394":"test",
"Node397":"test",
"Node401":"test",
"Node406":"test",
"Node411":"test",
"Node414":"test",
"Node420":"test",
"Node423":"test",
"Node426":"test",
"Node431":"test",
"Node435":"test",
"Node443":"test",
"Node444":"test",
"Node448":"test",
"Node488":"test",
"Node511":"test",
"Node551":"test",
"Node552":"test",
"Node553":"test",
"Node558":"test",
"Node565":"test",
"Node618":"test",
"Node641":"test",
"Node664":"test",
"Node687":"test",
"Node690":"test",
"Node76":"test",
"Node779":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":"test",
"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_418764_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_7":"test",
"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420241_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_420495_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421815_England_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_421841_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421980_England_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_423110_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423274_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423831_England_20200323_null_24":"test",
"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_425459_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428255_Wisconsin_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_428463_Guangdong_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_428766_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_429053_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429146_Varmland_20200308_null_24":"test",
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_430013_Amman_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_430180_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430353_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_3":"test",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430952_Idaho_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_432098_Wales_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_432118_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_432404_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432822_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_432991_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433005_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433038_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433563_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433575_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433999_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_434066_Washington_20200402_null_59":"test",
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_434637_Florida_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_434660_Vastra_Gotaland_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_435150_Abruzzo_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_435418_Baranya_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435422_Balassagyarmat_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_435645_California_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_436494_Pennsylvania_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_436730_Abruzzo_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_437193_Kinshasa_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437301_Styria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_437303_Styria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_437381_Minnesota_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437525_Oregon_20200420_null_4":"test",
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_437703_Makkah_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_438405_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":"test",
"epi_isl_438935_Scotland_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_439236_Scotland_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_439291_Scotland_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_439428_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_439498_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_439596_England_20200324_null_8":"test",
"epi_isl_439605_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_439717_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_439745_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_439926_England_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_440086_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_440194_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_440200_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_440236_England_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_440451_England_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_440617_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_440751_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_440879_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_440892_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_440918_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_440938_England_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_440980_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_441065_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_441093_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441313_England_20200402_null_5":"test",
"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_441717_Northern_Ireland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_441753_Northern_Ireland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_441893_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_442215_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_442243_England_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_442320_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_442367_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_442426_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442452_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442599_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_442615_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442797_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_442823_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_442886_England_20200410_null_3":"test",
"epi_isl_442943_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442949_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443052_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443056_England_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_443186_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_443396_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_443517_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_443621_England_20200416_null_9":"test",
"epi_isl_443642_England_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_443748_England_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_443788_England_20200326_null_9":"test",
"epi_isl_444112_England_20200406_null_3":"test",
"epi_isl_444373_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_444410_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_444415_England_20200420_null_5":"test",
"epi_isl_444600_Illinois_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_444640_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_444749_New_York_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_444935_Unknown_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445073_Luxembourg_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_445242_Norrbotten_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_445296_Coyhaique_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_9":"test",
"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446178_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_446194_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446221_Wales_20200406_null_7":"test",
"epi_isl_446464_Wales_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_446527_Wales_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_446714_Wales_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_446904_Wales_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_1":"test",
"epi_isl_447086_Michigan_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_447213_Michigan_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_447423_Jerusalem_District_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_447618_Taipei_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_447792_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_447864_Telangana_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_448160_Scotland_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_448208_Scotland_20200422_null_2":"test",
"epi_isl_448292_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_448295_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_448342_England_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_448409_England_20200429_null_6":"test",
"epi_isl_448528_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_448721_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_448788_England_20200408_null_140":"test",
"epi_isl_449249_Scotland_20200427_null_4":"test",
"epi_isl_449276_Scotland_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_449373_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_449465_England_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_449538_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_449717_England_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_449805_Utah_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_449906_Washington_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_449939_Washington_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_449956_Washington_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_450016_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_450772_Minnesota_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_450827_Uppsala_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_450842_Dhaka_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_451275_Louisiana_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_451336_Sichuan_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_451372_Sichuan_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_451427_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_451472_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451547_New_South_Wales_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_451557_New_South_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451612_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_451731_Graubunden_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_451744_Vaud_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451968_Moscow_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_451996_Denmark_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452095_Denmark_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_452199_Maharashtra_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_452459_Andalusia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_452584_Andalusia_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_452587_Andalusia_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_452633_Basque_Country_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_452829_Virginia_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_452914_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_452929_England_20200512_null_5":"test",
"epi_isl_453002_England_20200517_null_36":"test",
"epi_isl_453056_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_453093_Scotland_20200419_null_3":"test",
"epi_isl_453245_England_20200405_null_3":"test",
"epi_isl_453312_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453410_England_20200409_null_5":"test",
"epi_isl_453430_England_20200405_null_20":"test",
"epi_isl_453469_Northern_Ireland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_453489_England_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_453696_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_453757_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_453862_Portugal_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_454091_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_454138_Portugal_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_454236_Portugal_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_454400_Pennsylvania_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_454548_Maharashtra_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_454556_Maharashtra_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_454561_Maharashtra_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_454979_Hubei_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_455016_Gujarat_20200427_null_3":"test",
"epi_isl_455023_Gujarat_20200502_null_2":"test",
"epi_isl_455048_New_South_Wales_20200324_null_9":"test",
"epi_isl_455272_Netherlands_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_455297_Zuid_Holland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_455383_Hubei_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_455385_Hubei_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_455400_Hubei_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_455424_Osun_State_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_455650_West_Bengal_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_455670_West_Bengal_20200503_null_2":"test",
"epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_10":"test",
"epi_isl_455758_Odisha_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455768_Odisha_20200507_null_3":"test",
"epi_isl_455941_Bangkok_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_455966_Li_ge_20200509_null_9":"test",
"epi_isl_456138_Cali_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_456175_Auckland_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_456208_Auckland_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_456219_Southern_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_456509_Victoria_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_456519_Victoria_20200512_null_9":"test",
"epi_isl_456594_Victoria_20200510_null_4":"test",
"epi_isl_456613_Victoria_20200515_null_1":"test",
"epi_isl_456630_Victoria_20200429_null_9":"test",
"epi_isl_456685_England_20200101_null_4":"test",
"epi_isl_456829_Scotland_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_456848_Scotland_20200507_null_33":"test",
"epi_isl_456860_Scotland_20200510_null_10":"test",
"epi_isl_456886_Scotland_20200510_null_2":"test",
"epi_isl_456887_Scotland_20200510_null_5":"test",
"epi_isl_456909_Scotland_20200403_null_7":"test",
"epi_isl_457166_England_20200403_null_8":"test",
"epi_isl_457240_England_20200429_null_20":"test",
"epi_isl_457247_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_457264_England_20200507_null_4":"test",
"epi_isl_457270_England_20200417_null_9":"test",
"epi_isl_457396_England_20200430_null_4":"test",
"epi_isl_457454_England_20200508_null_2":"test",
"epi_isl_457486_England_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_457510_England_20200506_null_13":"test",
"epi_isl_457520_England_20200511_null_8":"test",
"epi_isl_457556_England_20200512_null_22":"test",
"epi_isl_457664_England_20200501_null_41":"test",
"epi_isl_457802_Maryland_20200310_null_8":"test",
"epi_isl_457805_Washington_DC_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_457816_Maryland_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_457972_Montevideo_20200421_null_8":"test",
"epi_isl_457993_Dakhiliyah_20200324_null_14":"test",
"epi_isl_458077_Telangana_20200418_null_4":"test",
"epi_isl_458079_Surabaya_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_458111_Gujarat_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_458196_Frameries_20200329_null_16":"test",
"epi_isl_458221_Malle_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_458229_Scherpenheuvel_Zichem_20200319_null_39":"test",
"epi_isl_458234_Leuven_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_458237_California_20200429_null_8":"test",
"epi_isl_458337_England_20200501_null_3":"test",
"epi_isl_458431_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458545_England_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_458565_England_20200507_null_18":"test",
"epi_isl_458709_England_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_458750_England_20200418_null_4":"test",
"epi_isl_458825_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_458888_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_459024_England_20200410_null_4":"test",
"epi_isl_459037_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_459069_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459082_England_20200410_null_39":"test",
"epi_isl_459205_England_20200503_null_3":"test",
"epi_isl_459207_England_20200507_null_10":"test",
"epi_isl_459209_England_20200506_null_52":"test",
"epi_isl_459293_England_20200502_null_28":"test",
"epi_isl_459306_England_20200501_null_7":"test",
"epi_isl_459351_Northern_Ireland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_459405_Northern_Ireland_20200410_null_71":"test",
"epi_isl_459408_Northern_Ireland_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_459429_England_20200429_null_101":"test",
"epi_isl_459432_England_20200429_null_16":"test",
"epi_isl_459453_England_20200426_null_36":"test",
"epi_isl_459484_England_20200427_null_15":"test",
"epi_isl_459510_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_459562_Scotland_20200323_null_18":"test",
"epi_isl_459574_Scotland_20200324_null_115":"test",
"epi_isl_459600_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_459724_Scotland_20200324_null_10":"test",
"epi_isl_460022_Michigan_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_460055_Minnesota_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_460146_Massachusetts_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_460316_Massachusetts_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_460327_Massachusetts_20200403_null_16":"test",
"epi_isl_460362_Massachusetts_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_460421_Massachusetts_20200325_null_21":"test",
"epi_isl_460459_Massachusetts_20200327_null_49":"test",
"epi_isl_460561_Michigan_20200429_null_17":"test",
"epi_isl_460790_Noord_Holland_20200414_null_23":"test",
"epi_isl_460793_Noord_Holland_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_461012_Limburg_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_461034_Limburg_20200407_null_37":"test",
"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_461048_Limburg_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_461059_Limburg_20200101_null_5":"test",
"epi_isl_461064_Netherlands_20200324_null_5":"test",
"epi_isl_461083_Netherlands_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_461124_Netherlands_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_461145_Netherlands_20200513_null_14":"test",
"epi_isl_461163_Noord_Brabant_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_461187_Noord_Brabant_20200428_null_3":"test",
"epi_isl_461203_Noord_Brabant_20200101_null_4":"test",
"epi_isl_461221_Noord_Holland_20200519_null_57":"test",
"epi_isl_461229_Utrecht_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_461288_Zeeland_20200402_null_12":"test",
"epi_isl_461364_Zuid_Holland_20200423_null_8":"test",
"epi_isl_461366_Zuid_Holland_20200511_null_49":"test",
"epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_273":"test",
"epi_isl_461449_Washington_20200411_null_32209":"test",
"epi_isl_461466_Washington_20200529_null_3988":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":10
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":7
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":18
}
}
}